登録情報 データベース : PDB / ID : 5xzn 構造の表示 ダウンロードとリンクタイトル CATPO mutant - V228C 要素Catalase 詳細 キーワード OXIDOREDUCTASE / catalase / phenol oxidase / lateral channel / mutant機能・相同性 機能・相同性情報分子機能 ドメイン・相同性 構成要素
catalase / catalase activity / hydrogen peroxide catabolic process / response to oxidative stress / heme binding / metal ion binding / cytosol 類似検索 - 分子機能 Catalase, four-helical domain / Large catalase, C-terminal domain / C-terminal domain found in long catalases / Catalase, mono-functional, haem-containing, clade 2 / Catalase, mono-functional, haem-containing, clade 2, helical domain / Hemocyanin, N-terminal domain / Catalase HpII, Chain A, domain 1 / Catalase core domain / Catalase haem-binding site / Catalase proximal heme-ligand signature. ... Catalase, four-helical domain / Large catalase, C-terminal domain / C-terminal domain found in long catalases / Catalase, mono-functional, haem-containing, clade 2 / Catalase, mono-functional, haem-containing, clade 2, helical domain / Hemocyanin, N-terminal domain / Catalase HpII, Chain A, domain 1 / Catalase core domain / Catalase haem-binding site / Catalase proximal heme-ligand signature. / Catalase / Catalase active site / Catalase proximal active site signature. / Catalase immune-responsive domain / Catalase-related immune-responsive / Catalase core domain / Catalase, mono-functional, haem-containing / Catalase / catalase family profile. / Catalase superfamily / Class I glutamine amidotransferase (GATase) domain / Class I glutamine amidotransferase-like / Up-down Bundle / Beta Barrel / Rossmann fold / 3-Layer(aba) Sandwich / Mainly Beta / Mainly Alpha / Alpha Beta 類似検索 - ドメイン・相同性 CIS-HEME D HYDROXYCHLORIN GAMMA-SPIROLACTONE / Catalase 類似検索 - 構成要素生物種 Mycothermus thermophilus (菌類)手法 X線回折 / シンクロトロン / 分子置換 / 解像度 : 1.47 Å 詳細データ登録者 Yuzugullu Karakus, Y. / Balci, S. / Goc, G. / Pearson, A.R. / Yorke, B. 資金援助 トルコ, 1件 詳細 詳細を隠す組織 認可番号 国 The Scientific and Technological Research Council of Turkey 113Z744 トルコ
引用ジャーナル : To Be Published タイトル : CATPO mutant - V228C著者 : Yuzugullu Karakus, Y. / Balci, S. / Goc, G. / Pearson, A.R. / Yorke, B. 履歴 登録 2017年7月13日 登録サイト : PDBJ / 処理サイト : PDBJ改定 1.0 2018年7月18日 Provider : repository / タイプ : Initial release改定 1.1 2018年8月1日 Group : Data collection / Experimental preparation / カテゴリ : exptl_crystal_grow / Item : _exptl_crystal_grow.temp改定 2.0 2021年4月14日 Group : Advisory / Atomic model ... Advisory / Atomic model / Author supporting evidence / Data collection / Derived calculations / Other / Refinement description / Structure summary カテゴリ : atom_site / atom_sites ... atom_site / atom_sites / diffrn / pdbx_audit_support / pdbx_distant_solvent_atoms / pdbx_entity_instance_feature / pdbx_entry_details / pdbx_nonpoly_scheme / pdbx_struct_conn_angle / pdbx_struct_sheet_hbond / pdbx_validate_close_contact / pdbx_validate_planes / pdbx_validate_rmsd_angle / pdbx_validate_rmsd_bond / pdbx_validate_torsion / refine / refine_hist / refine_ls_restr / refine_ls_shell / software / struct_conf / struct_conn / struct_mon_prot_cis / struct_site / struct_site_gen Item : _atom_sites.fract_transf_matrix[1][3] / _diffrn.pdbx_serial_crystal_experiment ... _atom_sites.fract_transf_matrix[1][3] / _diffrn.pdbx_serial_crystal_experiment / _pdbx_audit_support.funding_organization / _pdbx_distant_solvent_atoms.neighbor_macromolecule_distance / _pdbx_nonpoly_scheme.asym_id / _pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num / _pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num / _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num / _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id / _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_auth_atom_id / _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_auth_comp_id / _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_auth_seq_id / _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_label_atom_id / _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_label_comp_id / _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_label_seq_id / _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_auth_atom_id / _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_auth_seq_id / _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_label_atom_id / _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_label_seq_id / _refine.B_iso_max / _refine.B_iso_mean / _refine.B_iso_min / _refine.aniso_B[1][2] / _refine.aniso_B[1][3] / _refine.aniso_B[2][3] / _refine.aniso_B[3][3] / _refine.correlation_coeff_Fo_to_Fc / _refine.ls_R_factor_R_free / _refine.ls_R_factor_R_work / _refine.ls_R_factor_obs / _refine.ls_d_res_low / _refine.overall_SU_B / _refine.pdbx_overall_ESU_R / _refine_hist.d_res_low / _refine_hist.pdbx_B_iso_mean_ligand / _refine_hist.pdbx_B_iso_mean_solvent / _refine_ls_restr.dev_ideal / _refine_ls_restr.dev_ideal_target / _refine_ls_restr.number / _refine_ls_shell.R_factor_R_free / _refine_ls_shell.R_factor_R_work / _software.version / _struct_mon_prot_cis.pdbx_omega_angle 解説 : Model orientation/position / Provider : author / タイプ : Coordinate replacement改定 2.1 2023年11月22日 Group : Data collection / Database references / Refinement descriptionカテゴリ : chem_comp_atom / chem_comp_bond ... chem_comp_atom / chem_comp_bond / database_2 / pdbx_initial_refinement_model Item : _database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession
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