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-基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 5kjg | ||||||
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タイトル | Connexin 26 G12R mutant NMR structure | ||||||
要素 | Gap junction beta-2 protein | ||||||
キーワード | TRANSPORT PROTEIN (運搬体タンパク質) / Connexin 26 G12R Mutant | ||||||
機能・相同性 | 機能・相同性情報 Transport of connexons to the plasma membrane / response to human chorionic gonadotropin / gap junction-mediated intercellular transport / epididymis development / gap junction channel activity involved in cell communication by electrical coupling / Oligomerization of connexins into connexons / Transport of connexins along the secretory pathway / gap junction assembly / connexin complex / astrocyte projection ...Transport of connexons to the plasma membrane / response to human chorionic gonadotropin / gap junction-mediated intercellular transport / epididymis development / gap junction channel activity involved in cell communication by electrical coupling / Oligomerization of connexins into connexons / Transport of connexins along the secretory pathway / gap junction assembly / connexin complex / astrocyte projection / Gap junction assembly / gap junction channel activity / ギャップ結合 / cellular response to glucagon stimulus / inner ear development / decidualization / endoplasmic reticulum-Golgi intermediate compartment / lateral plasma membrane / response to retinoic acid / cellular response to dexamethasone stimulus / response to progesterone / response to ischemia / sensory perception of sound / transmembrane transport / cell-cell signaling / response to estradiol / cellular response to oxidative stress / cell body / response to lipopolysaccharide / calcium ion binding / perinuclear region of cytoplasm / identical protein binding / 細胞膜 類似検索 - 分子機能 | ||||||
生物種 | Homo sapiens (ヒト) | ||||||
手法 | 溶液NMR / simulated annealing | ||||||
データ登録者 | Dowd, T.L. / Bargiello, T.A. | ||||||
資金援助 | 米国, 1件
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引用 | ジャーナル: Arch.Biochem.Biophys. / 年: 2016 タイトル: Structural studies of N-terminal mutants of Connexin 26 and Connexin 32 using (1)H NMR spectroscopy. 著者: Batir, Y. / Bargiello, T.A. / Dowd, T.L. | ||||||
履歴 |
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-構造の表示
構造ビューア | 分子: MolmilJmol/JSmol |
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-ダウンロードとリンク
-ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | 5kjg.cif.gz | 128.5 KB | 表示 | PDBx/mmCIF形式 |
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PDB形式 | pdb5kjg.ent.gz | 102.2 KB | 表示 | PDB形式 |
PDBx/mmJSON形式 | 5kjg.json.gz | ツリー表示 | PDBx/mmJSON形式 | |
その他 | その他のダウンロード |
-検証レポート
アーカイブディレクトリ | https://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/kj/5kjg ftp://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/kj/5kjg | HTTPS FTP |
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-関連構造データ
-リンク
-集合体
登録構造単位 |
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1 |
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NMR アンサンブル |
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-要素
#1: タンパク質・ペプチド | 分子量: 2472.863 Da / 分子数: 1 / 変異: G12R / 由来タイプ: 合成 / 由来: (合成) Homo sapiens (ヒト) / 参照: UniProt: P29033 |
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-実験情報
-実験
実験 | 手法: 溶液NMR | ||||||||||||||||||||||||
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NMR実験 |
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-試料調製
詳細 | タイプ: solution 内容: 1.0 mM NA ACE-MET-ASP-TRP-GLY-THR-LEU-GLN-THR-ILE-LEU-GLY-ARG-VAL-ASN-LYS-HIS-SER-THR-SER-ILE-GLY-LYS, 100 mM KCL, 100 uM TSP, 90% H2O/10% D2O 詳細: Connexin 26 G12R mutant peptide dissolved in 0.1 M KCl solution Label: 1H_Cx26G12R sample / 溶媒系: 90% H2O/10% D2O | ||||||||||||||||
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試料 |
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試料状態 | イオン強度: 0.1 M / Ionic strength err: 0.01 / Label: conditions_1 / pH: 7.0 / PH err: 0.05 / 圧: 1 atm / Pressure err: 0.01 / 温度: 288 K / Temperature err: 0.2 |
-NMR測定
NMRスペクトロメーター |
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-解析
NMR software |
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精密化 | 手法: simulated annealing / ソフトェア番号: 4 | |||||||||||||||
代表構造 | 選択基準: low energy | |||||||||||||||
NMRアンサンブル | 登録したコンフォーマーの数: 20 |