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基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 7yoy | ||||||
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タイトル | Cryo-EM structure of EBV gHgL-gp42 in complex with mAbs 3E8 and 5E3 (localized refinement) | ||||||
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![]() | VIRAL PROTEIN / EBV / Cryo-EM / Glycoprotein / gHgL-gp42 complex / Antibody | ||||||
機能・相同性 | C-type lectin-like/link domain superfamily / C-type lectin fold / carbohydrate binding / virion membrane / membrane / Glycoprotein 42![]() | ||||||
生物種 | ![]() ![]() ![]() | ||||||
手法 | 電子顕微鏡法 / 単粒子再構成法 / クライオ電子顕微鏡法 / 解像度: 3.64 Å | ||||||
![]() | Liu, L. / Sun, H. / Jiang, Y. / Hong, J. / Zheng, Q. / Li, S. / Chen, Y. / Xia, N. | ||||||
資金援助 | 1件
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![]() | ![]() タイトル: Non-overlapping epitopes on the gHgL-gp42 complex for the rational design of a triple-antibody cocktail against EBV infection. 著者: Junping Hong / Ling Zhong / Liqin Liu / Qian Wu / Wanlin Zhang / Kaiyun Chen / Dongmei Wei / Hui Sun / Xiang Zhou / Xinyu Zhang / Yin-Feng Kang / Yang Huang / Junyu Chen / Guosong Wang / Yan ...著者: Junping Hong / Ling Zhong / Liqin Liu / Qian Wu / Wanlin Zhang / Kaiyun Chen / Dongmei Wei / Hui Sun / Xiang Zhou / Xinyu Zhang / Yin-Feng Kang / Yang Huang / Junyu Chen / Guosong Wang / Yan Zhou / Yanhong Chen / Qi-Sheng Feng / Hai Yu / Shaowei Li / Mu-Sheng Zeng / Yi-Xin Zeng / Miao Xu / Qingbing Zheng / Yixin Chen / Xiao Zhang / Ningshao Xia / ![]() ![]() 要旨: Epstein-Barr virus (EBV) is closely associated with cancer, multiple sclerosis, and post-acute coronavirus disease 2019 (COVID-19) sequelae. There are currently no approved therapeutics or vaccines ...Epstein-Barr virus (EBV) is closely associated with cancer, multiple sclerosis, and post-acute coronavirus disease 2019 (COVID-19) sequelae. There are currently no approved therapeutics or vaccines against EBV. It is noteworthy that combining multiple EBV glycoproteins can elicit potent neutralizing antibodies (nAbs) against viral infection, suggesting possible synergistic effects. Here, we characterize three nAbs (anti-gp42 5E3, anti-gHgL 6H2, and anti-gHgL 10E4) targeting different glycoproteins of the gHgL-gp42 complex. Two antibody cocktails synergistically neutralize infection in B cells (5E3+6H2+10E4) and epithelial cells (6H2+10E4) in vitro. Moreover, 5E3 alone and the 5E3+6H2+10E4 cocktail confer potent in vivo protection against lethal EBV challenge in humanized mice. The cryo-EM structure of a heptatomic gHgL-gp42 immune complex reveals non-overlapping epitopes of 5E3, 6H2, and 10E4 on the gHgL-gp42 complex. Structural and functional analyses highlight different neutralization mechanisms for each of the three nAbs. In summary, our results provide insight for the rational design of therapeutics or vaccines against EBV infection. | ||||||
履歴 |
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構造の表示
構造ビューア | 分子: ![]() ![]() |
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ダウンロードとリンク
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ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | ![]() | 110.4 KB | 表示 | ![]() |
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PDB形式 | ![]() | 85.5 KB | 表示 | ![]() |
PDBx/mmJSON形式 | ![]() | ツリー表示 | ![]() | |
その他 | ![]() |
-検証レポート
文書・要旨 | ![]() | 1.3 MB | 表示 | ![]() |
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文書・詳細版 | ![]() | 1.3 MB | 表示 | |
XML形式データ | ![]() | 32.6 KB | 表示 | |
CIF形式データ | ![]() | 45.2 KB | 表示 | |
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
-関連構造データ
関連構造データ | ![]() 33990MC ![]() 7yp1C ![]() 7yp2C M: このデータのモデリングに利用したマップデータ C: 同じ文献を引用 ( |
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類似構造データ | 類似検索 - 機能・相同性 ![]() |
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リンク
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集合体
登録構造単位 | ![]()
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1 |
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要素
#1: タンパク質 | 分子量: 15593.692 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 組換発現 由来: (組換発現) ![]() 株: GD1 / 遺伝子: BZLF2 / 細胞株 (発現宿主): HEK293 / 発現宿主: ![]() |
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#2: タンパク質 | 分子量: 13153.532 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 組換発現 / 由来: (組換発現) ![]() ![]() ![]() |
#3: タンパク質 | 分子量: 12123.596 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 組換発現 / 由来: (組換発現) ![]() ![]() ![]() |
#4: 抗体 | 分子量: 11543.807 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 組換発現 / 由来: (組換発現) ![]() ![]() ![]() |
#5: 抗体 | 分子量: 11834.026 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 組換発現 / 由来: (組換発現) ![]() ![]() ![]() |
-実験情報
-実験
実験 | 手法: 電子顕微鏡法 |
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EM実験 | 試料の集合状態: PARTICLE / 3次元再構成法: 単粒子再構成法 |
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試料調製
構成要素 |
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由来(天然) |
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由来(組換発現) |
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緩衝液 | pH: 7.4 | ||||||||||||||||||||||||
試料 | 包埋: NO / シャドウイング: NO / 染色: NO / 凍結: YES | ||||||||||||||||||||||||
急速凍結 | 凍結剤: ETHANE |
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電子顕微鏡撮影
実験機器 | ![]() モデル: Tecnai F30 / 画像提供: FEI Company |
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顕微鏡 | モデル: FEI TECNAI F30 |
電子銃 | 電子線源: ![]() |
電子レンズ | モード: BRIGHT FIELD / 最大 デフォーカス(公称値): 3000 nm / 最小 デフォーカス(公称値): 1000 nm |
撮影 | 電子線照射量: 60 e/Å2 / フィルム・検出器のモデル: GATAN K3 (6k x 4k) |
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解析
CTF補正 | タイプ: PHASE FLIPPING AND AMPLITUDE CORRECTION |
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3次元再構成 | 解像度: 3.64 Å / 解像度の算出法: FSC 0.143 CUT-OFF / 粒子像の数: 167595 / 対称性のタイプ: POINT |