PDB-8fz3: Sterile Alpha Motif of Human Translocation ETS Leukemia, Non-Poly...

IDまたはキーワード:

登録情報

データベース: PDB / ID: 8fz3

タイトル

Sterile Alpha Motif of Human Translocation ETS Leukemia, Non-Polymer Crystal Form

要素

Transcription factor ETV6, Activated CDC42 kinase 1 fusion

キーワード

PROTEIN BINDING / Sterile Alpha Motif / Ubiquitin Associated Domain

機能・相同性

機能・相同性情報

regulation of clathrin-dependent endocytosis / Grb2-EGFR complex / cytoophidium / GTPase inhibitor activity / Signaling by membrane-tethered fusions of PDGFRA or PDGFRB / mesenchymal cell apoptotic process / vitellogenesis / Signaling by LTK / clathrin-coated vesicle / epidermal growth factor receptor binding ...regulation of clathrin-dependent endocytosis / Grb2-EGFR complex / cytoophidium / GTPase inhibitor activity / Signaling by membrane-tethered fusions of PDGFRA or PDGFRB / mesenchymal cell apoptotic process / vitellogenesis / Signaling by LTK / clathrin-coated vesicle / epidermal growth factor receptor binding / positive regulation of peptidyl-tyrosine phosphorylation / WW domain binding / phosphorylation / small GTPase-mediated signal transduction / hematopoietic stem cell proliferation / clathrin-coated pit / neurogenesis / Signaling by FLT3 fusion proteins / protein serine/threonine/tyrosine kinase activity / cytoplasmic vesicle membrane / RNA polymerase II transcription regulatory region sequence-specific DNA binding / adherens junction / non-membrane spanning protein tyrosine kinase activity / non-specific protein-tyrosine kinase / DNA-binding transcription repressor activity, RNA polymerase II-specific / endocytosis / DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific / protein tyrosine kinase activity / eukaryotic translation initiation factor 2alpha kinase activity / cell differentiation / DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific / 3-phosphoinositide-dependent protein kinase activity / DNA-dependent protein kinase activity / ribosomal protein S6 kinase activity / histone H3S10 kinase activity / histone H2AXS139 kinase activity / histone H3S28 kinase activity / histone H4S1 kinase activity / histone H2BS14 kinase activity / histone H3T3 kinase activity / histone H2AS121 kinase activity / Rho-dependent protein serine/threonine kinase activity / histone H2BS36 kinase activity / histone H3S57 kinase activity / histone H2AT120 kinase activity / AMP-activated protein kinase activity / histone H2AS1 kinase activity / histone H3T6 kinase activity / histone H3T11 kinase activity / histone H3T45 kinase activity / cell surface receptor signaling pathway / non-specific serine/threonine protein kinase / endosome / protein domain specific binding / RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding / DNA-binding transcription factor activity / protein serine kinase activity / intracellular membrane-bounded organelle / ubiquitin protein ligase binding / regulation of transcription by RNA polymerase II / chromatin / nucleolus / perinuclear region of cytoplasm / negative regulation of transcription by RNA polymerase II / ATP binding / metal ion binding / identical protein binding / nucleus / membrane / plasma membrane / cytosol / cytoplasm
類似検索 - 分子機能

生物種

Homo sapiens (ヒト)

手法

X線回折 /

シンクロトロン /

分子置換 / 解像度: 2.784 Å

データ登録者

Averett, J.C. / Nawarathnage, S.D. / Moody, J.D.

資金援助

米国, 1件

引用

ジャーナル: To Be Published
タイトル: Sterile Alpha Motif of Human Translocation ETS Leukemia, Non-Polymer Crystal Form, With Disordered Human ACK1 UBA Domain Fused to C-terminus
著者: Averett, J.C. / Nawarathnage, S.D. / Moody, J.D.

履歴

登録	2023年1月27日	登録サイト: RCSB / 処理サイト: RCSB
改定 1.0	2023年3月29日	Provider: repository / タイプ: Initial release
改定 1.1	2024年5月22日	Group: Data collection / カテゴリ: chem_comp_atom / chem_comp_bond

構造ビューア	分子: MolmilJmol/JSmol

-
ダウンロード

PDBx/mmCIF形式	8fz3.cif.gz	215.8 KB	表示	PDBx/mmCIF形式
PDB形式	pdb8fz3.ent.gz	156.2 KB	表示	PDB形式
PDBx/mmJSON形式	8fz3.json.gz		ツリー表示	PDBx/mmJSON形式
その他	その他のダウンロード

-
検証レポート

アーカイブディレクトリ	https://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/fz/8fz3 ftp://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/fz/8fz3	HTTPS FTP

-
関連構造データ

関連構造データ	2qarS 8e1f S: 精密化の開始モデル
類似構造データ	類似検索 - 機能・相同性F&H 検索類似検索 - 機能F&H 検索類似検索 - 相同性F&H 検索

-
リンク

PDBのページ	PDBj / wwPDB / NCBI
「今月の分子」の関連する項目	#267 - 2022年3月血管内皮増殖因子と血管新生 (Vascular Endothelial Growth Factor (VegF) 類似性 (1) #148 - 2012年4月 Rasタンパク質 (Ras Protein) 類似性 (1) #88 - 2007年4月クラスリン (Clathrin) 類似性 (1) #195 - 2016年3月 RAFタンパク質キナーゼ (RAF Protein Kinases) 類似性 (1)

登録構造単位

A: Transcription factor ETV6, Activated CDC42 kinase 1 fusion

B: Transcription factor ETV6, Activated CDC42 kinase 1 fusion

C: Transcription factor ETV6, Activated CDC42 kinase 1 fusion

D: Transcription factor ETV6, Activated CDC42 kinase 1 fusion

ヘテロ分子

79.4 kDa, 4 ポリマー
Omokage検索でこの集合体の類似形状データを探す (詳細)

1

A: Transcription factor ETV6, Activated CDC42 kinase 1 fusion

ヘテロ分子

登録者が定義した集合体
根拠: 電子顕微鏡法, Kim CA, Phillips ML, Kim W, Gingery M, Tran HH, Robinson MA, Faham S, Bowie JU. Polymerization of the SAM domain of TEL in leukemogenesis and transcriptional repression. ...根拠: 電子顕微鏡法, Kim CA, Phillips ML, Kim W, Gingery M, Tran HH, Robinson MA, Faham S, Bowie JU. Polymerization of the SAM domain of TEL in leukemogenesis and transcriptional repression. EMBO J. 2001 Aug 1;20(15):4173-82. doi: 10.1093/emboj/20.15.4173. PMID: 11483520; PMCID: PMC149168.
19.8 kDa, 1 ポリマー
Omokage検索でこの集合体の類似形状データを探す (詳細)

2

B: Transcription factor ETV6, Activated CDC42 kinase 1 fusion

ヘテロ分子

登録者が定義した集合体
19.9 kDa, 1 ポリマー
Omokage検索でこの集合体の類似形状データを探す (詳細)

3

C: Transcription factor ETV6, Activated CDC42 kinase 1 fusion

ヘテロ分子

登録者が定義した集合体
19.8 kDa, 1 ポリマー
Omokage検索でこの集合体の類似形状データを探す (詳細)

4

D: Transcription factor ETV6, Activated CDC42 kinase 1 fusion

登録者が定義した集合体
19.8 kDa, 1 ポリマー
Omokage検索でこの集合体の類似形状データを探す (詳細)

単位格子

Length a, b, c (Å)	61.506, 61.506, 166.139
Angle α, β, γ (deg.)	90.000, 90.000, 120.000
Int Tables number	170
Space group name H-M	P6₅
Space group name Hall	P6₅
Symmetry operation	#1: x,y,z #2: x-y,x,z+5/6 #3: y,-x+y,z+1/6 #4: -y,x-y,z+2/3 #5: -x+y,-x,z+1/3 #6: -x,-y,z+1/2

#1: タンパク質	Transcription factor ETV6, Activated CDC42 kinase 1 fusion / ETS translocation variant 6 / ETS-related protein Tel1 / Tel / ACK-1 / Tyrosine kinase non-receptor protein 2 分子量: 19810.500 Da / 分子数: 4 / 変異: R45S, V77E / 由来タイプ: 組換発現 / 由来: (組換発現) Homo sapiens (ヒト) / 遺伝子: ETV6, TEL, TEL1, TNK2, ACK1 / プラスミド: pET42 / 詳細 (発現宿主): Kanamycin Resistant / 発現宿主: Escherichia coli BL21(DE3) (大腸菌) / 株 (発現宿主): B 参照: UniProt: P41212, UniProt: Q07912, non-specific protein-tyrosine kinase, non-specific serine/threonine protein kinase
#2: 化合物	ChemComp-CL / CHLORIDE ION / クロリド分子量: 35.453 Da / 分子数: 2 / 由来タイプ: 合成 / 式: Cl
#3: 化合物	ChemComp-PO4 / PHOSPHATE ION / ホスファ-ト分子量: 94.971 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 合成 / 式: PO₄
#4: 水	ChemComp-HOH / water 分子量: 18.015 Da / 分子数: 31 / 由来タイプ: 天然 / 式: H₂O
研究の焦点であるリガンドがあるか	N

-
実験

実験	手法: X線回折 / 使用した結晶の数: 1

-
試料調製

結晶化	温度: 298 K / 手法: 蒸気拡散法, シッティングドロップ法 / pH: 8.2 詳細: 1.4 M Sodium phosphate monobasic monohydrate/Potassium phosphate dibasic pH 8.2

-
データ収集

回折	平均測定温度: 100 K / Serial crystal experiment: N
放射光源	由来: シンクロトロン / サイト: SSRL / ビームライン: BL9-2 / 波長: 0.97946 Å
検出器	タイプ: DECTRIS PILATUS 6M / 検出器: PIXEL / 日付: 2022年1月20日
放射	プロトコル: SINGLE WAVELENGTH / 単色(M)・ラウエ(L): M / 散乱光タイプ: x-ray
放射波長	波長: 0.97946 Å / 相対比: 1
反射	解像度: 2.784→44.84 Å / Num. obs: 8929 / % possible obs: 99.84 % / 冗長度: 20 % / B_iso Wilson estimate: 63.22 Å² / CC_1/2: 1 / CC star: 1 / R_merge(I) obs: 0.1248 / R_pim(I) all: 0.02867 / R_rim(I) all: 0.1281 / Net I/σ(I): 20
反射シェル	解像度: 2.784→2.883 Å / 冗長度: 21 % / R_merge(I) obs: 1.48 / Num. unique obs: 898 / CC_1/2: 0.864 / CC star: 0.963 / R_pim(I) all: 0.3301 / R_rim(I) all: 1.516 / % possible all: 100

-
解析

ソフトウェア

名称	バージョン	分類
autoPROC	1.20.1_4487	data processing
PHENIX	1.20.1_4487	精密化
Coot		モデル構築
PHASER		位相決定
autoPROC		データスケーリング
autoPROC		データ削減

精密化

構造決定の手法:

分子置換
開始モデル: 2QAR

2qar

解像度: 2.784→44.84 Å / SU ML: 0.4651 / 交差検証法: FREE R-VALUE / σ(F): 1.35 / 位相誤差: 31.8854
立体化学のターゲット値: GeoStd + Monomer Library + CDL v1.2

	R_factor	反射数	%反射
R_free	0.2665	467	5.24 %
R_work	0.2286	8451	-
obs	0.2306	8918	99.87 %

溶媒の処理

減衰半径: 0.9 Å / VDWプローブ半径: 1.1 Å / 溶媒モデル: FLAT BULK SOLVENT MODEL

原子変位パラメータ

B_iso mean: 68.27 Å²

精密化ステップ

サイクル: LAST / 解像度: 2.784→44.84 Å

	タンパク質	核酸	リガンド	溶媒	全体
原子数	2439	0	7	31	2477

拘束条件

Refine-ID	タイプ	Dev ideal	数
X-RAY DIFFRACTION	f_bond_d	0.0075	2525
X-RAY DIFFRACTION	f_angle_d	0.8383	3446
X-RAY DIFFRACTION	f_chiral_restr	0.039	370
X-RAY DIFFRACTION	f_plane_restr	0.005	439
X-RAY DIFFRACTION	f_dihedral_angle_d	10.7686	877

LS精密化シェル

解像度 (Å)	R_factor R_free	Num. reflection R_free	R_factor R_work	Num. reflection R_work	Refine-ID	% reflection obs (%)
2.784-2.883	0.3613	153	0.3165	2823	X-RAY DIFFRACTION	99.97
3.19-4.01	0.2939	160	0.242	2801	X-RAY DIFFRACTION	99.93
4.01-44.84	0.2249	154	0.1988	2827	X-RAY DIFFRACTION	99.7

精密化 TLS

手法: refined / Refine-ID: X-RAY DIFFRACTION

ID	L11 (°²)	L12 (°²)	L13 (°²)	L22 (°²)	L23 (°²)	L33 (°²)	S11 (Å °)	S12 (Å °)	S13 (Å °)	S21 (Å °)	S22 (Å °)	S23 (Å °)	S31 (Å °)	S32 (Å °)	S33 (Å °)	T11 (Å²)	T12 (Å²)	T13 (Å²)	T22 (Å²)	T23 (Å²)	T33 (Å²)	Origin x (Å)	Origin y (Å)	Origin z (Å)
1	4.49053392781	-3.89925242766	-2.2292663168	3.62457378177	2.23233220434	1.16837038309	-0.544468413634	0.168801381953	1.09664480093	0.755491110571	-0.172965451923	0.0735417776986	-0.174981730873	-0.206143283281	0.579385045918	0.733363324348	-0.035403780898	-0.266742052946	0.544447099965	0.0315987859763	0.862853952235	-30.6759028165	35.985775583	-24.4324510633
2	5.00437129615	-7.37804854864	-2.44149693835	2.02710396068	3.30923989384	2.55301122627	1.00666027156	1.37728262009	2.37164161546	-0.659733276305	0.131743927977	-2.80705131258	-0.487070578657	0.507463550799	-0.116364150152	0.652412760206	0.0285049849459	-0.206642746509	0.801357715474	0.0688268387852	1.04530814905	-18.8859181672	32.0971099235	-29.6913235986
3	8.8107730804	0.968348565207	2.3256430967	2.84547478827	3.23518757212	7.50789884187	-0.81041586168	-0.649264805058	-0.322268733939	0.471319933225	-0.25465027399	-0.255563611693	-0.179739798915	-0.996848665053	1.10984052034	0.569899601585	0.0306475800972	-0.0802250779086	0.531223308737	0.0076208084541	0.452944625944	1.81141800715	24.3480036326	-0.781487983242
4	4.84621370144	0.918503678858	1.63074785989	7.01866472342	-1.2672641027	8.1990960315	-0.220600263301	-0.854071919303	-0.253341410316	0.23221012229	0.750827253894	0.25334365355	0.291462676725	-0.506500819165	-0.166732206121	0.476213824518	0.0260817259635	0.0678480895711	0.420492757498	0.122785809784	0.335205339998	-3.26191502035	18.4915614317	-6.72868725379
5	7.07759332415	1.04420503772	1.81445801255	3.75795163665	-0.427914164396	5.16981422582	-0.0983579660856	1.28634414724	-0.695961535867	-0.356374518218	0.0286870876956	-0.616419181137	0.702239351907	0.475787974816	-0.162703724251	0.473556444481	0.017636719578	0.0607996401727	0.590055881297	-0.131456121542	0.453631858364	3.63196456052	15.4437502093	-14.5262480464
6	8.70018477263	-0.0140978124336	0.681758027451	2.26930838324	1.84723341612	1.79042018396	-0.909580204868	0.824001910075	0.899582890897	-0.314074868247	0.486495620475	-0.147845950803	-1.3126668376	0.0711314326748	0.247958627185	0.742153673399	-0.116477157015	-0.0330044386754	0.588070937305	0.159525660056	0.490469689331	5.06337918451	27.4018596422	-12.7770072277
7	6.97660835585	3.30085779807	3.07208059059	5.51703376306	-3.33266997543	7.1248610552	0.705696891887	0.140838688967	1.00621760639	1.02012850432	-1.28000192494	0.103153531146	-0.898987181474	-0.578264894462	0.391252903279	0.81721474786	-0.048848001852	-0.128973021962	0.59876430289	0.0654259274408	0.393469725672	-21.3896733929	16.0745593234	-14.3816122613
8	6.74101146463	-1.52890615009	-0.213506892241	5.10280473667	1.03685608934	4.48691581588	0.325892288963	-0.0744875330308	-0.289919929004	-0.132198093461	-0.200480693164	-0.0977899026644	-0.0451679652892	0.175916157847	-0.13580138487	0.469146343087	-0.0158366204552	0.0195650777902	0.344481982887	-0.00370512133762	0.279814727236	-16.2280275546	7.70882152531	-8.42598751714
9	9.17816597242	-0.790876516192	7.04397228086	8.93133268093	-3.8290798524	8.17756049624	0.432459070125	-0.998069004583	-0.393525177282	0.619586693711	-0.34303635114	0.561346016142	0.426519717388	-0.18843963791	-0.178314508132	0.622973053938	-0.0526918790032	0.174355040295	0.592596682045	0.105159631213	0.503975047737	-20.9795632118	6.56591503437	-0.274324877688
10	3.16774509366	4.28654052532	2.04641399679	7.03481993613	1.74044412896	2.1050251864	0.0134782177499	-1.61990158862	1.44408062689	1.83494289678	-0.279053683884	-0.27473632903	0.196580019463	0.242620960265	-0.160360091678	0.884933752772	0.227348493536	-0.0241736175917	0.627880755167	-0.155615297616	0.580345343303	-12.5518513341	26.8188069867	2.57798093081
11	7.10389595046	-3.4353452672	4.86856891001	9.72587051523	-1.07793697214	9.55494047742	0.876511378126	1.73289178029	-0.557153709084	-0.927114091707	-0.993812669957	0.626645467091	0.168364770583	0.267724715138	-0.136032096115	0.495412995901	0.195636754755	-0.0485656831267	0.715630739393	-0.102458097088	0.523536112076	-11.9003689299	33.7955982124	3.29399305429
12	0.863873315714	-1.64033876859	0.365374465302	3.42823714521	1.2049161308	9.56740425443	0.609136961219	1.72370641318	-0.75232307703	-1.46699177239	0.802751910547	2.15495602208	-0.56110698234	1.27726898261	0.705839416131	0.836228864195	0.371654297655	-0.296845461828	0.960921084732	-0.0397665815876	0.866757104005	-21.8386121668	41.025194935	-1.48129996847
13	2.12014450326	-3.13539169966	0.601058026979	9.6804227111	-3.23297815675	2.13927934169	0.262307292621	-0.457331697228	0.342963799094	0.600626203941	-0.817320186516	-1.08578579992	0.523195635493	-0.475510629979	0.485992302567	0.535178982903	-0.0587921282016	-0.214899571098	0.634350364368	0.0181275750081	0.668211747737	-10.9385708251	43.0350502871	8.55639735031
14	3.60004626299	-2.49007158735	1.72790453488	4.80111396975	1.42735427892	8.92893694033	-0.566997582381	-0.5512292827	1.37627377203	-0.34157926993	-1.3795937688	3.81486864655	0.660364856803	-0.0835334403404	0.433913230342	0.653269608937	0.0159077709233	-0.153576812217	0.552742743464	-0.327629940088	1.77033692102	-20.9430955262	46.1321972644	9.23723801128
15	2.14419633645	1.60565955084	1.40912381554	3.02568400585	2.96260825019	3.01196163595	0.290171979293	-0.230510046826	0.651992742549	1.22203778604	-0.820531597869	1.9807349311	-0.11287813978	0.315043812526	0.337545468576	0.728800949201	-0.110441091233	-0.0280202020804	0.649819062264	-0.138057811274	0.818912240175	-18.6872994919	34.8992578522	11.4245759967
16	0.506546608313	-1.32510344326	-0.616625266337	7.8176885409	1.33603866583	0.805985386351	-0.324614216556	-1.07961190908	0.239419097043	2.78767955873	-0.85568380041	0.607281683218	-0.854165086468	0.279094443527	1.12852253497	0.698916765319	-0.0188606807142	-0.078921959742	1.08117363352	0.118065230235	0.934821025603	-16.4798213423	23.9644977681	17.88559083
17	3.54134666166	-1.77686305452	1.38997835722	3.56165852171	1.95936568461	3.15137065107	0.846281328448	-0.440299328142	0.358030682649	1.12396563223	-0.108385044661	-0.350128333781	0.645315864714	0.984262710541	0.242234158732	0.768363187497	0.148342395847	-0.196257557435	0.555037616992	0.0473218559735	0.596598481351	-16.8173625593	24.1767205331	-19.0419973894
18	8.80191116258	-2.27962340843	0.817933042236	9.61466696636	2.80290799868	8.69740114834	-0.270817055984	-0.887140869061	0.841402541566	1.62428975353	-0.209237079351	-0.982936890272	-0.173376274596	-0.00308773663721	0.440781313482	0.702845946322	0.0415245287751	-0.174563239047	0.385237727697	-0.0388957247544	0.430128894714	-23.1629418887	29.3534802839	-18.6696638221

精密化 TLSグループ

Refine-ID: X-RAY DIFFRACTION

ID	Refine TLS-ID	Selection details	Auth asym-ID	Label asym-ID	Auth seq-ID	Label seq-ID
1	1	chain 'D' and (resid 49 through 74 )	D	D	49 - 74	36 - 61
2	2	chain 'D' and (resid 75 through 92 )	D	D	75 - 92	62 - 79
3	3	chain 'A' and (resid 13 through 27 )	A	A	13 - 27	1 - 15
4	4	chain 'A' and (resid 28 through 41 )	A	A	28 - 41	16 - 29
5	5	chain 'A' and (resid 42 through 74 )	A	A	42 - 74	30 - 62
6	6	chain 'A' and (resid 75 through 90 )	A	A	75 - 90	63 - 78
7	7	chain 'B' and (resid 13 through 20 )	B	B	13 - 20	1 - 8
8	8	chain 'B' and (resid 21 through 63 )	B	B	21 - 63	9 - 51
9	9	chain 'B' and (resid 64 through 89 )	B	B	64 - 89	52 - 77
10	10	chain 'C' and (resid 14 through 19 )	C	C	14 - 19	1 - 6
11	11	chain 'C' and (resid 20 through 42 )	C	C	20 - 42	7 - 29
12	12	chain 'C' and (resid 43 through 49 )	C	C	43 - 49	30 - 36
13	13	chain 'C' and (resid 50 through 63 )	C	C	50 - 63	37 - 50
14	14	chain 'C' and (resid 64 through 74 )	C	C	64 - 74	51 - 61
15	15	chain 'C' and (resid 75 through 86 )	C	C	75 - 86	62 - 73
16	16	chain 'C' and (resid 87 through 91 )	C	C	87 - 91	74 - 78
17	17	chain 'D' and (resid 14 through 19 )	D	D	14 - 19	1 - 6
18	18	chain 'D' and (resid 20 through 48 )	D	D	20 - 48	7 - 35

-
お知らせ

-
2022年2月9日: EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

EMDBのヘッダファイルのバージョン3が、公式のフォーマットとなりました。
これまでは公式だったバージョン1.9は、アーカイブから削除されます。

関連情報:EMDBヘッダ

外部リンク:wwPDBはEMDBデータモデルのバージョン3へ移行します

-
2020年8月12日: 新型コロナ情報

新型コロナ情報

URL: https://pdbj.org/emnavi/covid19.php

新ページ: EM Navigatorに新型コロナウイルスの特設ページを開設しました。

関連情報:Covid-19情報 / 2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

+
2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

+
2019年1月31日: EMDBのIDの桁数の変更

+
2017年7月12日: PDB大規模アップデート

すべてのお知らせ

-
万見 (Yorodumi)

幾万の構造データを、幾万の視点から

万見(Yorodumi)は、EMDB/PDB/SASBDBなどの構造データを閲覧するためのページです。
EM Navigatorの詳細ページの後継、Omokage検索のフロントエンドも兼ねています。

関連情報:EMDB / PDB / SASBDB / 3つのデータバンクの比較 / 万見検索 / 2016年8月31日: 新しいEM Navigatorと万見 / 万見文献 / Jmol/JSmol / 機能・相同性情報 / 新しいEM Navigatorと万見の変更点

他の情報も見る

-
ムービー

-
構造ビューア

+
ビューアのログ

-
このページ

-
このウェブサイト

-
オプション

+
データを開く

-
基本情報

-
構造の表示

-
ダウンロードとリンク

-
ダウンロード

-
検証レポート

-
関連構造データ

-
リンク

-
集合体

-
要素

-
実験情報

-
実験

-
試料調製

-
データ収集

-
解析

+
万見について

-
お知らせ

-
2022年2月9日: EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

-
2020年8月12日: 新型コロナ情報

+
2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

+
2019年1月31日: EMDBのIDの桁数の変更

+
2017年7月12日: PDB大規模アップデート

-
万見 (Yorodumi)

-ムービー

-構造ビューア

+ビューアのログ

-このページ

-このウェブサイト

-オプション

+データを開く

-基本情報

-構造の表示

-ダウンロードとリンク

-ダウンロード

-検証レポート

-関連構造データ

-リンク

-集合体

-要素

-実験情報

-実験

-試料調製

-データ収集

-解析

+万見について

-お知らせ

-2022年2月9日: EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

-2020年8月12日: 新型コロナ情報

+2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

+2019年1月31日: EMDBのIDの桁数の変更

+2017年7月12日: PDB大規模アップデート

-万見 (Yorodumi)

-
ムービー

-
構造ビューア

+
ビューアのログ

-
このページ

-
このウェブサイト

-
オプション

+
データを開く

-
基本情報

-
構造の表示

-
ダウンロードとリンク

-
ダウンロード

-
検証レポート

-
関連構造データ

-
リンク

-
集合体

-
要素

-
実験情報

-
実験

-
試料調製

-
データ収集

-
解析

+
万見について

-
お知らせ

-
2022年2月9日: EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

-
2020年8月12日: 新型コロナ情報

+
2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

+
2019年1月31日: EMDBのIDの桁数の変更

+
2017年7月12日: PDB大規模アップデート

-
万見 (Yorodumi)