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基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 6tna | ||||||||||||
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タイトル | CRYSTAL STRUCTURE OF YEAST PHENYLALANINE T-RNA. I.CRYSTALLOGRAPHIC REFINEMENT | ||||||||||||
![]() | TRNAPHE | ||||||||||||
![]() | T-RNA / SINGLE STRAND / LOOPS | ||||||||||||
機能・相同性 | RNA / RNA (> 10)![]() | ||||||||||||
生物種 | ![]() ![]() | ||||||||||||
手法 | ![]() | ||||||||||||
![]() | Sussman, J.L. / Holbrook, S.R. / Warrant, R.W. / Church, G.M. / Kim, S.-H. | ||||||||||||
![]() | ![]() タイトル: Crystal structure of yeast phenylalanine transfer RNA. I. Crystallographic refinement. 著者: Sussman, J.L. / Holbrook, S.R. / Warrant, R.W. / Church, G.M. / Kim, S.H. #1: ![]() タイトル: Crystal Structure of Yeast Phenylalanine T-RNA. II.Structural Features and Functional Implications 著者: Holbrook, S.R. / Sussman, J.L. / Warrant, R.W. / Kim, S.-H. #2: ![]() タイトル: Three Dimensional Structure of T-RNA and Its Functional Implications 著者: Kim, S.-H. #3: ![]() タイトル: The Three-Dimensional Structure of Transfer RNA 著者: Rich, A. / Kim, S.H. #4: ![]() タイトル: Crystal Structure of Yeast Phenylalanine T-RNA, Its Correlation to the Solution Structure and the Functional Implications 著者: Kim, S.-H. #5: ![]() タイトル: RNA-Ligand Interactions. (1) Magnesium Binding Sites in Yeast T-RNA-PHE 著者: Holbrook, S.R. / Sussman, J.L. / Warrant, R.W. / Church, G.M. / Kim, S.-H. #6: ![]() タイトル: Idealized Atomic Coordinates of Yeast Phenylalanine Transfer RNA 著者: Sussman, J.L. / Kim, S.-H. #7: ![]() タイトル: Three-Dimensional Structure of a Transfer RNA in Two Crystal Forms 著者: Sussman, J.L. / Kim, S.-H. | ||||||||||||
履歴 |
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構造の表示
構造ビューア | 分子: ![]() ![]() |
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ダウンロードとリンク
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ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | ![]() | 56.8 KB | 表示 | ![]() |
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PDB形式 | ![]() | 37.8 KB | 表示 | ![]() |
PDBx/mmJSON形式 | ![]() | ツリー表示 | ![]() | |
その他 | ![]() |
-検証レポート
文書・要旨 | ![]() | 351.3 KB | 表示 | ![]() |
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文書・詳細版 | ![]() | 372 KB | 表示 | |
XML形式データ | ![]() | 7.2 KB | 表示 | |
CIF形式データ | ![]() | 9 KB | 表示 | |
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
-関連構造データ
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リンク
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集合体
登録構造単位 | ![]()
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1 |
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単位格子 |
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要素
#1: RNA鎖 | 分子量: 24890.121 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 天然 / 由来: (天然) ![]() ![]() | ||
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#2: 化合物 | ChemComp-MG / #3: 水 | ChemComp-HOH / | |
-実験情報
-実験
実験 | 手法: ![]() |
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試料調製
結晶 | マシュー密度: 2.99 Å3/Da / 溶媒含有率: 58.84 % |
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結晶化 | *PLUS 手法: other / 詳細: Kim, S.H., (1971) Proc.Natl.Acad.Sci.USA, 68, 841. |
-データ収集
放射 | 散乱光タイプ: x-ray |
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放射波長 | 相対比: 1 |
反射 | *PLUS 最高解像度: 2.7 Å / Num. all: 8741 / Num. obs: 8426 / % possible obs: 96.4 % / Observed criterion σ(F): 2 / Rmerge(I) obs: 0.39 |
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解析
ソフトウェア | 名称: CORELS / 分類: 精密化 | ||||||||||||
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精密化 | 最高解像度: 2.7 Å /
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精密化ステップ | サイクル: LAST / 最高解像度: 2.7 Å
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精密化 | *PLUS 最高解像度: 2.7 Å | ||||||||||||
溶媒の処理 | *PLUS | ||||||||||||
原子変位パラメータ | *PLUS |