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基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 8bdv | ||||||
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タイトル | Ribosome maturation factor P (RimP) from Staphylococcus aureus | ||||||
![]() | Ribosome maturation factor RimP | ||||||
![]() | TRANSLATION / Ribosome maturation / Staphylococcus aureus / Ribosome | ||||||
機能・相同性 | ![]() | ||||||
生物種 | ![]() ![]() | ||||||
手法 | 溶液NMR / simulated annealing | ||||||
![]() | Garaeva, N. / Usachev, K. | ||||||
資金援助 | ![]()
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![]() | ![]() タイトル: Ribosome maturation factor P (RimP) from Staphylococcus aureus 著者: Garaeva, N. / Usachev, K. | ||||||
履歴 |
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構造の表示
構造ビューア | 分子: ![]() ![]() |
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ダウンロードとリンク
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ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | ![]() | 490.5 KB | 表示 | ![]() |
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PDB形式 | ![]() | 407.6 KB | 表示 | ![]() |
PDBx/mmJSON形式 | ![]() | ツリー表示 | ![]() | |
その他 | ![]() |
-検証レポート
文書・要旨 | ![]() | 418.7 KB | 表示 | ![]() |
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文書・詳細版 | ![]() | 531.8 KB | 表示 | |
XML形式データ | ![]() | 48.9 KB | 表示 | |
CIF形式データ | ![]() | 65.8 KB | 表示 | |
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
-関連構造データ
関連構造データ | ![]() 8bh6C ![]() 8bh7C C: 同じ文献を引用 ( |
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類似構造データ | 類似検索 - 機能・相同性 ![]() |
その他のデータベース |
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リンク
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集合体
登録構造単位 | ![]()
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1 |
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NMR アンサンブル |
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要素
#1: タンパク質 | 分子量: 17720.354 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 組換発現 由来: (組換発現) ![]() ![]() 株: bovine RF122 / ET3-1 / 遺伝子: rimP, SAB1127 発現宿主: ![]() ![]() 株 (発現宿主): BL21-Gold(DE3)pLysS AG / 参照: UniProt: Q2YXK3 |
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-実験情報
-実験
実験 | 手法: 溶液NMR | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NMR実験 |
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試料調製
詳細 |
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試料 |
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試料状態 | イオン強度: 0 Not defined / Label: 250mMNaCl, 10mM Tris-HCl / pH: 7.4 / 圧: 1 atm / 温度: 298 K |
-NMR測定
NMRスペクトロメーター | タイプ: Bruker AVANCE III HD / 製造業者: Bruker / モデル: AVANCE III HD / 磁場強度: 700 MHz |
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解析
NMR software |
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精密化 | 手法: simulated annealing / ソフトェア番号: 2 | |||||||||
代表構造 | 選択基準: lowest energy | |||||||||
NMRアンサンブル | コンフォーマー選択の基準: structures with the lowest energy 計算したコンフォーマーの数: 500 / 登録したコンフォーマーの数: 10 |