登録情報 | データベース: PDB / ID: 8d5r |
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タイトル | Structure of Y430F D-ornithine/D-lysine decarboxylase complex with D-ornithine |
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要素 | D-ornithine/D-lysine decarboxylase |
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キーワード | LYASE / pyridoxal-5'-phosphate / D-amino acid / decarboxylase / Fold III |
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機能・相同性 | 機能・相同性情報
D-ornithine/D-lysine decarboxylase / diaminopimelate decarboxylase activity / lysine biosynthetic process via diaminopimelate類似検索 - 分子機能 Orn/DAP/Arg decarboxylase 2, C-terminal / Pyridoxal-dependent decarboxylase, C-terminal sheet domain / Ornithine/DAP/Arg decarboxylase / Orn/DAP/Arg decarboxylase 2, N-terminal / Pyridoxal-dependent decarboxylase, pyridoxal binding domain / Alanine racemase/group IV decarboxylase, C-terminal / PLP-binding barrel類似検索 - ドメイン・相同性 ACETATE ION / Chem-ORX / 1,4-DIAMINOBUTANE / D-ornithine/D-lysine decarboxylase類似検索 - 構成要素 |
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生物種 | Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium (サルモネラ菌) |
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手法 | X線回折 / シンクロトロン / 分子置換 / 解像度: 1.44 Å |
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データ登録者 | Phillips, R.S. / Nguyen Hoang, K.N. |
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資金援助 | 米国, 1件 組織 | 認可番号 | 国 |
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National Institutes of Health/National Institute of General Medical Sciences (NIH/NIGMS) | R01 GM137008 | 米国 |
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引用 | ジャーナル: Arch.Biochem.Biophys. / 年: 2022 タイトル: The Y430F mutant of Salmonella d-ornithine/d-lysine decarboxylase has altered stereospecificity and a putrescine allosteric activation site. 著者: Phillips, R.S. / Nguyen Hoang, K.N. |
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履歴 | 登録 | 2022年6月6日 | 登録サイト: RCSB / 処理サイト: RCSB |
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改定 1.0 | 2022年11月16日 | Provider: repository / タイプ: Initial release |
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改定 1.1 | 2023年10月18日 | Group: Data collection / Refinement description カテゴリ: chem_comp_atom / chem_comp_bond / pdbx_initial_refinement_model |
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