+データを開く
-基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 6iha | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
タイトル | antibacterial peptide SibaCec-A | ||||||
要素 | SibaCec-A | ||||||
キーワード | ANTITOXIN / antibacterial peptide / alpha-helix | ||||||
機能・相同性 | Cecropin 4 機能・相同性情報 | ||||||
生物種 | Simulium bannaense (昆虫) | ||||||
手法 | 溶液NMR / DGSA-distance geometry simulated annealing | ||||||
データ登録者 | Jing, H. / Lin, W. | ||||||
引用 | ジャーナル: To Be Published タイトル: antibacterial peptide SibaCec-A 著者: Jing, H. / Lin, W. | ||||||
履歴 |
|
-構造の表示
構造ビューア | 分子: MolmilJmol/JSmol |
---|
-ダウンロードとリンク
-ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | 6iha.cif.gz | 183.6 KB | 表示 | PDBx/mmCIF形式 |
---|---|---|---|---|
PDB形式 | pdb6iha.ent.gz | 153.2 KB | 表示 | PDB形式 |
PDBx/mmJSON形式 | 6iha.json.gz | ツリー表示 | PDBx/mmJSON形式 | |
その他 | その他のダウンロード |
-検証レポート
アーカイブディレクトリ | https://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/ih/6iha ftp://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/ih/6iha | HTTPS FTP |
---|
-関連構造データ
類似構造データ | |
---|---|
その他のデータベース |
|
-リンク
-集合体
登録構造単位 |
| |||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
1 |
| |||||||||
NMR アンサンブル |
|
-要素
#1: タンパク質・ペプチド | 分子量: 3114.813 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 合成 / 由来: (合成) Simulium bannaense (昆虫) / 参照: UniProt: A0A0U2QEK1*PLUS |
---|
-実験情報
-実験
実験 | 手法: 溶液NMR | ||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NMR実験 |
|
-試料調製
詳細 | タイプ: solution / 内容: 3.0 mM peptide, trifluoroethanol/water / Label: sample / 溶媒系: trifluoroethanol/water |
---|---|
試料 | 濃度: 3.0 mM / 構成要素: peptide / Isotopic labeling: natural abundance |
試料状態 | イオン強度: 0 M / Label: TFE / pH: 7 / 圧: 1 atm / 温度: 298 K |
-NMR測定
NMRスペクトロメーター | タイプ: Bruker AVANCE III / 製造業者: Bruker / モデル: AVANCE III / 磁場強度: 850 MHz |
---|
-解析
NMR software |
| |||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
精密化 | 手法: DGSA-distance geometry simulated annealing / ソフトェア番号: 1 | |||||||||||||||
代表構造 | 選択基準: lowest energy | |||||||||||||||
NMRアンサンブル | コンフォーマー選択の基準: structures with the lowest energy 計算したコンフォーマーの数: 200 / 登録したコンフォーマーの数: 20 |