+Open data
-Basic information
Entry | Database: PDB / ID: 8h58 | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
Title | Crystal structure of YhaJ effector binding domain | ||||||
Components | HTH-type transcriptional regulator YhaJ | ||||||
Keywords | TRANSCRIPTION | ||||||
Function / homology | Function and homology information transcription cis-regulatory region binding / DNA-binding transcription factor activity Similarity search - Function | ||||||
Biological species | Escherichia coli K-12 (bacteria) | ||||||
Method | X-RAY DIFFRACTION / SYNCHROTRON / MOLECULAR REPLACEMENT / Resolution: 2.639 Å | ||||||
Authors | Kim, M. / Ryu, S.E. | ||||||
Funding support | Korea, Republic Of, 1items
| ||||||
Citation | Journal: Iscience / Year: 2023 Title: Structural basis of transcription factor YhaJ for DNT detection. Authors: Kim, M. / Kang, R. / Jeon, T.J. / Ryu, S.E. | ||||||
History |
|
-Structure visualization
Structure viewer | Molecule: MolmilJmol/JSmol |
---|
-Downloads & links
-Download
PDBx/mmCIF format | 8h58.cif.gz | 650.9 KB | Display | PDBx/mmCIF format |
---|---|---|---|---|
PDB format | pdb8h58.ent.gz | 517.9 KB | Display | PDB format |
PDBx/mmJSON format | 8h58.json.gz | Tree view | PDBx/mmJSON format | |
Others | Other downloads |
-Validation report
Summary document | 8h58_validation.pdf.gz | 570.7 KB | Display | wwPDB validaton report |
---|---|---|---|---|
Full document | 8h58_full_validation.pdf.gz | 644.2 KB | Display | |
Data in XML | 8h58_validation.xml.gz | 115.5 KB | Display | |
Data in CIF | 8h58_validation.cif.gz | 152.1 KB | Display | |
Arichive directory | https://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/h5/8h58 ftp://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/h5/8h58 | HTTPS FTP |
-Related structure data
Related structure data | 8h5aC C: citing same article (ref.) |
---|---|
Similar structure data | Similarity search - Function & homologyF&H Search |
-Links
-Assembly
Deposited unit |
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
1 |
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
2 |
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
3 |
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
4 |
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Unit cell |
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Noncrystallographic symmetry (NCS) | NCS domain:
|