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基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 6coo | ||||||
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タイトル | CSP1-E1A | ||||||
![]() | Competence-stimulating peptide type 1 | ||||||
![]() | SIGNALING PROTEIN / pneumococcus / quorum sensing / signaling molecule / CSP | ||||||
機能・相同性 | Competence protein, ComC / COMC family / pheromone activity / establishment of competence for transformation / extracellular region / Competence-stimulating peptide type 1![]() | ||||||
生物種 | ![]() ![]() | ||||||
手法 | 溶液NMR / simulated annealing | ||||||
![]() | Yang, Y. | ||||||
![]() | ![]() タイトル: Structural Characterization of Competence-Stimulating Peptide Analogues Reveals Key Features for ComD1 and ComD2 Receptor Binding in Streptococcus pneumoniae. 著者: Yang, Y. / Cornilescu, G. / Tal-Gan, Y. | ||||||
履歴 |
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構造の表示
構造ビューア | 分子: ![]() ![]() |
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ダウンロードとリンク
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ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | ![]() | 116.6 KB | 表示 | ![]() |
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PDB形式 | ![]() | 80.7 KB | 表示 | ![]() |
PDBx/mmJSON形式 | ![]() | ツリー表示 | ![]() | |
その他 | ![]() |
-検証レポート
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
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-関連構造データ
関連構造データ | ![]() 6cj8C ![]() 6copC ![]() 6coqC ![]() 6corC ![]() 6cosC ![]() 6cotC ![]() 6couC ![]() 6covC ![]() 6cowC C: 同じ文献を引用 ( |
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類似構造データ | |
その他のデータベース |
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リンク
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集合体
登録構造単位 | ![]()
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1 |
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NMR アンサンブル |
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要素
#1: タンパク質・ペプチド | 分子量: 2190.699 Da / 分子数: 1 / 断片: UNP residues 25-41 / 変異: E1A / 由来タイプ: 合成 由来: (合成) ![]() ![]() 参照: UniProt: P60242 |
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-実験情報
-実験
実験 | 手法: 溶液NMR | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NMR実験 |
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試料調製
詳細 | タイプ: solution 内容: 250 mM D DPC, 1.9 mM competence stimulating peptide type 1 mutant - CSP1-E1A, 90% H2O/10% D2O Label: 1 / 溶媒系: 90% H2O/10% D2O | ||||||||||||
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試料 |
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試料状態 | イオン強度: 0.15 M / Label: 1 / pH: 7.4 / 圧: ambient atm / 温度: 298 K |
-NMR測定
NMRスペクトロメーター | タイプ: Bruker AVANCE / 製造業者: Bruker / モデル: AVANCE / 磁場強度: 900 MHz |
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解析
NMR software |
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精密化 | 手法: simulated annealing / ソフトェア番号: 3 / 詳細: also torsion angle dynamics with eefx refinement | ||||||||||||
代表構造 | 選択基準: lowest energy | ||||||||||||
NMRアンサンブル | コンフォーマー選択の基準: structures with the lowest energy 計算したコンフォーマーの数: 100 / 登録したコンフォーマーの数: 20 |