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基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 6oln | ||||||
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タイトル | Controlling the Self-Assembly of Synthetic Metal-Coordinating Coiled-Coil Peptides: Orthorhombic Lattice from a Trimeric Coiled Coil | ||||||
![]() | Designed trimeric coiled coil peptide | ||||||
![]() | DE NOVO PROTEIN / metal coordination framework / supramolecular assembly | ||||||
機能・相同性 | COPPER (II) ION![]() | ||||||
生物種 | synthetic construct (人工物) | ||||||
手法 | ![]() ![]() | ||||||
![]() | Scheib, K.A. / Horne, W.S. | ||||||
![]() | ![]() タイトル: Understanding and controlling the metal-directed assembly of terpyridine-functionalized coiled-coil peptides. 著者: Scheib, K.A. / Tavenor, N.A. / Lawless, M.J. / Saxena, S. / Horne, W.S. | ||||||
履歴 |
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構造の表示
構造ビューア | 分子: ![]() ![]() |
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ダウンロードとリンク
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ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | ![]() | 47 KB | 表示 | ![]() |
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PDB形式 | ![]() | 36.2 KB | 表示 | ![]() |
PDBx/mmJSON形式 | ![]() | ツリー表示 | ![]() | |
その他 | ![]() |
-検証レポート
文書・要旨 | ![]() | 440.6 KB | 表示 | ![]() |
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文書・詳細版 | ![]() | 440.9 KB | 表示 | |
XML形式データ | ![]() | 9.3 KB | 表示 | |
CIF形式データ | ![]() | 12.4 KB | 表示 | |
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
-関連構造データ
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リンク
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集合体
登録構造単位 | ![]()
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1 | ![]()
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2 | ![]()
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単位格子 |
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Components on special symmetry positions |
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要素
#1: タンパク質・ペプチド | 分子量: 3175.832 Da / 分子数: 6 / 由来タイプ: 合成 / 由来: (合成) synthetic construct (人工物) #2: 化合物 | ChemComp-CU / #3: 化合物 | ChemComp-CL / #4: 水 | ChemComp-HOH / | |
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-実験情報
-実験
実験 | 手法: ![]() |
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試料調製
結晶 | マシュー密度: 2.61 Å3/Da / 溶媒含有率: 52.92 % |
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結晶化 | 温度: 298 K / 手法: 蒸気拡散法, ハンギングドロップ法 / pH: 6.5 詳細: 0.1 M Bis-Tris pH 6.5, 25% w/v PEG 3350, 5 mM copper(II) chloride |
-データ収集
回折 | 平均測定温度: 100 K / Serial crystal experiment: N |
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放射光源 | 由来: ![]() |
検出器 | タイプ: RIGAKU SATURN 944 / 検出器: CCD / 日付: 2018年10月16日 |
放射 | プロトコル: SINGLE WAVELENGTH / 単色(M)・ラウエ(L): M / 散乱光タイプ: x-ray |
放射波長 | 波長: 1.5418 Å / 相対比: 1 |
反射 | 解像度: 2.5→41.545 Å / Num. obs: 7260 / % possible obs: 99.9 % / 冗長度: 3.68 % / Rmerge(I) obs: 0.057 / Net I/σ(I): 18 |
反射 シェル | 解像度: 2.5→2.59 Å / 冗長度: 3.4 % / Rmerge(I) obs: 0.081 / Mean I/σ(I) obs: 11.6 / Num. unique obs: 718 / % possible all: 98.4 |
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解析
ソフトウェア |
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精密化 | 構造決定の手法: ![]() 開始モデル: 4DZL 解像度: 2.5→41.55 Å / SU ML: 0.31 / 交差検証法: FREE R-VALUE / σ(F): 1.34 / 位相誤差: 30.53
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溶媒の処理 | 減衰半径: 0.9 Å / VDWプローブ半径: 1.11 Å | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
精密化ステップ | サイクル: LAST / 解像度: 2.5→41.55 Å
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拘束条件 |
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LS精密化 シェル |
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