登録情報 | データベース: PDB / ID: 6v7a |
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タイトル | Crystal structure of Danio rerio histone deacetylase 6 catalytic domain 2 (CD2) complexed with NF2657 |
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要素 | Hdac6 protein |
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キーワード | HYDROLASE / Histone Deacetylase |
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機能・相同性 | 機能・相同性情報
Aggrephagy / tubulin deacetylase activity / swimming behavior / definitive hemopoiesis / protein lysine deacetylase activity / regulation of tubulin deacetylation / histone deacetylase activity / potassium ion binding / histone deacetylase complex / hematopoietic progenitor cell differentiation ...Aggrephagy / tubulin deacetylase activity / swimming behavior / definitive hemopoiesis / protein lysine deacetylase activity / regulation of tubulin deacetylation / histone deacetylase activity / potassium ion binding / histone deacetylase complex / hematopoietic progenitor cell differentiation / angiogenesis / negative regulation of transcription by RNA polymerase II / zinc ion binding類似検索 - 分子機能 Ubiquitin Carboxyl-terminal Hydrolase-like zinc finger / Zinc finger, UBP-type / Zn-finger in ubiquitin-hydrolases and other protein / Zinc finger UBP-type profile. / Histone deacetylase family / Histone deacetylase domain / Histone deacetylase domain superfamily / Histone deacetylase domain / Ureohydrolase domain superfamily / Zinc finger, RING/FYVE/PHD-type類似検索 - ドメイン・相同性 : / Chem-QQG / Hdac6 protein / Histone deacetylase 6類似検索 - 構成要素 |
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生物種 | ![](img/tx_fish.gif) Danio rerio (ゼブラフィッシュ) |
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手法 | X線回折 / シンクロトロン / 分子置換 / 解像度: 2.08741757573 Å |
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データ登録者 | Osko, J.D. / Christianson, D.W. |
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資金援助 | 米国, 1件 組織 | 認可番号 | 国 |
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National Institutes of Health/National Institute of General Medical Sciences (NIH/NIGMS) | GM49758 | 米国 |
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引用 | ジャーナル: Acs Med.Chem.Lett. / 年: 2020 タイトル: Spiroindoline-Capped Selective HDAC6 Inhibitors: Design, Synthesis, Structural Analysis, and Biological Evaluation. 著者: Saraswati, A.P. / Relitti, N. / Brindisi, M. / Osko, J.D. / Chemi, G. / Federico, S. / Grillo, A. / Brogi, S. / McCabe, N.H. / Turkington, R.C. / Ibrahim, O. / O'Sullivan, J. / Lamponi, S. / ...著者: Saraswati, A.P. / Relitti, N. / Brindisi, M. / Osko, J.D. / Chemi, G. / Federico, S. / Grillo, A. / Brogi, S. / McCabe, N.H. / Turkington, R.C. / Ibrahim, O. / O'Sullivan, J. / Lamponi, S. / Ghanim, M. / Kelly, V.P. / Zisterer, D. / Amet, R. / Hannon Barroeta, P. / Vanni, F. / Ulivieri, C. / Herp, D. / Sarno, F. / Di Costanzo, A. / Saccoccia, F. / Ruberti, G. / Jung, M. / Altucci, L. / Gemma, S. / Butini, S. / Christianson, D.W. / Campiani, G. |
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履歴 | 登録 | 2019年12月8日 | 登録サイト: RCSB / 処理サイト: RCSB |
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改定 1.0 | 2020年12月2日 | Provider: repository / タイプ: Initial release |
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改定 1.1 | 2023年10月11日 | Group: Data collection / Database references / Refinement description カテゴリ: chem_comp_atom / chem_comp_bond ...chem_comp_atom / chem_comp_bond / database_2 / pdbx_initial_refinement_model Item: _database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession |
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