+
データを開く
-
基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 7qby | ||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
タイトル | Refined structure of the T193A mutant in the C-terminal domain of DNAJB6b | ||||||||||||
![]() | Isoform B of DnaJ homolog subfamily B member 6 | ||||||||||||
![]() | CHAPERONE / Hsp40 chaperone / anti-aggregation | ||||||||||||
機能・相同性 | ![]() chorion development / chorio-allantoic fusion / syncytiotrophoblast cell differentiation involved in labyrinthine layer development / negative regulation of inclusion body assembly / intermediate filament organization / ATPase activator activity / protein localization to nucleus / Regulation of HSF1-mediated heat shock response / chaperone-mediated protein folding / regulation of cellular response to heat ...chorion development / chorio-allantoic fusion / syncytiotrophoblast cell differentiation involved in labyrinthine layer development / negative regulation of inclusion body assembly / intermediate filament organization / ATPase activator activity / protein localization to nucleus / Regulation of HSF1-mediated heat shock response / chaperone-mediated protein folding / regulation of cellular response to heat / protein folding chaperone / heat shock protein binding / Hsp70 protein binding / extracellular matrix organization / negative regulation of cysteine-type endopeptidase activity involved in apoptotic process / Z disc / regulation of protein localization / unfolded protein binding / protein folding / protein-folding chaperone binding / actin cytoskeleton organization / negative regulation of DNA-templated transcription / perinuclear region of cytoplasm / DNA binding / nucleoplasm / identical protein binding / membrane / nucleus / cytosol / cytoplasm 類似検索 - 分子機能 | ||||||||||||
生物種 | ![]() | ||||||||||||
手法 | 溶液NMR / simulated annealing | ||||||||||||
![]() | Karamanos, T.K. / Cawood, E.E. | ||||||||||||
資金援助 | ![]()
| ||||||||||||
![]() | ![]() タイトル: Microsecond Backbone Motions Modulate the Oligomerization of the DNAJB6 Chaperone. 著者: Cawood, E.E. / Clore, G.M. / Karamanos, T.K. | ||||||||||||
履歴 |
|
-
構造の表示
構造ビューア | 分子: ![]() ![]() |
---|
-
ダウンロードとリンク
-
ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | ![]() | 178.9 KB | 表示 | ![]() |
---|---|---|---|---|
PDB形式 | ![]() | 148.3 KB | 表示 | ![]() |
PDBx/mmJSON形式 | ![]() | ツリー表示 | ![]() | |
その他 | ![]() |
-検証レポート
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
---|
-関連構造データ
関連構造データ | |
---|---|
類似構造データ | 類似検索 - 機能・相同性 ![]() |
その他のデータベース |
|
-
リンク
-
集合体
登録構造単位 | ![]()
| |||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
1 |
| |||||||||
NMR アンサンブル |
|
-
要素
#1: タンパク質 | 分子量: 6444.378 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 組換発現 詳細: The C terminal domain of DNAJB6b including the T193A mutation 由来: (組換発現) ![]() ![]() ![]() |
---|
-実験情報
-実験
実験 | 手法: 溶液NMR | ||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NMR実験 |
|
-
試料調製
詳細 | タイプ: solution 内容: 0.2 mM [U-13C; U-15N] DNAJ HOMOLOG SUBFAMILY B MEMBER 6 C-TERMINAL DOMAIN, 20 mM sodium phosphate, 150 mM sodium chloride, 0.02 % v/v sodium azide, 95% H2O/5% D2O Label: 13C15N_sample / 溶媒系: 95% H2O/5% D2O | ||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
試料 |
| ||||||||||||||||||||
試料状態 | イオン強度: 87 mM / Label: condition_1 / pH: 6.7 / 圧: 1 atm / 温度: 288 K |
-NMR測定
NMRスペクトロメーター | タイプ: Bruker AVANCE III / 製造業者: Bruker / モデル: AVANCE III / 磁場強度: 600 MHz |
---|
-
解析
NMR software |
| ||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
精密化 | 手法: simulated annealing / ソフトェア番号: 1 | ||||||||||||
代表構造 | 選択基準: 1 | ||||||||||||
NMRアンサンブル | コンフォーマー選択の基準: structures with the lowest energy 計算したコンフォーマーの数: 100 / 登録したコンフォーマーの数: 10 |