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基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 5i0w | ||||||
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タイトル | IRON AND COPPER-BOUND P19 FROM CAMPYLOBACTER JEJUNI UNDER REDUCING CONDITIONS | ||||||
![]() | P19 | ||||||
![]() | METAL TRANSPORT / MIXED BETA SANDWICH / IRON TRANSPORT | ||||||
機能・相同性 | ![]() | ||||||
生物種 | ![]() ![]() | ||||||
手法 | ![]() ![]() ![]() | ||||||
![]() | Chan, A.C. / Murphy, M.E. | ||||||
![]() | ![]() タイトル: A copper site is required for iron transport by the periplasmic proteins P19 and FetP. 著者: Chan, A.C.K. / Lin, H. / Koch, D. / Grass, G. / Nies, D.H. / Murphy, M.E.P. | ||||||
履歴 |
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構造の表示
構造ビューア | 分子: ![]() ![]() |
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ダウンロードとリンク
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ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | ![]() | 86 KB | 表示 | ![]() |
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PDB形式 | ![]() | 63.7 KB | 表示 | ![]() |
PDBx/mmJSON形式 | ![]() | ツリー表示 | ![]() | |
その他 | ![]() |
-検証レポート
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
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-関連構造データ
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リンク
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集合体
登録構造単位 | ![]()
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1 |
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単位格子 |
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Components on special symmetry positions |
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要素
-タンパク質 , 1種, 2分子 AB
#1: タンパク質 | 分子量: 17590.859 Da / 分子数: 2 / 由来タイプ: 組換発現 由来: (組換発現) ![]() ![]() 遺伝子: CJJ81176_1650 / プラスミド: PET28A / 発現宿主: ![]() ![]() ![]() |
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-非ポリマー , 5種, 292分子 ![](data/chem/img/TAM.gif)
![](data/chem/img/CU1.gif)
![](data/chem/img/CL.gif)
![](data/chem/img/FE2.gif)
![](data/chem/img/HOH.gif)
![](data/chem/img/CU1.gif)
![](data/chem/img/CL.gif)
![](data/chem/img/FE2.gif)
![](data/chem/img/HOH.gif)
#2: 化合物 | ChemComp-TAM / ![]() | ||||||
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#3: 化合物 | ![]() #4: 化合物 | ![]() #5: 化合物 | ChemComp-FE2 / | #6: 水 | ChemComp-HOH / | ![]() |
-実験情報
-実験
実験 | 手法: ![]() |
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試料調製
結晶 | マシュー密度: 2.1 Å3/Da / 溶媒含有率: 41.48 % |
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結晶化![]() | 温度: 295 K / 手法: 蒸気拡散法, ハンギングドロップ法 / pH: 9 / 詳細: 25-45% PEG 350, 0.1M CHES PH 9 / PH範囲: 9 |
-データ収集
回折 | 平均測定温度: 100 K |
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放射光源 | 由来: ![]() ![]() ![]() |
検出器 | タイプ: ADSC QUANTUM 315r / 検出器: CCD / 日付: 2010年2月12日 |
放射 | プロトコル: SINGLE WAVELENGTH / 単色(M)・ラウエ(L): M / 散乱光タイプ: x-ray |
放射波長 | 波長![]() |
反射 | 解像度: 1.55→50 Å / Num. obs: 43367 / % possible obs: 98.9 % / 冗長度: 6 % / Rmerge(I) obs: 0.05 / Net I/σ(I): 17.5 |
反射 シェル | 解像度: 1.55→1.61 Å / 冗長度: 5.5 % / Rmerge(I) obs: 0.417 / % possible all: 97.1 |
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解析
ソフトウェア |
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精密化 | 構造決定の手法![]() ![]() 開始モデル: 3LZO 解像度: 1.55→50 Å / Cor.coef. Fo:Fc: 0.966 / Cor.coef. Fo:Fc free: 0.949 / SU B: 1.502 / SU ML: 0.055 / 交差検証法: THROUGHOUT / σ(F): 0 / ESU R: 0.088 / ESU R Free: 0.088 / 詳細: U VALUES : REFINED INDIVIDUALLY
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溶媒の処理 | イオンプローブ半径: 0.8 Å / 減衰半径: 0.8 Å / VDWプローブ半径: 1.2 Å | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
原子変位パラメータ | Biso mean: 20.19 Å2
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精密化ステップ | サイクル: LAST / 解像度: 1.55→50 Å
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拘束条件 |
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