PDB-5mkb: Maltodextrin binding protein MalE1 from L. casei BL23 without ligand

IDまたはキーワード:

登録情報

データベース: PDB / ID: 5mkb

タイトル

Maltodextrin binding protein MalE1 from L. casei BL23 without ligand

要素

MalE1

キーワード

SUGAR BINDING PROTEIN / carbohydrate binding protein / lactobacillus casei

機能・相同性

Bacterial extracellular solute-binding protein / maltose binding / maltose transport / maltodextrin transmembrane transport / ATP-binding cassette (ABC) transporter complex, substrate-binding subunit-containing / Bacterial extracellular solute-binding protein / Prokaryotic membrane lipoprotein lipid attachment site profile. / MalE1

機能・相同性情報

生物種

Lactobacillus casei (バクテリア)

手法

X線回折 /

シンクロトロン /

分子置換 / 解像度: 1.698 Å

データ登録者

Homburg, C. / Bommer, M. / Wuttge, S. / Hobe, C. / Beck, S. / Dobbek, H. / Deutscher, J. / Licht, A. / Schneider, E.

資金援助

ドイツ, 1件

引用

ジャーナル: Mol. Microbiol. / 年: 2017
タイトル: Inducer exclusion in Firmicutes: insights into the regulation of a carbohydrate ATP binding cassette transporter from Lactobacillus casei BL23 by the signal transducing protein P-Ser46-HPr.
著者: Homburg, C. / Bommer, M. / Wuttge, S. / Hobe, C. / Beck, S. / Dobbek, H. / Deutscher, J. / Licht, A. / Schneider, E.

履歴

登録	2016年12月3日	登録サイト: PDBE / 処理サイト: PDBE
改定 1.0	2017年7月5日	Provider: repository / タイプ: Initial release
改定 1.1	2024年1月17日	Group: Author supporting evidence / Data collection ...Author supporting evidence / Data collection / Database references / Refinement description カテゴリ: chem_comp_atom / chem_comp_bond ...chem_comp_atom / chem_comp_bond / database_2 / pdbx_audit_support / pdbx_initial_refinement_model Item: _database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession / _pdbx_audit_support.funding_organization

構造ビューア	分子: MolmilJmol/JSmol

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ダウンロード

PDBx/mmCIF形式	5mkb.cif.gz	1.1 MB	表示	PDBx/mmCIF形式
PDB形式	pdb5mkb.ent.gz	943.9 KB	表示	PDB形式
PDBx/mmJSON形式	5mkb.json.gz		ツリー表示	PDBx/mmJSON形式
その他	その他のダウンロード

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検証レポート

文書・要旨	5mkb_validation.pdf.gz	495.2 KB	表示	wwPDB検証レポート
文書・詳細版	5mkb_full_validation.pdf.gz	539.5 KB	表示
XML形式データ	5mkb_validation.xml.gz	125.9 KB	表示
CIF形式データ	5mkb_validation.cif.gz	181.1 KB	表示
アーカイブディレクトリ	https://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/mk/5mkb ftp://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/mk/5mkb	HTTPS FTP

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関連構造データ

関連構造データ	5m28SC 5mk9C 5mkaC 5mttC 5mtuC S: 精密化の開始モデル C: 同じ文献を引用 (文献)
類似構造データ	5q1n-d 5q4u-d 5q3o-d 5q8t-d 5q5c-d 1ziu-d 5q71-d 5q5j-d 1zkb-d 2vno-d Omokage検索で類似形状データを探す (詳細) Omokage検索で類似形状データを探す (詳細) Omokage検索で類似形状データを探す (詳細) Omokage検索で類似形状データを探す (詳細) Omokage検索で類似形状データを探す (詳細) Omokage検索で類似形状データを探す (詳細) Omokage検索で類似形状データを探す (詳細) Omokage検索で類似形状データを探す (詳細) Omokage検索で類似形状データを探す (詳細) 類似検索 - 機能・相同性F&H 検索類似検索 - 機能F&H 検索類似検索 - 相同性F&H 検索

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リンク

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「今月の分子」の関連する項目

#261 - 2021年9月
DNA配列ナノポア (DNA-Sequencing Nanopores)
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#205 - 2017年1月
核膜孔複合体 (Nuclear Pore Complex)
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電位依存性ナトリウムチャネル (Voltage-gated Sodium Channels)
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ペニシリン結合タンパク質 (Penicillin-binding Proteins)
類似性 (1)
#95 - 2007年11月
多剤耐性輸送体 (Multidrug Resistance Transporters)
類似性 (1)

登録構造単位

A: MalE1

B: MalE1

C: MalE1

D: MalE1

E: MalE1

F: MalE1

G: MalE1

H: MalE1

324 kDa, 8 ポリマー
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1

A: MalE1

登録者が定義した集合体
40.5 kDa, 1 ポリマー
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2

B: MalE1

登録者が定義した集合体
40.5 kDa, 1 ポリマー
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3

C: MalE1

登録者が定義した集合体
40.5 kDa, 1 ポリマー
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4

D: MalE1

登録者が定義した集合体
40.5 kDa, 1 ポリマー
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5

E: MalE1

登録者が定義した集合体
40.5 kDa, 1 ポリマー
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6

F: MalE1

登録者が定義した集合体
40.5 kDa, 1 ポリマー
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7

G: MalE1

登録者が定義した集合体
40.5 kDa, 1 ポリマー
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8

H: MalE1

登録者が定義した集合体
40.5 kDa, 1 ポリマー
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9

登録構造と同一
ソフトウェアが定義した集合体

単位格子

Length a, b, c (Å)	41.036, 124.945, 143.739
Angle α, β, γ (deg.)	74.51, 89.61, 89.86
Int Tables number	1
Space group name H-M	P1

#1: タンパク質	MalE1 分子量: 40504.734 Da / 分子数: 8 / 由来タイプ: 組換発現由来: (組換発現) Lactobacillus casei (バクテリア) 遺伝子: malE1 / 発現宿主: Escherichia coli BL21(DE3) (大腸菌) / 参照: UniProt: B0L7B0
#2: 水	ChemComp-HOH / water 分子量: 18.015 Da / 分子数: 2315 / 由来タイプ: 天然 / 式: H₂O

-
実験

実験	手法: X線回折 / 使用した結晶の数: 1

-
試料調製

結晶	マシュー密度: 2.23 Å³/Da / 溶媒含有率: 45 %
結晶化	温度: 291 K / 手法: 蒸気拡散法, シッティングドロップ法 / pH: 7 詳細: 0.1 mM Na-Hepes, pH 7.0, 20-25% Jeffamine ED2003, pH 7.0

-
データ収集

回折	平均測定温度: 100 K
放射光源	由来: シンクロトロン / サイト: BESSY / ビームライン: 14.1 / 波長: 0.91841 Å
検出器	タイプ: DECTRIS PILATUS 6M / 検出器: PIXEL / 日付: 2014年12月17日
放射	モノクロメーター: Si-111 crystal / プロトコル: SINGLE WAVELENGTH / 単色(M)・ラウエ(L): M / 散乱光タイプ: x-ray
放射波長	波長: 0.91841 Å / 相対比: 1
反射	解像度: 1.698→46.171 Å / Num. obs: 294468 / % possible obs: 96.91 % / Observed criterion σ(I): 2 / 冗長度: 3.5 % / B_iso Wilson estimate: 15.4 Å² / CC_1/2: 0.999 / R_merge(I) obs: 0.0678 / Net I/σ(I): 13.21
反射シェル	解像度: 1.698→1.76 Å / 冗長度: 3.5 % / R_merge(I) obs: 0.607 / Mean I/σ(I) obs: 1.9 / CC_1/2: 0.663 / % possible all: 93.21

-
解析

ソフトウェア

名称	バージョン	分類
PHENIX	1.9_1690	精密化
XDS	VERSION November 3, 2014	データ削減
XDS	VERSION November 3, 2014	データスケーリング
PHASER	2.5.6	位相決定

精密化

構造決定の手法:

分子置換
開始モデル: 5M28

5m28

解像度: 1.698→46.171 Å / 交差検証法: FREE R-VALUE / σ(F): 1.97 / 位相誤差: 24.22

	R_factor	反射数	%反射	Selection details
R_free	0.2179	15201	5.16 %	random selection
R_work	0.1782	-	-	-
obs	0.1814	294468	96.91 %	-

溶媒の処理

減衰半径: 0.9 Å / VDWプローブ半径: 1.11 Å

原子変位パラメータ

B_iso mean: 24.9 Å²

精密化ステップ

サイクル: LAST / 解像度: 1.698→46.171 Å

	タンパク質	核酸	リガンド	溶媒	全体
原子数	22424	0	0	2315	24739

拘束条件

Refine-ID	タイプ	Dev ideal	数
X-RAY DIFFRACTION	f_bond_d	0.003	22896
X-RAY DIFFRACTION	f_angle_d	0.795	31080
X-RAY DIFFRACTION	f_dihedral_angle_d	13.006	8232
X-RAY DIFFRACTION	f_chiral_restr	0.031	3504
X-RAY DIFFRACTION	f_plane_restr	0.004	4000

LS精密化シェル

解像度 (Å)	R_factor R_free	Num. reflection R_free	R_factor R_work	Num. reflection R_work	Refine-ID	% reflection obs (%)
1.6983-1.7276	0.3064	691	0.2704	13125	X-RAY DIFFRACTION	87
1.7276-1.759	0.3054	734	0.2655	13949	X-RAY DIFFRACTION	92
1.759-1.7929	0.3102	734	0.2537	13898	X-RAY DIFFRACTION	91
1.7929-1.8295	0.2988	741	0.2434	13877	X-RAY DIFFRACTION	92
1.8295-1.8692	0.2786	728	0.2293	14035	X-RAY DIFFRACTION	92
1.8692-1.9127	0.2694	728	0.23	13870	X-RAY DIFFRACTION	92
1.9127-1.9606	0.2617	737	0.2222	14045	X-RAY DIFFRACTION	92
1.9606-2.0136	0.2579	734	0.2047	13913	X-RAY DIFFRACTION	92
2.0136-2.0728	0.2398	737	0.2008	13991	X-RAY DIFFRACTION	92
2.0728-2.1397	0.2245	730	0.1947	14053	X-RAY DIFFRACTION	92
2.1397-2.2162	0.2242	737	0.1928	13981	X-RAY DIFFRACTION	93
2.2162-2.3049	0.2373	731	0.1902	14123	X-RAY DIFFRACTION	92
2.3049-2.4098	0.2332	748	0.1845	14115	X-RAY DIFFRACTION	93
2.4098-2.5369	0.2192	731	0.1771	14062	X-RAY DIFFRACTION	93
2.5369-2.6958	0.2017	738	0.1725	14018	X-RAY DIFFRACTION	93
2.6958-2.9039	0.2226	746	0.1782	14225	X-RAY DIFFRACTION	93
2.9039-3.1961	0.2035	743	0.1699	14163	X-RAY DIFFRACTION	93
3.1961-3.6584	0.2042	753	0.1566	14041	X-RAY DIFFRACTION	93
3.6584-4.6085	0.1721	737	0.1345	14025	X-RAY DIFFRACTION	92
4.6085-46.1881	0.1782	751	0.152	14243	X-RAY DIFFRACTION	94

精密化 TLS

手法: refined / Refine-ID: X-RAY DIFFRACTION

ID	L11 (°²)	L12 (°²)	L13 (°²)	L22 (°²)	L23 (°²)	L33 (°²)	S11 (Å °)	S12 (Å °)	S13 (Å °)	S21 (Å °)	S22 (Å °)	S23 (Å °)	S31 (Å °)	S32 (Å °)	S33 (Å °)	T11 (Å²)	T12 (Å²)	T13 (Å²)	T22 (Å²)	T23 (Å²)	T33 (Å²)	Origin x (Å)	Origin y (Å)	Origin z (Å)
1	1.9404	-0.1482	0.1088	0.7051	-0.4736	0.6062	-0.0483	0.1126	0.0081	-0.0783	-0.0442	0.0061	-0.0205	-0.0894	0.0182	0.165	0.0115	-0.0175	0.2637	0.1044	0.2609	-34.3425	179.5107	-56.5098
2	0.3824	0.0376	0.0863	0.4707	0.1198	0.2792	-0.0519	0.1208	0.1935	0.0543	0.0039	-0.0684	-0.0147	-0.0439	0.0236	0.126	-0.03	-0.0443	0.1452	0.0486	0.1509	-28.6605	168.9092	-48.596
3	0.5199	-0.035	0.1236	0.3529	0.0568	0.5289	-0.1022	0.0985	-0.0275	-0.113	0.0196	0.0231	0.0819	-0.0545	0.0189	0.1436	-0.0713	0.0173	0.1373	-0.0016	0.0791	-35.847	142.9293	-55.0782
4	0.2861	0.0709	-0.0752	0.5314	-0.0877	0.3177	-0.1058	0.1082	0.0651	-0.0566	0.0654	-0.029	0.0151	-0.0766	0.0194	0.0829	-0.046	-0.0062	0.1369	0.0259	0.0881	-31.0214	157.8027	-49.3734
5	1.3804	0.2275	-0.0054	1.0806	0.097	0.7744	0.0272	-0.1735	-0.11	0.0369	0.0023	-0.0147	0.095	0.0859	0.0034	0.1634	-0.0116	0.0487	0.2084	0.1184	0.2725	-52.8942	74.5388	-45.8662
6	0.4692	-0.1564	-0.2763	0.5602	0.1534	0.4295	0.0259	-0.1114	-0.0476	0.0085	-0.0048	0.0266	-0.0042	0.1132	-0.0127	0.0714	-0.0108	0.0377	0.1193	0.0057	0.1613	-47.3351	88.5592	-54.8678
7	0.6364	-0.0699	-0.2124	0.278	0.059	0.3878	-0.006	-0.0823	-0.0382	0.0984	-0.0131	0.1961	-0.0476	-0.004	-0.0177	0.1272	-0.0017	0.0711	0.1074	-0.0121	0.1748	-55.0904	112.7165	-48.6347
8	0.3784	0.1777	-0.0562	0.6812	0.0077	0.4505	0.0508	-0.1158	-0.0509	0.1009	-0.0096	0.0884	0.0618	0.001	0.0382	0.09	-0.0042	0.0336	0.1143	0.0453	0.2052	-54.7763	83.3659	-52.6838
9	0.2531	0.0649	0.0117	0.4008	0.0008	0.3367	0.0403	-0.0579	-0.0584	0.0723	-0.0375	0.0927	-0.0472	0.051	-0.019	0.085	-0.0172	0.0474	0.1004	-0.0099	0.1625	-46.7377	108.0018	-54.2267
10	1.62	-0.067	-0.223	0.8814	-0.2839	0.6027	-0.0498	-0.0544	-0.0874	-0.0093	0.0503	-0.0305	0.1046	-0.0528	-0.0031	0.239	0.0236	0.1074	0.3393	0.1371	0.3228	-33.9927	113.8392	-12.4707
11	0.5197	-0.1549	-0.2563	0.6963	0.0992	0.4642	-0.105	-0.0646	-0.1761	-0.0463	-0.0263	-0.1502	0.04	0.0003	0.0261	0.1701	0.0599	0.1009	0.1637	0.0533	0.1736	-26.7076	126.4373	-21.8955
12	0.3982	-0.0593	-0.0682	0.2987	0.1476	0.2984	-0.1951	-0.1691	0.0405	0.1497	0.0648	0.0493	-0.1202	-0.0261	-0.054	0.2452	0.1438	-0.0269	0.1929	-0.0367	0.1053	-36.0181	151.8453	-12.9898
13	0.5175	-0.047	-0.0347	0.4181	-0.0306	0.4186	-0.221	-0.2086	-0.1208	0.1372	0.0831	0.047	-0.0625	-0.0541	-0.0708	0.1319	0.1006	0.0416	0.1767	0.0173	0.1291	-30.8751	137.2175	-19.0298
14	1.6726	-0.094	-0.2273	0.9133	-0.1777	0.8233	-0.0015	-0.0997	-0.0015	0.0135	0.0344	-0.0432	-0.0247	0.0204	-0.0106	0.1268	-0.0205	0.0358	0.2091	0.0462	0.1583	-31.214	160.6204	-77.4557
15	0.1995	-0.0694	0.06	0.3446	-0.008	0.0982	0.0453	-0.061	-0.0779	-0.0288	-0.0366	-0.0423	0.0306	0.0009	0.0161	0.1085	-0.0145	0.0606	0.1241	0.0092	0.1688	-25.4307	170.6844	-86.1874
16	0.5777	-0.0305	-0.1699	0.2935	0.0693	0.2269	-0.0628	-0.1572	-0.0118	0.0244	0.0084	0.0195	0.0306	0.0101	0.0374	0.0908	0.0258	0.021	0.1439	-0.0044	0.1035	-32.4509	196.574	-81.288
17	0.2	0.0611	0.1021	0.4762	0.0005	0.2	-0.0694	-0.0608	-0.0245	-0.0195	0.0616	0.0701	0.0252	0.0059	0.0086	0.0656	0.0189	0.0399	0.1241	0.0023	0.1177	-28.9807	183.6263	-87.0913
18	1.0279	-0.8286	0.2301	0.7775	-0.1102	0.1545	-0.0526	0.2137	0.2681	-0.0629	-0.0192	0.0721	-0.0983	0.0994	-0.0486	0.1933	-0.0277	-0.0494	0.222	0.0965	0.2505	-49.5735	217.6647	-22.4687
19	0.5854	0.1701	0.1814	0.6004	0.1381	0.4274	-0.0433	0.0239	0.2272	0.0699	-0.0315	0.0154	0.0475	0.023	0.0421	0.1014	-0.0126	-0.0361	0.1174	-0.0102	0.1426	-48.429	206.3037	-11.5684
20	0.6403	0.057	0.1689	0.4718	0.0447	0.4635	-0.0665	0.098	-0.0033	-0.0737	-0.0011	0.0989	0.0283	-0.0007	0.0193	0.1552	-0.0293	0.0146	0.1088	-0.0214	0.0892	-54.9429	182.3926	-19.6944
21	0.382	-0.0382	-0.0203	0.625	0.0308	0.3761	-0.0568	0.1045	0.0883	-0.042	-0.0005	0.0743	0.0067	0.0109	0.0432	0.0963	-0.014	-0.0084	0.1031	-0.005	0.1277	-49.9422	197.625	-14.7325
22	1.2156	-0.0649	-0.0147	0.8462	-0.2177	0.6441	-0.0636	0.1047	0.0455	-0.0564	0.0425	-0.0503	-0.069	-0.0098	-0.0069	0.1622	-0.0417	-0.0286	0.2298	0.1602	0.2358	-51.4643	139.1192	-93.3009
23	0.4551	0.2551	0.0881	0.4754	0.0831	0.2356	-0.0648	0.0562	0.0759	0.026	0.0071	0.0177	0.0074	0.015	0.0584	0.1429	-0.0338	-0.019	0.1587	0.0103	0.1561	-45.8241	125.3636	-83.9135
24	0.5913	-0.0593	0.1025	0.4185	0.0669	0.3448	-0.1147	0.205	-0.0732	-0.0519	0.023	0.0692	-0.0218	0.0079	0.0163	0.1393	-0.0795	0.0581	0.174	-0.055	0.1285	-53.6465	101.8418	-91.0308
25	0.1986	-0.0037	-0.1032	0.6044	0.0861	0.2411	-0.0878	0.1322	-0.0236	0.0474	0.0224	0.0671	-0.0076	-0.0325	0.0371	0.1066	-0.0455	0.0044	0.1282	-0.0065	0.1132	-49.9247	114.3705	-84.5686
26	0.8856	-0.1567	0.246	0.1699	-0.0446	0.3758	0.0124	0.0439	0.0368	-0.0116	-0.028	-0.0383	-0.0385	0.0021	0.0016	0.3427	0.1432	-0.1777	0.3848	0.1555	0.5237	-30.8022	135.6913	10.955
27	0.1458	-0.1459	0.1608	0.1489	-0.1436	0.293	-0.0003	0.1455	0.0999	-0.0573	-0.0246	-0.0102	-0.0294	0.0518	0.0847	0.1975	0.0014	-0.1949	0.2803	0.1529	0.3558	-18.5264	124.0133	14.7351
28	0.2441	0.084	0.0089	0.1793	0.0761	0.1906	-0.0665	0.1783	0.1487	0.0039	-0.0376	0.0169	-0.0684	-0.0209	-0.1095	0.202	0.0162	-0.233	0.1628	0.0116	0.3173	-30.06	120.4978	24.5355
29	0.623	0.1769	0.4274	0.0623	0.0694	0.5186	-0.1116	0.1591	-0.0304	-0.0941	-0.023	0.2062	0.038	-0.0294	0.0071	0.1922	-0.0156	-0.0592	0.19	-0.0836	0.2273	-33.7012	97.3888	17.0043
30	0.5554	0.5012	0.5567	1.5693	0.7109	1.078	-0.0395	-0.0001	-0.147	0.0621	0.0067	0.024	0.0988	-0.0355	-0.0109	0.138	0.0104	0.0049	0.1091	-0.035	0.1723	-23.4902	94.3111	25.3233
31	0.241	-0.1029	0.0193	0.145	-0.0467	0.1651	-0.0487	0.1754	-0.0271	-0.142	0.0042	0.0822	0.0057	-0.0798	-0.0097	0.2417	-0.016	-0.1466	0.2756	-0.1292	0.1997	-37.4215	100.7838	4.0724
32	0.617	0.251	-0.0611	0.943	0.1641	0.3234	-0.0633	0.1444	0.0508	0.0246	-0.1649	0.01	-0.0523	-0.0099	-0.0674	0.1727	0.0052	-0.1332	0.2046	-0.0078	0.2756	-30.1168	111.1646	21.4933
33	0.1467	-0.0972	-0.0131	0.1879	-0.0818	0.1867	-0.0312	0.0906	0.1223	0.0031	0.0039	-0.0087	-0.0507	-0.0507	-0.0033	0.1805	0.0543	-0.2008	0.2258	0.0718	0.3809	-38.645	126.7719	17.6998
34	0.8252	0.2688	0.6834	0.3006	-0.0408	0.887	-0.0489	0.1235	0.082	-0.0113	-0.0429	0.1854	-0.0296	-0.0925	0.0035	0.1573	0.0249	-0.1049	0.1707	-0.0466	0.2442	-36.8292	110.6763	20.8685
35	0.3727	0.2832	0.0028	1.2567	0.3025	0.5049	-0.1172	0.158	-0.0835	-0.0655	0.0431	-0.1147	0.0084	0.0725	0.0261	0.168	0.017	-0.0323	0.1756	-0.073	0.1665	-15.9174	96.2176	20.665
36	0.9261	0.279	-0.0537	0.2432	-0.0835	0.3424	0.0438	-0.0289	-0.0493	-0.0279	0.0269	0.0094	-0.0179	-0.0177	-0.0328	0.6298	0.0895	0.2154	0.4148	0.312	0.6652	-50.4796	155.8545	24.4143
37	0.1832	0.113	-0.059	0.4655	-0.0088	0.2052	-0.097	-0.0923	-0.1815	0.0636	-0.0062	-0.0522	0.1031	0.026	-0.0618	0.611	0.0856	0.2369	0.0955	0.099	0.3156	-50.0842	176.1131	17.4093
38	0.3304	-0.021	-0.0038	0.4187	-0.1751	0.3005	-0.1556	-0.1579	-0.1227	0.3075	0.0576	0.0528	0.11	0.0237	0.0363	0.443	0.0508	0.0871	0.1172	0.0304	0.1439	-50.6315	184.354	18.5274

精密化 TLSグループ

ID	Refine-ID	Refine TLS-ID	Selection details
1	X-RAY DIFFRACTION	1	chain 'A' and (resid 15 through 41 )
2	X-RAY DIFFRACTION	2	chain 'A' and (resid 42 through 135 )
3	X-RAY DIFFRACTION	3	chain 'A' and (resid 136 through 265 )
4	X-RAY DIFFRACTION	4	chain 'A' and (resid 266 through 387 )
5	X-RAY DIFFRACTION	5	chain 'B' and (resid 15 through 52 )
6	X-RAY DIFFRACTION	6	chain 'B' and (resid 53 through 135 )
7	X-RAY DIFFRACTION	7	chain 'B' and (resid 136 through 265 )
8	X-RAY DIFFRACTION	8	chain 'B' and (resid 266 through 317 )
9	X-RAY DIFFRACTION	9	chain 'B' and (resid 318 through 387 )
10	X-RAY DIFFRACTION	10	chain 'C' and (resid 15 through 52 )
11	X-RAY DIFFRACTION	11	chain 'C' and (resid 53 through 129 )
12	X-RAY DIFFRACTION	12	chain 'C' and (resid 130 through 265 )
13	X-RAY DIFFRACTION	13	chain 'C' and (resid 266 through 387 )
14	X-RAY DIFFRACTION	14	chain 'D' and (resid 15 through 42 )
15	X-RAY DIFFRACTION	15	chain 'D' and (resid 43 through 135 )
16	X-RAY DIFFRACTION	16	chain 'D' and (resid 136 through 250 )
17	X-RAY DIFFRACTION	17	chain 'D' and (resid 251 through 387 )
18	X-RAY DIFFRACTION	18	chain 'E' and (resid 15 through 66 )
19	X-RAY DIFFRACTION	19	chain 'E' and (resid 67 through 135 )
20	X-RAY DIFFRACTION	20	chain 'E' and (resid 136 through 265 )
21	X-RAY DIFFRACTION	21	chain 'E' and (resid 266 through 387 )
22	X-RAY DIFFRACTION	22	chain 'F' and (resid 15 through 52 )
23	X-RAY DIFFRACTION	23	chain 'F' and (resid 53 through 135 )
24	X-RAY DIFFRACTION	24	chain 'F' and (resid 136 through 250 )
25	X-RAY DIFFRACTION	25	chain 'F' and (resid 251 through 387 )
26	X-RAY DIFFRACTION	26	chain 'G' and (resid 15 through 52 )
27	X-RAY DIFFRACTION	27	chain 'G' and (resid 53 through 87 )
28	X-RAY DIFFRACTION	28	chain 'G' and (resid 88 through 135 )
29	X-RAY DIFFRACTION	29	chain 'G' and (resid 136 through 182 )
30	X-RAY DIFFRACTION	30	chain 'G' and (resid 183 through 206 )
31	X-RAY DIFFRACTION	31	chain 'G' and (resid 207 through 250 )
32	X-RAY DIFFRACTION	32	chain 'G' and (resid 251 through 283 )
33	X-RAY DIFFRACTION	33	chain 'G' and (resid 284 through 321 )
34	X-RAY DIFFRACTION	34	chain 'G' and (resid 322 through 346 )
35	X-RAY DIFFRACTION	35	chain 'G' and (resid 347 through 387 )
36	X-RAY DIFFRACTION	36	chain 'H' and (resid 15 through 56 )
37	X-RAY DIFFRACTION	37	chain 'H' and (resid 57 through 162 )
38	X-RAY DIFFRACTION	38	chain 'H' and (resid 163 through 387 )

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2022年2月9日: EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

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関連情報:EMDBヘッダ

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新型コロナ情報

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万見(Yorodumi)は、EMDB/PDB/SASBDBなどの構造データを閲覧するためのページです。
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