登録情報 | データベース: PDB / ID: 7pzb |
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タイトル | Structure of the Clr-cAMP-DNA complex |
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要素 | - DNA (5'-D(*CP*TP*AP*GP*GP*TP*AP*AP*CP*AP*TP*TP*AP*CP*TP*CP*GP*CP*G)-3')
- DNA (5'-D(*GP*CP*GP*AP*GP*TP*AP*AP*TP*GP*TP*TP*AP*C)-3')
- Putative cAMP-binding protein-catabolite gene activator
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キーワード | SIGNALING PROTEIN / cyclic nucleotide / second messenger / transcription factor / CRP family |
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機能・相同性 | 機能・相同性情報
regulation of DNA-templated transcription / DNA binding類似検索 - 分子機能 Crp-type HTH domain profile. / Crp-like helix-turn-helix domain / Crp-type HTH domain / Cyclic nucleotide-binding domain signature 2. / Cyclic nucleotide-binding, conserved site / Cyclic nucleotide-monophosphate binding domain / Cyclic nucleotide-binding domain / cAMP/cGMP binding motif profile. / Cyclic nucleotide-binding domain / Cyclic nucleotide-binding domain superfamily ...Crp-type HTH domain profile. / Crp-like helix-turn-helix domain / Crp-type HTH domain / Cyclic nucleotide-binding domain signature 2. / Cyclic nucleotide-binding, conserved site / Cyclic nucleotide-monophosphate binding domain / Cyclic nucleotide-binding domain / cAMP/cGMP binding motif profile. / Cyclic nucleotide-binding domain / Cyclic nucleotide-binding domain superfamily / RmlC-like jelly roll fold / Winged helix DNA-binding domain superfamily / Winged helix-like DNA-binding domain superfamily類似検索 - ドメイン・相同性 CYCLIC GUANOSINE MONOPHOSPHATE / DNA / DNA (> 10) / Putative cAMP-binding protein-catabolite gene activator類似検索 - 構成要素 |
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生物種 | Sinorhizobium meliloti 1021 (根粒菌)
Sinorhizobium meliloti (根粒菌) |
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手法 | X線回折 / シンクロトロン / 分子置換 / 解像度: 3.12 Å |
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データ登録者 | Werel, L. / Essen, L.-O. |
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資金援助 | ドイツ, 1件 組織 | 認可番号 | 国 |
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German Research Foundation (DFG) | SPP1879 | ドイツ |
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引用 | ジャーナル: Mbio / 年: 2023 タイトル: Structural Basis of Dual Specificity of Sinorhizobium meliloti Clr, a cAMP and cGMP Receptor Protein. 著者: Werel, L. / Farmani, N. / Krol, E. / Serrania, J. / Essen, L.O. / Becker, A. |
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履歴 | 登録 | 2021年10月11日 | 登録サイト: PDBE / 処理サイト: PDBE |
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改定 1.0 | 2022年11月2日 | Provider: repository / タイプ: Initial release |
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改定 1.1 | 2023年5月24日 | Group: Database references / Refinement description カテゴリ: citation / citation_author / struct_ncs_dom_lim Item: _citation.country / _citation.journal_abbrev ..._citation.country / _citation.journal_abbrev / _citation.journal_id_CSD / _citation.journal_id_ISSN / _citation.journal_volume / _citation.page_first / _citation.page_last / _citation.pdbx_database_id_DOI / _citation.pdbx_database_id_PubMed / _citation.title / _citation.year / _struct_ncs_dom_lim.beg_label_asym_id / _struct_ncs_dom_lim.beg_label_seq_id / _struct_ncs_dom_lim.end_label_asym_id / _struct_ncs_dom_lim.end_label_seq_id |
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改定 1.2 | 2024年2月7日 | Group: Data collection / Refinement description カテゴリ: chem_comp_atom / chem_comp_bond ...chem_comp_atom / chem_comp_bond / pdbx_initial_refinement_model / struct_ncs_dom_lim Item: _struct_ncs_dom_lim.beg_auth_asym_id / _struct_ncs_dom_lim.beg_auth_comp_id ..._struct_ncs_dom_lim.beg_auth_asym_id / _struct_ncs_dom_lim.beg_auth_comp_id / _struct_ncs_dom_lim.beg_auth_seq_id / _struct_ncs_dom_lim.end_auth_asym_id / _struct_ncs_dom_lim.end_auth_comp_id / _struct_ncs_dom_lim.end_auth_seq_id |
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