タイプ: solution 内容: 1 mM Optimised PPa-TYR, 8.2 mM Na2HPO4, 1.8 mM KH2PO4, 2.7 mM KCL, 137 mM NaCl, 10 % [U-99% 2H] D2O, 90% H2O/10% D2O Label: PPa_tyr_opt / 溶媒系: 90% H2O/10% D2O
試料
濃度 (mg/ml)
構成要素
Isotopic labeling
Solution-ID
1mM
Optimised PPa-TYR
naturalabundance
1
8.2mM
Na2HPO4
naturalabundance
1
1.8mM
KH2PO4
naturalabundance
1
2.7mM
KCL
naturalabundance
1
137mM
NaCl
naturalabundance
1
10 %
D2O
[U-99% 2H]
1
試料状態
詳細: The sample was prepared in phosphate buffered saline and the pH adjusted to pH 7.4 with NaOH, freeze-dried and then reconstituted in the appropriate volume to give peptide (1 mM), イオン強度: 0.1698 M / Label: conditions_1 / pH: 7.4 / 圧: 1 atm / 温度: 278 K
-
NMR測定
NMRスペクトロメーター
タイプ
製造業者
モデル
磁場強度 (MHz)
Spectrometer-ID
詳細
Bruker AVANCE III
Bruker
AVANCEIII
700
1
1.7mmTCIcryoprobe
Varian VNMRS
Varian
VNMRS
600
2
5mmcryoprobe
-
解析
NMR software
名称
バージョン
開発者
分類
CNS
1.2
Brunger, Adams, Clore, Gros, NilgesandRead
精密化
ARIA
2.3.1
Linge, O'DonoghueandNilges
structurecalculation
CcpNmr Analysis
2.4.1
CCPN
chemicalshiftassignment
CcpNmr Analysis
2.4.1
CCPN
peakpicking
TopSpin
3.5
BrukerBiospin
collection
VNMR
4
Varian
collection
NMRDraw
9.5
Delaglio, Grzesiek, Vuister, Zhu, PfeiferandBax
解析
NMRPipe
9.5
Delaglio, Grzesiek, Vuister, Zhu, PfeiferandBax
解析
精密化
手法: simulated annealing / ソフトェア番号: 1
代表構造
選択基準: closest to the average
NMRアンサンブル
コンフォーマー選択の基準: structures with the least restraint violations 計算したコンフォーマーの数: 250 / 登録したコンフォーマーの数: 20