登録情報 | データベース: PDB / ID: 5lxh |
---|
タイトル | GABARAP-L1 ATG4B LIR Complex |
---|
要素 | - Cysteine protease ATG4B
- Gamma-aminobutyric acid receptor-associated protein-like 1
|
---|
キーワード | SIGNALING PROTEIN / LIR / GABARAP / ATG8 / LC3 |
---|
機能・相同性 | 機能・相同性情報
protein-phosphatidylethanolamide deconjugating activity / otolith mineralization completed early in development / protein delipidation / glycophagy / microautophagy / aggrephagy / Tat protein binding / protein localization to phagophore assembly site / GABA receptor binding / piecemeal microautophagy of the nucleus ...protein-phosphatidylethanolamide deconjugating activity / otolith mineralization completed early in development / protein delipidation / glycophagy / microautophagy / aggrephagy / Tat protein binding / protein localization to phagophore assembly site / GABA receptor binding / piecemeal microautophagy of the nucleus / cellular response to nitrogen starvation / phosphatidylethanolamine binding / Macroautophagy / beta-tubulin binding / autophagosome membrane / mitophagy / autophagosome maturation / autophagosome assembly / autophagosome / cysteine-type peptidase activity / macroautophagy / cytoplasmic vesicle membrane / protein processing / phospholipid binding / autophagy / protein transport / cytoplasmic vesicle / scaffold protein binding / microtubule / endopeptidase activity / 加水分解酵素; プロテアーゼ; ペプチド結合加水分解酵素; システインプロテアーゼ / cysteine-type endopeptidase activity / ubiquitin protein ligase binding / Golgi apparatus / endoplasmic reticulum / mitochondrion / proteolysis / cytoplasm / cytosol類似検索 - 分子機能 Peptidase C54, catalytic domain / Cysteine protease ATG4, F-type LIR motif / ATG4, F-type LIR motif / Peptidase C54 / Peptidase family C54 / Autophagy protein Atg8 ubiquitin-like / Autophagy protein Atg8 ubiquitin like / Phosphatidylinositol 3-kinase Catalytic Subunit; Chain A, domain 1 / Papain-like cysteine peptidase superfamily / Ubiquitin-like (UB roll) ...Peptidase C54, catalytic domain / Cysteine protease ATG4, F-type LIR motif / ATG4, F-type LIR motif / Peptidase C54 / Peptidase family C54 / Autophagy protein Atg8 ubiquitin-like / Autophagy protein Atg8 ubiquitin like / Phosphatidylinositol 3-kinase Catalytic Subunit; Chain A, domain 1 / Papain-like cysteine peptidase superfamily / Ubiquitin-like (UB roll) / Ubiquitin-like domain superfamily / Roll / Alpha Beta類似検索 - ドメイン・相同性 Gamma-aminobutyric acid receptor-associated protein-like 1 / Cysteine protease ATG4B類似検索 - 構成要素 |
---|
生物種 | Homo sapiens (ヒト) |
---|
手法 | X線回折 / シンクロトロン / 分子置換 / 解像度: 1.58 Å |
---|
データ登録者 | Mouilleron, S. / Skytte Rasmussen, M. / Kumar Shrestha, B. / Wirth, M. / Bowitz Larsen, K. / Abudu Princely, Y. / Sjottem, E. / Tooze, S. / Lamark, T. / Johansen, T. / Lee, R. |
---|
引用 | ジャーナル: Autophagy / 年: 2017 タイトル: ATG4B contains a C-terminal LIR motif important for binding and efficient cleavage of mammalian orthologs of yeast Atg8. 著者: Skytte Rasmussen, M. / Mouilleron, S. / Kumar Shrestha, B. / Wirth, M. / Lee, R. / Bowitz Larsen, K. / Abudu Princely, Y. / O'Reilly, N. / Sjttem, E. / Tooze, S.A. / Lamark, T. / Johansen, T. |
---|
履歴 | 登録 | 2016年9月21日 | 登録サイト: PDBE / 処理サイト: PDBE |
---|
改定 1.0 | 2017年2月8日 | Provider: repository / タイプ: Initial release |
---|
改定 1.1 | 2017年2月15日 | Group: Database references |
---|
改定 1.2 | 2017年3月22日 | Group: Database references |
---|
改定 1.3 | 2017年5月31日 | Group: Database references |
---|
改定 1.4 | 2024年1月17日 | Group: Data collection / Database references / Refinement description カテゴリ: chem_comp_atom / chem_comp_bond ...chem_comp_atom / chem_comp_bond / database_2 / pdbx_initial_refinement_model Item: _database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession |
---|
|
---|