PDB-7z5n: Crystal structure of DYRK1A in complex with CX-4945

IDまたはキーワード:

登録情報

データベース: PDB / ID: 7z5n

タイトル

Crystal structure of DYRK1A in complex with CX-4945

要素

Dual specificity tyrosine-phosphorylation-regulated kinase 1A

キーワード

TRANSFERASE / Kinase / diabetes / kinase inhibitor

機能・相同性

機能・相同性情報

negative regulation of heterochromatin formation / peptidyl-serine autophosphorylation / dual-specificity kinase / [RNA-polymerase]-subunit kinase / tau-protein kinase activity / negative regulation of microtubule polymerization / negative regulation of DNA damage response, signal transduction by p53 class mediator / amyloid-beta formation / negative regulation of mRNA splicing, via spliceosome / G0 and Early G1 ...
類似検索 - 分子機能

生物種

Homo sapiens (ヒト)

手法

X線回折 /

シンクロトロン /

分子置換 / 解像度: 2.77 Å

データ登録者

Pustelny, K. / Grygier, P. / Golik, P. / Dubin, G. / Czarna, A.

資金援助

ポーランド, 2件

引用

ジャーナル: To Be Published
タイトル: Crystal structure DYRK1A in complex with CX-4945
著者: Grygier, P. / Pustelny, K. / Golik, P. / Popowicz, G. / Dubin, G. / Czarna, A.

履歴

登録	2022年3月9日	登録サイト: PDBE / 処理サイト: PDBE
改定 1.0	2023年3月22日	Provider: repository / タイプ: Initial release
改定 1.1	2024年2月7日	Group: Data collection / Refinement description カテゴリ: chem_comp_atom / chem_comp_bond / pdbx_initial_refinement_model
改定 1.2	2024年10月16日	Group: Structure summary カテゴリ: pdbx_entry_details / pdbx_modification_feature Item: _pdbx_entry_details.has_protein_modification

構造ビューア	分子: MolmilJmol/JSmol

-
ダウンロード

PDBx/mmCIF形式	7z5n.cif.gz	1.1 MB	表示	PDBx/mmCIF形式
PDB形式	pdb7z5n.ent.gz	913 KB	表示	PDB形式
PDBx/mmJSON形式	7z5n.json.gz		ツリー表示	PDBx/mmJSON形式
その他	その他のダウンロード

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検証レポート

アーカイブディレクトリ	https://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/z5/7z5n ftp://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/z5/7z5n	HTTPS FTP

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関連構造データ

関連構造データ	6eisS S: 精密化の開始モデル
類似構造データ	類似検索 - 機能・相同性F&H 検索類似検索 - 機能F&H 検索類似検索 - 相同性F&H 検索

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リンク

PDBのページ	PDBj / wwPDB / NCBI
「今月の分子」の関連する項目	#236 - 2019年8月サイクリンとサイクリン依存性キナーゼ (Cyclin and Cyclin-dependent Kinase) 類似性 (1)

登録構造単位

A: Dual specificity tyrosine-phosphorylation-regulated kinase 1A

B: Dual specificity tyrosine-phosphorylation-regulated kinase 1A

C: Dual specificity tyrosine-phosphorylation-regulated kinase 1A

D: Dual specificity tyrosine-phosphorylation-regulated kinase 1A

E: Dual specificity tyrosine-phosphorylation-regulated kinase 1A

F: Dual specificity tyrosine-phosphorylation-regulated kinase 1A

G: Dual specificity tyrosine-phosphorylation-regulated kinase 1A

H: Dual specificity tyrosine-phosphorylation-regulated kinase 1A

ヘテロ分子

353 kDa, 8 ポリマー
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1

A: Dual specificity tyrosine-phosphorylation-regulated kinase 1A

ヘテロ分子

登録者が定義した集合体
根拠: gel filtration
44.7 kDa, 1 ポリマー
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2

B: Dual specificity tyrosine-phosphorylation-regulated kinase 1A

ヘテロ分子

登録者が定義した集合体
44.7 kDa, 1 ポリマー
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3

C: Dual specificity tyrosine-phosphorylation-regulated kinase 1A

ヘテロ分子

登録者が定義した集合体
44.2 kDa, 1 ポリマー
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4

D: Dual specificity tyrosine-phosphorylation-regulated kinase 1A

ヘテロ分子

登録者が定義した集合体
44 kDa, 1 ポリマー
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5

E: Dual specificity tyrosine-phosphorylation-regulated kinase 1A

ヘテロ分子

登録者が定義した集合体
44.1 kDa, 1 ポリマー
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6

F: Dual specificity tyrosine-phosphorylation-regulated kinase 1A

ヘテロ分子

登録者が定義した集合体
43.7 kDa, 1 ポリマー
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7

G: Dual specificity tyrosine-phosphorylation-regulated kinase 1A

ヘテロ分子

登録者が定義した集合体
44.1 kDa, 1 ポリマー
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8

H: Dual specificity tyrosine-phosphorylation-regulated kinase 1A

ヘテロ分子

登録者が定義した集合体
44 kDa, 1 ポリマー
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単位格子

Length a, b, c (Å)	247.682, 134.317, 121.717
Angle α, β, γ (deg.)	90.000, 96.480, 90.000
Int Tables number	5
Space group name H-M	C121

-
タンパク質 , 1種, 8分子 ABCDEFGH

#1: タンパク質	Dual specificity tyrosine-phosphorylation-regulated kinase 1A / Dual specificity YAK1-related kinase / HP86 / Protein kinase minibrain homolog / MNBH / hMNB 分子量: 43180.574 Da / 分子数: 8 / 由来タイプ: 組換発現 / 由来: (組換発現) Homo sapiens (ヒト) / 遺伝子: DYRK1A, DYRK, MNB, MNBH / 発現宿主: Escherichia coli (大腸菌) / 株 (発現宿主): LOBSTR / 参照: UniProt: Q13627, dual-specificity kinase

#1: タンパク質

Dual specificity tyrosine-phosphorylation-regulated kinase 1A / Dual specificity YAK1-related kinase / HP86 / Protein kinase minibrain homolog / MNBH / hMNB

分子量: 43180.574 Da / 分子数: 8 / 由来タイプ: 組換発現 / 由来: (組換発現)

Homo sapiens (ヒト) / 遺伝子: DYRK1A, DYRK, MNB, MNBH / 発現宿主:

Escherichia coli (大腸菌) / 株 (発現宿主): LOBSTR / 参照: UniProt: Q13627, dual-specificity kinase

-
非ポリマー , 7種, 263分子

#2: 化合物	ChemComp-3NG / 5-[(3-chlorophenyl)amino]benzo[c][2,6]naphthyridine-8-carboxylic acid / CX-4945 分子量: 349.770 Da / 分子数: 8 / 由来タイプ: 合成 / 式: C₁₉H₁₂ClN₃O₂ / コメント: 化学療法薬, 阻害剤*YM
#3: 化合物	... ChemComp-SO4 / SULFATE ION / 硫酸ジアニオン分子量: 96.063 Da / 分子数: 22 / 由来タイプ: 合成 / 式: SO₄
#4: 化合物	ChemComp-PG4 / TETRAETHYLENE GLYCOL / テトラエチレングリコ-ル分子量: 194.226 Da / 分子数: 8 / 由来タイプ: 合成 / 式: C₈H₁₈O₅ / コメント: 沈殿剤*YM
#5: 化合物	ChemComp-PEG / DI(HYDROXYETHYL)ETHER / ジエチレングリコ-ル分子量: 106.120 Da / 分子数: 4 / 由来タイプ: 合成 / 式: C₄H₁₀O₃
#6: 化合物	ChemComp-EDO / 1,2-ETHANEDIOL / ETHYLENE GLYCOL / エチレングリコ-ル分子量: 62.068 Da / 分子数: 13 / 由来タイプ: 合成 / 式: C₂H₆O₂
#7: 化合物	ChemComp-PGE / TRIETHYLENE GLYCOL / トリエチレングリコ-ル分子量: 150.173 Da / 分子数: 2 / 由来タイプ: 合成 / 式: C₆H₁₄O₄
#8: 水	ChemComp-HOH / water 分子量: 18.015 Da / 分子数: 206 / 由来タイプ: 天然 / 式: H₂O

-
詳細

研究の焦点であるリガンドがあるか	Y
Has protein modification	Y

-
実験

実験	手法: X線回折 / 使用した結晶の数: 1

-
試料調製

結晶	マシュー密度: 2.91 Å³/Da / 溶媒含有率: 57.76 %
結晶化	温度: 293.15 K / 手法: 蒸気拡散法, シッティングドロップ法 / 詳細: 0,1M TRIS pH 7.7, 0,1M Li2SO4, 40% PEG300

-
データ収集

回折

平均測定温度: 100 K / Serial crystal experiment: N

放射光源

由来:

シンクロトロン / サイト:

BESSY

/ ビームライン: 14.2 / 波長: 0.9184 Å

検出器

タイプ: DECTRIS PILATUS3 2M / 検出器: PIXEL / 日付: 2020年12月3日

放射

プロトコル: SINGLE WAVELENGTH / 単色(M)・ラウエ(L): M / 散乱光タイプ: x-ray

放射波長

波長: 0.9184 Å / 相対比: 1

反射

解像度: 2.77→48.11 Å / Num. obs: 100435 / % possible obs: 99.8 % / 冗長度: 3.8 % / B_iso Wilson estimate: 71.87 Å² / CC_1/2: 0.997 / R_merge(I) obs: 0.103 / R_pim(I) all: 0.06 / R_rim(I) all: 0.119 / Net I/σ(I): 10.5 / Num. measured all: 385861 / Scaling rejects: 72

反射シェル

Diffraction-ID: 1

解像度 (Å)	冗長度 (%)	R_merge(I) obs	Num. measured all	Num. unique obs	CC_1/2	R_pim(I) all	R_rim(I) all	Net I/σ(I) obs	% possible all
2.77-2.82	3.9	1.685	19657	4979	0.34	0.965	1.947	0.9	99.9
15.17-48.11	3.1	0.035	1812	580	0.997	0.025	0.043	26.9	90.9

-
解析

ソフトウェア

名称	バージョン	分類
PHENIX	1.20.1_4487	精密化
Aimless	0.7.4	データスケーリング
PDB_EXTRACT	3.27	データ抽出
XDS		データ削減
PHASER		位相決定

精密化

構造決定の手法:

分子置換
開始モデル: 6EIS

6eis

解像度: 2.77→26.14 Å / SU ML: 0.43 / 交差検証法: THROUGHOUT / σ(F): 1.33 / 位相誤差: 27.84 / 立体化学のターゲット値: ML

	R_factor	反射数	%反射
R_free	0.2516	5108	5.09 %
R_work	0.205	95182	-
obs	0.2073	100290	99.78 %

溶媒の処理

減衰半径: 0.9 Å / VDWプローブ半径: 1.1 Å / 溶媒モデル: FLAT BULK SOLVENT MODEL

原子変位パラメータ

B_iso max: 247.92 Å² / B_iso mean: 84.9253 Å² / B_iso min: 37.69 Å²

精密化ステップ

サイクル: final / 解像度: 2.77→26.14 Å

	タンパク質	核酸	リガンド	溶媒	全体
原子数	21206	0	514	206	21926
B_iso mean	-	-	82.1	67.82	-
残基数	-	-	-	-	2697

LS精密化シェル

Refine-ID: X-RAY DIFFRACTION / R_factor R_free error: 0 / Total num. of bins used: 30

解像度 (Å)	R_factor R_free	Num. reflection R_free	R_factor R_work	Num. reflection R_work	Num. reflection all	% reflection obs (%)
2.77-2.8	0.3919	170	0.3435	3126	3296	100
2.8-2.83	0.4147	170	0.3272	3180	3350	100
2.83-2.87	0.3643	163	0.3089	3171	3334	100
2.87-2.91	0.3449	161	0.3116	3137	3298	100
2.91-2.94	0.3343	172	0.2977	3182	3354	100
2.94-2.98	0.3411	166	0.2959	3190	3356	100
2.98-3.03	0.3364	162	0.2919	3144	3306	100
3.03-3.07	0.3561	191	0.2919	3143	3334	100
3.07-3.12	0.3166	170	0.2756	3198	3368	100
3.12-3.17	0.3099	155	0.2614	3143	3298	100
3.17-3.22	0.2919	162	0.2591	3151	3313	100
3.22-3.28	0.3388	187	0.2557	3204	3391	100
3.28-3.35	0.304	184	0.2414	3128	3312	100
3.35-3.41	0.3072	164	0.2363	3166	3330	100
3.41-3.49	0.278	190	0.2236	3162	3352	100
3.49-3.57	0.2738	146	0.2238	3187	3333	100
3.57-3.66	0.2794	178	0.2025	3168	3346	100
3.66-3.76	0.2213	164	0.1945	3182	3346	100
3.76-3.87	0.2328	186	0.1827	3135	3321	100
3.87-3.99	0.2511	173	0.1766	3195	3368	100
3.99-4.13	0.237	152	0.1792	3211	3363	100
4.13-4.3	0.2413	159	0.1698	3163	3322	100
4.3-4.49	0.1897	168	0.1563	3152	3320	100
4.49-4.73	0.1914	172	0.1567	3193	3365	100
4.73-5.02	0.2059	175	0.1679	3185	3360	100
5.02-5.41	0.2379	174	0.1874	3182	3356	100
5.41-5.95	0.2433	206	0.2094	3135	3341	100
5.95-6.79	0.2471	179	0.2148	3207	3386	100
6.79-8.51	0.2518	145	0.1859	3244	3389	100
8.51-26.14	0.1943	164	0.1835	3218	3382	98

精密化 TLS

手法: refined / Refine-ID: X-RAY DIFFRACTION

ID	L11 (°²)	L12 (°²)	L13 (°²)	L22 (°²)	L23 (°²)	L33 (°²)	S11 (Å °)	S12 (Å °)	S13 (Å °)	S21 (Å °)	S22 (Å °)	S23 (Å °)	S31 (Å °)	S32 (Å °)	S33 (Å °)	T11 (Å²)	T12 (Å²)	T13 (Å²)	T22 (Å²)	T23 (Å²)	T33 (Å²)	Origin x (Å)	Origin y (Å)	Origin z (Å)
1	2.4732	0.4035	1.591	2.9778	0.4767	5.8322	-0.3601	0.0051	0.4654	0.1828	0.2226	-0.3968	-0.6141	0.497	0.1333	0.4873	-0.0385	-0.0936	0.3975	0.0154	0.4753	64.2173	35.3329	64.9775
2	3.5522	-0.5211	1.2707	2.1729	0.264	5.3309	-0.1037	0.3285	0.2623	0.0615	0.0731	-0.2864	-0.2269	0.3124	0.0509	0.5079	-0.0861	0.0433	0.3493	-0.0122	0.4044	55.8483	28.9184	48.8886
3	3.7923	-0.1834	-0.2541	1.5603	-0.3573	3.6726	-0.121	-0.1619	-0.3868	0.2551	0.0396	0.3857	0.4298	-0.2107	0.1169	0.5813	-0.0919	0.1119	0.3266	-0.064	0.4429	40.4508	18.6517	50.4545
4	3.5611	0.4836	0.3614	4.3908	-1.08	3.5636	-0.1934	0.33	-0.4609	0.0598	0.0921	0.7659	0.759	-1.0555	0.167	0.7441	-0.2263	0.0821	0.729	-0.1648	0.6569	28.5532	17.817	44.593
5	4.2959	-0.1147	-0.4068	2.6782	-0.1496	4.9043	-0.1094	0.5628	-0.028	-0.307	-0.0487	-0.2043	0.3398	0.0003	0.1141	0.6029	-0.0852	0.0625	0.4242	-0.1047	0.3772	48.1601	22.5921	34.4906
6	2.6325	1.4185	0.5196	4.2627	0.0606	3.8131	0.1153	-0.1256	-0.0124	0.4937	-0.106	0.0525	-0.1703	-0.0273	0.0001	0.4056	0.0009	-0.0125	0.458	0.1162	0.3771	54.1467	48.1274	121.2825
7	4.2271	0.6496	0.7018	6.3106	-1.9662	4.2635	-0.1102	0.2311	0.0916	0.0757	0.2904	0.4342	-0.1216	-0.1128	-0.1858	0.3281	-0.0283	-0.0054	0.5599	0.0197	0.4699	44.9029	40.8138	105.8645
8	5.0545	-0.1302	0.8774	1.5161	0.1715	3.5915	0.1003	-0.3199	-0.09	0.1969	-0.2174	0.931	0.4435	-0.5753	0.1109	0.4334	-0.1121	0.0309	0.6551	-0.0454	0.7717	27.51	31.3959	109.5727
9	5.0043	-0.5529	2.3046	2.9782	0.3485	1.2721	-0.3466	0.7322	-0.1321	0.2629	-0.1834	0.7346	-0.5393	-1.3546	0.2389	0.6442	-0.0296	-0.133	1.1592	-0.1415	1.0506	20.2731	38.2855	98.383
10	5.035	-2.051	1.276	6.1102	-0.9309	3.4633	0.0263	0.8839	-0.2724	-0.8662	-0.0832	0.1807	0.4223	-0.1855	0.0159	0.5938	-0.0943	-0.0938	0.7577	-0.0809	0.5346	36.4462	32.4639	93.5498
11	1.4341	-1.2134	-0.5798	4.8685	-0.4668	2.5943	-0.0253	-0.3345	0.0858	0.2223	-0.2115	-0.8135	0.1918	0.2157	0.2621	0.5281	0.0567	-0.1224	0.653	0.1527	0.6617	84.0084	49.9885	112.3724
12	3.4708	0.0856	-0.1881	5.111	0.4384	3.9081	0.0406	-0.2642	0.0291	0.1067	-0.1265	-0.5628	-0.066	-0.0104	0.0789	0.4944	0.0223	-0.026	0.3848	0.1389	0.4801	75.9659	66.3688	104.8978
13	2.4773	0.8464	-0.199	3.7699	0.343	4.231	-0.0076	0.099	-0.2035	-0.4955	0.022	0.1274	0.1368	-0.4914	-0.0148	0.6294	0.0514	0.0424	0.4022	0.1526	0.4203	60.6145	66.0159	90.8745
14	1.863	-0.8931	1.4213	5.1999	-0.253	2.0736	-0.1001	0.0162	-0.0073	-0.2006	-0.0212	-0.3162	-0.2603	0.0578	0.0761	0.6881	0.0078	0.1442	0.4267	0.1103	0.4549	69.6947	79.5446	96.6093
15	2.5868	0.8372	-1.6232	3.2735	0.7778	4.8965	0.199	0.2416	0.0292	-0.3588	-0.296	0.1316	-0.7318	-0.7991	0.1031	0.5095	0.1315	-0.0672	0.7829	-0.1928	0.4714	38.2175	105.5446	98.6305
16	1.9429	0.6935	-0.0454	2.1053	0.2139	1.1127	-0.0155	0.387	-0.1937	0.1663	-0.3363	0.5137	0.1885	-1.2959	0.2493	0.6525	-0.1926	0.0924	1.7005	-0.5814	0.9144	18.3544	84.7667	98.1926
17	2.8393	-0.5625	0.0359	3.6979	-0.3586	3.8586	-0.1541	-0.1638	0.0252	0.0792	0.0511	0.1354	-0.0416	-0.0477	0.0915	0.5064	0.0994	-0.0371	0.5671	-0.0136	0.4847	67.6879	23.6573	86.0481
18	3.2101	0.6704	2.1392	6.0681	0.7661	4.4238	-0.1955	-0.2574	-0.0964	0.3067	0.0199	-0.012	0.4274	0.1745	0.1796	0.6095	0.1768	0.1143	0.5603	0.0508	0.4822	76.4332	5.9787	88.9577
19	0.8695	-0.0895	-0.3386	3.2435	0.8655	1.7049	-0.0341	0.0489	-0.1199	0.0453	0.0905	-0.4871	0.6271	0.6599	-0.0623	0.8416	0.3652	0.0654	0.739	0.0569	0.7467	91.1908	-2.6773	83.2241
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22	3.592	2.2805	-1.2739	6.0579	0.4969	4.2343	-0.7442	0.0188	-0.6641	-0.2109	0.6402	0.508	1.0533	-0.1971	0.3509	0.9239	0.1097	0.1791	0.5816	-0.0741	1.2087	0.8902	9.0648	51.4055
23	2.8206	1.1453	-1.6012	5.8392	0.0435	4.3967	-0.4965	0.258	-0.2101	-0.0266	0.4291	1.22	0.431	-0.6969	0.0093	0.577	-0.1042	-0.0437	0.5802	0.0779	1.2711	-3.1705	21.6792	48.736
24	3.2177	-1.4638	-0.5787	6.9803	1.6555	3.8593	-0.3809	-0.0217	0.0375	-0.4948	0.7517	0.7751	-0.0024	0.3077	-0.3344	0.5516	-0.1579	-0.0721	0.4918	0.0381	0.6343	11.4948	33.2854	43.4871
25	2.2636	0.0789	0.3039	5.2541	0.0098	2.3754	-0.1564	-0.0338	0.2342	-0.7966	0.7138	-0.4649	-0.3674	0.6928	-0.5257	0.7815	-0.2162	0.1014	0.7694	-0.3223	0.8897	23.8782	44.1884	43.9161
26	1.2784	-1.3096	-1.4123	5.1718	1.2758	1.745	0.0827	-0.1347	0.0862	0.5934	-0.1023	-0.8595	0.1498	0.1012	0.0426	0.559	0.1369	-0.1073	0.7176	0.2218	0.791	93.0998	26.7291	105.5739
27	4.4264	-2.184	-2.2161	2.2091	1.9822	4.0386	0.3821	0.702	0.4814	-0.4617	-0.0936	-0.8608	-0.3331	-0.3947	-0.2578	0.6388	0.183	0.0997	0.831	0.2908	1.0871	98.8956	31.441	92.8177
28	3.622	-0.2864	-1.0575	1.692	-0.1908	1.7738	0.4435	0.5157	0.8091	-0.328	0.2285	-0.5529	-0.5537	-0.064	-0.6439	0.8281	0.2284	0.3321	0.979	0.2068	1.3439	116.4521	33.7633	82.6022

精密化 TLSグループ

ID	Refine-ID	Refine TLS-ID	Selection details	Auth asym-ID	Auth seq-ID
1	X-RAY DIFFRACTION	1	chain 'A' and (resid 135 through 239 )	A	135 - 239
2	X-RAY DIFFRACTION	2	chain 'A' and (resid 240 through 320 )	A	240 - 320
3	X-RAY DIFFRACTION	3	chain 'A' and (resid 322 through 398 )	A	322 - 398
4	X-RAY DIFFRACTION	4	chain 'A' and (resid 399 through 427 )	A	399 - 427
5	X-RAY DIFFRACTION	5	chain 'A' and (resid 428 through 480 )	A	428 - 480
6	X-RAY DIFFRACTION	6	chain 'B' and (resid 135 through 239 )	B	135 - 239
7	X-RAY DIFFRACTION	7	chain 'B' and (resid 240 through 320 )	B	240 - 320
8	X-RAY DIFFRACTION	8	chain 'B' and (resid 322 through 405 )	B	322 - 405
9	X-RAY DIFFRACTION	9	chain 'B' and (resid 406 through 436 )	B	406 - 436
10	X-RAY DIFFRACTION	10	chain 'B' and (resid 437 through 480 )	B	437 - 480
11	X-RAY DIFFRACTION	11	chain 'C' and (resid 134 through 239 )	C	134 - 239
12	X-RAY DIFFRACTION	12	chain 'C' and (resid 240 through 320 )	C	240 - 320
13	X-RAY DIFFRACTION	13	chain 'C' and (resid 322 through 436 )	C	322 - 436
14	X-RAY DIFFRACTION	14	chain 'C' and (resid 437 through 480 )	C	437 - 480
15	X-RAY DIFFRACTION	15	chain 'D' and (resid 135 through 239 )	D	135 - 239
16	X-RAY DIFFRACTION	16	chain 'D' and (resid 240 through 480 )	D	240 - 480
17	X-RAY DIFFRACTION	17	chain 'E' and (resid 135 through 239 )	E	135 - 239
18	X-RAY DIFFRACTION	18	chain 'E' and (resid 240 through 320 )	E	240 - 320
19	X-RAY DIFFRACTION	19	chain 'E' and (resid 322 through 480 )	E	322 - 480
20	X-RAY DIFFRACTION	20	chain 'F' and (resid 135 through 238 )	F	135 - 238
21	X-RAY DIFFRACTION	21	chain 'F' and (resid 239 through 480 )	F	239 - 480
22	X-RAY DIFFRACTION	22	chain 'G' and (resid 137 through 170 )	G	137 - 170
23	X-RAY DIFFRACTION	23	chain 'G' and (resid 171 through 239 )	G	171 - 239
24	X-RAY DIFFRACTION	24	chain 'G' and (resid 240 through 356 )	G	240 - 356
25	X-RAY DIFFRACTION	25	chain 'G' and (resid 357 through 480 )	G	357 - 480
26	X-RAY DIFFRACTION	26	chain 'H' and (resid 135 through 193 )	H	135 - 193
27	X-RAY DIFFRACTION	27	chain 'H' and (resid 194 through 258 )	H	194 - 258
28	X-RAY DIFFRACTION	28	chain 'H' and (resid 259 through 480 )	H	259 - 480

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EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

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これまでは公式だったバージョン1.9は、アーカイブから削除されます。

関連情報:EMDBヘッダ

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新型コロナ情報

URL: https://pdbj.org/emnavi/covid19.php

新ページ: EM Navigatorに新型コロナウイルスの特設ページを開設しました。

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万見(Yorodumi)は、EMDB/PDB/SASBDBなどの構造データを閲覧するためのページです。
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