プロトコル: SINGLE WAVELENGTH / 単色(M)・ラウエ(L): M / 散乱光タイプ: x-ray
放射波長
波長: 0.9786 Å / 相対比: 1
反射
解像度: 2.225→77.632 Å / Num. obs: 24678 / % possible obs: 93.8 % / 冗長度: 24 % / CC1/2: 0.998 / Net I/σ(I): 12.1
反射 シェル
解像度: 2.225→2.554 Å / Num. unique obs: 1235 / CC1/2: 0.632 / % possible all: 70.6
-
解析
ソフトウェア
名称
バージョン
分類
BUSTER
2.10.4
精密化
XDS
データ削減
XDS
データスケーリング
MOLREP
位相決定
精密化
構造決定の手法: 分子置換 開始モデル: homology model 解像度: 2.225→77.63 Å / Cor.coef. Fo:Fc: 0.924 / Cor.coef. Fo:Fc free: 0.865 / SU R Cruickshank DPI: 0.91 / 交差検証法: THROUGHOUT / SU R Blow DPI: 1.264 / SU Rfree Blow DPI: 0.345 / SU Rfree Cruickshank DPI: 0.344
Rfactor
反射数
%反射
Selection details
Rfree
0.2647
1292
-
RANDOM
Rwork
0.1941
-
-
-
obs
0.1977
24678
55 %
-
原子変位パラメータ
Biso mean: 49.61 Å2
Baniso -1
Baniso -2
Baniso -3
1-
5.2273 Å2
0 Å2
0 Å2
2-
-
-9.5586 Å2
0 Å2
3-
-
-
4.3312 Å2
Refine analyze
Luzzati coordinate error obs: 0.31 Å
精密化ステップ
サイクル: LAST / 解像度: 2.225→77.63 Å
タンパク質
核酸
リガンド
溶媒
全体
原子数
5331
0
110
253
5694
拘束条件
Refine-ID
タイプ
Dev ideal
数
Restraint function
Weight
X-RAY DIFFRACTION
t_bond_d
0.009
5554
HARMONIC
2
X-RAY DIFFRACTION
t_angle_deg
0.96
7540
HARMONIC
2
X-RAY DIFFRACTION
t_dihedral_angle_d
1934
SINUSOIDAL
2
X-RAY DIFFRACTION
t_gen_planes
951
HARMONIC
5
X-RAY DIFFRACTION
t_it
5554
HARMONIC
10
X-RAY DIFFRACTION
t_chiral_improper_torsion
718
SEMIHARMONIC
5
X-RAY DIFFRACTION
t_ideal_dist_contact
4407
SEMIHARMONIC
4
X-RAY DIFFRACTION
t_omega_torsion
3.08
X-RAY DIFFRACTION
t_other_torsion
18.7
LS精密化 シェル
解像度: 2.23→2.43 Å
Rfactor
反射数
%反射
Rfree
0.3757
23
-
Rwork
0.2712
-
-
obs
0.2762
494
4.9 %
精密化 TLS
Origin x: 29.5012 Å / Origin y: -9.2357 Å / Origin z: 21.9302 Å