PDB-5ldz: Quadruple space group ambiguity due to rotational and translation...

IDまたはキーワード:

登録情報

データベース: PDB / ID: 5ldz

タイトル

Quadruple space group ambiguity due to rotational and translational non-crystallographic symmetry in human liver fructose-1,6-bisphosphatase

要素

Fructose-1,6-bisphosphatase 1

キーワード

HYDROLASE / PHOSPHORIC MONOESTER / ALLOSTERIC ENZYME / CARBOHYDRATE / METABOLISM / GLUCONEOGENESIS

機能・相同性

機能・相同性情報

cellular response to raffinose / cellular hypotonic salinity response / cellular response to phorbol 13-acetate 12-myristate / fructose-bisphosphatase / fructose 1,6-bisphosphate 1-phosphatase activity / cellular response to magnesium ion / negative regulation of Ras protein signal transduction / fructose 1,6-bisphosphate metabolic process / Gluconeogenesis / monosaccharide binding ...
類似検索 - 分子機能

生物種

Homo sapiens (ヒト)

手法

X線回折 /

シンクロトロン /

分子置換 / 解像度: 2.2 Å

データ登録者

Ruf, A. / Tetaz, T. / Schott, B. / Joseph, C. / Rudolph, M.G.

引用

ジャーナル: Acta Crystallogr D Struct Biol / 年: 2016
タイトル: Quadruple space-group ambiguity owing to rotational and translational noncrystallographic symmetry in human liver fructose-1,6-bisphosphatase.
著者: Ruf, A. / Tetaz, T. / Schott, B. / Joseph, C. / Rudolph, M.G.

履歴

登録	2016年6月29日	登録サイト: PDBE / 処理サイト: PDBE
改定 1.0	2016年10月26日	Provider: repository / タイプ: Initial release
改定 1.1	2016年11月9日	Group: Database references
改定 1.2	2018年4月18日	Group: Data collection / Database references / カテゴリ: citation Item: _citation.country / _citation.journal_abbrev ..._citation.country / _citation.journal_abbrev / _citation.journal_id_ASTM / _citation.journal_id_ISSN / _citation.pdbx_database_id_PubMed / _citation.title
改定 1.3	2024年5月1日	Group: Data collection / Database references ...Data collection / Database references / Derived calculations / Refinement description カテゴリ: chem_comp_atom / chem_comp_bond ...chem_comp_atom / chem_comp_bond / database_2 / pdbx_initial_refinement_model / pdbx_struct_conn_angle / struct_conn Item: _database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession ..._database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_auth_asym_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_auth_comp_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_auth_seq_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_asym_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_atom_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_comp_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_seq_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_auth_asym_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_auth_seq_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_label_asym_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_symmetry / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_auth_asym_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_auth_comp_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_auth_seq_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_asym_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_atom_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_comp_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_seq_id / _pdbx_struct_conn_angle.value / _struct_conn.pdbx_dist_value / _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id / _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id / _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id / _struct_conn.ptnr1_label_asym_id / _struct_conn.ptnr1_label_atom_id / _struct_conn.ptnr1_label_comp_id / _struct_conn.ptnr1_label_seq_id / _struct_conn.ptnr1_symmetry / _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id / _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id / _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id / _struct_conn.ptnr2_label_asym_id / _struct_conn.ptnr2_label_atom_id / _struct_conn.ptnr2_label_comp_id / _struct_conn.ptnr2_label_seq_id / _struct_conn.ptnr2_symmetry

構造ビューア	分子: MolmilJmol/JSmol

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ダウンロード

PDBx/mmCIF形式	5ldz.cif.gz	731.1 KB	表示	PDBx/mmCIF形式
PDB形式	pdb5ldz.ent.gz	613.6 KB	表示	PDB形式
PDBx/mmJSON形式	5ldz.json.gz		ツリー表示	PDBx/mmJSON形式
その他	その他のダウンロード

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検証レポート

アーカイブディレクトリ	https://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/ld/5ldz ftp://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/ld/5ldz	HTTPS FTP

-
関連構造データ

類似構造データ	2fbp-1 2owz-1 5oey-d 1eyi-1 1fpk-1 1fbd-1 1fpb-1 4gwx-1 1nv6-2 1cnq-1 Omokage検索で類似形状データを探す (詳細) Omokage検索で類似形状データを探す (詳細) Omokage検索で類似形状データを探す (詳細) 類似検索 - 機能・相同性F&H 検索類似検索 - 機能F&H 検索類似検索 - 相同性F&H 検索

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リンク

PDBのページ	PDBj / wwPDB / NCBI
「今月の分子」の関連する項目	#50 - 2004年2月解糖系酵素 (Glycolytic Enzymes) 類似性 (1)

登録構造単位

A: Fructose-1,6-bisphosphatase 1

B: Fructose-1,6-bisphosphatase 1

C: Fructose-1,6-bisphosphatase 1

D: Fructose-1,6-bisphosphatase 1

E: Fructose-1,6-bisphosphatase 1

F: Fructose-1,6-bisphosphatase 1

ヘテロ分子

225 kDa, 6 ポリマー
Omokage検索でこの集合体の類似形状データを探す (詳細)

1

A: Fructose-1,6-bisphosphatase 1

B: Fructose-1,6-bisphosphatase 1

C: Fructose-1,6-bisphosphatase 1

D: Fructose-1,6-bisphosphatase 1

ヘテロ分子

ソフトウェアが定義した集合体
150 kDa, 4 ポリマー
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2

E: Fructose-1,6-bisphosphatase 1

F: Fructose-1,6-bisphosphatase 1

ヘテロ分子

E: Fructose-1,6-bisphosphatase 1

F: Fructose-1,6-bisphosphatase 1

ヘテロ分子

ソフトウェアが定義した集合体
150 kDa, 4 ポリマー
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単位格子

Length a, b, c (Å)	121.519, 121.519, 316.580
Angle α, β, γ (deg.)	90.000, 90.000, 90.000
Int Tables number	92
Space group name H-M	P4₁2₁2

#1: タンパク質	Fructose-1,6-bisphosphatase 1 / FBPase 1 / D-fructose-1 / 6-bisphosphate 1-phosphohydrolase 1 / Liver FBPase 分子量: 36887.434 Da / 分子数: 6 / 由来タイプ: 組換発現 / 由来: (組換発現) Homo sapiens (ヒト) / 遺伝子: FBP1, FBP / プラスミド: PET / 発現宿主: Escherichia coli BL21(DE3) (大腸菌) / 参照: UniProt: P09467, fructose-bisphosphatase
#2: 化合物	ChemComp-ZN / ZINC ION 分子量: 65.409 Da / 分子数: 9 / 由来タイプ: 合成 / 式: Zn
#3: 化合物	... ChemComp-SO4 / SULFATE ION / 硫酸ジアニオン分子量: 96.063 Da / 分子数: 29 / 由来タイプ: 合成 / 式: SO₄
#4: 化合物	ChemComp-CL / CHLORIDE ION / クロリド分子量: 35.453 Da / 分子数: 3 / 由来タイプ: 合成 / 式: Cl
#5: 水	ChemComp-HOH / water 分子量: 18.015 Da / 分子数: 488 / 由来タイプ: 天然 / 式: H₂O

-
実験

実験	手法: X線回折 / 使用した結晶の数: 1

-
試料調製

結晶	マシュー密度: 2.83 Å³/Da / 溶媒含有率: 56.6 %
結晶化	温度: 295 K / 手法: 蒸気拡散法, シッティングドロップ法 / pH: 8.5 / 詳細: 0.1 M Tris-HCl pH 8.5, 2 M (NH4)2SO4

-
データ収集

回折	平均測定温度: 100 K
放射光源	由来: シンクロトロン / サイト: SLS / ビームライン: X10SA / 波長: 0.979 Å
検出器	タイプ: MARMOSAIC 225 mm CCD / 検出器: CCD / 日付: 2007年1月23日
放射	プロトコル: SINGLE WAVELENGTH / 単色(M)・ラウエ(L): M / 散乱光タイプ: x-ray
放射波長	波長: 0.979 Å / 相対比: 1
反射	解像度: 2.2→39.8 Å / Num. obs: 121069 / % possible obs: 99.7 % / 冗長度: 7.5 % / B_iso Wilson estimate: 37.3 Å² / CC_1/2: 0.997 / R_sym value: 0.132 / Net I/σ(I): 7
反射シェル	解像度: 2.2→2.3 Å / 冗長度: 4.4 % / R_merge(I) obs: 1.22 / Mean I/σ(I) obs: 1.1 / CC_1/2: 0.807 / % possible all: 97.9

-
解析

ソフトウェア

名称	バージョン	分類
XSCALE		データスケーリング
PDB_EXTRACT	3.2	データ抽出
BUSTER		精密化
DENZO		データ削減
PHASER		位相決定

精密化

構造決定の手法:

分子置換
開始モデル: inhouse model

解像度: 2.2→39.8 Å / Cor.coef. F_o:F_c: 0.952 / Cor.coef. F_o:F_c free: 0.935 / SU R Cruickshank DPI: 0.227 / 交差検証法: FREE R-VALUE / σ(F): 0 / SU R Blow DPI: 0.229 / SU R_free Blow DPI: 0.185 / SU R_free Cruickshank DPI: 0.186
詳細: there is a short contact between two sulfate ions in the structure. Since the protein buffer contained phosphate, a hydrogenphosphate is probably present at one of these positions, but cannot ...

	R_factor	反射数	%反射	Selection details
R_free	0.239	6073	5.03 %	RANDOM
R_work	0.206	-	-	-
obs	0.208	120699	99.9 %	-

原子変位パラメータ

B_iso max: 170.32 Å² / B_iso mean: 46.53 Å² / B_iso min: 15.35 Å²

	B_aniso -1	B_aniso -2	B_aniso -3
1-	-5.5079 Å²	0 Å²	0 Å²
2-	-	-5.5079 Å²	0 Å²
3-	-	-	11.0158 Å²

Refine analyze

Luzzati coordinate error obs: 0.32 Å

精密化ステップ

サイクル: final / 解像度: 2.2→39.8 Å

	タンパク質	核酸	リガンド	溶媒	全体
原子数	14351	0	157	488	14996
B_iso mean	-	-	91.75	43.31	-
残基数	-	-	-	-	1872

LS精密化シェル

解像度: 2.2→2.26 Å / Total num. of bins used: 20

	R_factor	反射数	%反射
R_free	0.286	421	4.77 %
R_work	0.271	8397	-
all	-	8818	-
obs	-	-	99.95 %

精密化 TLS

手法: refined / Refine-ID: X-RAY DIFFRACTION

ID	L11 (°²)	L12 (°²)	L13 (°²)	L22 (°²)	L23 (°²)	L33 (°²)	S11 (Å °)	S12 (Å °)	S13 (Å °)	S21 (Å °)	S22 (Å °)	S23 (Å °)	S31 (Å °)	S32 (Å °)	S33 (Å °)	T11 (Å²)	T12 (Å²)	T13 (Å²)	T22 (Å²)	T23 (Å²)	T33 (Å²)	Origin x (Å)	Origin y (Å)	Origin z (Å)
1	0	-0.7887	-2.195	5.8233	0.7406	6.9706	0.0089	-0.1021	0.0297	0.0593	-0.0764	0.1619	-0.1359	0.0368	0.0675	0.2118	0.0427	-0.0269	-0.0286	-0.1301	-0.0962	23.9803	52.1504	208.355
2	2.0046	-2.1096	-1.2162	0.5933	0.711	1.0717	-0.0172	-0.0948	-0.0257	0.0997	-0.001	-0.097	0.0366	0.137	0.0182	-0.0368	0.0171	-0.0332	-0.0523	-0.0423	-0.1371	16.5374	39.2737	203.892
3	3.7697	-1.8364	-0.5224	1.3179	0.7955	0.0066	-0.0463	-0.0335	-0.3363	0.1679	0.0254	0.1588	0.2215	-0.3275	0.0209	0.0918	0.0348	-0.0178	0.0047	0.0025	-0.0569	8.0654	32.6031	199.204
4	2.4457	-0.9671	-0.3401	1.4093	-0.2495	1.4692	-0.0027	0.0378	0.1624	-0.0702	-0.0274	-0.0242	-0.0403	-0.1644	0.0302	0.0406	0.0334	-0.038	-0.0156	-0.0413	-0.0767	11.0114	42.274	193.987
5	0.6344	-0.4117	-0.3858	0.5404	0.9444	3.9418	0.1013	-0.0039	0.0908	0.0082	0.0234	-0.1099	-0.0856	0.0299	-0.1247	0.018	0.022	-0.017	-0.1092	0.0211	-0.1052	28.499	41.4329	180.306
6	1.2055	-0.3172	-1.0813	1.2362	-0.2	2.7039	-0.0768	0.1226	0.002	-0.1285	-0.022	0.0593	0.0171	-0.3019	0.0988	0.0816	0.0336	-0.0329	-0.0411	-0.0129	-0.0929	17.1641	43.38	178.008
7	0	2.2127	1.5114	2.5512	-0.5988	7.1139	-0.0041	-0.1472	-0.04	0.0457	-0.0794	-0.0802	0.0544	0.0276	0.0836	0.2261	0.0386	-0.021	-0.0495	0.0874	-0.0576	36.5489	10.6352	208.381
8	3.005	-0.6071	0.2758	0.9485	-0.0899	1.194	0.0176	-0.0037	0.0449	-0.0303	-0.016	-0.0606	-0.119	0.0337	-0.0016	-0.0116	-0.0034	-0.0098	-0.0528	0.0027	-0.134	50.9872	24.5892	198.472
9	0.8476	-0.4289	0.7558	0.7805	-0.3218	2.6633	0.0286	0.0273	-0.1084	-0.0314	-0.0066	0.0746	0.1907	-0.149	-0.022	0.0324	0.0131	-0.0132	-0.0849	-0.024	-0.0635	35.7921	20.1999	183.902
10	0.9527	-0.5229	0.9211	1.1164	0.3005	2.6823	-0.0313	0.076	-0.0264	-0.1664	-0.0253	-0.0123	0.0286	0.1622	0.0566	0.0628	0.0393	-0.0143	-0.0673	-0.0008	-0.0979	43.0183	19.4232	177.96
11	0.5802	0.0253	0.0031	0.9762	0.1063	2.2259	0.017	-0.022	-0.0609	-0.2019	-0.0068	-0.1753	-0.041	0.3184	-0.0102	0.0399	0.043	0.0403	-0.0621	-0.0036	-0.0969	44.0368	21.615	216.101
12	1.425	-1.2915	-0.5073	3.4981	0.3916	2.5144	0.0164	0.0232	-0.2059	0.0348	-0.1015	0.3502	0.0865	-0.3426	0.0851	0.0731	-0.0179	-0.0183	0.0053	-0.0014	-0.0463	32.736	10.7672	224.076
13	0	1.3471	-0.4489	0	2.2365	1.6988	0.0299	-0.0488	-0.1797	0.0077	0.1085	-0.1787	0.2821	-0.0401	-0.1384	0.0869	0.0377	-0.007	-0.1532	0.0094	-0.0987	44.8555	5.5102	227.939
14	0.8144	-0.368	-0.3167	0.7257	0.5242	2.2078	-0.0136	-0.0887	0.0268	0.0108	0.0464	-0.0562	-0.0907	0.0595	-0.0328	0.0151	0.0514	-0.0097	-0.0455	-0.0028	-0.081	40.8547	25.6544	238.359
15	0.994	-0.4628	0.0491	1.1332	1.1413	2.5471	-0.0241	-0.1862	-0.0277	0.0264	-0.0353	0.0276	0.3214	0.0678	0.0594	0.0107	0.0513	-0.0006	0.0025	0.0189	-0.1116	41.5587	18.4295	244.315
16	0	-0.0019	-0.3463	0.3227	-0.3718	1.4916	0.0085	0.104	0.1183	-0.3178	0.0327	0.0101	0.0762	-0.2478	-0.0412	0.114	0.0573	-0.0817	-0.04	-0.0274	-0.1398	15.6344	41.4372	215.805
17	0.2266	-0.2952	-0.1365	3.0248	-0.1055	1.3147	-0.0492	-0.0241	0.0905	0.0818	0.0147	-0.0325	-0.1658	0.0655	0.0345	0.0831	0.0367	-0.0248	-0.0611	-0.0296	-0.1216	23.9352	53.7773	224.828
18	0.633	-0.3119	0.1707	0.8336	-0.6721	1.7839	-0.0448	-0.0723	-0.0622	-0.0197	0.0802	0.1499	0.0254	-0.1279	-0.0354	0.0073	0.047	0.0013	-0.0291	-0.0171	-0.0556	18.4376	37.1174	238.106
19	1.1163	-0.1146	-0.1429	0.8248	-1.5429	1.8454	0.008	-0.1725	-0.0025	0.1435	-0.084	0.0131	-0.2816	-0.015	0.076	0.0211	0.0613	0.0017	0.0078	-0.0139	-0.1008	17.6719	44.3249	243.918
20	0.9934	0.1925	0.5857	0.6518	-0.0523	1.9959	-0.0009	-0.0978	-0.0728	0.1841	-0.0087	0.1112	-0.0445	-0.3426	0.0096	0.0048	0.0223	0.0561	0.0049	-0.0062	-0.1246	-45.4117	21.4818	232.482
21	0.1014	0.7328	-1.0378	2.2233	-0.4739	1.8833	0.0096	-0.1101	-0.1296	0.0172	-0.0776	-0.3726	0.3182	0.3272	0.068	0.0282	0.022	0.001	0.0593	-0.0034	-0.026	-32.4983	9.1464	225.895
22	0.7068	1.3754	0.018	5.1608	-0.5365	2.451	0.0034	0.0574	-0.1283	-0.1311	-0.0018	0.0197	0.1179	0.0209	-0.0017	0.0102	0.0628	0.0001	-0.0413	-0.0219	-0.1008	-39.9774	9.9182	221.697
23	0.6801	-0.0405	-0.5749	0.86	-0.3312	2.0994	-0.0488	0.0637	-0.0127	-0.0839	0.0782	0.0409	-0.0097	-0.0975	-0.0295	-0.0342	-0.0096	-0.0271	0.0109	-0.0187	-0.0933	-42.2076	25.3253	210.178
24	0.9442	0.6982	-0.1949	1.1475	-1.0729	2.4796	-0.0176	0.1433	-0.0719	-0.1849	-0.0599	-0.1055	0.3457	0.0099	0.0774	0.0056	-0.0011	-0.0156	0.0241	-0.0266	-0.1067	-42.9236	18.127	204.441
25	1.3655	-0.3988	0.3868	0	0.2973	1.9385	0.0207	-0.1257	0.0589	0.1665	0.0217	0.0183	0.0859	0.2678	-0.0424	-0.0051	0.0378	-0.0343	0.0239	-0.0166	-0.1181	-16.9388	41.2588	232.472
26	0.7281	0.8149	-0.1801	3.5486	0.2212	1.5251	-0.0292	-0.0265	0.0782	-0.1352	0.0055	0.1031	-0.0526	-0.1838	0.0237	0.0274	0.0498	-0.0056	0.013	-0.005	-0.1109	-25.1619	53.6175	223.499
27	0.7685	0.4485	0.2509	0.5568	0.7475	1.8582	-0.055	0.0557	-0.0319	-0.0293	0.0742	-0.1163	0.0742	0.1213	-0.0192	-0.0036	0.0143	0.0229	-0.0124	-0.0192	-0.0654	-19.7949	36.8089	210.319
28	1.1226	0.6183	-0.0589	0.2485	0.8529	2.4417	-0.0777	0.1415	0.0086	-0.1261	-0.0477	0.0339	-0.2225	0.0204	0.1253	0.0262	-0.0007	0.0208	0.002	-0.0076	-0.094	-18.947	43.9336	204.278

精密化 TLSグループ

ID	Refine-ID	Refine TLS-ID	Selection details	Auth asym-ID	Auth seq-ID
1	X-RAY DIFFRACTION	1	{ A\|6 - A\|29 }	A	6 - 29
2	X-RAY DIFFRACTION	2	{ A\|30 - A\|50 }	A	30 - 50
3	X-RAY DIFFRACTION	3	{ A\|51 - A\|107 }	A	51 - 107
4	X-RAY DIFFRACTION	4	{ A\|108 - A\|180 }	A	108 - 180
5	X-RAY DIFFRACTION	5	{ A\|181 - A\|248 }	A	181 - 248
6	X-RAY DIFFRACTION	6	{ A\|249 - A\|336 }	A	249 - 336
7	X-RAY DIFFRACTION	7	{ B\|6 - B\|29 }	B	6 - 29
8	X-RAY DIFFRACTION	8	{ B\|30 - B\|149 }	B	30 - 149
9	X-RAY DIFFRACTION	9	{ B\|150 - B\|248 }	B	150 - 248
10	X-RAY DIFFRACTION	10	{ B\|249 - B\|337 }	B	249 - 337
11	X-RAY DIFFRACTION	11	{ C\|6 - C\|50 }	C	6 - 50
12	X-RAY DIFFRACTION	12	{ C\|51 - C\|132 }	C	51 - 132
13	X-RAY DIFFRACTION	13	{ C\|133 - C\|149 }	C	133 - 149
14	X-RAY DIFFRACTION	14	{ C\|150 - C\|248 }	C	150 - 248
15	X-RAY DIFFRACTION	15	{ C\|249 - C\|337 }	C	249 - 337
16	X-RAY DIFFRACTION	16	{ D\|6 - D\|50 }	D	6 - 50
17	X-RAY DIFFRACTION	17	{ D\|51 - D\|149 }	D	51 - 149
18	X-RAY DIFFRACTION	18	{ D\|150 - D\|248 }	D	150 - 248
19	X-RAY DIFFRACTION	19	{ D\|249 - D\|336 }	D	249 - 336
20	X-RAY DIFFRACTION	20	{ E\|6 - E\|50 }	E	6 - 50
21	X-RAY DIFFRACTION	21	{ E\|51 - E\|107 }	E	51 - 107
22	X-RAY DIFFRACTION	22	{ E\|108 - E\|149 }	E	108 - 149
23	X-RAY DIFFRACTION	23	{ E\|150 - E\|248 }	E	150 - 248
24	X-RAY DIFFRACTION	24	{ E\|249 - E\|336 }	E	249 - 336
25	X-RAY DIFFRACTION	25	{ F\|6 - F\|50 }	F	6 - 50
26	X-RAY DIFFRACTION	26	{ F\|51 - F\|149 }	F	51 - 149
27	X-RAY DIFFRACTION	27	{ F\|150 - F\|248 }	F	150 - 248
28	X-RAY DIFFRACTION	28	{ F\|249 - F\|337 }	F	249 - 337

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2022年2月9日: EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

EMDBのヘッダファイルのバージョン3が、公式のフォーマットとなりました。
これまでは公式だったバージョン1.9は、アーカイブから削除されます。

関連情報:EMDBヘッダ

外部リンク:wwPDBはEMDBデータモデルのバージョン3へ移行します

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新型コロナ情報

URL: https://pdbj.org/emnavi/covid19.php

新ページ: EM Navigatorに新型コロナウイルスの特設ページを開設しました。

関連情報:Covid-19情報 / 2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

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万見(Yorodumi)は、EMDB/PDB/SASBDBなどの構造データを閲覧するためのページです。
EM Navigatorの詳細ページの後継、Omokage検索のフロントエンドも兼ねています。

関連情報:EMDB / PDB / SASBDB / 3つのデータバンクの比較 / 万見検索 / 2016年8月31日: 新しいEM Navigatorと万見 / 万見文献 / Jmol/JSmol / 機能・相同性情報 / 新しいEM Navigatorと万見の変更点

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