登録情報 | データベース: PDB / ID: 5lg0 |
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タイトル | Solution NMR structure of Tryptophan to Alanine mutant of Arkadia RING domain. |
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要素 | E3 ubiquitin-protein ligase Arkadia |
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キーワード | LIGASE / Arkadia / Rnf111 / E3 Ubiquitin ligase / RING domain / Tryptophan / TGF-b / UbcH5b E2 enzyme |
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機能・相同性 | 機能・相同性情報
SUMO polymer binding / global genome nucleotide-excision repair / pattern specification process / positive regulation of transforming growth factor beta receptor signaling pathway / SMAD binding / positive regulation of protein ubiquitination / Downregulation of SMAD2/3:SMAD4 transcriptional activity / SMAD2/SMAD3:SMAD4 heterotrimer regulates transcription / RING-type E3 ubiquitin transferase / PML body ...SUMO polymer binding / global genome nucleotide-excision repair / pattern specification process / positive regulation of transforming growth factor beta receptor signaling pathway / SMAD binding / positive regulation of protein ubiquitination / Downregulation of SMAD2/3:SMAD4 transcriptional activity / SMAD2/SMAD3:SMAD4 heterotrimer regulates transcription / RING-type E3 ubiquitin transferase / PML body / Formation of Incision Complex in GG-NER / protein polyubiquitination / ubiquitin protein ligase activity / Antigen processing: Ubiquitination & Proteasome degradation / ubiquitin-dependent protein catabolic process / protein ubiquitination / protein-containing complex / nucleoplasm / nucleus / metal ion binding / cytoplasm / cytosol類似検索 - 分子機能 E3 ubiquitin-protein ligase Arkadia, N-terminal / E3 ubiquitin-protein ligase Arkadia N-terminus / Ring finger domain / Ring finger / Zinc finger RING-type profile. / Zinc finger, RING-type / Zinc finger, RING/FYVE/PHD-type類似検索 - ドメイン・相同性 |
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生物種 | Homo sapiens (ヒト) |
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手法 | 溶液NMR / molecular mechanics |
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データ登録者 | Birkou, M. / Chasapis, C.T. / Loutsidou, A.K. / Bentrop, D. / Lelli, M. / Herrmann, T. / Episkopou, V. / Spyroulias, G.A. |
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資金援助 | ギリシャ, 1件 組織 | 認可番号 | 国 |
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FP7-CAPACITIES - Research Potentials REGPOT "SEE-DRUG" | 285950 | ギリシャ |
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引用 | ジャーナル: J. Mol. Biol. / 年: 2017 タイトル: A Residue Specific Insight into the Arkadia E3 Ubiquitin Ligase Activity and Conformational Plasticity. 著者: Birkou, M. / Chasapis, C.T. / Marousis, K.D. / Loutsidou, A.K. / Bentrop, D. / Lelli, M. / Herrmann, T. / Carthy, J.M. / Episkopou, V. / Spyroulias, G.A. |
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履歴 | 登録 | 2016年7月5日 | 登録サイト: PDBE / 処理サイト: PDBE |
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改定 1.0 | 2017年6月28日 | Provider: repository / タイプ: Initial release |
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改定 1.1 | 2017年7月5日 | Group: Database references / カテゴリ: citation / database_2 / pdbx_database_related Item: _citation.country / _citation.journal_abbrev ..._citation.country / _citation.journal_abbrev / _citation.journal_id_ASTM / _citation.journal_id_CSD / _citation.pdbx_database_id_PubMed / _citation.title / _database_2.database_code / _pdbx_database_related.db_id |
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改定 1.2 | 2017年7月26日 | Group: Database references / カテゴリ: citation Item: _citation.country / _citation.journal_id_ASTM ..._citation.country / _citation.journal_id_ASTM / _citation.journal_id_CSD / _citation.journal_volume / _citation.page_first / _citation.page_last / _citation.title |
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改定 1.3 | 2019年5月8日 | Group: Data collection / カテゴリ: pdbx_nmr_software / Item: _pdbx_nmr_software.name |
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改定 1.4 | 2023年6月14日 | Group: Data collection / Database references / Other カテゴリ: database_2 / pdbx_database_status / pdbx_nmr_spectrometer Item: _database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession ..._database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession / _pdbx_database_status.status_code_nmr_data / _pdbx_nmr_spectrometer.model |
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