登録情報 データベース : PDB / ID : 8gme 構造の表示 ダウンロードとリンクタイトル Crystal structure of the gp32-Dda-dT17 complex 要素 詳細 キーワード DNA BINDING PROTEIN/DNA / T4 / gp32 / Dda / complex / DNA BINDING PROTEIN-DNA complex機能・相同性 機能・相同性情報分子機能 ドメイン・相同性 構成要素
bidirectional double-stranded viral DNA replication / helicase activity / single-stranded DNA binding / DNA recombination / DNA replication / DNA repair / metal ion binding 類似検索 - 分子機能 Dda helicase SH3 domain / Dda helicase SH3 domain / Bacteriophage T4, Gp32, single-stranded DNA-binding domain / Bacteriophage T4, Gp32, single-stranded DNA-binding superfamily / Bacteriophage T4, Gp32, single-stranded DNA-binding / gp32 DNA binding protein like / AAA domain / ATPases associated with a variety of cellular activities / AAA+ ATPase domain / Nucleic acid-binding, OB-fold / P-loop containing nucleoside triphosphate hydrolase 類似検索 - ドメイン・相同性 DNA / DNA (> 10) / DNA helicase / Single-stranded DNA-binding protein 類似検索 - 構成要素生物種 Tequatrovirus T4 (ウイルス) Tequatrovirus (ウイルス)synthetic construct (人工物) 手法 X線回折 / シンクロトロン / 分子置換 / 解像度 : 4.98 Å 詳細データ登録者 He, X. / Yun, M.K. / White, S.W. 資金援助 米国, 2件 詳細 詳細を隠す組織 認可番号 国 National Institutes of Health/National Institute of General Medical Sciences (NIH/NIGMS) P20GM121293 米国 Other private CA021765
引用ジャーナル : To Be Published タイトル : Crystal structure of the gp32-Dda-dT17 complex著者 : He, X. / Yun, M.K. / White, S.W. 履歴 登録 2023年3月24日 登録サイト : RCSB / 処理サイト : RCSB改定 1.0 2023年6月28日 Provider : repository / タイプ : Initial release改定 2.0 2023年11月1日 Group : Advisory / Atomic model ... Advisory / Atomic model / Data collection / Derived calculations / Refinement description / Source and taxonomy / Structure summary カテゴリ : atom_site / chem_comp_atom ... atom_site / chem_comp_atom / chem_comp_bond / entity_src_gen / pdbx_contact_author / pdbx_poly_seq_scheme / pdbx_unobs_or_zero_occ_residues / pdbx_validate_torsion / refine / refine_hist / refine_ls_restr / refine_ls_shell / software / struct_conf Item : _entity_src_gen.gene_src_common_name / _entity_src_gen.pdbx_gene_src_scientific_name ... _entity_src_gen.gene_src_common_name / _entity_src_gen.pdbx_gene_src_scientific_name / _pdbx_poly_seq_scheme.auth_mon_id / _pdbx_poly_seq_scheme.auth_seq_num / _pdbx_poly_seq_scheme.pdb_mon_id / _refine.B_iso_mean / _refine.ls_R_factor_R_free / _refine.ls_R_factor_R_work / _refine.ls_R_factor_obs / _refine.pdbx_diffrn_id / _refine.pdbx_ls_sigma_F / _refine.pdbx_overall_phase_error / _refine_hist.number_atoms_total / _refine_hist.pdbx_number_atoms_protein / _refine_ls_restr.dev_ideal / _refine_ls_restr.number / _software.classification / _software.name 解説 : Model completeness / Provider : author / タイプ : Coordinate replacement改定 3.0 2023年12月20日 Group : Advisory / Atomic model ... Advisory / Atomic model / Database references / Derived calculations / Polymer sequence / Source and taxonomy / Structure summary カテゴリ : atom_site / entity ... atom_site / entity / entity_name_com / entity_poly / entity_poly_seq / entity_src_gen / pdbx_poly_seq_scheme / pdbx_struct_assembly / pdbx_struct_assembly_gen / pdbx_struct_conn_angle / pdbx_struct_sheet_hbond / pdbx_unobs_or_zero_occ_residues / struct_conf / struct_conn / struct_ref_seq / struct_ref_seq_dif / struct_sheet_range Item : _atom_site.label_seq_id / _entity.formula_weight ... _atom_site.label_seq_id / _entity.formula_weight / _entity.pdbx_description / _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code / _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code_can / _entity_src_gen.pdbx_end_seq_num / _entity_src_gen.pdbx_gene_src_gene / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_seq_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_seq_id / _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_label_seq_id / _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_label_seq_id / _struct_conf.beg_label_seq_id / _struct_conf.end_label_seq_id / _struct_conn.ptnr1_label_seq_id / _struct_ref_seq.seq_align_beg / _struct_ref_seq.seq_align_end / _struct_sheet_range.beg_label_seq_id / _struct_sheet_range.end_label_seq_id 改定 3.1 2023年12月27日 Group : Database references / Structure summary / カテゴリ : entity / pdbx_database_related / Item : _entity.pdbx_description
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