登録情報 | データベース: PDB / ID: 8dqj |
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タイトル | Crystal structure of pyrrolysyl-tRNA synthetase from Methanomethylophilus alvus engineered for acridone amino acid (AST) bound to ATP and acridone |
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要素 | AA_TRNA_LIGASE_II domain-containing protein |
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キーワード | LIGASE / Genetic code expansion / Methanomethylophilus alvus / pyrrolysyl-tRNA synthetase / acridone |
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機能・相同性 | 機能・相同性情報
aminoacyl-tRNA ligase activity / ATP binding / metal ion binding類似検索 - 分子機能 Phenylalanyl tRNA synthetase beta chain, core domain / Phenylalanyl tRNA synthetase beta chain CLM domain / Pyrrolysyl-tRNA ligase, C-terminal / Aminoacyl-tRNA synthetase, class II / Aminoacyl-transfer RNA synthetases class-II family profile. / Class II Aminoacyl-tRNA synthetase/Biotinyl protein ligase (BPL) and lipoyl protein ligase (LPL)類似検索 - ドメイン・相同性 ADENOSINE MONOPHOSPHATE / ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE / DI(HYDROXYETHYL)ETHER / Chem-T7Q / Aminoacyl-transfer RNA synthetases class-II family profile domain-containing protein類似検索 - 構成要素 |
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生物種 | Candidatus Methanomethylophilus alvus (古細菌) |
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手法 | X線回折 / シンクロトロン / 分子置換 / 解像度: 1.54 Å |
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データ登録者 | Gottfried-Lee, I. / Karplus, P.A. / Mehl, R.A. / Cooley, R.B. |
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資金援助 | 米国, 2件 組織 | 認可番号 | 国 |
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National Institutes of Health/National Institute of General Medical Sciences (NIH/NIGMS) | 1R01GM131168-01 | 米国 | National Institutes of Health/National Institute of General Medical Sciences (NIH/NIGMS) | RM1-GM144227 | 米国 |
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引用 | ジャーナル: Acs Chem.Biol. / 年: 2022 タイトル: Structures of Methanomethylophilus alvus Pyrrolysine tRNA-Synthetases Support the Need for De Novo Selections When Altering the Substrate Specificity. 著者: Gottfried-Lee, I. / Perona, J.J. / Karplus, P.A. / Mehl, R.A. / Cooley, R.B. |
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履歴 | 登録 | 2022年7月19日 | 登録サイト: RCSB / 処理サイト: RCSB |
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改定 1.0 | 2022年12月7日 | Provider: repository / タイプ: Initial release |
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改定 1.1 | 2022年12月28日 | Group: Database references / カテゴリ: citation Item: _citation.journal_volume / _citation.page_first / _citation.page_last |
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改定 1.2 | 2023年10月25日 | Group: Data collection / Refinement description カテゴリ: chem_comp_atom / chem_comp_bond / pdbx_initial_refinement_model |
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