登録情報 | データベース: PDB / ID: 5n4s |
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タイトル | VIM-2 metallo-beta-lactamase in complex with ((S)-3-mercapto-2-methylpropanoyl)-D-tryptophan (Compound 3) |
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要素 | Beta-lactamase VIM-2 |
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キーワード | HYDROLASE / metallo-beta-lactamase / inhibitor / complex / antibiotic resistance |
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機能・相同性 | 機能・相同性情報
antibiotic catabolic process / beta-lactamase / hydrolase activity / metal ion binding類似検索 - 分子機能 : / : / Metallo-beta-lactamase superfamily / Ribonuclease Z/Hydroxyacylglutathione hydrolase-like / Metallo-beta-lactamase; Chain A / Metallo-beta-lactamase superfamily / Metallo-beta-lactamase / Ribonuclease Z/Hydroxyacylglutathione hydrolase-like / 4-Layer Sandwich / Alpha Beta類似検索 - ドメイン・相同性 FORMIC ACID / Chem-R38 / Metallo-beta-lactamase type 2類似検索 - 構成要素 |
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生物種 | ![](img/tx_bacteria.gif) Pseudomonas aeruginosa (緑膿菌) |
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手法 | X線回折 / シンクロトロン / 分子置換 / 解像度: 1.2 Å |
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データ登録者 | Li, G.-B. / Brem, J. / McDonough, M.A. / Schofield, C.J. |
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引用 | ジャーナル: Chem. Commun. (Camb.) / 年: 2017 タイトル: Crystallographic analyses of isoquinoline complexes reveal a new mode of metallo-beta-lactamase inhibition. 著者: Li, G.B. / Brem, J. / Lesniak, R. / Abboud, M.I. / Lohans, C.T. / Clifton, I.J. / Yang, S.Y. / Jimenez-Castellanos, J.C. / Avison, M.B. / Spencer, J. / McDonough, M.A. / Schofield, C.J. |
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履歴 | 登録 | 2017年2月11日 | 登録サイト: PDBE / 処理サイト: PDBE |
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改定 1.0 | 2017年5月17日 | Provider: repository / タイプ: Initial release |
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改定 1.1 | 2017年6月7日 | Group: Database references |
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改定 1.2 | 2019年10月16日 | Group: Data collection / カテゴリ: reflns_shell Item: _reflns_shell.Rmerge_I_obs / _reflns_shell.pdbx_CC_half |
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改定 1.3 | 2024年1月17日 | Group: Data collection / Database references ...Data collection / Database references / Derived calculations / Refinement description カテゴリ: chem_comp_atom / chem_comp_bond ...chem_comp_atom / chem_comp_bond / database_2 / diffrn_radiation_wavelength / pdbx_initial_refinement_model / pdbx_struct_conn_angle / struct_conn Item: _database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession ..._database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession / _diffrn_radiation_wavelength.wavelength / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_auth_comp_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_auth_seq_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_asym_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_atom_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_comp_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_seq_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_symmetry / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_auth_comp_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_auth_seq_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_asym_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_atom_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_comp_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_seq_id / _pdbx_struct_conn_angle.value / _struct_conn.pdbx_dist_value / _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id / _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id / _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id / _struct_conn.ptnr1_label_asym_id / _struct_conn.ptnr1_label_atom_id / _struct_conn.ptnr1_label_comp_id / _struct_conn.ptnr1_label_seq_id / _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id / _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id / _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id / _struct_conn.ptnr2_label_asym_id / _struct_conn.ptnr2_label_atom_id / _struct_conn.ptnr2_label_comp_id / _struct_conn.ptnr2_symmetry |
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