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基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 6j37 | ||||||||||||||||||||
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タイトル | DNA minidumbbell structure of two CTTG repeats | ||||||||||||||||||||
![]() | DNA (5'-D(*![]() DNA / minidumbbell / reverse wobble TT mispair / hydrophobic interaction | 機能・相同性 | DNA | ![]() 生物種 | ![]() 手法 | 溶液NMR / not applicable | ![]() Lam, S.L. / Guo, P. | ![]() ![]() タイトル: Unprecedented hydrophobic stabilizations from a reverse wobble T·T mispair in DNA minidumbbell. 著者: Guo, P. / Lam, S.L. 履歴 |
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構造の表示
構造ビューア | 分子: ![]() ![]() |
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ダウンロードとリンク
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ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | ![]() | 91.8 KB | 表示 | ![]() |
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PDB形式 | ![]() | 63.4 KB | 表示 | ![]() |
PDBx/mmJSON形式 | ![]() | ツリー表示 | ![]() | |
その他 | ![]() |
-検証レポート
文書・要旨 | ![]() | 312.4 KB | 表示 | ![]() |
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文書・詳細版 | ![]() | 404 KB | 表示 | |
XML形式データ | ![]() | 5.4 KB | 表示 | |
CIF形式データ | ![]() | 8.5 KB | 表示 | |
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
-関連構造データ
類似構造データ | |
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その他のデータベース |
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リンク
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集合体
登録構造単位 | ![]()
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1 |
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NMR アンサンブル |
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要素
#1: DNA鎖 | 分子量: 2408.589 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 合成 / 由来: (合成) ![]() |
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#2: 化合物 | ChemComp-NA / |
-実験情報
-実験
実験 | 手法: 溶液NMR | ||||||||||||||||||||||||
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NMR実験 |
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試料調製
詳細 | タイプ: solution 内容: 1 mM No labeling DNA, 10 mM No labeling sodium phosphate, 0.02 mM No labeling DSS, 99.96% D2O Label: No labeling / 溶媒系: 99.96% D2O | ||||||||||||||||
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試料 |
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試料状態 | イオン強度: 10 mM / Ionic strength err: 0.1 / Label: condition_1 / pH: 7.0 / PH err: 0.1 / 圧: 1 bar / Pressure err: 0.01 / 温度: 273 K / Temperature err: 0.1 |
-NMR測定
NMRスペクトロメーター |
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解析
NMR software |
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精密化 | 手法: not applicable / ソフトェア番号: 1 | |||||||||
代表構造 | 選択基準: least restraint violation | |||||||||
NMRアンサンブル | コンフォーマー選択の基準: structures with the least restraint violations 計算したコンフォーマーの数: 1000 / 登録したコンフォーマーの数: 20 |