登録情報 | データベース: PDB / ID: 5xx1 |
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タイトル | Crystal structure of Arginine decarboxylase (AdiA) from Salmonella typhimurium |
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要素 | Arginine decarboxylase |
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キーワード | LYASE / Decamer / Phosphate bound / Salmonella typhimurium / loop movement / acid stress |
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機能・相同性 | 機能・相同性情報
arginine decarboxylase / arginine decarboxylase activity / amino acid metabolic process / cytoplasm類似検索 - 分子機能 Ornithine Decarboxylase; Chain A, domain 4 / Orn/Lys/Arg decarboxylase, C-terminal domain / Orn/Lys/Arg decarboxylase, N-terminal / Ornithine/lysine/arginine decarboxylase / Orn/Lys/Arg decarboxylase, N-terminal domain / Orn/Lys/Arg decarboxylases family 1 pyridoxal-P attachment site. / Orn/Lys/Arg decarboxylase, major domain / Orn/Lys/Arg decarboxylase, C-terminal / Orn/Lys/Arg decarboxylase, C-terminal domain superfamily / Orn/Lys/Arg decarboxylase, major domain ...Ornithine Decarboxylase; Chain A, domain 4 / Orn/Lys/Arg decarboxylase, C-terminal domain / Orn/Lys/Arg decarboxylase, N-terminal / Ornithine/lysine/arginine decarboxylase / Orn/Lys/Arg decarboxylase, N-terminal domain / Orn/Lys/Arg decarboxylases family 1 pyridoxal-P attachment site. / Orn/Lys/Arg decarboxylase, major domain / Orn/Lys/Arg decarboxylase, C-terminal / Orn/Lys/Arg decarboxylase, C-terminal domain superfamily / Orn/Lys/Arg decarboxylase, major domain / Orn/Lys/Arg decarboxylase, C-terminal domain / Response regulator / Aspartate Aminotransferase, domain 1 / Aspartate Aminotransferase, domain 1 / Aspartate Aminotransferase; domain 2 / Type I PLP-dependent aspartate aminotransferase-like (Major domain) / Pyridoxal phosphate-dependent transferase, small domain / Pyridoxal phosphate-dependent transferase, major domain / Pyridoxal phosphate-dependent transferase / Alpha-Beta Complex / Rossmann fold / 3-Layer(aba) Sandwich / Alpha Beta類似検索 - ドメイン・相同性 |
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生物種 | Salmonella typhi (サルモネラ菌) |
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手法 | X線回折 / シンクロトロン / 分子置換 / 解像度: 3.1 Å |
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データ登録者 | Deka, G. / Bharath, S.R. / Shavithri, H.S. / Murthy, M.R.N. |
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資金援助 | インド, 1件 組織 | 認可番号 | 国 |
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Department of Biotechnology (DBT) | DBT 0425 | インド |
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引用 | ジャーナル: Biochem. Biophys. Res. Commun. / 年: 2017 タイトル: Structural studies on the decameric S. typhimurium arginine decarboxylase (ADC): Pyridoxal 5'-phosphate binding induces conformational changes 著者: Deka, G. / Bharath, S.R. / Savithri, H.S. / Murthy, M.R.N. |
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履歴 | 登録 | 2017年6月30日 | 登録サイト: PDBJ / 処理サイト: PDBJ |
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改定 1.0 | 2018年5月16日 | Provider: repository / タイプ: Initial release |
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改定 1.1 | 2018年5月30日 | Group: Data collection / Database references / カテゴリ: citation / citation_author Item: _citation.country / _citation.journal_abbrev ..._citation.country / _citation.journal_abbrev / _citation.journal_id_ASTM / _citation.journal_id_CSD / _citation.journal_id_ISSN / _citation.journal_volume / _citation.page_first / _citation.page_last / _citation.pdbx_database_id_DOI / _citation.pdbx_database_id_PubMed / _citation.title / _citation.year / _citation_author.name |
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改定 1.2 | 2023年11月22日 | Group: Data collection / Database references / Refinement description カテゴリ: chem_comp_atom / chem_comp_bond ...chem_comp_atom / chem_comp_bond / database_2 / pdbx_initial_refinement_model / struct_ncs_dom_lim Item: _database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession ..._database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession / _struct_ncs_dom_lim.beg_auth_comp_id / _struct_ncs_dom_lim.beg_label_asym_id / _struct_ncs_dom_lim.beg_label_comp_id / _struct_ncs_dom_lim.beg_label_seq_id / _struct_ncs_dom_lim.end_auth_comp_id / _struct_ncs_dom_lim.end_label_asym_id / _struct_ncs_dom_lim.end_label_comp_id / _struct_ncs_dom_lim.end_label_seq_id |
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