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データを開く
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基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 6ern | ||||||
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タイトル | HIV Hexamer with ligand | ||||||
![]() | Gag polyprotein | ||||||
![]() | VIRAL PROTEIN / HIV | ||||||
機能・相同性 | ![]() viral process / viral nucleocapsid / host cell cytoplasm / host cell nucleus / structural molecule activity / virion membrane / RNA binding / zinc ion binding / ATP binding / cytoplasm 類似検索 - 分子機能 | ||||||
生物種 | ![]() ![]() | ||||||
手法 | ![]() ![]() ![]() | ||||||
![]() | James, L.C. | ||||||
![]() | ![]() タイトル: HIV hexamer 著者: James, L.C. | ||||||
履歴 |
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構造の表示
構造ビューア | 分子: ![]() ![]() |
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ダウンロードとリンク
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ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | ![]() | 53 KB | 表示 | ![]() |
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PDB形式 | ![]() | 40.2 KB | 表示 | ![]() |
PDBx/mmJSON形式 | ![]() | ツリー表示 | ![]() | |
その他 | ![]() |
-検証レポート
文書・要旨 | ![]() | 747.1 KB | 表示 | ![]() |
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文書・詳細版 | ![]() | 747.3 KB | 表示 | |
XML形式データ | ![]() | 10.8 KB | 表示 | |
CIF形式データ | ![]() | 14.5 KB | 表示 | |
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
-関連構造データ
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リンク
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集合体
登録構造単位 | ![]()
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1 | ![]()
| x 6||||||||||||||||||
単位格子 |
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Components on special symmetry positions |
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要素
#1: タンパク質 | 分子量: 24205.844 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 組換発現 由来: (組換発現) ![]() ![]() 遺伝子: gag / 発現宿主: ![]() ![]() |
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#2: 化合物 | ChemComp-ATP / |
#3: 水 | ChemComp-HOH / |
-実験情報
-実験
実験 | 手法: ![]() |
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試料調製
結晶 | マシュー密度: 2.98 Å3/Da / 溶媒含有率: 58.74 % |
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結晶化 | 温度: 277 K / 手法: batch mode / 詳細: PEG4K |
-データ収集
回折 | 平均測定温度: 277 K |
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放射光源 | 由来: ![]() ![]() ![]() |
検出器 | タイプ: OXFORD RUBY CCD / 検出器: CCD / 日付: 2017年1月3日 |
放射 | プロトコル: SINGLE WAVELENGTH / 単色(M)・ラウエ(L): M / 散乱光タイプ: x-ray |
放射波長 | 波長: 1 Å / 相対比: 1 |
反射 | 解像度: 2.359→78.68 Å / Num. obs: 11142 / % possible obs: 91.03 % / 冗長度: 4.9 % / Net I/σ(I): 15.4 |
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解析
ソフトウェア |
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精密化 | 構造決定の手法: ![]()
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溶媒の処理 | イオンプローブ半径: 0.8 Å / 減衰半径: 0.8 Å / VDWプローブ半径: 1.2 Å | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
原子変位パラメータ | Biso mean: 36.873 Å2
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精密化ステップ | サイクル: 1 / 解像度: 2.36→78.67 Å
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拘束条件 |
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