PDB-8evd: Crystal Structure of Nanobody VHH101 Bound to Its Antigen PA14 Cif

IDまたはキーワード:

登録情報

データベース: PDB / ID: 8evd

タイトル

Crystal Structure of Nanobody VHH101 Bound to Its Antigen PA14 Cif

要素

CFTR inhibitory factor
Nanobody VHH101

キーワード

IMMUNE SYSTEM / Pseudomonas aeruginosa / nanobody VHH / immunoglobulin domain / CFTR inhibitory factor (Cif)

機能・相同性

Alpha/beta hydrolase family / Alpha/beta hydrolase fold-1 / Alpha/Beta hydrolase fold / CFTR inhibitory factor

機能・相同性情報

生物種

Vicugna pacos (アルパカ)

Pseudomonas aeruginosa PA14 (緑膿菌)

手法

X線回折 /

シンクロトロン /

分子置換 / 解像度: 2 Å

データ登録者

Simard, A.R. / Taher, N.M. / Beauchemin, K.S. / Madden, D.R.

資金援助

米国, 5件

組織	認可番号	国
National Institutes of Health/National Institute Of Allergy and Infectious Diseases (NIH/NIAID)	R01-AI091699	米国
National Institutes of Health/National Institute of Diabetes and Digestive and Kidney Disease (NIH/NIDDK)	P30-DK117469	米国
National Institutes of Health/National Institute of General Medical Sciences (NIH/NIGMS)	P20-GM113132	米国
National Institutes of Health/National Institute Of Allergy and Infectious Diseases (NIH/NIAID)	T32AI007519	米国
Cystic Fibrosis Foundation	STANTO19R0	米国

引用

ジャーナル: To Be Published
タイトル: Crystal Structure of Nanobody VHH101 Bound to Its Antigen PA14 Cif
著者: Simard, A.R. / Madden, D.R.

履歴

登録	2022年10月20日	登録サイト: RCSB / 処理サイト: RCSB
改定 1.0	2024年3月13日	Provider: repository / タイプ: Initial release
改定 1.1	2024年10月16日	Group: Structure summary カテゴリ: pdbx_entry_details / pdbx_modification_feature

構造ビューア	分子: MolmilJmol/JSmol

-
ダウンロード

PDBx/mmCIF形式	8evd.cif.gz	1.1 MB	表示	PDBx/mmCIF形式
PDB形式	pdb8evd.ent.gz	818.1 KB	表示	PDB形式
PDBx/mmJSON形式	8evd.json.gz		ツリー表示	PDBx/mmJSON形式
その他	その他のダウンロード

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検証レポート

アーカイブディレクトリ	https://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/ev/8evd ftp://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/ev/8evd	HTTPS FTP

-
関連構造データ

関連構造データ	3kd2S 8e2nS 8ee2 8eln S: 精密化の開始モデル
類似構造データ	類似検索 - 機能・相同性F&H 検索類似検索 - 相同性F&H 検索

-
リンク

PDBのページ	PDBj / wwPDB / NCBI
「今月の分子」の関連する項目	#21 - 2001年9月抗体 (Antibodies) 類似性 (1) #256 - 2021年4月 SARSコロナウイルス2型のスパイクと抗体 (SARS-CoV-2 Spike and Antibodies) 類似性 (1) #165 - 2013年9月人工設計されたタンパク質製の籠 (Designed Protein Cages) 類似性 (1) #220 - 2018年4月脱ハロゲン酵素 (Dehalogenases) 類似性 (1)

登録構造単位

A: Nanobody VHH101

B: Nanobody VHH101

C: CFTR inhibitory factor

D: CFTR inhibitory factor

E: Nanobody VHH101

F: Nanobody VHH101

G: CFTR inhibitory factor

H: CFTR inhibitory factor

I: Nanobody VHH101

J: Nanobody VHH101

K: CFTR inhibitory factor

L: CFTR inhibitory factor

302 kDa, 12 ポリマー
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1

A: Nanobody VHH101

B: Nanobody VHH101

C: CFTR inhibitory factor

D: CFTR inhibitory factor

登録者が定義した集合体
根拠: gel filtration, Cif is an obligate homodimer. The biological assembly contains one Cif dimer and two nanobody VHH101 molecules.
101 kDa, 4 ポリマー
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2

E: Nanobody VHH101

F: Nanobody VHH101

G: CFTR inhibitory factor

H: CFTR inhibitory factor

登録者が定義した集合体
根拠: gel filtration, Cif is an obligate homodimer. The biological assembly contains one Cif dimer and two nanobody VHH101 molecules.
101 kDa, 4 ポリマー
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3

I: Nanobody VHH101

J: Nanobody VHH101

K: CFTR inhibitory factor

L: CFTR inhibitory factor

登録者が定義した集合体
根拠: gel filtration, Cif is an obligate homodimer. The biological assembly contains one Cif dimer and two nanobody VHH101 molecules.
101 kDa, 4 ポリマー
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単位格子

Length a, b, c (Å)	188.960, 91.990, 151.215
Angle α, β, γ (deg.)	90.000, 92.540, 90.000
Int Tables number	5
Space group name H-M	C121
Space group name Hall	C2y
Symmetry operation	#1: x,y,z #2: -x,y,-z #3: x+1/2,y+1/2,z #4: -x+1/2,y+1/2,-z

Components on special symmetry positions

ID	モデル	要素
1	1	E-208- HOH
2	1	E-240- HOH

非結晶学的対称性 (NCS)

NCSドメイン:

ID	Ens-ID	詳細
d_1	ens_1	(chain "A" and resid 4 through 127)
d_2	ens_1	chain "B"
d_3	ens_1	(chain "E" and resid 4 through 127)
d_4	ens_1	(chain "F" and resid 4 through 127)
d_5	ens_1	chain "I"
d_6	ens_1	(chain "J" and resid 4 through 127)
d_1	ens_2	(chain "C" and resid 26 through 317)
d_2	ens_2	(chain "D" and resid 26 through 317)
d_3	ens_2	chain "G"
d_4	ens_2	(chain "H" and resid 26 through 317)
d_5	ens_2	chain "K"
d_6	ens_2	(chain "L" and resid 26 through 317)

NCSドメイン領域:

Dom-ID	Component-ID	Ens-ID	Beg label comp-ID	End label comp-ID	Label asym-ID	Label seq-ID
d_1	1	ens_1	VAL	VAL	A	1 - 124
d_2	1	ens_1	VAL	VAL	B	1 - 124
d_3	1	ens_1	VAL	VAL	E	2 - 125
d_4	1	ens_1	VAL	VAL	F	2 - 125
d_5	1	ens_1	VAL	VAL	I	1 - 124
d_6	1	ens_1	VAL	VAL	J	1 - 124
d_1	1	ens_2	GLU	ARG	C	1 - 292
d_2	1	ens_2	GLU	ARG	D	1 - 292
d_3	1	ens_2	GLU	ARG	G	1 - 292
d_4	1	ens_2	GLU	ARG	H	1 - 292
d_5	1	ens_2	GLU	ARG	K	1 - 292
d_6	1	ens_2	GLU	ARG	L	1 - 292

NCSアンサンブル:

ID
ens_1
ens_2

NCS oper:

ID	Code	Matrix	ベクター
1	given	(0.283713831033, -0.0358337709437, 0.958239220101), (-0.0675027950659, -0.997568767321, -0.0173184041803), (0.956530101324, -0.0597703549012, -0.285442936392)	-55.8715551593, 40.1145195548, 77.1741214836
2	given	(-0.455935865267, -0.0192700154849, 0.889803997106), (0.00241073192437, 0.999735174694, 0.0228859968142), (-0.890009368004, 0.0125796256622, -0.455768667071)	-71.8950023756, 30.7974269829, 33.0320820044
3	given	(0.695209523572, -0.00552328784966, -0.718785928929), (-0.0173170876721, -0.999808941548, -0.00906635957805), (-0.718598522688, 0.0187502984715, -0.695172345176)	20.3959417449, 74.1096350774, 46.971463886
4	given	(-0.992574761016, 0.0286539908216, -0.118212912175), (-0.0189436874329, -0.996414050545, -0.0824631831921), (-0.120151905942, -0.0796114858907, 0.989558250338)	-47.0134502217, 103.228340815, -1.93145202213
5	given	(-0.422283016996, 0.00100792299745, -0.906463478386), (-0.027406434431, 0.999528020313, 0.0138789034472), (0.906049634903, 0.0307037571047, -0.422056084415)	-0.681099047854, 58.186229307, 77.9390136687
6	given	(0.287714327077, -0.0239093439697, 0.957417781987), (-0.019640784608, -0.999625386537, -0.019061116708), (0.957514859193, -0.0133202800689, -0.288076143692)	-55.8609823009, 42.6962391465, 75.9069191859
7	given	(-0.482816460296, 0.00375457010857, 0.875713519863), (-0.0117733046681, 0.999872603932, -0.0107779963), (-0.875642424146, -0.015513836094, -0.482710747679)	-73.4224323436, 31.1834728289, 35.3148876884
8	given	(0.711517243638, 0.00146026710139, -0.702667118645), (-0.0118626276449, -0.999830362523, -0.0140898631042), (-0.702568494932, 0.018360658946, -0.711379221043)	20.4960341136, 74.5009679587, 48.2583556314
9	given	(-0.99090816391, 0.00567648711253, -0.134420192646), (0.00415802782021, -0.997340160151, -0.0727689202506), (-0.134475728299, -0.0726662400558, 0.988248903897)	-45.7816055397, 104.289043974, -2.76023742463
10	given	(-0.401335403345, 0.0127329931668, -0.91584265292), (-0.0583306613512, 0.997518330443, 0.0394298665507), (0.91407189431, 0.0692463090344, -0.39959669758)	0.427665300692, 55.4964876049, 76.5156421172

#1: 抗体	Nanobody VHH101 分子量: 16206.850 Da / 分子数: 6 / 由来タイプ: 組換発現 / 由来: (組換発現) Vicugna pacos (アルパカ) / プラスミド: pComb3X / 詳細 (発現宿主): C-terminal 6X-His and HA tag / 発現宿主: Escherichia coli BL21 (大腸菌) / Variant (発現宿主): DE3 RIL
#2: タンパク質	CFTR inhibitory factor 分子量: 34164.699 Da / 分子数: 6 / 由来タイプ: 組換発現由来: (組換発現) Pseudomonas aeruginosa PA14 (緑膿菌) 遺伝子: PA2394 / プラスミド: pDPM73 / 詳細 (発現宿主): C-terminal 6X-His / 発現宿主: Escherichia coli (大腸菌) / 株 (発現宿主): TOP10 / 参照: UniProt: A0A0M3KL26
#3: 水	ChemComp-HOH / water 分子量: 18.015 Da / 分子数: 922 / 由来タイプ: 天然 / 式: H₂O
Has protein modification	Y

-
実験

実験	手法: X線回折 / 使用した結晶の数: 1

-
試料調製

結晶	マシュー密度: 2.18 Å³/Da / 溶媒含有率: 43.72 % / 解説: Two crystals growing together
結晶化	温度: 292.8 K / 手法: 蒸気拡散法, シッティングドロップ法 / pH: 8.5 詳細: 15% (v/v) isopropanol, 1 M ammonium citrate/ammonium hydroxide pH 8.5

-
データ収集

回折	平均測定温度: 100 K / Serial crystal experiment: N
放射光源	由来: シンクロトロン / サイト: NSLS-II / ビームライン: 17-ID-2 / 波長: 0.979339 Å
検出器	タイプ: DECTRIS EIGER X 16M / 検出器: PIXEL / 日付: 2018年8月14日
放射	プロトコル: SINGLE WAVELENGTH / 単色(M)・ラウエ(L): M / 散乱光タイプ: x-ray
放射波長	波長: 0.979339 Å / 相対比: 1
反射	解像度: 2→47.19 Å / Num. obs: 165194 / % possible obs: 94.53 % / 冗長度: 3.6 % / B_iso Wilson estimate: 35.12 Å² / CC_1/2: 0.997 / CC star: 0.999 / R_merge(I) obs: 0.08194 / R_pim(I) all: 0.04854 / R_rim(I) all: 0.09597 / Net I/σ(I): 10.57
反射シェル	解像度: 2→2.071 Å / 冗長度: 3.6 % / R_merge(I) obs: 0.9025 / Mean I/σ(I) obs: 2.02 / Num. unique obs: 16964 / CC_1/2: 0.539 / CC star: 0.837 / R_pim(I) all: 0.5297 / R_rim(I) all: 1.054 / % possible all: 97.76

-
解析

ソフトウェア

名称	バージョン	分類
XDS		データ削減
XSCALE		データスケーリング
PHASER		位相決定
Coot		モデル構築
PHENIX	1.20.1_4487	精密化

精密化

構造決定の手法:

分子置換
開始モデル: 3KD2, 8E2N

3kd2

8e2n

解像度: 2→47.19 Å / SU ML: 0.2232 / 交差検証法: FREE R-VALUE / σ(F): 1.34 / 位相誤差: 21.309
立体化学のターゲット値: GeoStd + Monomer Library + CDL v1.2
詳細: Atoms modeled with zero occupancy could not be placed with confidence and were selected for zero-occupancy flagging after manual inspection of the 2Fo-Fc map at a 0.5-sigma cutoff.

	R_factor	反射数	%反射
R_free	0.2061	8270	5.01 %
R_work	0.1844	156862	-
obs	0.1855	165132	94.54 %

溶媒の処理

減衰半径: 0.9 Å / VDWプローブ半径: 1.1 Å / 溶媒モデル: FLAT BULK SOLVENT MODEL

原子変位パラメータ

B_iso mean: 40.94 Å²

精密化ステップ

サイクル: LAST / 解像度: 2→47.19 Å

	タンパク質	核酸	リガンド	溶媒	全体
原子数	19650	0	0	922	20572

拘束条件

Refine-ID	タイプ	Dev ideal	数
X-RAY DIFFRACTION	f_bond_d	0.0089	20184
X-RAY DIFFRACTION	f_angle_d	0.9659	27376
X-RAY DIFFRACTION	f_chiral_restr	0.0619	2868
X-RAY DIFFRACTION	f_plane_restr	0.0069	3580
X-RAY DIFFRACTION	f_dihedral_angle_d	13.8027	7218

Refine LS restraints NCS

Ens-ID	Dom-ID	Auth asym-ID	Refine-ID	タイプ	Rms dev position (Å)
ens_1	d_2	A	X-RAY DIFFRACTION	Torsion NCS	0.551149538015
ens_1	d_3	A	X-RAY DIFFRACTION	Torsion NCS	0.640424790101
ens_1	d_4	A	X-RAY DIFFRACTION	Torsion NCS	0.548036115083
ens_1	d_5	A	X-RAY DIFFRACTION	Torsion NCS	0.550343369998
ens_1	d_6	A	X-RAY DIFFRACTION	Torsion NCS	0.496557465483
ens_2	d_2	C	X-RAY DIFFRACTION	Torsion NCS	0.575369916819
ens_2	d_3	C	X-RAY DIFFRACTION	Torsion NCS	0.663678017136
ens_2	d_4	C	X-RAY DIFFRACTION	Torsion NCS	0.57949942877
ens_2	d_5	C	X-RAY DIFFRACTION	Torsion NCS	0.692809768736
ens_2	d_6	C	X-RAY DIFFRACTION	Torsion NCS	0.646015703174

LS精密化シェル

解像度 (Å)	R_factor R_free	Num. reflection R_free	R_factor R_work	Num. reflection R_work	Refine-ID	% reflection obs (%)
2-2.02	0.3024	248	0.2792	5446	X-RAY DIFFRACTION	98.05
2.02-2.05	0.2992	305	0.2638	5339	X-RAY DIFFRACTION	97.94
2.05-2.07	0.3021	244	0.2567	5379	X-RAY DIFFRACTION	97.3
2.07-2.1	0.2685	339	0.2498	5384	X-RAY DIFFRACTION	97.65
2.1-2.13	0.2654	276	0.2379	5348	X-RAY DIFFRACTION	97.47
2.13-2.15	0.2498	258	0.2348	5375	X-RAY DIFFRACTION	97.31
2.15-2.19	0.2534	305	0.2273	5340	X-RAY DIFFRACTION	97.08
2.19-2.22	0.2661	267	0.2308	5330	X-RAY DIFFRACTION	97.05
2.22-2.25	0.2577	280	0.2232	5318	X-RAY DIFFRACTION	96.75
2.25-2.29	0.2395	298	0.2199	5362	X-RAY DIFFRACTION	96.72
2.29-2.33	0.2549	273	0.2207	5315	X-RAY DIFFRACTION	96.73
2.33-2.37	0.2453	281	0.2146	5272	X-RAY DIFFRACTION	96.24
2.37-2.42	0.2312	245	0.2102	5322	X-RAY DIFFRACTION	95.65
2.42-2.47	0.2539	286	0.2189	5240	X-RAY DIFFRACTION	95.57
2.47-2.52	0.2504	301	0.2155	5260	X-RAY DIFFRACTION	95.71
2.52-2.58	0.2318	269	0.2079	5277	X-RAY DIFFRACTION	95.55
2.58-2.64	0.2566	268	0.2107	5234	X-RAY DIFFRACTION	94.33
2.64-2.71	0.2547	266	0.2016	5225	X-RAY DIFFRACTION	94.53
2.71-2.79	0.2082	340	0.1987	5252	X-RAY DIFFRACTION	95.95
2.79-2.88	0.2207	201	0.1947	5330	X-RAY DIFFRACTION	95.38
2.88-2.99	0.2261	283	0.1955	5265	X-RAY DIFFRACTION	95.2
2.99-3.11	0.2119	371	0.1937	5145	X-RAY DIFFRACTION	94.74
3.11-3.25	0.186	145	0.172	5261	X-RAY DIFFRACTION	93.42
3.25-3.42	0.1962	324	0.171	5113	X-RAY DIFFRACTION	92.56
3.42-3.63	0.1684	388	0.1636	4959	X-RAY DIFFRACTION	91.42
3.63-3.91	0.219	33	0.1547	5240	X-RAY DIFFRACTION	90.48
3.91-4.31	0.1749	390	0.1523	4788	X-RAY DIFFRACTION	88.29
4.31-4.93	0.1552	390	0.143	4726	X-RAY DIFFRACTION	87.07
4.93-6.21		0	0.1706	5146	X-RAY DIFFRACTION	87.25
6.21-47.19	0.1927	396	0.168	4871	X-RAY DIFFRACTION	87.55

精密化 TLS

手法: refined / Refine-ID: X-RAY DIFFRACTION

ID	L11 (°²)	L12 (°²)	L13 (°²)	L22 (°²)	L23 (°²)	L33 (°²)	S11 (Å °)	S12 (Å °)	S13 (Å °)	S21 (Å °)	S22 (Å °)	S23 (Å °)	S31 (Å °)	S32 (Å °)	S33 (Å °)	T11 (Å²)	T12 (Å²)	T13 (Å²)	T22 (Å²)	T23 (Å²)	T33 (Å²)	Origin x (Å)	Origin y (Å)	Origin z (Å)
1	1.81875412037	0.0456202920873	-0.547598467953	2.01422836224	-0.175909826422	2.12321253402	-0.0219398191002	-0.247821435106	-0.114946006873	0.324912167661	0.0563585838883	0.0335423587063	0.298841468714	-0.131759288373	-0.0282608647555	0.279410830508	-0.0152487912932	-0.00263356444444	0.24661441773	0.00905320562789	0.1719585231	-56.3886224144	19.9453563268	50.4021464031
2	1.87866872264	0.00521213262065	0.0990145988666	2.62700769425	-0.19821944397	2.2250310385	0.101572788001	0.204079840169	0.36324068171	-0.342102638564	-0.0189697759358	-0.573842817699	-0.248755477548	0.323337675242	-0.0799431807103	0.283221040905	0.0045325209011	0.105389145573	0.254383302699	0.0145837893345	0.370767168596	-24.3544386188	23.0303100905	7.6967042967
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5	3.08812123378	-0.718406157303	0.222065931647	2.89826815803	-0.00446833571809	2.7680349016	0.0588126428877	0.292616614932	-0.375976552485	-0.298541526556	-0.120843945947	-0.43875802349	0.233999581856	0.468490565688	0.0299112058482	0.252830166966	0.0168172064938	0.0534098180163	0.368982028192	0.022168863825	0.350232177332	-1.69142401342	51.9121765635	60.5753319624
6	2.94564063527	-0.0215538013623	-0.108522342217	3.17275433826	-0.178695355553	2.6717506751	-0.0817676348167	0.102166623711	0.320453631892	-0.27812901553	-0.0700124943679	0.544312656214	-0.396790423104	-0.489212322261	0.134281008808	0.322123566792	0.0479261154102	-0.0747579633911	0.322851344687	-0.0770184275628	0.301354318438	-55.2640543079	54.6661086417	52.8342362842
7	2.61681721884	0.00486972246247	-0.323797329768	2.7814726857	-0.0256149718349	1.41104560544	0.0614301671592	-0.115492616824	0.690731512525	0.104968040807	-0.0441106081394	-0.0413582866389	-0.311472466878	-0.0124317403986	-0.0201765652476	0.256887601631	0.00111187779549	0.00601327472715	0.261736627094	-0.0465205429262	0.350075900779	-29.9746297047	74.0578216411	68.3414187057
8	1.26584947954	0.405851473984	0.258776506101	2.43334521724	0.193282868878	1.25895281034	0.0523865760165	-0.120570201517	-0.274926320004	0.158357745441	-0.0324534959141	-0.306162404503	0.20343268265	0.107361460597	-0.01742267216	0.263629374771	0.00387885463705	-0.0283938438727	0.27467171757	0.00981414890573	0.300734385118	-30.5338698594	32.1535125375	68.9733880903
9	2.46482732019	0.108513715789	0.310350840663	3.06673516372	-0.348539056511	1.78406795411	0.103637815766	-0.59787017079	0.17008986232	0.878721857372	-0.197719293054	-0.0985192112202	-0.472680387833	0.0926635857209	0.115184525821	0.529008865518	-0.0878516311883	-0.0200439451574	0.5428594898	0.0362209723179	0.306829449434	3.55750013535	80.1521345541	53.0455106209
10	1.78703638658	0.637596420973	0.814723285258	2.62972497971	0.38623595528	2.32706776207	0.043386275538	-0.0146795600245	-0.103113815064	-0.0375917079111	0.0588478478728	-0.02735690078	0.0899384377101	-0.0992259569016	-0.0838030880814	0.154984602445	0.00637621437497	0.00861983670395	0.226634142714	-0.00209843932015	0.168411100746	-22.6059544307	80.2334890561	6.14696635607
11	1.55441666328	-0.311421131539	-0.0106456793949	2.11987390605	0.240777790152	1.88356001402	-0.0452041436114	-0.099779050418	-0.417865463134	0.0825108990376	-0.0548888022381	-0.00872987560182	0.411977226011	0.0113805841141	0.0953243006511	0.290088265756	0.00818559822333	0.0293337692742	0.298849843228	0.0538547020587	0.347903693226	1.49391943111	60.0984174788	22.317960058
12	1.52904082842	-0.576585773315	-0.0581458354297	2.44726170581	-0.234670688519	1.23629700404	0.0557940954034	-0.266075727615	0.402179119988	0.300564078357	-0.0599615113211	-0.342668613056	-0.262265740255	0.239702030596	-0.00371711981138	0.266546176892	-0.0687246281344	-0.0264946883385	0.321309424537	-0.0413633742166	0.332378532063	1.29406662914	101.830818746	24.7573412931

精密化 TLSグループ

Refine-ID: X-RAY DIFFRACTION

ID	Refine TLS-ID	Selection details	Auth asym-ID	Label asym-ID	Auth seq-ID	Label seq-ID
1	1	Chain 'A'	A	A	4 - 128	1 - 125
2	2	Chain 'B'	B	B	4 - 127	1 - 124
3	3	Chain 'C'	C	C	26 - 319	1 - 294
4	4	Chain 'D'	D	D	26 - 319	1 - 294
5	5	Chain 'E'	E	E	3 - 128	1 - 126
6	6	Chain 'F'	F	F	3 - 129	1 - 127
7	7	Chain 'G'	G	G	26 - 317	1 - 292
8	8	Chain 'H'	H	H	26 - 319	1 - 294
9	9	Chain 'I'	I	I	4 - 127	1 - 124
10	10	Chain 'J'	J	J	4 - 129	1 - 126
11	11	Chain 'K'	K	K	26 - 317	1 - 292
12	12	Chain 'L'	L	L	26 - 319	1 - 294

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2022年2月9日: EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

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これまでは公式だったバージョン1.9は、アーカイブから削除されます。

関連情報:EMDBヘッダ

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新型コロナ情報

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万見(Yorodumi)は、EMDB/PDB/SASBDBなどの構造データを閲覧するためのページです。
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関連情報:EMDB / PDB / SASBDB / 3つのデータバンクの比較 / 万見検索 / 2016年8月31日: 新しいEM Navigatorと万見 / 万見文献 / Jmol/JSmol / 機能・相同性情報 / 新しいEM Navigatorと万見の変更点

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