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基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 7dus | ||||||
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タイトル | Crystal structure of Mei2-RRM3 domain in S.pombe | ||||||
![]() | Meiosis protein mei2![]() | ||||||
![]() | ![]() ![]() | ||||||
機能・相同性 | ![]() Tor2-Mei2-Ste11 complex / : / negative regulation of conjugation with zygote / positive regulation of metaphase/anaphase transition of meiosis II / Mei2 nuclear dot complex / ![]() ![]() ![]() ![]() ![]() ![]() ![]() ![]() 類似検索 - 分子機能 | ||||||
生物種 | ![]() ![]() ![]() | ||||||
手法 | ![]() ![]() ![]() | ||||||
![]() | Wu, B.X. / Xu, J.H. / Ma, J.B. | ||||||
![]() | ![]() タイトル: Crystal structure of Mei2-RRM3 domain in S.pombe 著者: Wu, B.X. / Xu, J.H. / Ma, J.B. | ||||||
履歴 |
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構造の表示
構造ビューア | 分子: ![]() ![]() |
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ダウンロードとリンク
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ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | ![]() | 38 KB | 表示 | ![]() |
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PDB形式 | ![]() | 27.7 KB | 表示 | ![]() |
PDBx/mmJSON形式 | ![]() | ツリー表示 | ![]() | |
その他 | ![]() |
-検証レポート
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
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-関連構造データ
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リンク
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集合体
登録構造単位 | ![]()
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1 | ![]()
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単位格子 |
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要素
#1: タンパク質 | ![]() 分子量: 17845.762 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 組換発現 由来: (組換発現) ![]() ![]() ![]() 株: 972 / ATCC 24843 / 遺伝子: mei2, SPAC27D7.03c / 発現宿主: ![]() ![]() ![]() |
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#2: 化合物 | ChemComp-CIT / ![]() |
#3: 水 | ChemComp-HOH / ![]() |
研究の焦点であるリガンドがあるか | N |
-実験情報
-実験
実験 | 手法: ![]() |
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試料調製
結晶 | マシュー密度: 3.99 Å3/Da / 溶媒含有率: 69.2 % |
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結晶化![]() | 温度: 293 K / 手法: 蒸気拡散法, ハンギングドロップ法 / pH: 8.6 / 詳細: 15% PEG 3350, 0.2MTri-Sodium Citrate Tris pH 8.6 |
-データ収集
回折 | 平均測定温度: 100 K / Serial crystal experiment: N |
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放射光源 | 由来: ![]() ![]() ![]() |
検出器 | タイプ: DECTRIS PILATUS 6M / 検出器: PIXEL / 日付: 2015年11月3日 |
放射 | プロトコル: SINGLE WAVELENGTH / 単色(M)・ラウエ(L): M / 散乱光タイプ: x-ray |
放射波長 | 波長![]() |
反射 | 解像度: 2.5→30 Å / Num. obs: 10649 / % possible obs: 99.9 % / 冗長度: 16.5 % / CC1/2: 0.933 / CC star: 0.98 / Rmerge(I) obs: 0.125 / Rpim(I) all: 0.028 / Rrim(I) all: 0.117 / Net I/σ(I): 21.879 |
反射 シェル | 解像度: 2.5→2.59 Å / 冗長度: 14.3 % / Mean I/σ(I) obs: 2.16 / Num. unique obs: 1034 / CC1/2: 0.771 / CC star: 0.933 / Rpim(I) all: 0.271 / % possible all: 100 |
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解析
ソフトウェア |
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精密化 | 構造決定の手法![]() ![]() 立体化学のターゲット値: GeoStd + Monomer Library + CDL v1.2
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原子変位パラメータ | Biso mean: 41.28 Å2 | ||||||||||||||||||||||||
精密化ステップ | サイクル: LAST / 解像度: 2.5→30 Å
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拘束条件 |
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