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基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 7wsp | ||||||
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タイトル | Structure of a membrane protein M | ||||||
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![]() | IMMUNE SYSTEM / membrane | ||||||
機能・相同性 | ![]() hexameric IgM immunoglobulin complex / IgM B cell receptor complex / pentameric IgM immunoglobulin complex / pre-B cell allelic exclusion / B cell receptor complex / IgM immunoglobulin complex / CD22 mediated BCR regulation / B cell activation / B cell proliferation / immunoglobulin complex, circulating ...hexameric IgM immunoglobulin complex / IgM B cell receptor complex / pentameric IgM immunoglobulin complex / pre-B cell allelic exclusion / B cell receptor complex / IgM immunoglobulin complex / CD22 mediated BCR regulation / B cell activation / B cell proliferation / immunoglobulin complex, circulating / multivesicular body / B cell differentiation / complement activation, classical pathway / Antigen activates B Cell Receptor (BCR) leading to generation of second messengers / antigen binding / Cell surface interactions at the vascular wall / B cell receptor signaling pathway / transmembrane signaling receptor activity / antibacterial humoral response / defense response to Gram-negative bacterium / adaptive immune response / Potential therapeutics for SARS / blood microparticle / immune response / membrane raft / external side of plasma membrane / innate immune response / cell surface / signal transduction / extracellular space / extracellular exosome / identical protein binding / plasma membrane 類似検索 - 分子機能 | ||||||
生物種 | ![]() | ||||||
手法 | 電子顕微鏡法 / 単粒子再構成法 / クライオ電子顕微鏡法 / 解像度: 4.09 Å | ||||||
![]() | Ma, X. / Zhu, Y. / Chen, Y. / Huang, Z. | ||||||
資金援助 | ![]()
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![]() | ![]() タイトル: Structure of a membrane protein M 著者: Ma, X. / Zhu, Y. / Chen, Y. / Huang, Z. | ||||||
履歴 |
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構造の表示
構造ビューア | 分子: ![]() ![]() |
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ダウンロードとリンク
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ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | ![]() | 180.1 KB | 表示 | ![]() |
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PDB形式 | ![]() | 146.8 KB | 表示 | ![]() |
PDBx/mmJSON形式 | ![]() | ツリー表示 | ![]() | |
その他 | ![]() |
-検証レポート
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
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-関連構造データ
関連構造データ | ![]() 32763MC M: このデータのモデリングに利用したマップデータ C: 同じ文献を引用 ( |
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類似構造データ | 類似検索 - 機能・相同性 ![]() |
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リンク
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集合体
登録構造単位 | ![]()
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1 |
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要素
#1: タンパク質 | 分子量: 15504.718 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 組換発現 / 由来: (組換発現) ![]() ![]() |
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#2: タンパク質 | 分子量: 16143.744 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 組換発現 / 由来: (組換発現) ![]() ![]() |
#3: タンパク質 | 分子量: 40470.355 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 組換発現 / 由来: (組換発現) ![]() ![]() |
#4: タンパク質 | 分子量: 40599.535 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 組換発現 / 由来: (組換発現) ![]() ![]() |
-実験情報
-実験
実験 | 手法: 電子顕微鏡法 |
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EM実験 | 試料の集合状態: PARTICLE / 3次元再構成法: 単粒子再構成法 |
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試料調製
構成要素 | 名称: complex / タイプ: COMPLEX / Entity ID: all / 由来: RECOMBINANT |
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由来(天然) | 生物種: ![]() |
由来(組換発現) | 生物種: ![]() |
緩衝液 | pH: 7 |
試料 | 包埋: NO / シャドウイング: NO / 染色: NO / 凍結: YES |
急速凍結 | 凍結剤: NITROGEN |
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電子顕微鏡撮影
実験機器 | ![]() モデル: Titan Krios / 画像提供: FEI Company |
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顕微鏡 | モデル: FEI TITAN KRIOS |
電子銃 | 電子線源: ![]() |
電子レンズ | モード: BRIGHT FIELD / 最大 デフォーカス(公称値): 2500 nm / 最小 デフォーカス(公称値): 1200 nm |
撮影 | 電子線照射量: 1.5 e/Å2 フィルム・検出器のモデル: GATAN K2 QUANTUM (4k x 4k) |
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解析
CTF補正 | タイプ: PHASE FLIPPING AND AMPLITUDE CORRECTION |
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3次元再構成 | 解像度: 4.09 Å / 解像度の算出法: FSC 0.143 CUT-OFF / 粒子像の数: 47428 / 対称性のタイプ: POINT |