登録情報 | データベース: PDB / ID: 7sgj |
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タイトル | Crystal Structure of Danio rerio Histone Deacetylase 10 in Complex with DKFZ-711 |
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要素 | Polyamine deacetylase HDAC10 |
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キーワード | HYDROLASE / Histone Deacetylase |
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機能・相同性 | 機能・相同性情報
polyamine deacetylation / spermidine deacetylation / HDACs deacetylate histones / acetylspermidine deacetylase / acetylspermidine deacetylase activity / acetylputrescine deacetylase / acetylputrescine deacetylase activity / deacetylase activity / homologous recombination / swimming behavior ...polyamine deacetylation / spermidine deacetylation / HDACs deacetylate histones / acetylspermidine deacetylase / acetylspermidine deacetylase activity / acetylputrescine deacetylase / acetylputrescine deacetylase activity / deacetylase activity / homologous recombination / swimming behavior / regulation of tubulin deacetylation / epigenetic regulation of gene expression / macroautophagy / zinc ion binding / nucleus / cytoplasm類似検索 - 分子機能 : / Histone deacetylase family / Histone deacetylase domain / Histone deacetylase domain superfamily / Histone deacetylase domain / Ureohydrolase domain superfamily類似検索 - ドメイン・相同性 Chem-9BI / : / DI(HYDROXYETHYL)ETHER / PHOSPHATE ION / Polyamine deacetylase HDAC10類似検索 - 構成要素 |
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生物種 | ![](img/tx_fish.gif) Danio rerio (ゼブラフィッシュ) |
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手法 | X線回折 / シンクロトロン / 分子置換 / 解像度: 2.15 Å |
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データ登録者 | Herbst-Gervasoni, C.J. / Christianson, D.W. |
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資金援助 | 米国, 1件 組織 | 認可番号 | 国 |
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National Institutes of Health/National Human Genome Research Institute (NIH/NHGRI) | GM49758 | 米国 |
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引用 | ジャーナル: J.Am.Chem.Soc. / 年: 2022 タイトル: Aza-SAHA Derivatives Are Selective Histone Deacetylase 10 Chemical Probes That Inhibit Polyamine Deacetylation and Phenocopy HDAC10 Knockout. 著者: Steimbach, R.R. / Herbst-Gervasoni, C.J. / Lechner, S. / Stewart, T.M. / Klinke, G. / Ridinger, J. / Geraldy, M.N.E. / Tihanyi, G. / Foley, J.R. / Uhrig, U. / Kuster, B. / Poschet, G. / ...著者: Steimbach, R.R. / Herbst-Gervasoni, C.J. / Lechner, S. / Stewart, T.M. / Klinke, G. / Ridinger, J. / Geraldy, M.N.E. / Tihanyi, G. / Foley, J.R. / Uhrig, U. / Kuster, B. / Poschet, G. / Casero Jr., R.A. / Medard, G. / Oehme, I. / Christianson, D.W. / Gunkel, N. / Miller, A.K. |
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履歴 | 登録 | 2021年10月5日 | 登録サイト: RCSB / 処理サイト: RCSB |
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改定 1.0 | 2022年10月5日 | Provider: repository / タイプ: Initial release |
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改定 1.1 | 2022年10月19日 | Group: Database references / カテゴリ: citation / citation_author Item: _citation.country / _citation.journal_abbrev ..._citation.country / _citation.journal_abbrev / _citation.journal_id_ASTM / _citation.journal_id_CSD / _citation.journal_id_ISSN / _citation.pdbx_database_id_DOI / _citation.pdbx_database_id_PubMed / _citation.title / _citation.year |
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改定 1.2 | 2022年11月2日 | Group: Database references / カテゴリ: citation / citation_author Item: _citation.journal_volume / _citation.page_first ..._citation.journal_volume / _citation.page_first / _citation.page_last / _citation_author.identifier_ORCID |
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改定 1.3 | 2023年10月18日 | Group: Data collection / Refinement description カテゴリ: chem_comp_atom / chem_comp_bond / pdbx_initial_refinement_model |
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