登録情報 データベース : PDB / ID : 5ocq 構造の表示 ダウンロードとリンクタイトル Crystal structure of the complex of the kappa-carrageenase from Pseudoalteromonas carrageenovora with an oligotetrasaccharide of kappa-carrageenan 要素Kappa-carrageenase 詳細 キーワード HYDROLASE / Glycoside hydrolase / kappa-carrageenase / beta jellyroll / marine carbohydrase機能・相同性 機能・相同性情報分子機能 ドメイン・相同性 構成要素
kappa-carrageenase / kappa-carrageenase activity / carbohydrate metabolic process / periplasmic space 類似検索 - 分子機能 Glycoside hydrolase, family 16, active site / Glycosyl hydrolases family 16 active sites. / : / Glycosyl hydrolases family 16 / Glycoside hydrolase family 16 / Glycosyl hydrolases family 16 (GH16) domain profile. / Bacterial Ig-like domain (group 2) / Bacterial Ig-like domain 2 / Invasin/intimin cell-adhesion fragments / Bacterial Ig-like domain, group 2 ... Glycoside hydrolase, family 16, active site / Glycosyl hydrolases family 16 active sites. / : / Glycosyl hydrolases family 16 / Glycoside hydrolase family 16 / Glycosyl hydrolases family 16 (GH16) domain profile. / Bacterial Ig-like domain (group 2) / Bacterial Ig-like domain 2 / Invasin/intimin cell-adhesion fragments / Bacterial Ig-like domain, group 2 / Jelly Rolls - #200 / Concanavalin A-like lectin/glucanase domain superfamily / Jelly Rolls / Sandwich / Mainly Beta 類似検索 - ドメイン・相同性生物種 Pseudoalteromonas carrageenovora (バクテリア)手法 X線回折 / シンクロトロン / 分子置換 / 解像度 : 1.7 Å 詳細データ登録者 Czjzek, M. / Leroux, C. / Bernard, T. / Matard-Mann, M. / Jeudy, A. / Michel, G. 引用ジャーナル : J. Biol. Chem. / 年 : 2017タイトル : Structural insights into marine carbohydrate degradation by family GH16 kappa-carrageenases.著者 : Matard-Mann, M. / Bernard, T. / Leroux, C. / Barbeyron, T. / Larocque, R. / Prechoux, A. / Jeudy, A. / Jam, M. / Nyvall Collen, P. / Michel, G. / Czjzek, M. 履歴 登録 2017年7月3日 登録サイト : PDBE / 処理サイト : PDBE改定 1.0 2017年10月18日 Provider : repository / タイプ : Initial release改定 1.1 2017年12月6日 Group : Database references / カテゴリ : citation / citation_authorItem : _citation.country / _citation.journal_abbrev ... _citation.country / _citation.journal_abbrev / _citation.journal_id_ASTM / _citation.journal_id_CSD / _citation.journal_id_ISSN / _citation.pdbx_database_id_DOI / _citation.pdbx_database_id_PubMed / _citation.title / _citation.year 改定 1.2 2017年12月13日 Group : Database references / カテゴリ : citation / citation_authorItem : _citation.journal_volume / _citation.page_first ... _citation.journal_volume / _citation.page_first / _citation.page_last / _citation_author.name 改定 1.3 2020年7月29日 Group : Data collection / Derived calculationsカテゴリ : chem_comp / diffrn_radiation_wavelength ... chem_comp / diffrn_radiation_wavelength / pdbx_chem_comp_identifier / struct_site / struct_site_gen Item : _chem_comp.mon_nstd_flag / _chem_comp.type / 解説 : Carbohydrate remediation / Provider : repository / タイプ : Remediation改定 1.4 2024年1月17日 Group : Data collection / Database references ... Data collection / Database references / Derived calculations / Refinement description / Structure summary カテゴリ : chem_comp / chem_comp_atom ... chem_comp / chem_comp_atom / chem_comp_bond / database_2 / pdbx_initial_refinement_model / struct_conn Item : _chem_comp.pdbx_synonyms / _database_2.pdbx_DOI ... _chem_comp.pdbx_synonyms / _database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession / _struct_conn.pdbx_leaving_atom_flag 改定 2.0 2024年11月6日 Group : Atomic model / Data collection ... Atomic model / Data collection / Derived calculations / Structure summary カテゴリ : atom_site / chem_comp ... atom_site / chem_comp / chem_comp_atom / chem_comp_bond / entity / pdbx_branch_scheme / pdbx_entity_branch / pdbx_entity_branch_descriptor / pdbx_entity_branch_link / pdbx_entity_branch_list / pdbx_entity_nonpoly / pdbx_entry_details / pdbx_modification_feature / pdbx_nonpoly_scheme / pdbx_struct_assembly_gen / struct_asym / struct_conn Item : _atom_site.B_iso_or_equiv / _atom_site.Cartn_x ... _atom_site.B_iso_or_equiv / _atom_site.Cartn_x / _atom_site.Cartn_y / _atom_site.Cartn_z / _atom_site.auth_asym_id / _atom_site.auth_atom_id / _atom_site.auth_comp_id / _atom_site.auth_seq_id / _atom_site.label_asym_id / _atom_site.label_atom_id / _atom_site.label_comp_id / _atom_site.label_entity_id / _atom_site.type_symbol / _chem_comp.name / _chem_comp.type / _chem_comp_atom.atom_id / _chem_comp_bond.atom_id_2 / _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list / _struct_conn.pdbx_dist_value / _struct_conn.pdbx_leaving_atom_flag / _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id / _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id / _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id / _struct_conn.ptnr1_label_asym_id / _struct_conn.ptnr1_label_atom_id / _struct_conn.ptnr1_label_comp_id / _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id / _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id / _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id / _struct_conn.ptnr2_label_asym_id / _struct_conn.ptnr2_label_atom_id / _struct_conn.ptnr2_label_comp_id
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