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基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 7sfy | ||||||
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タイトル | Crystal structure of human Mis18ab_cc | ||||||
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![]() | CELL CYCLE / Mis18ab complex | ||||||
機能・相同性 | ![]() chromocenter / CENP-A containing chromatin assembly / cell communication / chromosome, centromeric region / Cajal body / Deposition of new CENPA-containing nucleosomes at the centromere / chromosome segregation / nuclear speck / cell division / intracellular membrane-bounded organelle ...chromocenter / CENP-A containing chromatin assembly / cell communication / chromosome, centromeric region / Cajal body / Deposition of new CENPA-containing nucleosomes at the centromere / chromosome segregation / nuclear speck / cell division / intracellular membrane-bounded organelle / chromatin / nucleoplasm / identical protein binding / nucleus / metal ion binding / cytosol 類似検索 - 分子機能 | ||||||
生物種 | ![]() | ||||||
手法 | ![]() ![]() ![]() | ||||||
![]() | Park, S.H. / Cho, U. | ||||||
資金援助 | ![]()
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![]() | ![]() タイトル: Structural Basis for Mis18 Complex Assembly: Implications for Centromere Maintenance 著者: Park, S.H. / Shimanaka, K. / Cho, U. | ||||||
履歴 |
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構造の表示
構造ビューア | 分子: ![]() ![]() |
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ダウンロードとリンク
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ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | ![]() | 113.2 KB | 表示 | ![]() |
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PDB形式 | ![]() | 74.9 KB | 表示 | ![]() |
PDBx/mmJSON形式 | ![]() | ツリー表示 | ![]() | |
その他 | ![]() |
-検証レポート
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
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-関連構造データ
関連構造データ | ![]() 7sfzC C: 同じ文献を引用 ( |
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類似構造データ | 類似検索 - 機能・相同性 ![]() |
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リンク
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集合体
登録構造単位 | ![]()
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1 | ![]()
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2 | ![]()
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単位格子 |
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要素
#1: タンパク質・ペプチド | 分子量: 5283.056 Da / 分子数: 4 / 由来タイプ: 組換発現 / 由来: (組換発現) ![]() ![]() ![]() #2: タンパク質・ペプチド | 分子量: 4807.607 Da / 分子数: 2 / 由来タイプ: 組換発現 / 由来: (組換発現) ![]() ![]() ![]() #3: 水 | ChemComp-HOH / | |
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-実験情報
-実験
実験 | 手法: ![]() |
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試料調製
結晶 | マシュー密度: 2.84 Å3/Da / 溶媒含有率: 56.71 % |
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結晶化 | 温度: 295.15 K / 手法: 蒸気拡散法, ハンギングドロップ法 / 詳細: Magnesium acetate, PEG 3350 |
-データ収集
回折 | 平均測定温度: 193.15 K / Serial crystal experiment: N |
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放射光源 | 由来: ![]() ![]() ![]() |
検出器 | タイプ: MARMOSAIC 300 mm CCD / 検出器: CCD / 日付: 2017年8月16日 |
放射 | プロトコル: SINGLE WAVELENGTH / 単色(M)・ラウエ(L): M / 散乱光タイプ: x-ray |
放射波長 | 波長: 0.97856 Å / 相対比: 1 |
反射 | 解像度: 2.5→50 Å / Num. obs: 12467 / % possible obs: 99 % / 冗長度: 5.2 % / Biso Wilson estimate: 49.32 Å2 / CC1/2: 0.995 / Rmerge(I) obs: 0.078 / Net I/σ(I): 9.2 |
反射 シェル | 解像度: 2.5→2.54 Å / Num. unique obs: 600 / CC1/2: 0.912 |
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解析
ソフトウェア |
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精密化 | 構造決定の手法: ![]() 立体化学のターゲット値: GeoStd + Monomer Library + CDL v1.2
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溶媒の処理 | 減衰半径: 0.9 Å / VDWプローブ半径: 1.11 Å / 溶媒モデル: FLAT BULK SOLVENT MODEL | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
原子変位パラメータ | Biso mean: 91.18 Å2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
精密化ステップ | サイクル: LAST / 解像度: 2.5→44.28 Å
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拘束条件 |
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LS精密化 シェル |
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精密化 TLS | 手法: refined / Refine-ID: X-RAY DIFFRACTION
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精密化 TLSグループ |
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