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基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 8a7z | ||||||
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タイトル | NMR structure of holo-acp | ||||||
![]() | Hybrid polyketide synthase-non ribosomal peptide synthetase | ||||||
![]() | TRANSFERASE / Acyl carrier protein | ||||||
機能・相同性 | ![]() toxin biosynthetic process / amide biosynthetic process / : / DIM/DIP cell wall layer assembly / fatty acid synthase activity / phosphopantetheine binding / 3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] synthase activity / antibiotic biosynthetic process / fatty acid biosynthetic process / plasma membrane / cytoplasm 類似検索 - 分子機能 | ||||||
生物種 | ![]() | ||||||
手法 | 溶液NMR / molecular dynamics | ||||||
![]() | Collin, S. / Weissman, K.J. / Chagot, B. / Gruez, A. | ||||||
資金援助 | ![]()
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![]() | ![]() タイトル: Decrypting the programming of beta-methylation in virginiamycin M biosynthesis. 著者: Collin, S. / Cox, R.J. / Paris, C. / Jacob, C. / Chagot, B. / Weissman, K.J. / Gruez, A. | ||||||
履歴 |
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構造の表示
構造ビューア | 分子: ![]() ![]() |
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ダウンロードとリンク
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ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | ![]() | 498.4 KB | 表示 | ![]() |
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PDB形式 | ![]() | 420.1 KB | 表示 | ![]() |
PDBx/mmJSON形式 | ![]() | ツリー表示 | ![]() | |
その他 | ![]() |
-検証レポート
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
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-関連構造データ
関連構造データ | ![]() 8ahqC ![]() 8ahzC ![]() 8aigC ![]() 8allC C: 同じ文献を引用 ( |
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類似構造データ | 類似検索 - 機能・相同性 ![]() |
その他のデータベース |
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リンク
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集合体
登録構造単位 | ![]()
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1 |
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NMR アンサンブル |
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要素
#1: タンパク質 | 分子量: 8882.927 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 組換発現 由来: (組換発現) ![]() 遺伝子: virA / プラスミド: pBG102 / 発現宿主: ![]() ![]() |
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#2: 化合物 | ChemComp-PNS / |
研究の焦点であるリガンドがあるか | Y |
-実験情報
-実験
実験 | 手法: 溶液NMR | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NMR実験 |
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試料調製
詳細 | タイプ: solution 内容: 1.0 mM [U-13C; U-15N] acp5a-holo, 100 mM sodium phosphate, 0.5 mM TCEP, 90% H2O/10% D2O Label: sample1 / 溶媒系: 90% H2O/10% D2O | ||||||||||||||||
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試料 |
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試料状態 | 詳細: 100 mM NaP / イオン強度: 100 mM / Label: condition_1 / pH: 6 / 圧: 1 atm / 温度: 298 K |
-NMR測定
NMRスペクトロメーター | タイプ: Bruker AVANCE III / 製造業者: Bruker / モデル: AVANCE III / 磁場強度: 600 MHz |
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解析
NMR software |
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精密化 | 手法: molecular dynamics / ソフトェア番号: 4 | ||||||||||||||||||||||||||||
代表構造 | 選択基準: fewest violations | ||||||||||||||||||||||||||||
NMRアンサンブル | コンフォーマー選択の基準: structures with the least restraint violations 計算したコンフォーマーの数: 50 / 登録したコンフォーマーの数: 20 |