- PDB-5ha9: Crystal structure-based design and disovery of a novel PARP1 anti... -
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基本情報
登録情報
データベース: PDB / ID: 5ha9
タイトル
Crystal structure-based design and disovery of a novel PARP1 antiagonist (BL-PA10) that induces apoptosis and inhibits metastasis in triple negative breast cancer
プロトコル: SINGLE WAVELENGTH / 単色(M)・ラウエ(L): M / 散乱光タイプ: x-ray
放射波長
波長: 1.006323 Å / 相対比: 1
反射
解像度: 4→50 Å / Num. obs: 6434 / % possible obs: 99.1 % / 冗長度: 4.5 % / Rmerge(I) obs: 0.212 / Χ2: 2.04 / Net I/av σ(I): 9.947 / Net I/σ(I): 6.2 / Num. measured all: 29162
反射 シェル
Diffraction-ID: 1 / Rejects: _
解像度 (Å)
冗長度 (%)
Rmerge(I) obs
Num. unique all
Χ2
% possible all
4-4.07
4.8
0.398
292
1.962
100
4.07-4.14
4.7
0.437
322
1.94
99.7
4.14-4.22
4.7
0.349
304
2.106
100
4.22-4.31
4.5
0.348
325
2.207
98.5
4.31-4.4
4.5
0.291
307
2.577
98.4
4.4-4.5
4.8
0.286
313
2.179
99.4
4.5-4.62
4.6
0.253
320
2.324
100
4.62-4.74
4.6
0.258
319
2.249
99.7
4.74-4.88
4.6
0.24
315
2.411
99.4
4.88-5.04
4.7
0.238
306
2.123
99.7
5.04-5.22
4.6
0.267
323
1.947
99.7
5.22-5.43
4.4
0.256
324
1.93
99.1
5.43-5.67
4.7
0.297
318
1.897
100
5.67-5.97
4.4
0.272
331
1.689
99.7
5.97-6.35
4.5
0.255
310
1.606
98.4
6.35-6.84
4.1
0.218
336
1.573
99.7
6.84-7.52
4.7
0.14
320
1.591
99.7
7.52-8.6
4.5
0.109
341
1.784
99.7
8.6-10.82
4.4
0.082
342
2.12
99.4
10.82-50
3.8
0.086
366
2.651
93.8
-
解析
ソフトウェア
名称
バージョン
分類
HKL-2000
データスケーリング
REFMAC
5.8.0049
精密化
PDB_EXTRACT
3.15
データ抽出
MOLREP
位相決定
精密化
解像度: 4.01→50 Å / Cor.coef. Fo:Fc: 0.888 / Cor.coef. Fo:Fc free: 0.73 / SU B: 101.143 / SU ML: 1.276 / 交差検証法: THROUGHOUT / σ(F): 0 / ESU R Free: 1.399 / 立体化学のターゲット値: MAXIMUM LIKELIHOOD 詳細: HYDROGENS HAVE BEEN ADDED IN THE RIDING POSITIONS U VALUES : REFINED INDIVIDUALLY
Rfactor
反射数
%反射
Selection details
Rfree
0.3578
300
4.7 %
RANDOM
Rwork
0.2421
-
-
-
obs
0.2475
6104
98.31 %
-
溶媒の処理
イオンプローブ半径: 0.8 Å / 減衰半径: 0.8 Å / VDWプローブ半径: 1.2 Å / 溶媒モデル: MASK