PDB-5vlg: Crystal structure of EilR in complex with malachite green

IDまたはキーワード:

登録情報

データベース: PDB / ID: 5vlg

タイトル

Crystal structure of EilR in complex with malachite green

要素

Regulatory protein TetR

キーワード

TRANSCRIPTION / transcription factor

機能・相同性

機能・相同性情報

regulation of biosynthetic process / regulation of primary metabolic process / DNA binding
類似検索 - 分子機能

生物種

Enterobacter lignolyticus (バクテリア)

手法

X線回折 /

シンクロトロン / 解像度: 2.932 Å

データ登録者

Pereira, J.H. / Ruegg, T.L. / Chen, J. / Novichkov, P. / DeGiovani, A. / Tomaleri, G.P. / Singer, S. / Simmons, B. / Thelen, M. / Adams, P.D.

資金援助

米国, 1件

引用

ジャーナル: Nat Commun / 年: 2018
タイトル: Jungle Express is a versatile repressor system for tight transcriptional control.
著者: Ruegg, T.L. / Pereira, J.H. / Chen, J.C. / DeGiovanni, A. / Novichkov, P. / Mutalik, V.K. / Tomaleri, G.P. / Singer, S.W. / Hillson, N.J. / Simmons, B.A. / Adams, P.D. / Thelen, M.P.

履歴

登録	2017年4月25日	登録サイト: RCSB / 処理サイト: RCSB
改定 1.0	2018年6月27日	Provider: repository / タイプ: Initial release
改定 1.1	2018年11月28日	Group: Data collection / Database references / カテゴリ: citation / citation_author Item: _citation.country / _citation.journal_abbrev ..._citation.country / _citation.journal_abbrev / _citation.journal_id_CSD / _citation.journal_id_ISSN / _citation.journal_volume / _citation.page_first / _citation.page_last / _citation.pdbx_database_id_DOI / _citation.pdbx_database_id_PubMed / _citation.title / _citation.year
改定 1.2	2019年12月4日	Group: Author supporting evidence / カテゴリ: pdbx_audit_support / Item: _pdbx_audit_support.funding_organization
改定 1.3	2024年3月13日	Group: Data collection / Database references / カテゴリ: chem_comp_atom / chem_comp_bond / database_2 Item: _database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession

構造ビューア	分子: MolmilJmol/JSmol

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ダウンロード

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PDB形式	pdb5vlg.ent.gz	743.9 KB	表示	PDB形式
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その他	その他のダウンロード

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検証レポート

文書・要旨	5vlg_validation.pdf.gz	2.4 MB	表示	wwPDB検証レポート
文書・詳細版	5vlg_full_validation.pdf.gz	2.4 MB	表示
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アーカイブディレクトリ	https://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/vl/5vlg ftp://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/vl/5vlg	HTTPS FTP

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関連構造データ

関連構造データ	5vl9C 5vlmC C: 同じ文献を引用 (文献)
類似構造データ	5vlm-3 5vlm-1 5vlm-2 3hta-2 3aux-d 5haw-1 5ztc-d 5vlm-4 5xay-4 5haw-d Omokage検索で類似形状データを探す (詳細) Omokage検索で類似形状データを探す (詳細) Omokage検索で類似形状データを探す (詳細) Omokage検索で類似形状データを探す (詳細) Omokage検索で類似形状データを探す (詳細) 類似検索 - 機能・相同性F&H 検索類似検索 - 機能F&H 検索類似検索 - 相同性F&H 検索

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リンク

PDBのページ	PDBj / wwPDB / NCBI

登録構造単位

A: Regulatory protein TetR

B: Regulatory protein TetR

C: Regulatory protein TetR

D: Regulatory protein TetR

E: Regulatory protein TetR

F: Regulatory protein TetR

G: Regulatory protein TetR

H: Regulatory protein TetR

ヘテロ分子

176 kDa, 8 ポリマー
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1

A: Regulatory protein TetR

B: Regulatory protein TetR

ヘテロ分子

登録者・ソフトウェアが定義した集合体
根拠: native gel electrophoresis
44.1 kDa, 2 ポリマー
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2

C: Regulatory protein TetR

D: Regulatory protein TetR

ヘテロ分子

登録者・ソフトウェアが定義した集合体
44.1 kDa, 2 ポリマー
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3

E: Regulatory protein TetR

F: Regulatory protein TetR

ヘテロ分子

登録者・ソフトウェアが定義した集合体
44.1 kDa, 2 ポリマー
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4

G: Regulatory protein TetR

H: Regulatory protein TetR

ヘテロ分子

登録者・ソフトウェアが定義した集合体
44.1 kDa, 2 ポリマー
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単位格子

Length a, b, c (Å)	100.145, 85.985, 102.275
Angle α, β, γ (deg.)	90.00, 101.69, 90.00
Int Tables number	4
Space group name H-M	P12₁1

#1: タンパク質	Regulatory protein TetR 分子量: 21709.783 Da / 分子数: 8 / 由来タイプ: 組換発現由来: (組換発現) Enterobacter lignolyticus (バクテリア) 発現宿主: Escherichia coli (大腸菌) / 参照: UniProt: E3G817
#2: 化合物	ChemComp-MGR / MALACHITE GREEN / N,N-ジメチル-4-[α-[4-(ジメチルアミノ)フェニル]ベンジリデン]-2,5-シクロヘキサジエニリデンイミニウム分子量: 329.458 Da / 分子数: 8 / 由来タイプ: 合成 / 式: C₂₃H₂₅N₂ / コメント: 抗菌剤*YM
#3: 水	ChemComp-HOH / water 分子量: 18.015 Da / 分子数: 17 / 由来タイプ: 天然 / 式: H₂O

-
実験

実験	手法: X線回折 / 使用した結晶の数: 1

-
試料調製

結晶	マシュー密度: 2.48 Å³/Da / 溶媒含有率: 50.46 %
結晶化	温度: 293 K / 手法: 蒸気拡散法, シッティングドロップ法 / 詳細: 0.2 M Tri-Sodium citrate, 20 % PEG 3350

-
データ収集

回折	平均測定温度: 100 K
放射光源	由来: シンクロトロン / サイト: ALS / ビームライン: 8.2.2 / 波長: 1 Å
検出器	タイプ: ADSC QUANTUM 315r / 検出器: AREA DETECTOR / 日付: 2014年10月14日
放射	プロトコル: SINGLE WAVELENGTH / 単色(M)・ラウエ(L): M / 散乱光タイプ: x-ray
放射波長	波長: 1 Å / 相対比: 1
反射	解像度: 2.93→50.076 Å / Num. obs: 36135 / % possible obs: 99.9 % / 冗長度: 2.9 % / Net I/σ(I): 6.8

-
解析

ソフトウェア

名称	バージョン	分類
PHENIX	(dev_2650: ???)	精密化
xia2		データ削減
xia2		データスケーリング
PHASER		位相決定

精密化

解像度: 2.932→50.076 Å / SU ML: 0.35 / 交差検証法: FREE R-VALUE / σ(F): 1.35 / 位相誤差: 23.79

	R_factor	反射数	%反射
R_free	0.2401	2007	5.55 %
R_work	0.1966	-	-
obs	0.199	36135	98.35 %

溶媒の処理

減衰半径: 0.9 Å / VDWプローブ半径: 1.11 Å

精密化ステップ

サイクル: LAST / 解像度: 2.932→50.076 Å

	タンパク質	核酸	リガンド	溶媒	全体
原子数	11976	0	200	17	12193

拘束条件

Refine-ID	タイプ	Dev ideal	数
X-RAY DIFFRACTION	f_bond_d	0.002	12409
X-RAY DIFFRACTION	f_angle_d	0.468	16763
X-RAY DIFFRACTION	f_dihedral_angle_d	9.661	7299
X-RAY DIFFRACTION	f_chiral_restr	0.033	1825
X-RAY DIFFRACTION	f_plane_restr	0.002	2175

LS精密化シェル

解像度 (Å)	R_factor R_free	Num. reflection R_free	R_factor R_work	Num. reflection R_work	Refine-ID	% reflection obs (%)
2.9317-3.005	0.3073	120	0.2944	1925	X-RAY DIFFRACTION	79
3.005-3.0862	0.3573	145	0.286	2443	X-RAY DIFFRACTION	100
3.0862-3.177	0.322	141	0.2754	2461	X-RAY DIFFRACTION	100
3.177-3.2796	0.2746	140	0.2606	2464	X-RAY DIFFRACTION	100
3.2796-3.3967	0.2733	148	0.2458	2435	X-RAY DIFFRACTION	100
3.3967-3.5327	0.2958	145	0.2185	2481	X-RAY DIFFRACTION	100
3.5327-3.6934	0.2143	141	0.203	2468	X-RAY DIFFRACTION	100
3.6934-3.8881	0.2564	157	0.2	2477	X-RAY DIFFRACTION	100
3.8881-4.1316	0.2348	141	0.1803	2472	X-RAY DIFFRACTION	100
4.1316-4.4504	0.2062	141	0.1625	2475	X-RAY DIFFRACTION	100
4.4504-4.8979	0.2185	148	0.1599	2479	X-RAY DIFFRACTION	100
4.8979-5.6059	0.23	146	0.1719	2491	X-RAY DIFFRACTION	100
5.6059-7.0597	0.2234	144	0.1938	2507	X-RAY DIFFRACTION	100
7.0597-50.0834	0.1796	150	0.1522	2550	X-RAY DIFFRACTION	99

精密化 TLS

手法: refined / Refine-ID: X-RAY DIFFRACTION

ID	L11 (°²)	L12 (°²)	L13 (°²)	L22 (°²)	L23 (°²)	L33 (°²)	S11 (Å °)	S12 (Å °)	S13 (Å °)	S21 (Å °)	S22 (Å °)	S23 (Å °)	S31 (Å °)	S32 (Å °)	S33 (Å °)	T11 (Å²)	T12 (Å²)	T13 (Å²)	T22 (Å²)	T23 (Å²)	T33 (Å²)	Origin x (Å)	Origin y (Å)	Origin z (Å)
1	4.4019	0.6274	-1.5379	2.5799	-1.5547	8.0357	-0.0646	0.4388	0.3358	-0.3721	0.0218	0.0007	-0.1424	0.3285	0.0635	0.6698	0.0337	0.0679	0.4436	0.058	0.3196	-22.2621	30.9322	-56.7171
2	4.511	0.5428	-0.5486	2.0572	-0.6452	3.4336	-0.1399	0.7634	0.3885	-0.5605	0.2134	0.2574	-0.0434	-0.3372	-0.0458	0.6867	-0.0037	-0.0162	0.4797	0.1275	0.3021	-41.3017	26.9232	-48.8885
3	5.5775	0.3583	1.1559	6.9311	-5.4627	8.872	0.0327	-0.1266	-0.197	-0.4985	-0.2696	-0.3107	0.623	0.3485	0.1519	0.33	-0.0162	-0.0056	0.3074	0.024	0.215	-23.9664	15.1264	-12.6633
4	5.6328	-0.9086	0.5298	3.3164	1.9496	3.8013	-0.2222	-0.1816	-0.3238	0.5426	0.2871	-0.0507	-0.1433	0.6694	-0.0321	0.4085	-0.0323	0.0573	0.4162	0.0046	0.1881	-15.8481	17.1403	-15.2937
5	9.0431	0.0744	1.5241	0.2092	-0.6708	2.9364	0.3183	-0.4551	-0.271	-0.3119	-0.1284	-0.1116	-0.1167	-0.6957	-0.1939	0.3945	0.0111	0.0199	0.2353	0.039	0.2893	-39.6613	19.677	-23.4241
6	1.4306	-0.8734	-0.996	3.0008	-0.1711	4.5304	0.4461	-0.1542	0.1579	-0.6336	-0.3564	0.064	-1.5825	0.4457	0.0394	0.6304	0.0344	0.0102	0.1458	0.0583	0.4077	-28.9447	24.8762	-28.3027
7	8.3571	0.5026	3.6054	1.7996	0.665	2.4882	0.4878	-0.3949	-0.931	-0.0121	-0.0817	0.1227	0.429	-0.2091	-0.3985	0.4462	-0.0086	0.028	0.3413	0.0118	0.2659	-39.2647	13.713	-30.9632
8	5.152	1.5746	0.9324	4.8703	1.7436	4.7962	-0.1233	0.3985	-0.0843	-0.9735	0.5116	0.3699	-0.1344	-0.4411	-0.3749	0.5702	-0.0261	-0.0708	0.4068	0.119	0.3132	-44.7192	20.928	-37.8645
9	9.2069	3.9799	1.1287	6.1609	1.666	3.2678	-0.1831	0.4779	0.9097	0.0298	0.4137	-0.1074	-1.2241	-0.5631	-0.2057	0.7491	0.2182	0.0171	0.4332	0.1292	0.4542	-47.3716	30.6626	-37.444
10	3.6615	4.045	2.7641	5.7954	4.4849	4.9771	0.1738	-0.0743	-0.4646	-0.3984	0.1605	-0.2299	0.584	-0.3036	-0.3395	0.6454	0.0381	-0.1206	0.2948	0.0363	0.4206	-55.3919	6.2748	-16.6391
11	6.1392	2.3292	-1.2229	9.3586	0.4892	2.3263	-0.0397	0.6564	0.4725	-0.4145	-0.3479	0.6538	-0.7352	-0.568	0.2806	0.5515	0.0629	0.083	0.2807	-0.0799	0.4247	-37.7683	25.9076	-7.0962
12	6.115	1.0634	0.164	1.1405	-0.8353	2.9863	-0.0062	-0.0035	-0.3741	-0.3249	0.0926	-0.2048	0.2133	0.1139	-0.0395	0.4982	0.1317	0.013	0.1701	-0.0837	0.3985	-45.4568	13.1843	-2.7067
13	2.9485	-0.5526	-0.6727	5.1887	-0.5499	4.3732	0.2476	-0.5225	0.4199	-0.526	0.0553	-0.1464	-0.5952	0.1924	-0.327	0.3801	0.0794	-0.0269	0.252	-0.0617	0.3082	-40.5682	24.3415	6.2216
14	2.3272	-0.7877	-0.8576	3.4315	0.5303	5.3466	0.7738	-0.9628	-0.1244	0.6101	-0.3642	1.7961	0.2003	-1.4239	-0.2997	0.6331	-0.291	0.2086	1.2239	0.267	1.0503	-70.4748	6.2657	28.3929
15	9.6219	0.1583	-1.1162	2.1902	-1.455	8.4095	-0.4883	0.1106	0.7957	0.1995	-0.2637	1.114	-0.7076	-1.1568	0.4707	0.3671	0.2369	0.2716	1.8898	0.4192	1.7755	-78.1277	11.6838	25.5684
16	1.6116	0.8302	2.1972	8.5711	2.7161	3.6611	0.108	-0.3669	-0.4705	0.4014	0.3426	0.6993	-0.0023	-1.2272	-0.2484	0.2757	0.0503	0.0549	0.7341	0.1573	0.4844	-60.8515	14.3788	24.8375
17	5.3917	4.3938	1.9357	9.6197	0.4269	5.8419	0.205	-0.5466	-0.3284	0.7876	0.0236	-0.1166	-0.273	0.5408	-0.1719	0.477	0.1404	-0.0968	0.6019	-0.0647	0.3626	-41.4407	18.9317	28.987
18	3.1025	2.5177	1.1785	6.05	0.4424	1.9725	0.0744	-0.7735	0.1203	0.2619	-0.0136	0.3277	0.0274	-0.4719	-0.0257	0.2925	0.1464	0.0021	0.5213	-0.0105	0.2585	-51.6135	19.8771	19.6271
19	3.926	3.5623	1.7521	7.8356	1.056	3.8223	-0.0745	-0.462	-0.3284	-0.0525	0.1371	-0.2251	0.0561	0.1686	-0.1306	0.2458	0.1279	0.0495	0.3501	0.0294	0.242	-40.0296	17.1164	14.4022
20	3.7594	0.2335	-2.3846	5.9828	-2.2141	8.0624	0.0031	0.9114	0.2138	-0.1528	0.4589	0.4376	-0.3893	0.3313	-0.4218	0.3095	-0.0964	-0.0329	0.6418	0.1204	0.2944	32.1806	46.4256	-36.0534
21	5.1595	0.4163	1.4107	3.4384	-0.5665	5.0458	0.0101	1.0379	0.6404	0.2587	0.257	0.2326	-0.6149	0.3016	-0.2947	0.413	-0.0816	0.0348	0.493	0.1682	0.3286	28.4582	49.6309	-32.7205
22	2.3455	3.1831	-1.6859	2.0035	-2.0157	1.2265	0.2367	-0.2296	-0.0018	-0.1906	-0.5779	-1.2276	-0.2099	-0.0746	0.4838	0.6019	-0.143	0.1078	1.2464	0.2821	0.4537	3.6647	43.7755	-41.9298
23	7.9843	0.511	0.0567	2.2422	1.1996	2.9047	-0.0274	1.1257	0.9134	-0.0795	0.1059	0.3564	-0.126	-0.1925	-0.0777	0.3337	-0.0999	-0.014	0.3945	0.212	0.466	9.0738	44.5988	-28.6945
24	4.5754	0.4539	0.3215	0.1574	0.7311	4.4583	0.0981	0.584	0.3595	-0.2961	0.1862	0.16	0.1382	-0.1352	-0.268	0.3188	-0.1259	0.0583	0.3017	0.1326	0.4067	2.8189	36.2552	-23.4733
25	7.5416	-0.2649	-0.1247	3.6871	-4.092	4.5686	-0.3671	-0.5902	-1.1393	0.6053	1.1048	0.3854	0.0228	0.2337	-0.4541	0.809	0.0679	0.06	0.4752	0.0325	0.3715	20.3281	29.1656	12.0551
26	7.5849	-0.1904	0.5849	5.9313	-1.3615	7.8052	-0.201	-0.4973	-0.4368	0.1246	0.0654	-0.334	0.4847	0.7753	0.1479	0.5229	0.0318	-0.0019	0.2792	-0.0847	0.3304	21.6416	30.5008	4.7251
27	6.0539	2.2569	0.4489	7.8839	-1.5552	8.6197	-0.2474	-1.5922	-0.4325	0.2947	-0.8913	0.4697	0.0537	-0.4205	0.8176	0.6446	-0.0128	0.2869	0.6067	-0.0665	0.5538	-4.8161	38.1366	-1.673
28	4.8893	0.6783	1.446	1.2358	0.4378	4.137	0.0897	-0.2081	0.5289	0.232	-0.0832	0.2016	0.0101	-0.2341	-0.0476	0.5095	-0.0306	0.0857	0.1362	-0.0464	0.4134	4.0716	37.0112	-10.7053
29	8.573	1.068	1.7361	4.1159	2.9815	8.8961	-0.298	0.8478	-0.5082	-0.507	0.4456	0.6719	0.9553	1.1046	-0.1501	0.7249	0.1698	-0.1019	0.3703	0.0586	0.3765	-13.9759	55.0719	5.5991
30	0.4874	-1.2584	-0.5013	5.3386	-1.2112	5.2193	0.7841	0.3679	-0.7011	-1.4502	0.0123	0.9553	1.0637	-0.6774	-0.6686	0.633	-0.0026	-0.1739	0.4228	-0.0521	0.4207	-15.1402	52.613	8.2966
31	7.9869	-3.2681	-3.2254	8.0648	2.8732	9.5752	-0.2491	1.2947	0.0445	-0.5213	0.2132	-0.4618	0.5358	0.096	0.1036	0.2248	-0.0366	0.0944	0.4757	-0.0286	0.3241	10.6942	45.1068	16.7562
32	5.0658	4.6272	-4.8933	5.3627	-4.5919	6.27	0.7553	0.2817	-0.3513	0.5591	-0.6155	0.0242	-0.2473	-0.0257	-0.0781	0.3179	-0.0323	0.019	0.2526	-0.0224	0.3278	-7.9201	53.819	21.3398
33	3.1759	-0.8073	1.1171	3.5284	0.0438	2.246	0.5913	-0.1682	-0.3131	-0.7946	-0.0886	0.217	0.854	-0.1964	-0.2973	0.3112	0.018	-0.0099	0.2484	-0.0036	0.26	0.6903	37.5611	20.6767
34	4.0072	0.3884	0.5911	5.3157	-1.0602	2.4215	-0.009	0.0902	0.2274	0.0941	0.1917	-0.2357	-0.2191	0.34	-0.2008	0.2963	-0.0078	0.0295	0.2832	-0.0318	0.1517	5.9159	46.8959	30.3628
35	4.9567	-4.6688	-4.0728	5.0902	4.12	3.5308	-0.9449	-1.3676	0.3945	0.4971	1.3796	0.3018	0.5074	0.7182	-0.0645	0.5264	-0.0429	0.0414	1.1469	0.0116	0.6125	-22.7606	56.6053	56.2001
36	7.1591	3.2044	-7.1523	2.6326	-2.2023	8.453	0.1571	0.2357	-0.1315	-0.1198	0.0103	0.5782	0.1664	-1.3624	-0.1152	0.3374	0.0223	0.0726	0.5456	-0.1151	0.5682	-28.113	55.5634	46.5547
37	7.5538	3.7746	-3.6884	2.5472	-2.3334	6.6412	0.2975	-0.0743	1.1031	1.0432	0.0884	0.0827	-1.0602	-1.0185	-0.1174	0.8445	0.0481	0.0041	0.7615	-0.1752	0.9207	-27.1849	65.1176	53.0511
38	5.3903	-6.1458	4.9151	9.2175	-6.6421	9.0814	-0.2921	-1.6558	-0.1327	0.4195	0.8385	0.4671	-0.4909	-0.8076	-0.5396	0.2451	-0.0695	0.0533	0.4666	0.0058	0.509	-13.2893	53.5517	49.5498
39	8.8632	-0.0882	4.5735	6.3144	-1.425	3.1031	-0.2561	-0.576	-0.0518	0.2929	0.1692	0.4104	-0.0991	-1.0052	-0.0431	0.4387	-0.0265	0.1087	0.4374	0.0742	0.3705	0.0392	38.3467	51.2863
40	9.0825	0.1732	0.822	9.9255	-5.0825	6.3329	-0.4462	-0.1923	-0.4873	-0.112	0.5866	-0.4189	0.184	-1.334	-0.0602	0.3477	-0.0567	-0.0075	0.3032	-0.061	0.2495	-14.4741	48.6831	40.5924
41	7.6517	-3.5617	2.1948	4.2137	-1.6537	2.5861	0.1789	-0.4626	0.0268	-0.1581	0.0548	0.0795	-0.0585	0.068	-0.2034	0.2626	0.0096	0.0133	0.2341	-0.0656	0.294	-0.5006	52.3926	45.9155
42	6.9379	2.1985	3.2831	3.9264	0.0458	5.1844	0.2807	-0.1501	-0.4319	0.0846	-0.0889	0.2562	0.5843	0.0121	-0.2161	0.2572	-0.0271	0.0681	0.2393	-0.064	0.2761	1.7507	42.1899	37.564
43	7.398	-0.1534	1.8859	2.3824	2.1365	7.0651	1.2163	0.2025	-0.7364	0.1017	-0.1115	0.5096	0.8686	0.8109	-0.5295	0.4809	0.0488	-0.0464	0.1915	0.1744	0.4308	3.6711	35.1112	38.9108

精密化 TLSグループ

ID	Refine-ID	Refine TLS-ID	Selection details
1	X-RAY DIFFRACTION	1	chain 'A' and (resid 5 through 111 )
2	X-RAY DIFFRACTION	2	chain 'A' and (resid 112 through 192 )
3	X-RAY DIFFRACTION	3	chain 'B' and (resid 4 through 24 )
4	X-RAY DIFFRACTION	4	chain 'B' and (resid 25 through 51 )
5	X-RAY DIFFRACTION	5	chain 'B' and (resid 52 through 91 )
6	X-RAY DIFFRACTION	6	chain 'B' and (resid 92 through 111 )
7	X-RAY DIFFRACTION	7	chain 'B' and (resid 112 through 139 )
8	X-RAY DIFFRACTION	8	chain 'B' and (resid 140 through 168 )
9	X-RAY DIFFRACTION	9	chain 'B' and (resid 169 through 192 )
10	X-RAY DIFFRACTION	10	chain 'C' and (resid 5 through 70 )
11	X-RAY DIFFRACTION	11	chain 'C' and (resid 71 through 91 )
12	X-RAY DIFFRACTION	12	chain 'C' and (resid 92 through 139 )
13	X-RAY DIFFRACTION	13	chain 'C' and (resid 140 through 192 )
14	X-RAY DIFFRACTION	14	chain 'D' and (resid 4 through 44 )
15	X-RAY DIFFRACTION	15	chain 'D' and (resid 45 through 51 )
16	X-RAY DIFFRACTION	16	chain 'D' and (resid 52 through 71 )
17	X-RAY DIFFRACTION	17	chain 'D' and (resid 72 through 91 )
18	X-RAY DIFFRACTION	18	chain 'D' and (resid 92 through 147 )
19	X-RAY DIFFRACTION	19	chain 'D' and (resid 148 through 192 )
20	X-RAY DIFFRACTION	20	chain 'E' and (resid 5 through 38 )
21	X-RAY DIFFRACTION	21	chain 'E' and (resid 39 through 70 )
22	X-RAY DIFFRACTION	22	chain 'E' and (resid 71 through 78 )
23	X-RAY DIFFRACTION	23	chain 'E' and (resid 79 through 147 )
24	X-RAY DIFFRACTION	24	chain 'E' and (resid 148 through 192 )
25	X-RAY DIFFRACTION	25	chain 'F' and (resid 2 through 24 )
26	X-RAY DIFFRACTION	26	chain 'F' and (resid 25 through 71 )
27	X-RAY DIFFRACTION	27	chain 'F' and (resid 72 through 91 )
28	X-RAY DIFFRACTION	28	chain 'F' and (resid 92 through 192 )
29	X-RAY DIFFRACTION	29	chain 'G' and (resid 5 through 30 )
30	X-RAY DIFFRACTION	30	chain 'G' and (resid 31 through 71 )
31	X-RAY DIFFRACTION	31	chain 'G' and (resid 72 through 91 )
32	X-RAY DIFFRACTION	32	chain 'G' and (resid 92 through 111 )
33	X-RAY DIFFRACTION	33	chain 'G' and (resid 112 through 147 )
34	X-RAY DIFFRACTION	34	chain 'G' and (resid 148 through 192 )
35	X-RAY DIFFRACTION	35	chain 'H' and (resid 4 through 24 )
36	X-RAY DIFFRACTION	36	chain 'H' and (resid 25 through 38 )
37	X-RAY DIFFRACTION	37	chain 'H' and (resid 39 through 51 )
38	X-RAY DIFFRACTION	38	chain 'H' and (resid 52 through 71 )
39	X-RAY DIFFRACTION	39	chain 'H' and (resid 72 through 91 )
40	X-RAY DIFFRACTION	40	chain 'H' and (resid 92 through 111 )
41	X-RAY DIFFRACTION	41	chain 'H' and (resid 112 through 138 )
42	X-RAY DIFFRACTION	42	chain 'H' and (resid 139 through 174 )
43	X-RAY DIFFRACTION	43	chain 'H' and (resid 175 through 192 )

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EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

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関連情報:EMDBヘッダ

外部リンク:wwPDBはEMDBデータモデルのバージョン3へ移行します

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新型コロナ情報

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万見(Yorodumi)は、EMDB/PDB/SASBDBなどの構造データを閲覧するためのページです。
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