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基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 7rul | ||||||
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タイトル | I5R8 Mastoparano is a peptide synthetic, modified of Mastoparano (extracted from wasp venom) | ||||||
![]() | Mastoparan-L peptide | ||||||
![]() | ANTIVIRAL PROTEIN / antimicrobial | ||||||
機能・相同性 | ![]() other organism cell membrane / defense response to fungus / toxin activity / killing of cells of another organism / defense response to bacterium / innate immune response / extracellular region / membrane 類似検索 - 分子機能 | ||||||
生物種 | ![]() | ||||||
手法 | 溶液NMR / simulated annealing | ||||||
![]() | Alves, E.S.F. / Santos, B.P.O. | ||||||
資金援助 | 1件
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![]() | ![]() タイトル: Mastoparan I5R8, peptide antiviral derived of Mastoparan, venenon vesp. 著者: Alves, E.S.F. / Santos, B.P.O. | ||||||
履歴 |
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構造の表示
構造ビューア | 分子: ![]() ![]() |
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ダウンロードとリンク
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ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | ![]() | 49.6 KB | 表示 | ![]() |
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PDB形式 | ![]() | 34.4 KB | 表示 | ![]() |
PDBx/mmJSON形式 | ![]() | ツリー表示 | ![]() | |
その他 | ![]() |
-検証レポート
文書・要旨 | ![]() | 347.1 KB | 表示 | ![]() |
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文書・詳細版 | ![]() | 402 KB | 表示 | |
XML形式データ | ![]() | 4.8 KB | 表示 | |
CIF形式データ | ![]() | 6.4 KB | 表示 | |
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
-関連構造データ
類似構造データ | 類似検索 - 機能・相同性 ![]() |
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その他のデータベース |
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リンク
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集合体
登録構造単位 | ![]()
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1 |
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NMR アンサンブル |
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要素
#1: タンパク質・ペプチド | 分子量: 1609.119 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 組換発現 由来: (組換発現) ![]() 発現宿主: ![]() ![]() |
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研究の焦点であるリガンドがあるか | Y |
-実験情報
-実験
実験 | 手法: 溶液NMR | ||||||||||||||||||||||||
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NMR実験 |
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試料調製
詳細 | タイプ: solution 内容: 2 mM I5R8, 100 mM [U-98% 2H] SDS-D25, 5 % v/v [U-98% 2H] DSS, 90% H2O/10% D2O 詳細: A solution containing 2 mM of peptide was prepared in 100 mM of SDS-d25, 90:10 H2O/D2O and 5% of DSS, and the pH adjusted for 4.0. Label: I5R8 / 溶媒系: 90% H2O/10% D2O | ||||||||||||||||
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試料 |
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試料状態 | 詳細: A solution containing 2 mM of peptide was prepared in 100 mM of SDS-d25, 90:10 H2O/D2O and 5% of DSS, and the pH adjusted for 4.0. イオン強度: neutral Not defined / Label: I5R8 / pH: 7 / 圧: 1 atm / 温度: 298 K |
-NMR測定
NMRスペクトロメーター | タイプ: Bruker AVANCE / 製造業者: Bruker / モデル: AVANCE / 磁場強度: 500 MHz |
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解析
NMR software |
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精密化 | 手法: simulated annealing / ソフトェア番号: 4 | |||||||||||||||
代表構造 | 選択基準: lowest energy | |||||||||||||||
NMRアンサンブル | コンフォーマー選択の基準: structures with the lowest energy 計算したコンフォーマーの数: 200 / 登録したコンフォーマーの数: 10 |