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基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 8aig | ||||||
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タイトル | NMR structure of holo-acp | ||||||
![]() | Hybrid non ribosomal peptide synthetase-polyketide synthase | ||||||
![]() | TRANSFERASE / Acyl carrier protein | ||||||
機能・相同性 | ![]() polyketide biosynthetic process / : / phosphopantetheine binding / 3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] synthase activity / antibiotic biosynthetic process / fatty acid biosynthetic process 類似検索 - 分子機能 | ||||||
生物種 | ![]() | ||||||
手法 | 溶液NMR / molecular dynamics | ||||||
![]() | Collin, S. / Weissman, K.J. / Chagot, B. / Gruez, A. | ||||||
資金援助 | ![]()
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![]() | ![]() タイトル: Decrypting the programming of beta-methylation in virginiamycin M biosynthesis. 著者: Collin, S. / Cox, R.J. / Paris, C. / Jacob, C. / Chagot, B. / Weissman, K.J. / Gruez, A. | ||||||
履歴 |
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構造の表示
構造ビューア | 分子: ![]() ![]() |
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ダウンロードとリンク
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ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | ![]() | 496.4 KB | 表示 | ![]() |
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PDB形式 | ![]() | 418.1 KB | 表示 | ![]() |
PDBx/mmJSON形式 | ![]() | ツリー表示 | ![]() | |
その他 | ![]() |
-検証レポート
文書・要旨 | ![]() | 454.4 KB | 表示 | ![]() |
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文書・詳細版 | ![]() | 550.4 KB | 表示 | |
XML形式データ | ![]() | 28.4 KB | 表示 | |
CIF形式データ | ![]() | 48 KB | 表示 | |
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
-関連構造データ
関連構造データ | ![]() 8a7zC ![]() 8ahqC ![]() 8ahzC ![]() 8allC C: 同じ文献を引用 ( |
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類似構造データ | 類似検索 - 機能・相同性 ![]() |
その他のデータベース |
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リンク
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集合体
登録構造単位 | ![]()
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1 |
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NMR アンサンブル |
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要素
#1: タンパク質 | 分子量: 8863.971 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 組換発現 由来: (組換発現) ![]() 遺伝子: virG / 発現宿主: ![]() ![]() |
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#2: 化合物 | ChemComp-PNS / |
研究の焦点であるリガンドがあるか | Y |
-実験情報
-実験
実験 | 手法: 溶液NMR | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NMR実験 |
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試料調製
詳細 | タイプ: solution 内容: 1.0 mM [U-100% 13C; U-100% 15N] virginiamycin ACP6, 100 mM sodium phosphate, 0.5 mM TCEP, 90% H2O/10% D2O Label: sample_1 / 溶媒系: 90% H2O/10% D2O | ||||||||||||
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試料 |
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試料状態 | イオン強度: 0.1 M / Label: conditions_1 / pH: 6.5 / 圧: 1 atm / 温度: 298 K |
-NMR測定
NMRスペクトロメーター | タイプ: Bruker AVANCE III / 製造業者: Bruker / モデル: AVANCE III / 磁場強度: 600 MHz |
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解析
NMR software |
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精密化 | 手法: molecular dynamics / ソフトェア番号: 1 | |||||||||||||||
代表構造 | 選択基準: fewest violations | |||||||||||||||
NMRアンサンブル | コンフォーマー選択の基準: structures with the least restraint violations 計算したコンフォーマーの数: 50 / 登録したコンフォーマーの数: 20 |