PDB-8cj4: Crystal structure of ClpP from Staphylococcus epidermidis, tetrad...

IDまたはキーワード:

登録情報

データベース: PDB / ID: 8cj4

タイトル

Crystal structure of ClpP from Staphylococcus epidermidis, tetradecamer

要素

ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit

キーワード

HYDROLASE / Serine protease / apo protein / ClpP

機能・相同性

機能・相同性情報

endopeptidase Clp / ATP-dependent peptidase activity / serine-type endopeptidase activity / proteolysis / cytoplasm
類似検索 - 分子機能

生物種

Staphylococcus epidermidis (表皮ブドウ球菌)

手法

X線回折 /

シンクロトロン /

分子置換 / 解像度: 1.9 Å

データ登録者

Alves Franca, B. / Rohde, H. / Betzel, C.

資金援助

ドイツ, 3件

組織	認可番号	国
German Research Foundation (DFG)	390715994	ドイツ
German Federal Ministry for Education and Research	05K16GUA	ドイツ
German Federal Ministry for Education and Research	5K19GU4	ドイツ

引用

ジャーナル: Sci Rep / 年: 2024
タイトル: Molecular insights into the dynamic modulation of bacterial ClpP function and oligomerization by peptidomimetic boronate compounds.
著者: Alves Franca, B. / Falke, S. / Rohde, H. / Betzel, C.

履歴

登録	2023年2月12日	登録サイト: PDBE / 処理サイト: PDBE
改定 1.0	2024年1月17日	Provider: repository / タイプ: Initial release
改定 1.1	2024年1月24日	Group: Database references / カテゴリ: citation / citation_author Item: _citation.country / _citation.journal_abbrev ..._citation.country / _citation.journal_abbrev / _citation.journal_id_CSD / _citation.journal_id_ISSN / _citation.pdbx_database_id_DOI / _citation.title / _citation.year
改定 1.2	2024年2月14日	Group: Database references / カテゴリ: citation Item: _citation.journal_volume / _citation.page_first ..._citation.journal_volume / _citation.page_first / _citation.page_last / _citation.pdbx_database_id_PubMed / _citation.title

構造ビューア	分子: MolmilJmol/JSmol

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ダウンロード

PDBx/mmCIF形式	8cj4.cif.gz	978 KB	表示	PDBx/mmCIF形式
PDB形式	pdb8cj4.ent.gz	820.2 KB	表示	PDB形式
PDBx/mmJSON形式	8cj4.json.gz		ツリー表示	PDBx/mmJSON形式
その他	その他のダウンロード

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検証レポート

文書・要旨	8cj4_validation.pdf.gz	549.6 KB	表示	wwPDB検証レポート
文書・詳細版	8cj4_full_validation.pdf.gz	562.6 KB	表示
XML形式データ	8cj4_validation.xml.gz	100 KB	表示
CIF形式データ	8cj4_validation.cif.gz	143.2 KB	表示
アーカイブディレクトリ	https://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/cj/8cj4 ftp://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/cj/8cj4	HTTPS FTP

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関連構造データ

関連構造データ	8qyfC C: 同じ文献を引用 (文献)
類似構造データ	類似検索 - 機能・相同性F&H 検索類似検索 - 機能F&H 検索類似検索 - 相同性F&H 検索

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リンク

PDBのページ	PDBj / wwPDB / NCBI

登録構造単位

A: ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit

B: ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit

C: ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit

D: ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit

E: ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit

F: ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit

G: ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit

H: ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit

I: ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit

J: ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit

K: ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit

L: ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit

M: ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit

N: ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit

ヘテロ分子

311 kDa, 14 ポリマー
Omokage検索でこの集合体の類似形状データを探す (詳細)

1

登録構造と同一
登録者・ソフトウェアが定義した集合体
根拠: SAXS, SEC-SAXS results indicate that the structure is a tetradecamer (approx. 300kDa)

単位格子

Length a, b, c (Å)	95.423, 123.662, 126.787
Angle α, β, γ (deg.)	90.00, 91.21, 90.00
Int Tables number	4
Space group name H-M	P12₁1

#1: タンパク質	ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit / Endopeptidase Clp 分子量: 22106.025 Da / 分子数: 14 / 由来タイプ: 組換発現由来: (組換発現) Staphylococcus epidermidis (表皮ブドウ球菌) 遺伝子: clpP, E1M97_03460, E1M98_06460, E1N00_07180, E1N03_05195, E1N04_00635, E1N05_04945, E1N06_06240, E1N09_07235, E1N11_03825, E1N12_01760, E1N13_04220, FHG76_01330, FHQ17_10195, H3963_07430, I3V53_07130 発現宿主: Escherichia coli BL21(DE3) (大腸菌) / Variant (発現宿主): Star / 参照: UniProt: A0A0N1MQL5, endopeptidase Clp
#2: 化合物	ChemComp-MPD / (4S)-2-METHYL-2,4-PENTANEDIOL / (S)-2-メチル-2,4-ペンタンジオ-ル分子量: 118.174 Da / 分子数: 14 / 由来タイプ: 合成 / 式: C₆H₁₄O₂ / コメント: 沈殿剤*YM
#3: 水	ChemComp-HOH / water 分子量: 18.015 Da / 分子数: 1641 / 由来タイプ: 天然 / 式: H₂O
研究の焦点であるリガンドがあるか	N

-
実験

実験	手法: X線回折 / 使用した結晶の数: 1

-
試料調製

結晶	マシュー密度: 2.42 Å³/Da / 溶媒含有率: 49.1 %
結晶化	温度: 298.15 K / 手法: 蒸気拡散法, ハンギングドロップ法 / pH: 4.5 詳細: 0.1M sodium acetate (pH 4.5), 35% v/v MPD and 40mM calcium chloride

-
データ収集

回折	平均測定温度: 100 K / Serial crystal experiment: N
放射光源	由来: シンクロトロン / サイト: PETRA III, DESY / ビームライン: P11 / 波長: 1.0332 Å
検出器	タイプ: DECTRIS PILATUS 6M / 検出器: PIXEL / 日付: 2020年6月2日
放射	プロトコル: SINGLE WAVELENGTH / 単色(M)・ラウエ(L): M / 散乱光タイプ: x-ray
放射波長	波長: 1.0332 Å / 相対比: 1
反射	解像度: 1.9→44.96 Å / Num. obs: 227961 / % possible obs: 98.65 % / 冗長度: 7 % / B_iso Wilson estimate: 27.82 Å² / CC_1/2: 1 / R_rim(I) all: 0.09 / Net I/σ(I): 14.12
反射シェル	解像度: 1.9→1.97 Å / 冗長度: 7.1 % / Mean I/σ(I) obs: 2.14 / Num. unique obs: 22466 / CC_1/2: 0.8 / R_rim(I) all: 0.94 / % possible all: 97.58

-
解析

ソフトウェア

名称	バージョン	分類
PHENIX	1.20.1-4487	精密化
XDS		データスケーリング
XDS		データ削減
PHASER		位相決定

精密化

構造決定の手法:

分子置換 / 解像度: 1.9→44.96 Å / SU ML: 0.21 / 交差検証法: FREE R-VALUE / σ(F): 1.36 / 位相誤差: 22.65 / 立体化学のターゲット値: ML

	R_factor	反射数	%反射
R_free	0.2194	2392	1.05 %
R_work	0.1825	-	-
obs	0.1829	227921	98.66 %

溶媒の処理

減衰半径: 0.9 Å / VDWプローブ半径: 1.1 Å / 溶媒モデル: FLAT BULK SOLVENT MODEL

原子変位パラメータ

B_iso mean: 31.38 Å²

精密化ステップ

サイクル: LAST / 解像度: 1.9→44.96 Å

	タンパク質	核酸	リガンド	溶媒	全体
原子数	19366	0	112	1641	21119

拘束条件

Refine-ID	タイプ	Dev ideal	数
X-RAY DIFFRACTION	f_bond_d	0.008
X-RAY DIFFRACTION	f_angle_d	0.949
X-RAY DIFFRACTION	f_dihedral_angle_d	7.376	2752
X-RAY DIFFRACTION	f_chiral_restr	0.059	3116
X-RAY DIFFRACTION	f_plane_restr	0.01	3492

LS精密化シェル

解像度 (Å)	R_factor R_free	Num. reflection R_free	R_factor R_work	Num. reflection R_work	Refine-ID	% reflection obs (%)
1.9-1.94	0.2882	138	0.2523	13038	X-RAY DIFFRACTION	97
1.94-1.98	0.2681	140	0.2422	13140	X-RAY DIFFRACTION	98
1.98-2.03	0.3056	139	0.2246	13106	X-RAY DIFFRACTION	98
2.03-2.08	0.2847	139	0.2096	13102	X-RAY DIFFRACTION	98
2.08-2.13	0.2414	140	0.1988	13181	X-RAY DIFFRACTION	98
2.13-2.2	0.2289	139	0.1915	13134	X-RAY DIFFRACTION	98
2.2-2.27	0.2363	141	0.1814	13222	X-RAY DIFFRACTION	98
2.27-2.35	0.2098	140	0.1797	13208	X-RAY DIFFRACTION	99
2.35-2.44	0.2111	140	0.1824	13250	X-RAY DIFFRACTION	99
2.44-2.55	0.2139	141	0.1815	13251	X-RAY DIFFRACTION	99
2.55-2.69	0.2366	141	0.1823	13313	X-RAY DIFFRACTION	99
2.69-2.86	0.1971	141	0.1855	13312	X-RAY DIFFRACTION	99
2.86-3.08	0.2184	142	0.1897	13372	X-RAY DIFFRACTION	99
3.08-3.39	0.2703	142	0.1915	13362	X-RAY DIFFRACTION	100
3.39-3.88	0.21	142	0.1722	13388	X-RAY DIFFRACTION	99
3.88-4.88	0.1796	144	0.1522	13512	X-RAY DIFFRACTION	100

精密化 TLS

手法: refined / Refine-ID: X-RAY DIFFRACTION

ID	L11 (°²)	L12 (°²)	L13 (°²)	L22 (°²)	L23 (°²)	L33 (°²)	S11 (Å °)	S12 (Å °)	S13 (Å °)	S21 (Å °)	S22 (Å °)	S23 (Å °)	S31 (Å °)	S32 (Å °)	S33 (Å °)	T11 (Å²)	T12 (Å²)	T13 (Å²)	T22 (Å²)	T23 (Å²)	T33 (Å²)	Origin x (Å)	Origin y (Å)	Origin z (Å)
1	0.0655	0.0207	0.0665	-0.0112	0.0079	0.0111	-0.0918	-0.5298	-0.5616	0.1701	0.021	0.0174	0.4009	0.2817	-0.0002	0.511	0.033	0.098	0.4042	0.0944	0.322	-35.9264	-50.4774	2.4293
2	0.3311	-0.4497	0.1198	0.513	0.0298	-0.0244	-0.006	0.0193	-0.1069	0.1117	-0.0302	-0.0062	0.2346	-0.0689	0.1389	0.4204	-0.0463	0.1825	0.3253	0.0542	0.3272	-46.3958	-46.828	-5.0534
3	0.4972	-0.5694	0.1069	0.5546	-0.061	0.7345	-0.2385	-0.0784	0.0006	0.0674	-0.1422	0.2239	0.2003	-0.1644	-1.206	0.2931	-0.0838	0.1961	0.3215	0.0359	0.2816	-52.3159	-37.4405	-8.1301
4	0.3174	-0.0585	0.1479	0.5431	-0.0412	0.1001	-0.0792	0.0794	0.0239	-0.0459	-0.0946	0.4144	0.1775	-0.398	-0.0686	0.1917	-0.0539	0.0748	0.3208	-0.0065	0.3892	-59.7999	-34.3358	-21.9719
5	0.9071	0.0668	0.1892	0.3605	0.2184	0.5091	-0.1601	-0.1392	0.2612	0.2439	-0.0135	0.3135	-0.062	-0.2677	-0.2983	0.2956	-0.0099	0.1634	0.3727	0.0062	0.3724	-57.4549	-26.8267	-4.4358
6	0.0146	-0.0364	-0.0042	0.002	-0.0226	-0.0376	-0.1458	0.0359	-0.5314	0.0548	0.0008	0.2993	0.294	0.1035	0.0002	0.4288	0.0174	0.0181	0.3128	0.0575	0.3838	-21.4202	-48.7295	6.0576
7	0.4154	-0.3152	0.0998	0.7201	0.1155	0.2864	-0.0636	-0.123	-0.1647	0.1837	0.047	0.1516	0.1318	-0.0648	-0.1582	0.3684	0.0329	0.103	0.303	0.0946	0.212	-32.6032	-35.3726	7.2436
8	0.0693	0.0762	0.2668	0.4715	0.2361	0.1044	-0.1199	0.0406	0.0836	0.1112	-0.0307	0.0553	0.0448	0.0674	-0	0.3082	0.0679	0.0526	0.3164	0.0668	0.2404	-29.1986	-22.3372	3.5689
9	0.0154	-0.2965	0.0819	0.1001	0.1361	0.233	-0.1648	-0.161	0.0228	0.1232	0.0426	0.2758	0.1011	-0.3289	-0.0274	0.2648	0.0188	0.1005	0.3359	0.0437	0.3176	-42.2641	-16.5251	-1.3438
10	0.1636	0.1448	0.0409	0.3183	0.1961	0.1086	-0.1009	-0.1107	0.3717	0.302	0.0424	0.1222	-0.1107	0.0005	-0.0004	0.3851	0.0777	0.0631	0.3424	0.0506	0.2943	-28.3247	-12.379	7.4221
11	0.0601	-0.1188	0.061	0.2685	-0.1083	0.1263	-0.1278	-0.5937	-0.3107	0.4603	0.3196	0.1941	0.2366	0.0614	0.0726	0.5982	0.1777	0.0059	0.4268	0.0423	0.1925	-21.2651	-24.306	16.9541
12	0.0221	-0.1427	-0.0748	0.0743	0.1044	0.0292	0.1075	0.0881	-0.2149	0.0675	0.037	0.3718	0.8291	0.0957	0.0001	0.4074	0.0246	0.0025	0.3033	0.0302	0.303	-10.1279	-53.9785	0.5766
13	0.9339	-0.3005	-0.133	0.9716	-0.3192	0.2356	-0.0526	0.0071	-0.0704	0.0747	0.0813	0.0823	0.0227	0.0228	0.0001	0.2817	0.0308	-0.0265	0.2247	0.0393	0.1796	-8.408	-36.7141	5.0146
14	0.1079	-0.1905	0.1254	0.0361	-0.1309	-0.1808	-0.0042	-0.0828	0.1012	-0.0492	0.0332	-0.1275	-0.0202	-0.1224	-0	0.3208	0.0303	-0.0591	0.2391	0.0197	0.2383	-1.8926	-27.1151	-1.4659
15	0.2181	-0.0124	0.0225	0.4156	-0.0466	-0.0252	-0.1876	-0.1147	0.214	0.4424	0.1014	-0.0977	-0.0979	-0.1472	0.0025	0.3701	0.0318	-0.0177	0.2454	-0.004	0.1833	-10.0622	-15.2446	1.9107
16	0.254	-0.0313	-0.2426	0.2223	-0.0958	0.1771	0.0211	0.0704	0.2903	0.08	-0.1755	-0.3626	-0.2575	0.2133	-0.0002	0.3621	-0.0228	-0.1189	0.276	0.0323	0.3007	5.9303	-20.8555	0.2586
17	0.0412	-0.0903	0.0375	0.0353	0.0343	0.0674	-0.0937	0.0171	0.1903	0.1645	-0.0489	-0.2593	0.0978	0.4123	-0.098	0.3612	0.0356	-0.1006	0.2933	0.0316	0.231	9.4922	-36.2022	5.3779
18	0.3308	0.0493	-0.1254	1.3483	0.2371	0.3267	0.0153	0.0312	-0.0332	0.2021	0.0149	0.0307	0.0626	-0.0106	-0	0.2393	-0.0001	-0.0313	0.2234	0.0285	0.2263	2.1961	-52.676	-9.7422
19	0.2349	0.0992	-0.0823	0.3237	0.1703	-0.1173	0.0018	-0.0409	0.0158	-0.1386	0.1124	-0.238	-0.0934	0.0612	0.0015	0.2552	0.0037	-0.0477	0.2446	0.0055	0.26	9.8328	-44.7113	-20.1814
20	0.3287	-0.0189	0.0907	0.1013	0.1318	0.112	-0.1484	-0.0573	0.1021	0.6976	0.0748	-0.4829	-0.2161	0.1299	0	0.2737	-0.0307	-0.046	0.2714	0.0189	0.2639	12.7999	-31.2833	-14.4203
21	0.7569	0.3228	-0.1055	0.2438	0.3105	0.8631	-0.0086	0.0051	-0.0579	-0.1269	-0.003	-0.2436	-0.0131	0.2739	-0.0003	0.1799	-0.0098	-0.0252	0.3158	-0.0081	0.3648	18.0915	-47.829	-23.1304
22	0.1612	0.0625	0.0292	0.0076	0.0325	0.0075	-0.0794	-0.2156	-0.2099	0.7529	-0.0426	0.295	-0.1936	0.1198	-0.0002	0.4687	-0.042	0.0431	0.3032	0.0266	0.3322	-18.2778	-69.2194	-16.8869
23	0.1973	0.2471	-0.4641	0.6653	0.2086	0.7912	0.005	0.0108	-0.088	0.1295	0.0292	-0.0497	0.1372	0.0301	-0	0.2137	-0.0188	-0.0469	0.171	0.029	0.2201	-4.2036	-66.5214	-28.5544
24	0.1397	-0.0866	0.0036	0.0559	-0.0008	0.0696	0.0207	0.0402	0.0731	0.1573	0.0661	0.0737	0.1304	-0.0239	0	0.3018	-0.0445	0.0205	0.264	-0.0233	0.3438	1.7979	-44.4798	-39.6619
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68	1.1021	-0.0324	0.2527	0.195	-0.0337	0.8963	-0.0382	0.0075	0.0776	-0.1136	0.0075	0.1083	-0.0671	0.0138	-0.0024	0.3033	-0.0267	-0.0913	0.187	0.0362	0.2353	-25.5535	9.7889	-29.7826
69	0.1851	-0.0418	0.3663	0.245	0.0013	0.2295	-0.1087	-0.1177	-0.0147	0.0731	0.0713	-0.0527	-0.03	0.0019	0	0.2863	0.0018	-0.0291	0.2275	0.0145	0.2046	-16.9916	-0.3609	-12.1183
70	0.2225	0.1631	-0.1417	-0.0073	0.0513	0.3211	-0.0933	-0.3655	0.016	0.1679	0.0713	0.2058	-0.2062	-0.2696	0.0002	0.3311	0.0341	-0.0437	0.3187	0.0153	0.3062	-33.0903	6.6112	-11.5578
71	0.0609	-0.0362	-0.0036	0.0179	0.0248	0.0458	-0.2825	0.056	0.6401	-0.0414	0.0496	0.3064	-0.2869	0.0366	0.0002	0.3772	-0.006	-0.1119	0.2568	0.0154	0.3662	-39.2069	15.1056	-24.6617
72	0.1245	-0.0758	0.1037	0.0308	-0.0685	0.0074	0.0658	0.3866	-0.241	-0.4576	-0.0335	0.1999	0.3514	0.2912	-0	0.414	-0.0206	-0.1077	0.257	0.0057	0.2664	-14.6085	7.8421	-45.7397
73	0.3023	-0.5844	0.2532	0.4912	-0.0183	0.8529	0.0591	0.0507	0.0951	-0.153	0.0145	-0.0161	-0.0646	0.0262	-0.0001	0.3028	-0.0485	0.0001	0.2004	0.0233	0.2012	-0.9606	3.3212	-36.4458
74	0.1941	-0.0321	0.2521	0.2983	0.0161	0.3319	-0.1511	-0.083	-0.144	-0.0544	0.141	-0.2113	-0.1197	-0.0321	0.0025	0.2725	-0.0269	-0.0438	0.2367	0.0356	0.2241	-3.5144	8.6618	-24.465
75	0.0536	-0.0058	0.1048	0.0225	-0.0291	0.1291	-0.0815	-0.0293	0.0889	-0.0466	0.0582	0.096	0.0369	-0.1536	-0.0001	0.3068	-0.0398	0.0242	0.242	0.0167	0.3056	2.5424	-18.186	-23.0471
76	0.5653	-0.1377	0.0099	0.1195	0.0946	0.1511	-0.0311	0.0047	0.131	-0.2295	0.0502	-0.2929	-0.0549	0.0363	-0.0001	0.2501	-0.0307	0.0003	0.2565	-0.0073	0.245	10.3992	-10.3671	-24.0248
77	0.1956	0.09	-0.0852	0.0689	-0.0356	0.0266	-0.1124	-0.2753	-0.0741	0.2457	0.1938	-0.0957	-0.0817	0.0156	0.0001	0.2991	-0.0123	-0.0486	0.2715	-0.0077	0.2597	2.2823	1.5316	-15.0077
78	0.0857	0.1141	-0.0387	0.1115	-0.0061	0.053	0.0303	-0.2267	0.3969	-0.161	-0.0016	0.177	-0.5437	0.0058	0.0002	0.4138	-0.0066	-0.0196	0.2302	-0.0238	0.2945	-4.4372	14.5553	-23.1672

精密化 TLSグループ

ID	Refine-ID	Refine TLS-ID	Selection details
1	X-RAY DIFFRACTION	1	chain 'A' and (resid 5 through 27 )
2	X-RAY DIFFRACTION	2	chain 'A' and (resid 28 through 70 )
3	X-RAY DIFFRACTION	3	chain 'A' and (resid 71 through 132 )
4	X-RAY DIFFRACTION	4	chain 'A' and (resid 133 through 158 )
5	X-RAY DIFFRACTION	5	chain 'A' and (resid 159 through 192 )
6	X-RAY DIFFRACTION	6	chain 'B' and (resid 4 through 27 )
7	X-RAY DIFFRACTION	7	chain 'B' and (resid 28 through 94 )
8	X-RAY DIFFRACTION	8	chain 'B' and (resid 95 through 132 )
9	X-RAY DIFFRACTION	9	chain 'B' and (resid 133 through 158 )
10	X-RAY DIFFRACTION	10	chain 'B' and (resid 159 through 183 )
11	X-RAY DIFFRACTION	11	chain 'B' and (resid 184 through 192 )
12	X-RAY DIFFRACTION	12	chain 'C' and (resid 4 through 27 )
13	X-RAY DIFFRACTION	13	chain 'C' and (resid 28 through 106 )
14	X-RAY DIFFRACTION	14	chain 'C' and (resid 107 through 132 )
15	X-RAY DIFFRACTION	15	chain 'C' and (resid 133 through 158 )
16	X-RAY DIFFRACTION	16	chain 'C' and (resid 159 through 183 )
17	X-RAY DIFFRACTION	17	chain 'C' and (resid 184 through 192 )
18	X-RAY DIFFRACTION	18	chain 'D' and (resid 3 through 106 )
19	X-RAY DIFFRACTION	19	chain 'D' and (resid 107 through 132 )
20	X-RAY DIFFRACTION	20	chain 'D' and (resid 133 through 158 )
21	X-RAY DIFFRACTION	21	chain 'D' and (resid 159 through 192 )
22	X-RAY DIFFRACTION	22	chain 'E' and (resid 4 through 27 )
23	X-RAY DIFFRACTION	23	chain 'E' and (resid 28 through 122 )
24	X-RAY DIFFRACTION	24	chain 'E' and (resid 123 through 132 )
25	X-RAY DIFFRACTION	25	chain 'E' and (resid 133 through 158 )
26	X-RAY DIFFRACTION	26	chain 'E' and (resid 159 through 183 )
27	X-RAY DIFFRACTION	27	chain 'E' and (resid 184 through 192 )
28	X-RAY DIFFRACTION	28	chain 'F' and (resid 4 through 37 )
29	X-RAY DIFFRACTION	29	chain 'F' and (resid 38 through 70 )
30	X-RAY DIFFRACTION	30	chain 'F' and (resid 71 through 132 )
31	X-RAY DIFFRACTION	31	chain 'F' and (resid 133 through 158 )
32	X-RAY DIFFRACTION	32	chain 'F' and (resid 159 through 192 )
33	X-RAY DIFFRACTION	33	chain 'G' and (resid 4 through 54 )
34	X-RAY DIFFRACTION	34	chain 'G' and (resid 55 through 122 )
35	X-RAY DIFFRACTION	35	chain 'G' and (resid 123 through 158 )
36	X-RAY DIFFRACTION	36	chain 'G' and (resid 159 through 192 )
37	X-RAY DIFFRACTION	37	chain 'H' and (resid 4 through 27 )
38	X-RAY DIFFRACTION	38	chain 'H' and (resid 28 through 54 )
39	X-RAY DIFFRACTION	39	chain 'H' and (resid 55 through 106 )
40	X-RAY DIFFRACTION	40	chain 'H' and (resid 107 through 122 )
41	X-RAY DIFFRACTION	41	chain 'H' and (resid 123 through 132 )
42	X-RAY DIFFRACTION	42	chain 'H' and (resid 133 through 158 )
43	X-RAY DIFFRACTION	43	chain 'H' and (resid 159 through 183 )
44	X-RAY DIFFRACTION	44	chain 'H' and (resid 184 through 192 )
45	X-RAY DIFFRACTION	45	chain 'I' and (resid 4 through 27 )
46	X-RAY DIFFRACTION	46	chain 'I' and (resid 28 through 122 )
47	X-RAY DIFFRACTION	47	chain 'I' and (resid 123 through 132 )
48	X-RAY DIFFRACTION	48	chain 'I' and (resid 133 through 158 )
49	X-RAY DIFFRACTION	49	chain 'I' and (resid 159 through 172 )
50	X-RAY DIFFRACTION	50	chain 'I' and (resid 173 through 192 )
51	X-RAY DIFFRACTION	51	chain 'J' and (resid 4 through 27 )
52	X-RAY DIFFRACTION	52	chain 'J' and (resid 28 through 122 )
53	X-RAY DIFFRACTION	53	chain 'J' and (resid 123 through 158 )
54	X-RAY DIFFRACTION	54	chain 'J' and (resid 159 through 192 )
55	X-RAY DIFFRACTION	55	chain 'K' and (resid 4 through 27 )
56	X-RAY DIFFRACTION	56	chain 'K' and (resid 28 through 122 )
57	X-RAY DIFFRACTION	57	chain 'K' and (resid 123 through 158 )
58	X-RAY DIFFRACTION	58	chain 'K' and (resid 159 through 192 )
59	X-RAY DIFFRACTION	59	chain 'L' and (resid 4 through 27 )
60	X-RAY DIFFRACTION	60	chain 'L' and (resid 28 through 54 )
61	X-RAY DIFFRACTION	61	chain 'L' and (resid 55 through 70 )
62	X-RAY DIFFRACTION	62	chain 'L' and (resid 71 through 132 )
63	X-RAY DIFFRACTION	63	chain 'L' and (resid 133 through 158 )
64	X-RAY DIFFRACTION	64	chain 'L' and (resid 159 through 169 )
65	X-RAY DIFFRACTION	65	chain 'L' and (resid 170 through 183 )
66	X-RAY DIFFRACTION	66	chain 'L' and (resid 184 through 192 )
67	X-RAY DIFFRACTION	67	chain 'M' and (resid 4 through 27 )
68	X-RAY DIFFRACTION	68	chain 'M' and (resid 28 through 122 )
69	X-RAY DIFFRACTION	69	chain 'M' and (resid 123 through 158 )
70	X-RAY DIFFRACTION	70	chain 'M' and (resid 159 through 183 )
71	X-RAY DIFFRACTION	71	chain 'M' and (resid 184 through 192 )
72	X-RAY DIFFRACTION	72	chain 'N' and (resid 4 through 27 )
73	X-RAY DIFFRACTION	73	chain 'N' and (resid 28 through 106 )
74	X-RAY DIFFRACTION	74	chain 'N' and (resid 107 through 122 )
75	X-RAY DIFFRACTION	75	chain 'N' and (resid 123 through 132 )
76	X-RAY DIFFRACTION	76	chain 'N' and (resid 133 through 158 )
77	X-RAY DIFFRACTION	77	chain 'N' and (resid 159 through 183 )
78	X-RAY DIFFRACTION	78	chain 'N' and (resid 184 through 192 )

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EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

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これまでは公式だったバージョン1.9は、アーカイブから削除されます。

関連情報:EMDBヘッダ

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新型コロナ情報

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万見(Yorodumi)は、EMDB/PDB/SASBDBなどの構造データを閲覧するためのページです。
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