登録情報 | データベース: PDB / ID: 5ytl |
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タイトル | Crystal structure of Geobacillus thermodenitrificans copper-containing nitrite reductase determined with an anaerobically manipulated crystal |
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要素 | Copper-containing nitrite reductase |
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キーワード | OXIDOREDUCTASE / copper / nitrite reductase |
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機能・相同性 | 機能・相同性情報
: / nitrite reductase (NO-forming) / nitrite reductase (NO-forming) activity / copper ion binding類似検索 - 分子機能 Nitrite reductase, copper-type / Multicopper oxidase / Multicopper oxidase, C-terminal / Multicopper oxidase / Multicopper oxidase, N-terminal / Multicopper oxidase / Cupredoxins - blue copper proteins / Cupredoxin / Prokaryotic membrane lipoprotein lipid attachment site profile. / Immunoglobulin-like ...Nitrite reductase, copper-type / Multicopper oxidase / Multicopper oxidase, C-terminal / Multicopper oxidase / Multicopper oxidase, N-terminal / Multicopper oxidase / Cupredoxins - blue copper proteins / Cupredoxin / Prokaryotic membrane lipoprotein lipid attachment site profile. / Immunoglobulin-like / Sandwich / Mainly Beta類似検索 - ドメイン・相同性 ACETIC ACID / COPPER (II) ION / Copper-containing nitrite reductase類似検索 - 構成要素 |
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生物種 | Geobacillus thermodenitrificans (バクテリア) |
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手法 | X線回折 / シンクロトロン / 分子置換 / 解像度: 1.401 Å |
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データ登録者 | Fukuda, Y. / Matsusaki, T. / Tse, K.M. / Mizohata, E. / Murphy, M.E.P. / Inoue, T. |
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資金援助 | 日本, カナダ, 2件 組織 | 認可番号 | 国 |
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Japan Society for the Promotion of Science | | 日本 | The Natural Sciences and Engineering Research Council of Canada | | カナダ |
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引用 | ジャーナル: Acta Crystallogr D Struct Biol / 年: 2018 タイトル: Crystallographic study of dioxygen chemistry in a copper-containing nitrite reductase from Geobacillus thermodenitrificans. 著者: Fukuda, Y. / Matsusaki, T. / Tse, K.M. / Mizohata, E. / Murphy, M.E.P. / Inoue, T. |
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履歴 | 登録 | 2017年11月19日 | 登録サイト: PDBJ / 処理サイト: PDBJ |
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改定 1.0 | 2018年8月22日 | Provider: repository / タイプ: Initial release |
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改定 1.1 | 2024年3月27日 | Group: Data collection / Database references / Derived calculations カテゴリ: chem_comp_atom / chem_comp_bond ...chem_comp_atom / chem_comp_bond / database_2 / pdbx_struct_conn_angle / struct_conn Item: _database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession ..._database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_auth_comp_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_auth_seq_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_alt_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_asym_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_atom_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_comp_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_seq_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_auth_comp_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_auth_seq_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_alt_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_asym_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_atom_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_comp_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_seq_id / _pdbx_struct_conn_angle.value / _struct_conn.pdbx_dist_value / _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id / _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id / _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id / _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id / _struct_conn.ptnr1_label_asym_id / _struct_conn.ptnr1_label_atom_id / _struct_conn.ptnr1_label_comp_id / _struct_conn.ptnr1_label_seq_id / _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id / _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id / _struct_conn.ptnr2_label_asym_id / _struct_conn.ptnr2_label_atom_id / _struct_conn.ptnr2_label_comp_id / _struct_conn.ptnr2_symmetry |
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