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データを開く
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基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 7xff | ||||||
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タイトル | Polysaccharide export protein Wza | ||||||
![]() | Polysaccharide export protein | ||||||
![]() | MEMBRANE PROTEIN / polysaccharide export protein | ||||||
機能・相同性 | ![]() polysaccharide transmembrane transporter activity / porin activity / pore complex / monoatomic ion transport / cell outer membrane 類似検索 - 分子機能 | ||||||
生物種 | ![]() ![]() | ||||||
手法 | ![]() ![]() ![]() | ||||||
![]() | Zheng, J. / Wang, B. | ||||||
資金援助 | ![]()
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![]() | ![]() タイトル: Polysaccharide export protein Wza 著者: Wang, B. / Zheng, J. | ||||||
履歴 |
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構造の表示
構造ビューア | 分子: ![]() ![]() |
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ダウンロードとリンク
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ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | ![]() | 377.9 KB | 表示 | ![]() |
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PDB形式 | ![]() | 249 KB | 表示 | ![]() |
PDBx/mmJSON形式 | ![]() | ツリー表示 | ![]() | |
その他 | ![]() |
-検証レポート
文書・要旨 | ![]() | 500.3 KB | 表示 | ![]() |
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文書・詳細版 | ![]() | 527.7 KB | 表示 | |
XML形式データ | ![]() | 63.8 KB | 表示 | |
CIF形式データ | ![]() | 89.9 KB | 表示 | |
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
-関連構造データ
関連構造データ | ![]() 2j58S S: 精密化の開始モデル |
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類似構造データ | 類似検索 - 機能・相同性 ![]() |
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リンク
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集合体
登録構造単位 | ![]()
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1 |
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単位格子 |
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Components on special symmetry positions |
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要素
#1: タンパク質 | 分子量: 20403.742 Da / 分子数: 8 / 由来タイプ: 組換発現 / 由来: (組換発現) ![]() ![]() 遺伝子: wza, A5U30_002223, A8499_004210, BON78_05920, BON79_06745, BR158_000680, CCV12_003719, CT143_03515, D3G36_16900, D4U49_08845, D9E49_15345, E2646_01750, E3O05_07155, ELT23_04100, ELT31_ ...遺伝子: wza, A5U30_002223, A8499_004210, BON78_05920, BON79_06745, BR158_000680, CCV12_003719, CT143_03515, D3G36_16900, D4U49_08845, D9E49_15345, E2646_01750, E3O05_07155, ELT23_04100, ELT31_04920, ELT38_06380, ELT50_04065, ELT52_20945, ELT56_02735, ELU95_02210, ELV05_05145, ELY31_02030, GF147_02635, HMW38_04280, IFB95_000024, NCTC10089_01822, NCTC9075_02568 発現宿主: ![]() ![]() 参照: UniProt: A0A0V9R7J8 #2: 水 | ChemComp-HOH / | |
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-実験情報
-実験
実験 | 手法: ![]() |
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試料調製
結晶 | マシュー密度: 2.93 Å3/Da / 溶媒含有率: 57.96 % |
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結晶化 | 温度: 291.1 K / 手法: 蒸気拡散法, ハンギングドロップ法 / pH: 7.3 詳細: 0.05 M Potassium phosphate monobasic, pH 7.3, 5% glycerol |
-データ収集
回折 | 平均測定温度: 100 K / Serial crystal experiment: N |
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放射光源 | 由来: ![]() ![]() ![]() |
検出器 | タイプ: AGILENT EOS CCD / 検出器: CCD / 日付: 2021年10月16日 |
放射 | モノクロメーター: synchrotron / プロトコル: SINGLE WAVELENGTH / 単色(M)・ラウエ(L): M / 散乱光タイプ: x-ray |
放射波長 | 波長: 0.988 Å / 相対比: 1 |
反射 | 解像度: 2.3→26.63 Å / Num. obs: 76600 / % possible obs: 83.77 % / 冗長度: 5 % / Biso Wilson estimate: 29.47 Å2 / CC1/2: 0.8 / Net I/σ(I): 0.8 |
反射 シェル | 解像度: 2.3→2.382 Å / Num. unique obs: 7 / CC1/2: 0.8 |
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解析
ソフトウェア |
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精密化 | 構造決定の手法: ![]() 開始モデル: 2J58 解像度: 2.3→26.63 Å / SU ML: 0.2829 / 交差検証法: FREE R-VALUE / σ(F): 0 / 位相誤差: 22.6677 立体化学のターゲット値: GeoStd + Monomer Library + CDL v1.2
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溶媒の処理 | 減衰半径: 0.9 Å / VDWプローブ半径: 1.11 Å / 溶媒モデル: FLAT BULK SOLVENT MODEL | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
原子変位パラメータ | Biso mean: 37.68 Å2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
精密化ステップ | サイクル: LAST / 解像度: 2.3→26.63 Å
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拘束条件 |
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LS精密化 シェル |
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