PDB-6xnq: Crystal Structure of Argininosuccinate synthase from Legionella p...

IDまたはキーワード:

登録情報

データベース: PDB / ID: 6xnq

タイトル

Crystal Structure of Argininosuccinate synthase from Legionella pneumophila Philadelphia 1

要素

Argininosuccinate synthase

キーワード

LIGASE / SSGCID / Argininosuccinate synthase / argG / Structural Genomics / Seattle Structural Genomics Center for Infectious Disease

機能・相同性

機能・相同性情報

argininosuccinate synthase / argininosuccinate metabolic process / argininosuccinate synthase activity / urea cycle / L-arginine biosynthetic process / ATP binding / cytoplasm
類似検索 - 分子機能

生物種

Legionella pneumophila subsp. pneumophila (バクテリア)

手法

X線回折 /

シンクロトロン /

分子置換 / 解像度: 1.95 Å

データ登録者

Seattle Structural Genomics Center for Infectious Disease (SSGCID)

引用

ジャーナル: to be published
タイトル: Crystal Structure of Argininosuccinate synthase from Legionella pneumophila Philadelphia 1
著者: Abendroth, J. / Dranow, D.M. / Lorimer, D.D. / Horanyi, P.S. / Edwards, T.E.

履歴

登録	2020年7月3日	登録サイト: RCSB / 処理サイト: RCSB
改定 1.0	2020年7月22日	Provider: repository / タイプ: Initial release
改定 1.1	2023年10月18日	Group: Data collection / Database references / Refinement description カテゴリ: chem_comp_atom / chem_comp_bond ...chem_comp_atom / chem_comp_bond / database_2 / pdbx_initial_refinement_model Item: _database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession

構造ビューア	分子: MolmilJmol/JSmol

-
ダウンロード

PDBx/mmCIF形式	6xnq.cif.gz	639.8 KB	表示	PDBx/mmCIF形式
PDB形式	pdb6xnq.ent.gz	525.1 KB	表示	PDB形式
PDBx/mmJSON形式	6xnq.json.gz		ツリー表示	PDBx/mmJSON形式
その他	その他のダウンロード

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検証レポート

アーカイブディレクトリ	https://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/xn/6xnq ftp://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/xn/6xnq	HTTPS FTP

-
関連構造データ

関連構造データ	1j20S S: 精密化の開始モデル
類似構造データ	7k5z-d 1j21-d 1kh1-d 1kp2-1 4u7j-1 1vl2-d 7bfp-d 1kh2-d Omokage検索で類似形状データを探す (詳細) 類似検索 - 機能・相同性F&H 検索類似検索 - 機能F&H 検索類似検索 - 相同性F&H 検索

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リンク

PDBのページ	PDBj / wwPDB / NCBI

登録構造単位

A: Argininosuccinate synthase

B: Argininosuccinate synthase

C: Argininosuccinate synthase

D: Argininosuccinate synthase

ヘテロ分子

186 kDa, 4 ポリマー
Omokage検索でこの集合体の類似形状データを探す (詳細)

1

登録構造と同一
登録者が定義した集合体
根拠: gel filtration

単位格子

Length a, b, c (Å)	122.990, 102.660, 147.660
Angle α, β, γ (deg.)	90.000, 95.930, 90.000
Int Tables number	5
Space group name H-M	C121
Symmetry operation	#1: x,y,z #2: -x,y,-z #3: x+1/2,y+1/2,z #4: -x+1/2,y+1/2,-z

非結晶学的対称性 (NCS)

NCSドメイン:

ID	Ens-ID	詳細
1	1	(chain A and (resid 4 through 6 or resid 8...
2	1	(chain B and (resid 4 through 6 or resid 8...
3	1	(chain C and (resid 4 through 6 or resid 8...
4	1	(chain D and (resid 4 through 6 or resid 8...

NCSドメイン領域:

Dom-ID	Component-ID	Ens-ID	Selection details	Auth asym-ID	Auth seq-ID
1	1	1	(chain A and (resid 4 through 6 or resid 8...	A	4 - 6
1	2	1	(chain A and (resid 4 through 6 or resid 8...	A	8 - 12
1	3	1	(chain A and (resid 4 through 6 or resid 8...	A	14 - 26
1	4	1	(chain A and (resid 4 through 6 or resid 8...	A	28 - 55
1	5	1	(chain A and (resid 4 through 6 or resid 8...	A	4 - 505
1	6	1	(chain A and (resid 4 through 6 or resid 8...	A	4 - 505
1	7	1	(chain A and (resid 4 through 6 or resid 8...	A	4 - 505
1	8	1	(chain A and (resid 4 through 6 or resid 8...	A	4 - 505
1	9	1	(chain A and (resid 4 through 6 or resid 8...	A	4 - 505
2	1	1	(chain B and (resid 4 through 6 or resid 8...	B	4 - 6
2	2	1	(chain B and (resid 4 through 6 or resid 8...	B	8 - 12
2	3	1	(chain B and (resid 4 through 6 or resid 8...	B	0
2	4	1	(chain B and (resid 4 through 6 or resid 8...	B	6
2	5	1	(chain B and (resid 4 through 6 or resid 8...	B	70 - 7352
2	6	1	(chain B and (resid 4 through 6 or resid 8...	B	4 - 507
2	7	1	(chain B and (resid 4 through 6 or resid 8...	B	4 - 507
2	8	1	(chain B and (resid 4 through 6 or resid 8...	B	4 - 507
2	9	1	(chain B and (resid 4 through 6 or resid 8...	B	4 - 507
2	10	1	(chain B and (resid 4 through 6 or resid 8...	B	4 - 507
2	11	1	(chain B and (resid 4 through 6 or resid 8...	B	4 - 507
3	1	1	(chain C and (resid 4 through 6 or resid 8...	C	4 - 6
3	2	1	(chain C and (resid 4 through 6 or resid 8...	C	8 - 12
3	3	1	(chain C and (resid 4 through 6 or resid 8...	C	14 - 26
3	4	1	(chain C and (resid 4 through 6 or resid 8...	C	28 - 64
3	5	1	(chain C and (resid 4 through 6 or resid 8...	C	66 - 68
3	6	1	(chain C and (resid 4 through 6 or resid 8...	C	70 - 73
3	7	1	(chain C and (resid 4 through 6 or resid 8...	C	75 - 111
3	8	1	(chain C and (resid 4 through 6 or resid 8...	C	112
3	9	1	(chain C and (resid 4 through 6 or resid 8...	C	4 - 506
3	10	1	(chain C and (resid 4 through 6 or resid 8...	C	4 - 506
3	11	1	(chain C and (resid 4 through 6 or resid 8...	C	4 - 506
3	12	1	(chain C and (resid 4 through 6 or resid 8...	C	4 - 506
4	1	1	(chain D and (resid 4 through 6 or resid 8...	D	4 - 6
4	2	1	(chain D and (resid 4 through 6 or resid 8...	D	8 - 12
4	3	1	(chain D and (resid 4 through 6 or resid 8...	D	14 - 26
4	4	1	(chain D and (resid 4 through 6 or resid 8...	D	28 - 55
4	5	1	(chain D and (resid 4 through 6 or resid 8...	D	56
4	6	1	(chain D and (resid 4 through 6 or resid 8...	D	4 - 505
4	7	1	(chain D and (resid 4 through 6 or resid 8...	D	4 - 505
4	8	1	(chain D and (resid 4 through 6 or resid 8...	D	4 - 505
4	9	1	(chain D and (resid 4 through 6 or resid 8...	D	4 - 505

NCS oper:

ID	Code	Matrix	ベクター
1	given	(-0.977865462018, 0.00198881398353, -0.209225196406), (0.00440025939366, -0.999538202391, -0.030066919984), (-0.209188374221, -0.0303220477375, 0.977405134789)	57.6719459079, 0.793186082281, 6.11334425233
2	given	(-0.999956118486, -0.00157479208072, -0.0092347783973), (-0.00186376882644, 0.999506178796, 0.0313675774324), (0.00918082065538, 0.0313834124677, -0.999465254)	50.9217523581, -1.20731656235, 72.7349553465
3	given	(0.979015550788, -0.00150491672676, 0.203779995441), (-0.00110180625375, -0.999997205604, -0.00209160405626), (0.203782573689, 0.0018231868238, -0.979014473157)	-6.95373975342, -0.155099772468, 67.0543355624

#1: タンパク質	Argininosuccinate synthase / Citrulline--aspartate ligase / LepnA.00809.a 分子量: 46069.465 Da / 分子数: 4 / 由来タイプ: 組換発現由来: (組換発現) Legionella pneumophila subsp. pneumophila (strain Philadelphia 1 / ATCC 33152 / DSM 7513) (バクテリア) 株: Philadelphia 1 / ATCC 33152 / DSM 7513 / 遺伝子: argG, lpg0494 / 発現宿主: Escherichia coli BL21(DE3) (大腸菌) / 参照: UniProt: Q5ZY78, argininosuccinate synthase
#2: 化合物	ChemComp-EDO / 1,2-ETHANEDIOL / ETHYLENE GLYCOL / エチレングリコ-ル分子量: 62.068 Da / 分子数: 15 / 由来タイプ: 合成 / 式: C₂H₆O₂
#3: 化合物	ChemComp-SO4 / SULFATE ION / 硫酸ジアニオン分子量: 96.063 Da / 分子数: 7 / 由来タイプ: 合成 / 式: SO₄
#4: 水	ChemComp-HOH / water 分子量: 18.015 Da / 分子数: 1331 / 由来タイプ: 天然 / 式: H₂O
研究の焦点であるリガンドがあるか	N

-
実験

実験	手法: X線回折 / 使用した結晶の数: 1

-
試料調製

結晶	マシュー密度: 2.52 Å³/Da / 溶媒含有率: 51.2 %
結晶化	温度: 287 K / 手法: 蒸気拡散法, シッティングドロップ法 / pH: 5.5 詳細: Rigaku Reagents JCSG+ screen, G8: 25% (w/V) PEG 3350, 200mM NaCl, 100mM BisTris / HCl pH 5.5: LepnA.00809.a.B1.PS38414 at 17.3mg/ml: tray 299030 g8: cryo 15%EG, puck rjp0-8

-
データ収集

回折

平均測定温度: 100 K / Serial crystal experiment: N

放射光源

由来:

シンクロトロン / サイト:

APS

/ ビームライン: 21-ID-F / 波長: 0.97872 Å

検出器

タイプ: RAYONIX MX-300 / 検出器: CCD / 日付: 2018年8月8日 / 詳細: Beryllium Lenses

放射

モノクロメーター: Diamond [111] / プロトコル: SINGLE WAVELENGTH / 単色(M)・ラウエ(L): M / 散乱光タイプ: x-ray

放射波長

波長: 0.97872 Å / 相対比: 1

反射

解像度: 1.95→42.86 Å / Num. obs: 132663 / % possible obs: 99.9 % / 冗長度: 4.223 % / B_iso Wilson estimate: 31.112 Å² / CC_1/2: 0.996 / R_merge(I) obs: 0.084 / R_rim(I) all: 0.096 / Χ²: 0.971 / Net I/σ(I): 10.52 / Num. measured all: 560249 / Scaling rejects: 23

反射シェル

Diffraction-ID: 1

解像度 (Å)	冗長度 (%)	R_merge(I) obs	Mean I/σ(I) obs	Num. measured obs	Num. possible	Num. unique obs	CC_1/2	R_rim(I) all	% possible all
1.95-2	4.238	0.506	2.7	41605	9828	9816	0.849	0.58	99.9
2-2.06	4.233	0.404	3.35	40371	9546	9538	0.894	0.463	99.9
2.06-2.12	4.231	0.321	4.16	39109	9243	9243	0.934	0.367	100
2.12-2.18	4.228	0.261	5.03	37981	8995	8984	0.954	0.299	99.9
2.18-2.25	4.219	0.217	5.91	36802	8726	8722	0.968	0.248	100
2.25-2.33	4.223	0.184	6.91	35640	8452	8440	0.976	0.21	99.9
2.33-2.42	4.228	0.16	7.81	34608	8192	8185	0.982	0.183	99.9
2.42-2.52	4.217	0.135	9.07	33023	7840	7830	0.986	0.155	99.9
2.52-2.63	4.22	0.117	10.18	31791	7546	7533	0.989	0.134	99.8
2.63-2.76	4.224	0.103	11.45	30511	7225	7223	0.991	0.118	100
2.76-2.91	4.21	0.09	12.74	28765	6839	6832	0.992	0.103	99.9
2.91-3.08	4.218	0.077	14.35	27488	6526	6517	0.994	0.089	99.9
3.08-3.3	4.209	0.069	15.96	25438	6049	6044	0.995	0.079	99.9
3.3-3.56	4.218	0.059	18.3	24022	5704	5695	0.996	0.068	99.8
3.56-3.9	4.238	0.056	20.01	22238	5248	5247	0.995	0.064	100
3.9-4.36	4.248	0.052	21.44	20227	4769	4761	0.996	0.059	99.8
4.36-5.03	4.251	0.05	22.07	17871	4207	4204	0.996	0.058	99.9
5.03-6.17	4.231	0.052	20.75	15050	3559	3557	0.996	0.059	99.9
6.17-8.72	4.196	0.05	21.3	11599	2767	2764	0.996	0.057	99.9
8.72-42.86	3.999	0.05	23.2	6110	1551	1528	0.996	0.058	98.5

-
解析

ソフトウェア

名称	バージョン	分類
PHENIX	1.18.2	精密化
XDS		データ削減
XSCALE		データスケーリング
PDB_EXTRACT	3.25	データ抽出
MoRDa		位相決定
Coot		モデル構築
PHENIX		モデル構築

精密化

構造決定の手法:

分子置換
開始モデル: pdb entry 1j20 as per Morda

1j20

解像度: 1.95→42.86 Å / SU ML: 0.23 / 交差検証法: THROUGHOUT / σ(F): 1.35 / 位相誤差: 21.39 / 立体化学のターゲット値: ML

	R_factor	反射数	%反射	Selection details
R_free	0.1937	1986	1.5 %	0
R_work	0.1633	130596	-	-
obs	0.1638	132582	99.84 %	-

溶媒の処理

減衰半径: 0.9 Å / VDWプローブ半径: 1.11 Å / 溶媒モデル: FLAT BULK SOLVENT MODEL

原子変位パラメータ

B_iso max: 104.04 Å² / B_iso mean: 28.3543 Å² / B_iso min: 12.11 Å²

精密化ステップ

サイクル: final / 解像度: 1.95→42.86 Å

	タンパク質	核酸	リガンド	溶媒	全体
原子数	11926	0	95	1356	13377
B_iso mean	-	-	40.01	34.55	-
残基数	-	-	-	-	1556

拘束条件

Refine-ID	タイプ	Dev ideal	数
X-RAY DIFFRACTION	f_bond_d	0.007	12530
X-RAY DIFFRACTION	f_angle_d	0.817	17094
X-RAY DIFFRACTION	f_chiral_restr	0.054	1959
X-RAY DIFFRACTION	f_plane_restr	0.005	2183
X-RAY DIFFRACTION	f_dihedral_angle_d	15.495	4565

Refine LS restraints NCS

Ens-ID	Dom-ID	Auth asym-ID	数	Refine-ID	Rms	タイプ
1	1	A	3283	X-RAY DIFFRACTION	4.418	TORSIONAL
1	2	B	3283	X-RAY DIFFRACTION	4.418	TORSIONAL
1	3	C	3283	X-RAY DIFFRACTION	4.418	TORSIONAL
1	4	D	3283	X-RAY DIFFRACTION	4.418	TORSIONAL

LS精密化シェル

Refine-ID: X-RAY DIFFRACTION / R_factor R_free error: 0 / Total num. of bins used: 14

解像度 (Å)	R_factor R_free	Num. reflection R_free	R_factor R_work	Num. reflection R_work	Num. reflection all	% reflection obs (%)
1.95-2	0.3014	151	0.2252	9307	9458	100
2-2.05	0.278	133	0.2058	9311	9444	100
2.05-2.11	0.2494	136	0.1939	9291	9427	100
2.11-2.18	0.2236	122	0.189	9271	9393	100
2.18-2.26	0.2076	123	0.1847	9300	9423	100
2.26-2.35	0.1929	120	0.1749	9351	9471	100
2.35-2.46	0.2163	160	0.1771	9284	9444	100
2.46-2.59	0.2176	155	0.1697	9349	9504	100
2.59-2.75	0.2015	158	0.1688	9265	9423	100
2.75-2.96	0.2188	135	0.1676	9345	9480	100
2.96-3.26	0.1924	143	0.1674	9320	9463	100
3.26-3.73	0.174	151	0.1456	9339	9490	100
3.73-4.7	0.1505	143	0.1291	9416	9559	100
4.7-42.86	0.1701	156	0.1569	9447	9603	99

精密化 TLS

手法: refined / Refine-ID: X-RAY DIFFRACTION

ID	L11 (°²)	L12 (°²)	L13 (°²)	L22 (°²)	L23 (°²)	L33 (°²)	S11 (Å °)	S12 (Å °)	S13 (Å °)	S21 (Å °)	S22 (Å °)	S23 (Å °)	S31 (Å °)	S32 (Å °)	S33 (Å °)	T11 (Å²)	T12 (Å²)	T13 (Å²)	T22 (Å²)	T23 (Å²)	T33 (Å²)	Origin x (Å)	Origin y (Å)	Origin z (Å)
1	4.8216	0.8827	-1.2039	4.3421	-0.2125	4.8049	-0.0578	-0.3601	0.4086	0.0082	0.0374	0.0982	-0.6098	0.2368	0.0105	0.267	0.05	-0.0377	0.2014	-0.0691	0.2583	3.7879	34.7543	52.8558
2	0.9926	-0.8907	-0.093	3.1098	-0.188	1.2949	-0.0653	-0.0802	0.0812	0.0015	0.0487	0.022	-0.1673	-0.0069	0.025	0.159	0.0344	-0.0175	0.1778	-0.0174	0.1662	8.2437	21.3197	46.4005
3	0.4443	-0.7389	0.5487	1.2703	-0.8156	0.6116	-0.2503	-0.0606	0.1702	0.1621	0.1802	-0.2322	-0.4458	0.1411	0.0765	0.4053	0.0213	-0.0273	0.2775	-0.0658	0.2451	16.2542	30.5749	60.7274
4	1.1475	0.1165	-0.0195	0.8026	0.1609	1.102	-0.0219	-0.1557	0.0841	0.2009	0.0452	0.0944	-0.0614	-0.0681	-0.0167	0.2163	0.0725	0.0211	0.1983	0.0061	0.1764	14.138	7.2682	63.3431
5	0.2965	0.1596	0.0615	0.7481	0.0788	0.7217	-0.0199	-0.012	-0.0206	-0.0032	0.0352	0.0446	-0.0097	-0.0433	-0.0351	0.1495	0.0347	0.002	0.1996	0.0089	0.1827	13.919	1.3108	44.8585
6	1.09	0.3599	0.6479	1.2804	0.5153	2.0589	0.0992	-0.1191	-0.1642	0.1516	0.0466	0.0245	0.341	-0.257	-0.035	0.2183	0.0162	0.007	0.1896	0.0216	0.2205	10.0029	-10.7785	56.8838
7	8.025	2.1717	-5.0498	5.1746	-1.2398	7.1393	0.052	-0.6312	-0.3433	0.1605	-0.1116	-0.2928	0.2818	0.4493	0.0677	0.2663	0.0835	-0.053	0.1854	-0.0118	0.164	36.9136	-23.2703	34.9714
8	4.5217	1.1112	0.7963	4.6702	-1.1848	2.6372	-0.0397	0.0629	-0.5044	-0.3706	0.0263	0.0345	0.5286	-0.057	-0.0046	0.3534	0.0478	-0.0034	0.2035	0.021	0.25	42.1058	-37.7322	52.206
9	1.7515	-1.8506	0.4599	4.3129	-0.6139	0.7841	-0.0683	-0.1542	-0.1234	0.1195	0.1052	-0.0666	0.0831	0.0072	-0.0391	0.1651	0.0327	-0.0091	0.1891	-0.0047	0.1553	41.4845	-21.5338	54.0322
10	0.627	1.9509	-1.6559	6.3057	-5.2587	6.6053	-0.0684	-0.0518	-0.0086	-0.2763	0.2415	0.2957	0.6064	-0.3884	-0.1787	0.2629	-0.0026	-0.036	0.2504	0.0114	0.2292	33.9984	-34.2435	48.9629
11	1.0407	-0.0993	0.1376	0.828	-0.2373	0.7893	0.0208	-0.1187	-0.1954	0.1835	0.0411	-0.0382	0.1628	0.0333	-0.0552	0.241	0.06	-0.0222	0.1855	0.0125	0.1642	30.2357	-12.6647	64.4664
12	0.1252	-0.029	0.082	0.3662	-0.1692	0.4881	-0.0149	-0.0054	0.006	0.0685	0.0508	-0.0262	-0.0171	-0.0087	-0.0356	0.1577	0.0312	-0.01	0.2015	-0.0077	0.1889	34.6969	-1.8682	46.9504
13	1.5867	1.0879	-1.2339	1.8592	-0.9458	2.7999	0.0836	-0.2213	0.1721	0.1686	0.0162	0.0494	-0.3213	0.3005	-0.0699	0.1969	0.024	-0.0315	0.189	-0.0291	0.1897	36.2079	9.9593	59.8781
14	7.952	3.127	5.4063	5.168	2.3963	3.7514	0.2481	-0.5735	0.4769	0.0663	-0.4106	0.341	-0.1609	-0.5203	0.2621	0.2742	0.0474	0.0614	0.2454	0.0211	0.2348	14.1371	23.0583	33.4294
15	3.1162	-0.3993	-0.3156	4.1606	-0.5265	1.8483	-0	-0.0306	0.504	0.2153	0.0804	-0.0478	-0.6067	-0.0562	-0.0398	0.3841	-0.044	0.0301	0.2199	0.0003	0.2802	45.1103	37.1901	24.5332
16	1.6648	0.0989	-0.5201	5.7308	-0.8264	1.3455	-0.1214	0.4414	0.1838	-0.2831	0.0137	-0.4342	-0.2332	0.1489	0.0244	0.3093	-0.1037	0.0301	0.3314	0.0319	0.2702	50.8771	29.4392	16.1075
17	2.3981	0.2705	-0.1841	3.5194	-0.4609	1.3022	-0.0464	0.0659	-0.2109	-0.1187	0.119	-0.1118	-0.0415	0.1028	-0.0295	0.169	-0.0432	0.0242	0.1686	-0.0245	0.1295	40.123	8.8079	22.5193
18	1.8239	-0.6079	-0.6206	4.8093	-0.8638	3.7876	-0.0228	-0.0299	0.1999	0.1129	0.0817	0.0672	-0.3255	0.0678	0.0361	0.2142	-0.0161	0.038	0.1738	0.012	0.1787	44.3207	25.9234	28.4671
19	1.0869	-0.7586	-0.4306	4.4965	-2.1501	3.655	0.0289	0.2368	0.1048	0.0843	0.1465	0.257	-0.6161	-0.4152	-0.1964	0.3416	-0.0072	0.022	0.2581	0.0025	0.2262	36.5277	33.8671	26.1578
20	0.5518	0.4052	0.2217	0.3499	0.2594	0.3075	0.0606	0.3326	0.4923	-0.1528	0.0213	0.1147	-0.3797	0.1299	-0.0405	0.384	-0.0618	0.0598	0.2388	0.0619	0.3379	34.0978	24.5168	11.1939
21	1.3452	0.0971	-0.8055	0.8964	0.2414	1.6381	0.023	0.3894	0.1712	-0.2835	0.0509	0.0466	-0.084	-0.1618	-0.0902	0.3291	-0.0555	0.0006	0.3135	0.0805	0.203	29.1734	11.5979	1.7305
22	1.9249	-0.1781	-0.1283	1.0936	-0.3066	0.9892	0.0335	0.0265	0.1786	-0.224	0.045	-0.2155	-0.0842	0.13	-0.0749	0.2094	-0.0568	0.031	0.1876	-0.0158	0.1596	39.2272	6.6534	12.9948
23	0.1856	0.0519	-0.1315	1.0447	0.2091	1.1725	-0.0186	0.0053	0.0108	-0.0272	0.0523	-0.0434	-0.0076	0.018	-0.0326	0.1325	-0.016	-0.001	0.185	-0.0079	0.1727	36.5696	1.5549	28.1157
24	1.1367	-0.3688	0.5234	1.6235	-0.3974	2.4251	0.0209	0.1365	-0.026	-0.2757	-0.0194	-0.1757	0.3872	0.2909	-0.0189	0.1937	-0.0037	0.0378	0.2063	-0.0286	0.1878	40.6302	-10.2945	15.7546
25	3.1197	-2.2322	-4.3105	4.9116	2.0705	6.373	0.1032	0.5933	-0.2424	-0.1118	-0.1854	0.1898	0.2019	-0.4533	0.0804	0.2783	-0.081	-0.044	0.2371	0.0153	0.2101	13.7665	-23.3823	37.3777
26	1.7904	1.6818	0.1983	4.5524	0.6632	1.3126	-0.0922	0.1297	-0.2415	-0.0327	0.0977	-0.022	0.2301	-0.0415	-0.0009	0.189	-0.0265	0.0094	0.2188	-0.0152	0.1753	8.5987	-26.0629	18.8963
27	0.707	-1.4343	-1.594	3.2881	2.5796	4.2989	-0.1202	0.1053	-0.1687	0.082	0.1452	-0.249	0.5048	0.5516	-0.0624	0.2711	0.0268	0.01	0.3675	-0.0432	0.3066	16.1634	-33.613	23.4939
28	0.6531	0.0453	-0.2668	0.7774	0.1122	0.9344	-0.0296	0.1252	0.0011	-0.1577	0.0538	0.0312	0.0268	-0.062	-0.019	0.1706	-0.0298	-0.0239	0.1926	0.0081	0.1505	17.9731	-5.2542	14.31
29	4.1262	-2.2444	6.0344	4.204	-3.1085	9.3644	0.1502	0.3859	0.4892	-0.0192	-0.2564	-0.3403	-0.1204	0.4122	0.1349	0.2652	-0.0576	0.0472	0.184	-0.0363	0.2417	36.4001	22.941	40.325

精密化 TLSグループ

ID	Refine-ID	Refine TLS-ID	Selection details	Auth asym-ID	Auth seq-ID
1	X-RAY DIFFRACTION	1	chain 'A' and (resid 4 through 57 )	A	4 - 57
2	X-RAY DIFFRACTION	2	chain 'A' and (resid 58 through 148 )	A	58 - 148
3	X-RAY DIFFRACTION	3	chain 'A' and (resid 149 through 194 )	A	149 - 194
4	X-RAY DIFFRACTION	4	chain 'A' and (resid 195 through 277 )	A	195 - 277
5	X-RAY DIFFRACTION	5	chain 'A' and (resid 278 through 334 )	A	278 - 334
6	X-RAY DIFFRACTION	6	chain 'A' and (resid 335 through 377 )	A	335 - 377
7	X-RAY DIFFRACTION	7	chain 'A' and (resid 378 through 404 )	A	378 - 404
8	X-RAY DIFFRACTION	8	chain 'B' and (resid 4 through 40 )	B	4 - 40
9	X-RAY DIFFRACTION	9	chain 'B' and (resid 41 through 125 )	B	41 - 125
10	X-RAY DIFFRACTION	10	chain 'B' and (resid 126 through 165 )	B	126 - 165
11	X-RAY DIFFRACTION	11	chain 'B' and (resid 166 through 277 )	B	166 - 277
12	X-RAY DIFFRACTION	12	chain 'B' and (resid 278 through 334 )	B	278 - 334
13	X-RAY DIFFRACTION	13	chain 'B' and (resid 335 through 377 )	B	335 - 377
14	X-RAY DIFFRACTION	14	chain 'B' and (resid 378 through 404 )	B	378 - 404
15	X-RAY DIFFRACTION	15	chain 'C' and (resid 4 through 40 )	C	4 - 40
16	X-RAY DIFFRACTION	16	chain 'C' and (resid 41 through 67 )	C	41 - 67
17	X-RAY DIFFRACTION	17	chain 'C' and (resid 68 through 92 )	C	68 - 92
18	X-RAY DIFFRACTION	18	chain 'C' and (resid 93 through 125 )	C	93 - 125
19	X-RAY DIFFRACTION	19	chain 'C' and (resid 126 through 165 )	C	126 - 165
20	X-RAY DIFFRACTION	20	chain 'C' and (resid 166 through 194 )	C	166 - 194
21	X-RAY DIFFRACTION	21	chain 'C' and (resid 195 through 218 )	C	195 - 218
22	X-RAY DIFFRACTION	22	chain 'C' and (resid 219 through 277 )	C	219 - 277
23	X-RAY DIFFRACTION	23	chain 'C' and (resid 278 through 334 )	C	278 - 334
24	X-RAY DIFFRACTION	24	chain 'C' and (resid 335 through 377 )	C	335 - 377
25	X-RAY DIFFRACTION	25	chain 'C' and (resid 378 through 404 )	C	378 - 404
26	X-RAY DIFFRACTION	26	chain 'D' and (resid 4 through 125 )	D	4 - 125
27	X-RAY DIFFRACTION	27	chain 'D' and (resid 126 through 165 )	D	126 - 165
28	X-RAY DIFFRACTION	28	chain 'D' and (resid 166 through 377 )	D	166 - 377
29	X-RAY DIFFRACTION	29	chain 'D' and (resid 378 through 404 )	D	378 - 404

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EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

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新型コロナ情報

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