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- PDB-7t2u: SARS-CoV2 3C-Like protease complexed with Nemo peptide -

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基本情報

登録情報
データベース: PDB / ID: 7t2u
タイトルSARS-CoV2 3C-Like protease complexed with Nemo peptide
要素
  • 3C-Like Protease
  • NEMO peptide
キーワードHYDROLASE / SARS CoV2 / 3C-Like protease / Nemo peptide.
機能・相同性
機能・相同性情報


IKBKB deficiency causes SCID / IKBKG deficiency causes anhidrotic ectodermal dysplasia with immunodeficiency (EDA-ID) (via TLR) / SLC15A4:TASL-dependent IRF5 activation / IkappaB kinase complex / establishment of vesicle localization / linear polyubiquitin binding / transferrin receptor binding / IkBA variant leads to EDA-ID / NF-kB activation through FADD/RIP-1 pathway mediated by caspase-8 and -10 / RIP-mediated NFkB activation via ZBP1 ...IKBKB deficiency causes SCID / IKBKG deficiency causes anhidrotic ectodermal dysplasia with immunodeficiency (EDA-ID) (via TLR) / SLC15A4:TASL-dependent IRF5 activation / IkappaB kinase complex / establishment of vesicle localization / linear polyubiquitin binding / transferrin receptor binding / IkBA variant leads to EDA-ID / NF-kB activation through FADD/RIP-1 pathway mediated by caspase-8 and -10 / RIP-mediated NFkB activation via ZBP1 / SUMOylation of immune response proteins / positive regulation of ubiquitin-dependent protein catabolic process / anoikis / K63-linked polyubiquitin modification-dependent protein binding / positive regulation of T cell receptor signaling pathway / TRAF6 mediated NF-kB activation / positive regulation of macroautophagy / polyubiquitin modification-dependent protein binding / canonical NF-kappaB signal transduction / signaling adaptor activity / ubiquitin ligase complex / IRAK1 recruits IKK complex / IRAK1 recruits IKK complex upon TLR7/8 or 9 stimulation / TICAM1, RIP1-mediated IKK complex recruitment / MAP3K8 (TPL2)-dependent MAPK1/3 activation / IKK complex recruitment mediated by RIP1 / JNK (c-Jun kinases) phosphorylation and activation mediated by activated human TAK1 / TNFR1-induced NF-kappa-B signaling pathway / Regulation of NF-kappa B signaling / activated TAK1 mediates p38 MAPK activation / Activation of NF-kappaB in B cells / Regulation of TNFR1 signaling / TAK1-dependent IKK and NF-kappa-B activation / NOD1/2 Signaling Pathway / response to virus / PKR-mediated signaling / mitotic spindle / CLEC7A (Dectin-1) signaling / spindle pole / FCERI mediated NF-kB activation / Interleukin-1 signaling / Ovarian tumor domain proteases / protein guanylyltransferase activity / RNA endonuclease activity, producing 3'-phosphomonoesters / Downstream TCR signaling / mRNA guanylyltransferase activity / 5'-3' RNA helicase activity / 付加脱離酵素（リアーゼ）; P-Oリアーゼ類; - / positive regulation of NF-kappaB transcription factor activity / symbiont-mediated suppression of host cytoplasmic pattern recognition receptor signaling pathway via inhibition of TBK1 activity / Assembly of the SARS-CoV-2 Replication-Transcription Complex (RTC) / Maturation of replicase proteins / ISG15-specific peptidase activity / T cell receptor signaling pathway / Transcription of SARS-CoV-2 sgRNAs / symbiont-mediated suppression of host NF-kappaB cascade / Translation of Replicase and Assembly of the Replication Transcription Complex / TRAF3-dependent IRF activation pathway / Replication of the SARS-CoV-2 genome / snRNP Assembly / double membrane vesicle viral factory outer membrane / ER-Phagosome pathway / 加水分解酵素; エステル加水分解酵素; 5'-リン酸モノエステル産生エキソリボヌクレアーゼ / 5'-3' DNA helicase activity / 3'-5'-RNA exonuclease activity / SARS coronavirus main proteinase / host cell endoplasmic reticulum-Golgi intermediate compartment / host cell endosome / symbiont-mediated suppression of host toll-like receptor signaling pathway / symbiont-mediated degradation of host mRNA / mRNA guanylyltransferase / symbiont-mediated suppression of host ISG15-protein conjugation / G-quadruplex RNA binding / omega peptidase activity / symbiont-mediated suppression of host cytoplasmic pattern recognition receptor signaling pathway via inhibition of IRF3 activity / SARS-CoV-2 modulates host translation machinery / mRNA (guanine-N7)-methyltransferase / protein-containing complex assembly / host cell Golgi apparatus / methyltransferase cap1 / symbiont-mediated perturbation of host ubiquitin-like protein modification / DNA helicase / positive regulation of canonical NF-kappaB signal transduction / mRNA (nucleoside-2'-O-)-methyltransferase activity / mRNA 5'-cap (guanine-N7-)-methyltransferase activity / ubiquitinyl hydrolase 1 / cysteine-type deubiquitinase activity / 加水分解酵素; プロテアーゼ; ペプチド結合加水分解酵素; システインプロテアーゼ / single-stranded RNA binding / host cell perinuclear region of cytoplasm / viral protein processing / host cell endoplasmic reticulum membrane / lyase activity / Ub-specific processing proteases / symbiont-mediated suppression of host type I interferon-mediated signaling pathway / RNA helicase / defense response to bacterium / viral translational frameshifting / inflammatory response / induction by virus of host autophagy
類似検索 - 分子機能
: / C2H2 type zinc-finger / NF-kappa-B essential modulator NEMO, N-terminal / NF-kappa-B essential modulator NEMO / NEMO, Zinc finger / Zinc finger CCHC NOA-type profile. / NF-kappa-B essential modulator NEMO, CC2-LZ domain / Leucine zipper of domain CC2 of NEMO, NF-kappa-B essential modulator / RNA-dependent RNA polymerase, SARS-CoV-like / Nonstructural protein 14, betacoronavirus ...: / C2H2 type zinc-finger / NF-kappa-B essential modulator NEMO, N-terminal / NF-kappa-B essential modulator NEMO / NEMO, Zinc finger / Zinc finger CCHC NOA-type profile. / NF-kappa-B essential modulator NEMO, CC2-LZ domain / Leucine zipper of domain CC2 of NEMO, NF-kappa-B essential modulator / RNA-dependent RNA polymerase, SARS-CoV-like / Nonstructural protein 14, betacoronavirus / NSP15, NendoU domain, coronavirus / : / : / Coronavirus Nonstructural protein 13, 1B domain / Coronavirus Non-structural protein 13, zinc-binding domain / Coronavirus Nonstructural protein 13, stalk domain / : / Coronavirus Nsp12 Interface domain profile. / Nonstructural protein 15, middle domain, alpha/betacoronavirus / Nonstructural protein 15, N-terminal domain, alpha/beta-coronavirus / NSP14, guanine-N7-methyltransferase domain, coronavirus / NSP12 RNA-dependent RNA polymerase, coronavirus / Coronavirus (CoV) guanine-N7-methyltransferase (N7-MTase) domain profile. / Coronavirus (CoV) Nsp15 N-terminal oligomerization domain profile. / Nidovirus 2-O-methyltransferase / Coronavirus Nsp12 RNA-dependent RNA polymerase (RdRp) domain profile. / Nidovirus 3'-5' exoribonuclease domain / Nidovirus 2'-O-methyltransferase (2'-O-MTase) domain profile. / Nidovirus 3'-5' exoribonuclease (ExoN) domain profile. / Nonstructural protein 13, 1B domain, coronavirus / Arterivirus Nsp11 N-terminal/Coronavirus NSP15 middle domain / Non-structural protein NSP15, N-terminal domain superfamily, coronavirus / Non-structural protein NSP15, middle domain superfamily / Coronavirus replicase NSP15, N-terminal oligomerization / Nonstructural protein 15, middle domain, coronavirus / Coronavirus replicase NSP15, middle domain / Coronavirus replicase NSP15, N-terminal oligomerisation / Arterivirus Nsp11 N-terminal/coronavirus NSP15 middle (AV-Nsp11N/CoV-Nsp15M) domain profile. / Non-structural protein NSP16, coronavirus-like / Non-structural protein 14, coronavirus / RNA polymerase, N-terminal, coronavirus / Coronavirus 2'-O-methyltransferase / Coronavirus proofreading exoribonuclease / Coronavirus RNA-dependent RNA polymerase, N-terminal / Nidoviral uridylate-specific endoribonuclease (NendoU) domain profile. / : / Nidovirus RdRp-associated nucleotidyl transferase (NiRAN) domain / Nonstructural protein 13, zinc-binding domain, coronavirus-like / Coronaviridae zinc-binding (CV ZBD) domain profile. / Nidovirus RdRp-associated nucleotidyl transferase (NiRAN) domain profile. / Endoribonuclease EndoU-like / NendoU domain, nidovirus / Coronavirus replicase NSP15, uridylate-specific endoribonuclease / DNA2/NAM7 helicase-like, C-terminal / AAA domain / Lipocalin signature. / (+) RNA virus helicase core domain / (+)RNA virus helicase core domain profile. / Non-structural protein NSP3, SUD-N (Mac2) domain, betacoronavirus / Sarbecovirus Nsp3c-N domain profile. / Non-structural protein NSP3, N-terminal, betacoronavirus / Polyprotein cleavage domain PL2pro superfamily, betacoronavirus / Non-structural protein NSP3, SUD-N (Mac2) domain superfamily, betacoronavirus / Betacoronavirus SUD-C domain / Betacoronavirus replicase NSP3, N-terminal / NSP1 globular domain superfamily, betacoronavirus / Non-structural protein 2, SARS-CoV-like / Carbamoyl-phosphate synthase subdomain signature 2. / : / Betacoronavirus Nsp3e group 2-specific marker (G2M) domain profile. / NSP1, C-terminal domain, betacoronavirus / Betacoronavirus Nsp3c-M domain profile. / NSP1, globular domain, betacoronavirus / Non-structural protein NSP3, SUD-M domain, betacoronavirus / Non-structural protein NSP3, SUD-M domain superfamily, betacoronavirus / Betacoronavirus replicase NSP1 / Betacoronavirus single-stranded poly(A) binding domain / Betacoronavirus (BetaCoV) Nsp1 C-terminal domain profile. / Betacoronavirus Nsp3c-C domain profile. / Betacoronavirus Nsp3e nucleic acid-binding (NAB) domain profile. / DPUP/SUD, C-terminal, betacoronavirus / Non-structural protein NSP3, nucleic acid-binding domain superfamily, betacoronavirus / Non-structural protein 6, betacoronavirus / Betacoronavirus nucleic acid-binding (NAB) / Non-structural protein NSP3, nucleic acid-binding domain, betacoronavirus / Non-structural protein NSP3A domain-like superfamily / Papain-like protease, N-terminal domain superfamily, coronavirus / Papain-like viral protease, palm and finger domains, coronavirus / : / : / Coronavirus (CoV) Nsp2 middle domain profile. / Coronavirus 3Ecto domain profile. / Coronavirus (CoV) Nsp2 N-terminal domain profile. / Coronavirus (CoV) Nsp2 C-terminal domain profile. / NSP1, globular domain, alpha/betacoronavirus / : / Coronavirus (CoV) Nsp3 Y domain profile. / Coronavirus (CoV) Nsp1 globular domain profile. / Coronavirus replicase NSP2, N-terminal / Nonstructural protein 2, N-terminal domain, coronavirus
類似検索 - ドメイン・相同性
Replicase polyprotein 1ab / NF-kappa-B essential modulator
類似検索 - 構成要素
生物種Severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 (ウイルス)
Homo sapiens (ヒト)
手法X線回折 / シンクロトロン / 分子置換 / 解像度: 2.1 Å
データ登録者Wakatsuki, S. / Mathews, I.I. / Hameedi, M.A.
資金援助 米国, 1件
組織認可番号国
Department of Energy (DOE, United States)DE-AC02-76SF00515 米国
引用ジャーナル: Nat Commun / 年: 2022
タイトル: Structural and functional characterization of NEMO cleavage by SARS-CoV-2 3CLpro.
著者: Hameedi, M.A. / T Prates, E. / Garvin, M.R. / Mathews, I.I. / Amos, B.K. / Demerdash, O. / Bechthold, M. / Iyer, M. / Rahighi, S. / Kneller, D.W. / Kovalevsky, A. / Irle, S. / Vuong, V.Q. / ...著者: Hameedi, M.A. / T Prates, E. / Garvin, M.R. / Mathews, I.I. / Amos, B.K. / Demerdash, O. / Bechthold, M. / Iyer, M. / Rahighi, S. / Kneller, D.W. / Kovalevsky, A. / Irle, S. / Vuong, V.Q. / Mitchell, J.C. / Labbe, A. / Galanie, S. / Wakatsuki, S. / Jacobson, D.
履歴
登録2021年12月6日登録サイト: RCSB / 処理サイト: RCSB
改定 1.02022年9月14日Provider: repository / タイプ: Initial release
改定 1.12022年9月21日Group: Database references / カテゴリ: citation / citation_author
Item: _citation.page_first / _citation.page_last ..._citation.page_first / _citation.page_last / _citation.pdbx_database_id_PubMed / _citation.title / _citation_author.identifier_ORCID / _citation_author.name
改定 1.22024年4月3日Group: Data collection / Refinement description
カテゴリ: chem_comp_atom / chem_comp_bond / pdbx_initial_refinement_model

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構造の表示

構造ビューア分子:
MolmilJmol/JSmol

ダウンロードとリンク

-
集合体

登録構造単位
A: 3C-Like Protease
B: 3C-Like Protease
E: NEMO peptide
C: 3C-Like Protease
F: NEMO peptide
D: 3C-Like Protease


分子量 (理論値)分子数
合計 (水以外)144,6026
ポリマ－144,6026
非ポリマー00
水3,549197
1
A: 3C-Like Protease
B: 3C-Like Protease
E: NEMO peptide


分子量 (理論値)分子数
合計 (水以外)72,3013
ポリマ－72,3013
非ポリマー00
水543
タイプ名称対称操作数
identity operation1_555x,y,z1
Buried area4460 Å2
ΔGint-24 kcal/mol
Surface area25800 Å2
手法PISA
2
C: 3C-Like Protease
F: NEMO peptide
D: 3C-Like Protease


分子量 (理論値)分子数
合計 (水以外)72,3013
ポリマ－72,3013
非ポリマー00
水362
タイプ名称対称操作数
identity operation1_555x,y,z1
Buried area4590 Å2
ΔGint-22 kcal/mol
Surface area25800 Å2
手法PISA
単位格子
Length a, b, c (Å)63.390, 67.710, 77.840
Angle α, β, γ (deg.)102.510, 89.910, 107.390
Int Tables number1
Space group name H-MP1

-
要素

#1: タンパク質
3C-Like Protease / 3CL-PRO / 3CLP / Main protease / Mpro


分子量: 35564.395 Da / 分子数: 4 / 変異: C145S / 由来タイプ: 組換発現
由来: (組換発現) Severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 (ウイルス)
遺伝子: rep, 1a-1b / 発現宿主: Escherichia coli (大腸菌) / 参照: UniProt: P0DTD1, SARS coronavirus main proteinase
#2: タンパク質・ペプチド NEMO peptide / NF-kappa-B essential modulator / NEMO / FIP-3 / IkB kinase-associated protein 1 / IKKAP1 / ...NF-kappa-B essential modulator / NEMO / FIP-3 / IkB kinase-associated protein 1 / IKKAP1 / Inhibitor of nuclear factor kappa-B kinase subunit gamma / I-kappa-B kinase subunit gamma / IKK-gamma / IKKG / IkB kinase subunit gamma / NF-kappa-B essential modifier


分子量: 1172.375 Da / 分子数: 2 / 由来タイプ: 組換発現 / 由来: (組換発現) Homo sapiens (ヒト) / 遺伝子: IKBKG, FIP3, NEMO / 発現宿主: Escherichia coli (大腸菌) / 参照: UniProt: Q9Y6K9
#3: 水 ChemComp-HOH / water


分子量: 18.015 Da / 分子数: 197 / 由来タイプ: 天然 / 式: H2O

-
実験情報

-
実験

実験手法: X線回折 / 使用した結晶の数: 1

-
試料調製

結晶マシュー密度: 2.15 Å3/Da / 溶媒含有率: 42.73 %
結晶化温度: 295 K / 手法: 蒸気拡散法, ハンギングドロップ法 / pH: 6.5 / 詳細: 20% PEG3350, 0.1M Bis-Tris (pH 6.5)

-
データ収集

回折平均測定温度: 100 K / Serial crystal experiment: N
放射光源由来: シンクロトロン / サイト: SSRL / ビームライン: BL12-2 / 波長: 0.97946 Å
検出器タイプ: DECTRIS PILATUS 6M / 検出器: PIXEL / 日付: 2021年5月31日 / 詳細: Flat Si Rh coated Mirror
放射モノクロメーター: Si(111) / プロトコル: SINGLE WAVELENGTH / 単色(M)・ラウエ(L): M / 散乱光タイプ: x-ray
放射波長波長: 0.97946 Å / 相対比: 1
反射解像度: 2.1→38.12 Å / Num. obs: 67720 / % possible obs: 96.4 % / 冗長度: 3.529 % / Biso Wilson estimate: 42.783 Å2 / CC1/2: 0.995 / Rmerge(I) obs: 0.097 / Rrim(I) all: 0.115 / Χ2: 0.856 / Net I/σ(I): 8.86 / Num. measured all: 239009 / Scaling rejects: 16
反射 シェル

Diffraction-ID: 1

解像度 (Å)冗長度 (%)Rmerge(I) obsMean I/σ(I) obsNum. measured obsNum. possibleNum. unique obsCC1/2Rrim(I) all% possible all
2.1-2.153.6280.9241.7818099520049890.6031.08695.9
2.15-2.213.5780.7312.2117360503748520.6860.8696.3
2.21-2.283.5220.6542.4716787495647660.6960.77396.2
2.28-2.353.330.5532.7615411481346280.7390.66396.2
2.35-2.423.2890.4653.214592461344360.7950.55896.2
2.42-2.513.6710.3814.2215946450343440.8770.44796.5
2.51-2.63.7220.3145.0915540431841750.910.36796.7
2.6-2.713.7040.2585.9215003418340500.9380.30296.8
2.71-2.833.6580.2017.1413995394338260.9580.23697
2.83-2.973.6220.1538.7413434383737090.9730.17996.7
2.97-3.133.5670.11910.1912530364335130.9820.14196.4
3.13-3.323.3520.09711.211076342033040.9850.11796.6
3.32-3.553.1350.07513.099757325331120.9880.09295.7
3.55-3.833.6220.05917.1110398297128710.9930.06996.6
3.83-4.23.6090.05220.179684276426830.9940.06197.1
4.2-4.73.5850.04622.748579249023930.9940.05496.1
4.7-5.423.4860.04422.837321220721000.9950.05295.2
5.42-6.643.190.04719.935736187817980.9940.05795.7
6.64-9.393.5290.03926.914958143414050.9960.04698
9.39-38.123.6590.0333.1728037887660.9980.03697.2

-
解析

ソフトウェア
名称バージョン分類
REFMAC5.8.0267精密化
XSCALEデータスケーリング
PDB_EXTRACT3.27データ抽出
XDSデータ削減
MOLREP位相決定
精密化構造決定の手法: 分子置換
開始モデル: Native protein

解像度: 2.1→38.12 Å / Cor.coef. Fo:Fc: 0.93 / Cor.coef. Fo:Fc free: 0.893 / WRfactor Rfree: 0.2999 / WRfactor Rwork: 0.2452 / FOM work R set: 0.734 / SU B: 8.688 / SU ML: 0.221 / SU R Cruickshank DPI: 0.3294 / SU Rfree: 0.2526 / 交差検証法: THROUGHOUT / σ(F): 0 / ESU R: 0.329 / ESU R Free: 0.253 / 立体化学のターゲット値: MAXIMUM LIKELIHOOD
詳細: HYDROGENS HAVE BEEN ADDED IN THE RIDING POSITIONS U VALUES : REFINED INDIVIDUALLY
Rfactor反射数%反射Selection details
Rfree0.2999 3386 5 %RANDOM
Rwork0.2451 ---
obs0.2479 64333 96.43 %-
溶媒の処理イオンプローブ半径: 0.8 Å / 減衰半径: 0.8 Å / VDWプローブ半径: 1.2 Å / 溶媒モデル: MASK
原子変位パラメータBiso max: 111.86 Å2 / Biso mean: 37.666 Å2 / Biso min: 9.2 Å2
Baniso -1Baniso -2Baniso -3
1-0.17 Å2-0.51 Å2-1.18 Å2
2---0.27 Å20.13 Å2
3---0.5 Å2
精密化ステップサイクル: final / 解像度: 2.1→38.12 Å
タンパク質核酸リガンド溶媒全体
原子数9530 0 0 204 9734
Biso mean---35.09 -
残基数----1232
拘束条件
Refine-IDタイプDev idealDev ideal target数
X-RAY DIFFRACTIONr_bond_refined_d0.0050.0139767
X-RAY DIFFRACTIONr_bond_other_d0.0010.0159087
X-RAY DIFFRACTIONr_angle_refined_deg1.4131.63913269
X-RAY DIFFRACTIONr_angle_other_deg1.1951.57620867
X-RAY DIFFRACTIONr_dihedral_angle_1_deg7.92451226
X-RAY DIFFRACTIONr_dihedral_angle_2_deg36.12723.224487
X-RAY DIFFRACTIONr_dihedral_angle_3_deg16.596151567
X-RAY DIFFRACTIONr_dihedral_angle_4_deg16.0041544
X-RAY DIFFRACTIONr_chiral_restr0.060.21272
X-RAY DIFFRACTIONr_gen_planes_refined0.0060.0211262
X-RAY DIFFRACTIONr_gen_planes_other0.0010.022326
LS精密化 シェル解像度: 2.1→2.154 Å / Rfactor Rfree error: 0 / Total num. of bins used: 20
Rfactor反射数%反射
Rfree0.396 248 -
Rwork0.354 4722 -
all-4970 -
obs--95.8 %

+
万見について

-
お知らせ

-
2022年2月9日: EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

  • EMDBのヘッダファイルのバージョン3が、公式のフォーマットとなりました。
  • これまでは公式だったバージョン1.9は、アーカイブから削除されます。

関連情報:EMDBヘッダ

外部リンク:wwPDBはEMDBデータモデルのバージョン3へ移行します

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2020年8月12日: 新型コロナ情報

新型コロナ情報

URL: https://pdbjlvh1.pdbj.org/emnavi/covid19.php

新ページ: EM Navigatorに新型コロナウイルスの特設ページを開設しました。

関連情報:Covid-19情報 / 2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

+
2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

新型コロナウイルスの構造データ

関連情報:万見生物種 / 2020年8月12日: 新型コロナ情報

外部リンク:COVID-19特集ページ - PDBj / 今月の分子2020年2月：コロナウイルスプロテーアーゼ

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2019年1月31日: EMDBのIDの桁数の変更

EMDBのIDの桁数の変更

  • EMDBエントリに付与されているアクセスコード(EMDB-ID)は4桁の数字(例、EMD-1234)でしたが、間もなく枯渇します。これまでの4桁のID番号は4桁のまま変更されませんが、4桁の数字を使い切った後に発行されるIDは5桁以上の数字(例、EMD-12345)になります。5桁のIDは2019年の春頃から発行される見通しです。
  • EM Navigator/万見では、接頭語「EMD-」は省略されています。

関連情報:Q: 「EMD」とは何ですか？ / 万見/EM NavigatorにおけるID/アクセスコードの表記

外部リンク:EMDB Accession Codes are Changing Soon! / PDBjへお問い合わせ

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2017年7月12日: PDB大規模アップデート

PDB大規模アップデート

  • 新バージョンのPDBx/mmCIF辞書形式に基づくデータがリリースされました。
  • 今回の更新はバージョン番号が4から5になる大規模なもので、全エントリデータの書き換えが行われる「Remediation」というアップデートに該当します。
  • このバージョンアップで、電子顕微鏡の実験手法に関する多くの項目の書式が改定されました(例：em_softwareなど)。
  • EM NavigatorとYorodumiでも、この改定に基づいた表示内容になります。

外部リンク:wwPDB Remediation / OneDepデータ基準に準拠した、より強化された内容のモデル構造ファイルが、PDBアーカイブで公開されました。

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万見 (Yorodumi)

幾万の構造データを、幾万の視点から

  • 万見(Yorodumi)は、EMDB/PDB/SASBDBなどの構造データを閲覧するためのページです。
  • EM Navigatorの詳細ページの後継、Omokage検索のフロントエンドも兼ねています。

関連情報:EMDB / PDB / SASBDB / 3つのデータバンクの比較 / 万見検索 / 2016年8月31日: 新しいEM Navigatorと万見 / 万見文献 / Jmol/JSmol / 機能・相同性情報 / 新しいEM Navigatorと万見の変更点

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