登録情報 | データベース: PDB / ID: 6xh3 |
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タイトル | Co-crystal structure of HIV-1 TAR RNA in complex with lab-evolved RRM TBP6.3 |
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要素 | - TAR BINDING PROTEIN TBP 6.3
- TRANS-ACTIVATION RESPONSE ELEMENT
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キーワード | RNA BINDING PROTEIN/RNA / PROTEIN-RNA COMPLEX / TAR RNA / LAB-EVOLVED PROTEIN / ARGININE FORK / BETA HAIRPIN / MAJOR-GROOVE READOUT / BASE TRIPLE / U1A / HIV-1 / TRANS- ACTIVATION / RNA RECOGNITION MOTIF / RRM / RNA BINDING PROTEIN-RNA COMPLEX / RNA BINDING PROTEIN |
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機能・相同性 | 機能・相同性情報
U1 snRNP binding / U1 snRNP / U1 snRNA binding / U4/U6 x U5 tri-snRNP complex / mRNA Splicing - Major Pathway / spliceosomal complex / mRNA splicing, via spliceosome / DNA binding / RNA binding / nucleoplasm ...U1 snRNP binding / U1 snRNP / U1 snRNA binding / U4/U6 x U5 tri-snRNP complex / mRNA Splicing - Major Pathway / spliceosomal complex / mRNA splicing, via spliceosome / DNA binding / RNA binding / nucleoplasm / identical protein binding / nucleus類似検索 - 分子機能 U1 small nuclear ribonucleoprotein A, RNA recognition motif 2 / U1 small nuclear ribonucleoprotein A, RNA recognition motif 1 / RNA recognition motif / RNA recognition motif / Eukaryotic RNA Recognition Motif (RRM) profile. / RNA recognition motif domain / RNA-binding domain superfamily / Nucleotide-binding alpha-beta plait domain superfamily類似検索 - ドメイン・相同性 RNA / RNA (> 10) / U1 small nuclear ribonucleoprotein A類似検索 - 構成要素 |
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生物種 | Homo sapiens (ヒト) Human immunodeficiency virus 1 (ヒト免疫不全ウイルス) |
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手法 | X線回折 / シンクロトロン / フーリエ合成 / 解像度: 2.353 Å |
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データ登録者 | Chavali, S.S. / Jenkins, J.L. / Wedekind, J.E. |
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資金援助 | 米国, 1件 組織 | 認可番号 | 国 |
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National Institutes of Health/National Institute of General Medical Sciences (NIH/NIGMS) | AI150463 | 米国 |
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引用 | ジャーナル: J.Biol.Chem. / 年: 2020 タイトル: Co-crystal structures of HIV TAR RNA bound to lab-evolved proteins show key roles for arginine relevant to the design of cyclic peptide TAR inhibitors. 著者: Chavali, S.S. / Mali, S.M. / Jenkins, J.L. / Fasan, R. / Wedekind, J.E. |
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履歴 | 登録 | 2020年6月18日 | 登録サイト: RCSB / 処理サイト: RCSB |
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改定 1.0 | 2020年10月14日 | Provider: repository / タイプ: Initial release |
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改定 1.1 | 2020年11月4日 | Group: Database references / カテゴリ: citation / citation_author Item: _citation.country / _citation.journal_abbrev ..._citation.country / _citation.journal_abbrev / _citation.journal_id_ASTM / _citation.journal_id_CSD / _citation.journal_id_ISSN / _citation.pdbx_database_id_DOI / _citation.pdbx_database_id_PubMed / _citation.title / _citation.year / _citation_author.identifier_ORCID |
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改定 1.2 | 2020年12月16日 | Group: Database references / カテゴリ: citation Item: _citation.journal_volume / _citation.page_first / _citation.page_last |
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改定 1.3 | 2024年3月6日 | Group: Data collection / Database references / カテゴリ: chem_comp_atom / chem_comp_bond / database_2 Item: _database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession |
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