[English] 日本語
Yorodumi- PDB-7cl6: The crystal structure of KanJ in complex with neamine and N-oxaly... -
+Open data
-Basic information
Entry | Database: PDB / ID: 7cl6 | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
Title | The crystal structure of KanJ in complex with neamine and N-oxalylglycine | ||||||
Components | Kanamycin B dioxygenase | ||||||
Keywords | OXIDOREDUCTASE / Dioxygenase / kanamycin biosynthesis | ||||||
Function / homology | kanamycin B dioxygenase / kanamycin biosynthetic process / Phytanoyl-CoA dioxygenase / Phytanoyl-CoA dioxygenase (PhyH) / 2-oxoglutarate-dependent dioxygenase activity / NICKEL (II) ION / N-OXALYLGLYCINE / Chem-XXX / Kanamycin B dioxygenase Function and homology information | ||||||
Biological species | Streptomyces kanamyceticus (bacteria) | ||||||
Method | X-RAY DIFFRACTION / SYNCHROTRON / MOLECULAR REPLACEMENT / Resolution: 2.44 Å | ||||||
Authors | Kitayama, Y. / Miyanaga, A. / Kudo, F. / Eguchi, T. | ||||||
Citation | Journal: Chembiochem / Year: 2021 Title: Stepwise Post-glycosylation Modification of Sugar Moieties in Kanamycin Biosynthesis. Authors: Kudo, F. / Kitayama, Y. / Miyanaga, A. / Numakura, M. / Eguchi, T. | ||||||
History |
|
-Structure visualization
Structure viewer | Molecule: MolmilJmol/JSmol |
---|
-Downloads & links
-Download
PDBx/mmCIF format | 7cl6.cif.gz | 672.1 KB | Display | PDBx/mmCIF format |
---|---|---|---|---|
PDB format | pdb7cl6.ent.gz | 555.4 KB | Display | PDB format |
PDBx/mmJSON format | 7cl6.json.gz | Tree view | PDBx/mmJSON format | |
Others | Other downloads |
-Validation report
Arichive directory | https://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/cl/7cl6 ftp://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/cl/7cl6 | HTTPS FTP |
---|
-Related structure data
Related structure data | 7cl2SC 7cl3C 7cl4C 7cl5C S: Starting model for refinement C: citing same article (ref.) |
---|---|
Similar structure data |
-Links
-Assembly
Deposited unit |
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
1 |
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
2 |
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
3 |
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Unit cell |
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Noncrystallographic symmetry (NCS) | NCS domain:
NCS domain segments: Component-ID: 0 / Refine code: 0
|