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基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 8brh | ||||||
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タイトル | Co-crystal structure of She4 with Myo4 peptide | ||||||
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![]() | CHAPERONE / UNC-45 / UCS / myosin | ||||||
機能・相同性 | UNC-45/Cro1/She4, central domain / Myosin-binding striated muscle assembly central / chaperone-mediated protein folding / Hsp90 protein binding / Armadillo-like helical / Armadillo-type fold / cytoplasm / KLLA0E16699p![]() | ||||||
生物種 | ![]() ![]() ![]() | ||||||
手法 | ![]() ![]() ![]() | ||||||
![]() | Arnese, R. / Gudino, R. / Meinhart, A. / Clausen, T. | ||||||
資金援助 | ![]()
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![]() | ![]() タイトル: Co-crystal structure of She4 with Myo4 peptide 著者: Arnese, R. / Gudino, R. / Meinhart, A. / Clausen, T. #1: ![]() タイトル: UNC-45 assisted myosin folding depends on a conserved FX3HY motif implicated in Freeman Sheldon Syndrome 著者: Vogel, A. / Arnese, R. / Gudino, R. / Sehr, D. / Bylicki, A. / Meinhart, A. / Clausen, T. | ||||||
履歴 |
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構造の表示
構造ビューア | 分子: ![]() ![]() |
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ダウンロードとリンク
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ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | ![]() | 301.5 KB | 表示 | ![]() |
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PDB形式 | ![]() | 217.1 KB | 表示 | ![]() |
PDBx/mmJSON形式 | ![]() | ツリー表示 | ![]() | |
その他 | ![]() |
-検証レポート
文書・要旨 | ![]() | 439.1 KB | 表示 | ![]() |
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文書・詳細版 | ![]() | 454.5 KB | 表示 | |
XML形式データ | ![]() | 25.6 KB | 表示 | |
CIF形式データ | ![]() | 35.3 KB | 表示 | |
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
-関連構造データ
関連構造データ | ![]() 8brgS S: 精密化の開始モデル |
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類似構造データ | 類似検索 - 機能・相同性 ![]() |
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リンク
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集合体
登録構造単位 | ![]()
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1 |
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単位格子 |
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要素
#1: タンパク質 | 分子量: 75856.875 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 組換発現 / 詳細: She4 / 由来: (組換発現) ![]() ![]() ![]() |
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#2: タンパク質・ペプチド | 分子量: 895.056 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 合成 / 由来: (合成) ![]() ![]() |
#3: 水 | ChemComp-HOH / |
-実験情報
-実験
実験 | 手法: ![]() |
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試料調製
結晶 | マシュー密度: 2.41 Å3/Da / 溶媒含有率: 48.9 % |
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結晶化 | 温度: 292 K / 手法: 蒸気拡散法, シッティングドロップ法 / pH: 8.5 詳細: 100mM bicine/Trizma base pH 8.5 10% P20K, 20% PEG MME 550 20mM carboxylic acid |
-データ収集
回折 | 平均測定温度: 100 K / Serial crystal experiment: N |
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放射光源 | 由来: ![]() ![]() ![]() |
検出器 | タイプ: DECTRIS PILATUS 6M / 検出器: PIXEL / 日付: 2014年12月9日 |
放射 | プロトコル: SINGLE WAVELENGTH / 単色(M)・ラウエ(L): M / 散乱光タイプ: x-ray |
放射波長 | 波長: 1.1512 Å / 相対比: 1 |
反射 | 解像度: 2.4→49.47 Å / Num. obs: 29225 / % possible obs: 99.9 % / 冗長度: 8.1 % / Biso Wilson estimate: 51.9 Å2 / Rmerge(I) obs: 0.1406 / Rrim(I) all: 0.1502 / Net I/σ(I): 10.05 |
反射 シェル | 解像度: 2.4→2.54 Å / Num. unique obs: 4655 / CC1/2: 0.465 / % possible all: 99.8 |
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解析
ソフトウェア |
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精密化 | 構造決定の手法: ![]() 開始モデル: 8BRG 解像度: 2.4→49.47 Å / SU ML: 0.3596 / 交差検証法: FREE R-VALUE / σ(F): 1.35 / 位相誤差: 25.7169 立体化学のターゲット値: GeoStd + Monomer Library + CDL v1.2
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溶媒の処理 | 減衰半径: 0.9 Å / VDWプローブ半径: 1.1 Å / 溶媒モデル: FLAT BULK SOLVENT MODEL | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
原子変位パラメータ | Biso mean: 68.15 Å2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
精密化ステップ | サイクル: LAST / 解像度: 2.4→49.47 Å
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拘束条件 |
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LS精密化 シェル |
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精密化 TLS | 手法: refined / Refine-ID: X-RAY DIFFRACTION
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精密化 TLSグループ | Refine-ID: X-RAY DIFFRACTION
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