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基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 7cct | |||||||||
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タイトル | Quinolone synthase from Aegle marmelos Correa complexed with N-Methylanthraniloyl-CoA | |||||||||
![]() | Type III polyketide synthase | |||||||||
![]() | PLANT PROTEIN / Quinolone synthase / type III PKS | |||||||||
機能・相同性 | ![]() polyketide biosynthetic process / acyltransferase activity, transferring groups other than amino-acyl groups 類似検索 - 分子機能 | |||||||||
生物種 | ![]() | |||||||||
手法 | ![]() ![]() | |||||||||
![]() | Mallika, V. / Abhinav, K.V. / Frandsen, K.E.H. / Soniya, E.V. | |||||||||
資金援助 | ![]() ![]()
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![]() | ![]() タイトル: Structural and mechanistic insights into Quinolone Synthase to address its functional promiscuity 著者: Mallika, V. / Abhinav, K.V. / Frandsen, K.E.H. / Soniya, E.V. | |||||||||
履歴 |
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構造の表示
構造ビューア | 分子: ![]() ![]() |
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ダウンロードとリンク
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ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | ![]() | 90.7 KB | 表示 | ![]() |
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PDB形式 | ![]() | 65.2 KB | 表示 | ![]() |
PDBx/mmJSON形式 | ![]() | ツリー表示 | ![]() | |
その他 | ![]() |
-検証レポート
文書・要旨 | ![]() | 677 KB | 表示 | ![]() |
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文書・詳細版 | ![]() | 686.7 KB | 表示 | |
XML形式データ | ![]() | 17.2 KB | 表示 | |
CIF形式データ | ![]() | 22.7 KB | 表示 | |
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
-関連構造データ
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リンク
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集合体
登録構造単位 | ![]()
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1 | ![]()
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単位格子 |
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要素
#1: タンパク質 | 分子量: 42885.449 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 組換発現 / 由来: (組換発現) ![]() ![]() ![]() |
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#2: 化合物 | ChemComp-FWC / |
#3: 化合物 | ChemComp-CD / |
#4: 水 | ChemComp-HOH / |
研究の焦点であるリガンドがあるか | Y |
-実験情報
-実験
実験 | 手法: ![]() |
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試料調製
結晶 | マシュー密度: 2.62 Å3/Da / 溶媒含有率: 53.02 % |
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結晶化 | 温度: 298 K / 手法: マイクロバッチ法 / pH: 7.5 詳細: 0.1 HEPES (pH-7.5), 1.4 M sodium citrate tribasic dihydrate, 0.1M cadmium chloride hydrate After crystal obtained soaked 2mM N-Methylanthraniloyl-CoA dissolved in the same buffer for 30 minutes |
-データ収集
回折 | 平均測定温度: 100 K / Serial crystal experiment: N |
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放射光源 | 由来: ![]() |
検出器 | タイプ: MAR scanner 345 mm plate / 検出器: IMAGE PLATE / 日付: 2016年1月3日 |
放射 | プロトコル: SINGLE WAVELENGTH / 単色(M)・ラウエ(L): M / 散乱光タイプ: x-ray |
放射波長 | 波長: 1.5418 Å / 相対比: 1 |
反射 | 解像度: 2.35→48.76 Å / Num. obs: 18090 / % possible obs: 96.23 % / 冗長度: 1.5 % / Biso Wilson estimate: 58.93 Å2 / Rrim(I) all: 0.336 / Net I/σ(I): 1.5 |
反射 シェル | 解像度: 2.35→2.43 Å / Num. unique obs: 849 / Rrim(I) all: 0.0933 |
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解析
ソフトウェア |
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精密化 | 構造決定の手法: ![]() 開始モデル: 3wd7 解像度: 2.35→48.76 Å / SU ML: 0.39 / 交差検証法: FREE R-VALUE / σ(F): 1.35 / 位相誤差: 39.95 / 立体化学のターゲット値: ML
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溶媒の処理 | 減衰半径: 0.9 Å / VDWプローブ半径: 1.1 Å / 溶媒モデル: FLAT BULK SOLVENT MODEL | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
精密化ステップ | サイクル: LAST / 解像度: 2.35→48.76 Å
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拘束条件 |
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LS精密化 シェル |
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