登録情報 | データベース: PDB / ID: 8bft |
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タイトル | The E. coli TrpD2 protein YbiB in complex with a C-terminal peptide from ObgE |
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要素 | - GTPase ObgE/CgtA
- Protein YbiB
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キーワード | DNA BINDING PROTEIN / TrpD2 / YbiB / ObgE / DNA-binding |
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機能・相同性 | 機能・相同性情報
guanyl ribonucleotide binding / dormancy process / anthranilate phosphoribosyltransferase activity / negative regulation of ribosome biogenesis / tryptophan biosynthetic process / guanosine tetraphosphate binding / ribosomal large subunit binding / ribosome assembly / chromosome segregation / 加水分解酵素; 酸無水物に作用; GTPに作用・細胞または細胞小器官の運動に関与 ...guanyl ribonucleotide binding / dormancy process / anthranilate phosphoribosyltransferase activity / negative regulation of ribosome biogenesis / tryptophan biosynthetic process / guanosine tetraphosphate binding / ribosomal large subunit binding / ribosome assembly / chromosome segregation / 加水分解酵素; 酸無水物に作用; GTPに作用・細胞または細胞小器官の運動に関与 / GDP binding / rRNA binding / GTPase activity / GTP binding / magnesium ion binding / protein homodimerization activity / DNA binding / RNA binding / cytosol類似検索 - 分子機能 GTP1/OBG, conserved site / GTP1/OBG family signature. / OBG-type GTPase / GTP1/OBG domain / GTP-binding protein Obg/CgtA / GTP1/OBG domain superfamily / GTP1/OBG / Obg domain profile. / Anthranilate phosphoribosyl transferase / Glycosyl transferase family 3, N-terminal domain ...GTP1/OBG, conserved site / GTP1/OBG family signature. / OBG-type GTPase / GTP1/OBG domain / GTP-binding protein Obg/CgtA / GTP1/OBG domain superfamily / GTP1/OBG / Obg domain profile. / Anthranilate phosphoribosyl transferase / Glycosyl transferase family 3, N-terminal domain / Glycosyl transferase family 3, N-terminal domain superfamily / Glycosyl transferase family, helical bundle domain / Nucleoside phosphorylase/phosphoribosyltransferase catalytic domain superfamily / OBG-type guanine nucleotide-binding (G) domain / OBG-type guanine nucleotide-binding (G) domain profile. / 50S ribosome-binding GTPase / GTP binding domain / P-loop containing nucleoside triphosphate hydrolase類似検索 - ドメイン・相同性 DI(HYDROXYETHYL)ETHER / Uncharacterized protein YbiB / GTPase ObgE/CgtA類似検索 - 構成要素 |
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生物種 | ![](img/tx_bacteria.gif) Escherichia coli (大腸菌) |
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手法 | X線回折 / シンクロトロン / 分子置換 / 解像度: 1.19 Å |
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データ登録者 | Deckers, B. / Galicia, C. / Versees, W. |
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資金援助 | ベルギー, 3件 組織 | 認可番号 | 国 |
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Research Foundation - Flanders (FWO) | 11D4621N | ベルギー | Vrije Universiteit Brussel (Blegium) | SRP50 | ベルギー | Research Foundation - Flanders (FWO) | G0I1522N | ベルギー |
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引用 | ジャーナル: Nucleic Acids Res. / 年: 2023 タイトル: YbiB: a novel interactor of the GTPase ObgE. 著者: Deckers, B. / Vercauteren, S. / De Kock, V. / Martin, C. / Lazar, T. / Herpels, P. / Dewachter, L. / Verstraeten, N. / Peeters, E. / Ballet, S. / Michiels, J. / Galicia, C. / Versees, W. |
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履歴 | 登録 | 2022年10月26日 | 登録サイト: PDBE / 処理サイト: PDBE |
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改定 1.0 | 2023年2月22日 | Provider: repository / タイプ: Initial release |
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改定 1.1 | 2023年3月22日 | Group: Database references / カテゴリ: citation / citation_author Item: _citation.country / _citation.journal_abbrev ..._citation.country / _citation.journal_abbrev / _citation.journal_id_ASTM / _citation.journal_id_CSD / _citation.journal_id_ISSN / _citation.pdbx_database_id_DOI / _citation.pdbx_database_id_PubMed / _citation.title / _citation.year / _citation_author.identifier_ORCID |
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改定 1.2 | 2023年5月3日 | Group: Database references / カテゴリ: citation / citation_author Item: _citation.journal_volume / _citation.page_first ..._citation.journal_volume / _citation.page_first / _citation.page_last / _citation_author.identifier_ORCID |
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改定 1.3 | 2024年2月7日 | Group: Data collection / カテゴリ: chem_comp_atom / chem_comp_bond |
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