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- PDB-5gm2: Crystal structure of methyltransferase TleD complexed with SAH an... -

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基本情報

登録情報

データベース: PDB / ID: 5gm2

タイトル

Crystal structure of methyltransferase TleD complexed with SAH and teleocidin A1

要素

O-methylransferase

キーワード

TRANSFERASE / TleD / Teleocidin / methyltransferases / terpene cyclization

機能・相同性

機能・相同性情報

S-adenosylmethionine-dependent methyltransferase activity
類似検索 - 分子機能

生物種

Streptomyces blastmyceticus (バクテリア)

手法

X線回折 /

シンクロトロン /

分子置換 / 解像度: 2.8 Å

データ登録者

Yu, F. / Li, M.J. / Xu, C.Y. / Zhou, H. / Sun, B. / Wang, Z.J. / Xu, Q. / Xie, M.Y. / Zuo, G. / Huang, P. ...

引用

ジャーナル: Biochem.J. / 年: 2016
タイトル: Crystal structure and enantioselectivity of terpene cyclization in SAM-dependent methyltransferase TleD
著者: Yu, F. / Li, M.J. / Xu, C.Y. / Sun, B. / Zhou, H. / Wang, Z.J. / Xu, Q. / Xie, M.Y. / Zuo, G. / Huang, P. / Guo, H. / Wang, Q.S. / He, J.H.

履歴

登録	2016年7月12日	登録サイト: PDBJ / 処理サイト: PDBJ
改定 1.0	2016年9月28日	Provider: repository / タイプ: Initial release
改定 1.1	2016年12月7日	Group: Database references
改定 1.2	2024年3月20日	Group: Data collection / Database references カテゴリ: chem_comp_atom / chem_comp_bond ...chem_comp_atom / chem_comp_bond / citation / database_2 Item: _citation.journal_id_CSD / _database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession

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構造の表示

構造ビューア	分子: MolmilJmol/JSmol

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ダウンロードとリンク

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ダウンロード

PDBx/mmCIF形式	5gm2.cif.gz	1.9 MB	表示	PDBx/mmCIF形式
PDB形式	pdb5gm2.ent.gz	1.6 MB	表示	PDB形式
PDBx/mmJSON形式	5gm2.json.gz		ツリー表示	PDBx/mmJSON形式
その他	その他のダウンロード

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検証レポート

文書・要旨	5gm2_validation.pdf.gz	10.3 MB	表示	wwPDB検証レポート
文書・詳細版	5gm2_full_validation.pdf.gz	10.7 MB	表示
XML形式データ	5gm2_validation.xml.gz	179.4 KB	表示
CIF形式データ	5gm2_validation.cif.gz	224.3 KB	表示
アーカイブディレクトリ	https://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/gm/5gm2 ftp://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/gm/5gm2	HTTPS FTP

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関連構造データ

関連構造データ	5gm1C C: 同じ文献を引用 (文献)
類似構造データ	5gm1-3 5gm1-2 5gm1-1 6kup-d 6z86-2 7byx-d 6z87-1 3ck6-d Omokage検索で類似形状データを探す (詳細) Omokage検索で類似形状データを探す (詳細) Omokage検索で類似形状データを探す (詳細) Omokage検索で類似形状データを探す (詳細) 類似検索 - 機能・相同性F&H 検索類似検索 - 機能F&H 検索類似検索 - 相同性F&H 検索

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リンク

PDBのページ	PDBj / wwPDB / NCBI

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集合体

登録構造単位

A: O-methylransferase

B: O-methylransferase

C: O-methylransferase

D: O-methylransferase

E: O-methylransferase

F: O-methylransferase

G: O-methylransferase

H: O-methylransferase

I: O-methylransferase

J: O-methylransferase

K: O-methylransferase

L: O-methylransferase

M: O-methylransferase

N: O-methylransferase

O: O-methylransferase

P: O-methylransferase

Q: O-methylransferase

R: O-methylransferase

ヘテロ分子

606 kDa, 18 ポリマー
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A: O-methylransferase

B: O-methylransferase

C: O-methylransferase

D: O-methylransferase

E: O-methylransferase

F: O-methylransferase

ヘテロ分子

登録者が定義した集合体
202 kDa, 6 ポリマー
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G: O-methylransferase

H: O-methylransferase

I: O-methylransferase

J: O-methylransferase

K: O-methylransferase

L: O-methylransferase

ヘテロ分子

登録者が定義した集合体
202 kDa, 6 ポリマー
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M: O-methylransferase

N: O-methylransferase

O: O-methylransferase

P: O-methylransferase

Q: O-methylransferase

R: O-methylransferase

ヘテロ分子

登録者が定義した集合体
202 kDa, 6 ポリマー
Omokage検索でこの集合体の類似形状データを探す (詳細)

単位格子

Length a, b, c (Å)	257.459, 152.757, 154.171
Angle α, β, γ (deg.)	90.00, 93.06, 90.00
Int Tables number	5
Space group name H-M	C121

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要素

#1: タンパク質	O-methylransferase / Methyltransferase TleD 分子量: 32823.102 Da / 分子数: 18 / 由来タイプ: 組換発現由来: (組換発現) Streptomyces blastmyceticus (バクテリア) 遺伝子: tleD / 発現宿主: Escherichia coli (大腸菌) / 参照: UniProt: A0A077K7L1
#2: 化合物	ChemComp-SAH / S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE タイプ: L-peptide linking / 分子量: 384.411 Da / 分子数: 18 / 由来タイプ: 組換発現 / 式: C₁₄H₂₀N₆O₅S
#3: 化合物	ChemComp-TEX / (2S,5S)-9-[(3R)-3,7-dimethylocta-1,6-dien-3-yl]-5-(hydroxymethyl)-1-methyl-2-(propan-2-yl)-1,2,4,5,6,8-hexahydro-3H-[1,4]diazonino[7,6,5-cd]indol-3-one / Teleocidin A 1 分子量: 437.617 Da / 分子数: 18 / 由来タイプ: 組換発現 / 式: C₂₇H₃₉N₃O₂ / コメント: 毒素*YM
#4: 水	ChemComp-HOH / water 分子量: 18.015 Da / 分子数: 166 / 由来タイプ: 天然 / 式: H₂O

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実験情報

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実験

実験	手法: X線回折 / 使用した結晶の数: 1

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試料調製

結晶	マシュー密度: 2.53 Å³/Da / 溶媒含有率: 51.43 %
結晶化	温度: 291 K / 手法: 蒸気拡散法, ハンギングドロップ法 / pH: 8 詳細: 100 mM Tris-HCl, 18% PEG400, 14% PEG3350, 100 mM MgCl2, 2mM TCEP

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データ収集

回折	平均測定温度: 100 K
放射光源	由来: シンクロトロン / サイト: SSRF / ビームライン: BL17U / 波長: 0.97915 Å
検出器	タイプ: ADSC QUANTUM 315r / 検出器: CCD / 日付: 2015年5月7日
放射	プロトコル: SINGLE WAVELENGTH / 単色(M)・ラウエ(L): M / 散乱光タイプ: x-ray
放射波長	波長: 0.97915 Å / 相対比: 1
反射	解像度: 2.8→153.95 Å / Num. obs: 146088 / % possible obs: 99.8 % / 冗長度: 4.7 % / CC_1/2: 0.999 / R_merge(I) obs: 0.072 / Net I/σ(I): 16.5
反射シェル	解像度: 2.8→2.95 Å / 冗長度: 4.8 % / R_merge(I) obs: 0.484 / Mean I/σ(I) obs: 3.3 / CC_1/2: 0.846 / % possible all: 100

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解析

ソフトウェア

名称	バージョン	分類
PHENIX	(1.10.1_2155: ???)	精密化
XDS		データ削減
Aimless		データスケーリング
PHASER		位相決定

精密化

構造決定の手法:

分子置換 / 解像度: 2.8→153.95 Å / SU ML: 0.4 / 交差検証法: FREE R-VALUE / σ(F): 1.35 / 位相誤差: 27.09

	R_factor	反射数	%反射
R_free	0.2487	7109	4.87 %
R_work	0.2066	-	-
obs	0.2086	146088	99.78 %

溶媒の処理

減衰半径: 0.9 Å / VDWプローブ半径: 1.11 Å

精密化ステップ

サイクル: LAST / 解像度: 2.8→153.95 Å

	タンパク質	核酸	リガンド	溶媒	全体
原子数	38443	0	576	166	39185

拘束条件

Refine-ID	タイプ	Dev ideal	数
X-RAY DIFFRACTION	f_bond_d	0.003	39893
X-RAY DIFFRACTION	f_angle_d	0.713	54234
X-RAY DIFFRACTION	f_dihedral_angle_d	14.886	24501
X-RAY DIFFRACTION	f_chiral_restr	0.052	6113
X-RAY DIFFRACTION	f_plane_restr	0.004	6975

精密化 TLS

手法: refined / Refine-ID: X-RAY DIFFRACTION

ID	L11 (°²)	L12 (°²)	L13 (°²)	L22 (°²)	L23 (°²)	L33 (°²)	S11 (Å °)	S12 (Å °)	S13 (Å °)	S21 (Å °)	S22 (Å °)	S23 (Å °)	S31 (Å °)	S32 (Å °)	S33 (Å °)	T11 (Å²)	T12 (Å²)	T13 (Å²)	T22 (Å²)	T23 (Å²)	T33 (Å²)	Origin x (Å)	Origin y (Å)	Origin z (Å)
1	0.7599	-0.3247	0.5963	2.4066	1.0616	2.1413	0.0639	0.0157	-0.2414	0.1204	-0.051	0.6771	0.5351	-0.242	-0.0384	0.7912	0.0348	-0.1882	0.1739	0.0675	1.0193	-95.5389	36.062	72.8158
2	0.4452	0.4194	-0.1622	1.3263	-0.1192	0.3179	-0.0299	-0.0256	-0.158	-0.0856	0.0336	-0.1787	0.0827	0.0256	0.1034	0.5315	0.0078	-0.0546	0.0405	-0.033	0.6837	-85.1628	59.4709	74.9179
3	0.2904	-0.0268	0.0108	1.3368	-0.095	0.3283	0.0493	-0.0246	-0.0935	0.0128	-0.0071	-0.218	-0.039	0.0582	-0.0561	0.4964	-0.0062	-0.0863	0.1136	-0.0643	0.679	-81.6798	73.0859	76.291
4	0.2786	-0.0981	-0.2249	0.3708	-0.2044	0.4142	0.1385	-0.0273	0.2758	-0.1581	0.0026	-0.0128	-0.3322	-0.0035	-0.183	0.687	0.0576	-0.0725	0.1532	-0.1302	0.7661	-87.0091	80.3843	76.0334
5	0.8763	-0.0207	0.0188	0.8379	-0.7244	0.6273	0.14	0.1242	0.3184	-0.3726	-0.0574	0.0056	-0.0986	-0.0502	-0.0978	0.7854	0.1019	-0.093	0.1363	-0.0308	0.6909	-83.2004	74.6724	62.3105
6	7.3409	0.0611	-4.2235	2.8523	-0.5661	8.4168	0.4054	1.0714	0.0004	-0.9188	-0.0947	0.7195	0.069	-0.4681	-0.3202	0.9985	0.1851	-0.5099	0.5107	-0.1233	0.8919	-100.4032	64.4869	51.9214
7	0.5084	-0.6328	0.0617	2.0898	-0.8251	0.4382	0.1026	0.2055	0.1723	-0.6125	-0.1493	-0.095	0.0245	-0.0723	0.1136	0.9186	0.1416	-0.105	0.213	-0.0117	0.707	-83.3774	68.7893	55.1317
8	0.8042	-0.3369	-0.6316	4.314	-0.0714	1.3101	0.134	0.0074	0.0221	0.3007	-0.0389	0.735	-0.217	-0.1477	0.1024	0.7165	-0.0619	-0.2043	0.1735	-0.0528	0.8833	-103.1551	57.9912	70.5557
9	2.2287	0.6494	-0.3499	1.4519	-0.2174	0.4601	-0.1845	0.0888	-0.1001	-0.6748	0.0496	0.1055	-0.0172	-0.1424	0.1593	0.845	0.0899	-0.1876	0.1768	-0.0601	0.7335	-92.2737	63.3684	60.0896
10	1.3498	1.1254	-1.1742	4.5568	-3.5268	3.6445	0.1092	0.2457	0.3918	-0.6765	0.0532	0.4111	-0.3377	-0.2228	-0.1634	0.7677	0.0768	-0.2122	0.1917	0.0449	0.8318	-100.8964	72.5931	67.3743
11	0.8373	-1.1661	-0.6291	3.3913	1.4095	0.8676	0.071	0.0928	-0.1932	-0.289	-0.0407	0.2373	0.2091	-0.0403	0.0695	0.694	0.0393	-0.1866	0.1678	-0.0326	0.7053	-87.538	54.22	66.8126
12	0.3855	-0.4842	0.2968	0.6638	-0.4464	0.3347	-0.0711	0.0302	0.0908	-0.0743	-0.0388	-0.0253	-0.0777	-0.0228	0.0107	0.6752	0.0378	-0.215	0.0655	-0.047	0.8316	-84.1547	40.2456	69.3779
13	0.0358	0.1729	-0.015	1.1985	0.2734	0.3283	0.0649	-0.0292	-0.1455	-0.0424	0.0804	-0.2575	-0.0069	0.0765	-0.0102	0.7602	0.0576	-0.1802	0.1809	-0.0937	0.9717	-80.2161	26.7498	68.9706
14	0.012	-0.0434	0.0334	0.2985	-0.251	0.3148	0.0642	0.0711	-0.3204	-0.0991	0.0838	0.0377	0.3207	-0.042	-0.0168	0.8462	0.0055	-0.2338	0.195	0.0061	1.1496	-85.8978	22.0656	74.0395
15	0.5729	-0.8365	0.0581	1.2857	0.1197	0.7103	-0.0262	-0.3368	-0.6291	0.1153	0.2192	0.8695	0.4148	-0.3674	-0.3149	0.871	-0.0023	0.0003	0.4201	0.3045	1.2398	-95.7119	32.0417	87.0499
16	3.5736	1.0996	2.8111	1.8343	0.1916	3.9929	0.0864	0.1831	-0.3082	-0.1956	0.1259	1.0684	0.1751	-0.2733	-0.2377	0.7186	0.0044	-0.2319	0.2453	0.0543	1.1126	-102.4875	41.73	66.846
17	0.2657	0.0758	0.0368	2.4533	0.4784	1.0454	-0.4457	-0.0151	-0.4253	0.3069	0.142	0.849	-0.2354	-0.2357	0.1109	0.7371	0.0072	-0.0898	0.2355	0.1362	1.1081	-96.4155	36.0918	80.5115
18	2.1477	-0.1776	-0.131	1.4047	0.1992	2.2	0.2141	0.6278	0.0514	-0.7828	-0.4205	-0.5432	0.137	0.2259	0.2431	1.1966	0.216	0.2639	0.3968	0.1263	0.9165	-56.509	59.2316	47.6092
19	0.1281	-0.0991	-0.0061	0.7921	-0.0167	0.291	0.0019	-0.0276	0.4147	0.1513	-0.043	-0.1611	-0.2049	0.0349	-0.0535	0.8373	0.0658	0.0129	0.1471	-0.0626	1.2854	-53.1438	68.6099	79.8054
20	0.9257	-1.2495	-0.094	3.9358	0.3426	1.9503	-0.0256	-0.0579	0.3358	0.2186	-0.0205	0.8099	-0.6647	-0.3063	0.0394	1.1593	0.0848	0.0561	0.5155	-0.2217	2.0508	-51.2369	81.1346	83.7022
21	0.5376	0.0876	-0.0141	0.299	-0.2772	0.2692	0.0882	-0.0122	0.7533	0.0354	0.0329	-0.6413	-0.5037	0.1897	-0.1152	0.9059	0.0625	-0.0475	0.1241	-0.2213	1.8797	-38.0806	65.3657	77.1424
22	0.3958	-0.2108	0.5051	2.5285	-0.7026	0.8809	-0.0554	0.1181	0.3949	-0.4114	-0.1273	-0.5502	-0.0312	0.182	0.1553	0.8515	0.019	0.0214	0.2463	-0.1332	1.4987	-37.8365	62.7077	70.6694
23	0.983	-0.758	0.1108	1.1952	0.0511	0.9159	0.1252	0.0909	0.2385	-0.0427	-0.0654	-0.5275	-0.2753	0.1182	-0.2175	1.0568	0.1232	0.141	0.2034	0.0316	0.9512	-53.102	56.8085	60.2014
24	4.6361	-1.4211	0.6355	7.2353	-0.3929	4.7483	0.3677	0.4741	-0.7278	-1.1926	-0.0912	-0.5692	0.3914	0.4583	-0.2998	1.3562	0.3419	0.1546	0.5172	-0.1167	0.8772	-57.541	39.5135	41.9547
25	3.62	-0.018	0.1198	2.1721	0.0777	0.4964	0.1828	0.777	0.1199	-1.2406	-0.4214	-0.4242	-0.1031	0.087	0.0838	1.393	0.3104	0.1228	0.3662	0.0617	0.6905	-65.6354	59.3885	43.8894
26	3.9692	-0.439	-0.3321	2.118	-0.594	1.3616	0.1497	0.3827	0.3654	-0.8034	-0.3929	-0.4771	-0.1822	0.2929	0.2054	1.2581	0.1805	0.1615	0.3292	0.1374	0.715	-62.4945	64.578	47.0002
27	4.4697	-2.3825	-1.1164	3.9891	-0.2995	2.5276	-0.2008	-0.2811	-0.0823	-0.0386	0.4131	-0.8048	0.4691	0.3519	-0.1365	0.7447	0.1731	-0.1178	0.2765	-0.0727	0.8694	-40.1315	21.7574	89.6198
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113	1.2716	0.0856	0.0123	1.8918	-0.563	0.2894	0.4084	-0.2759	-0.7924	0.4399	-0.4415	0.8577	0.8116	-0.9578	0.1882	1.5039	-0.9023	-0.1456	1.7248	-0.5369	1.3217	-115.1532	-15.7663	26.3702

精密化 TLSグループ

ID	Refine-ID	Refine TLS-ID	Selection details
1	X-RAY DIFFRACTION	1	chain 'A' and (resid 10 through 53 )
2	X-RAY DIFFRACTION	2	chain 'A' and (resid 54 through 73 )
3	X-RAY DIFFRACTION	3	chain 'A' and (resid 74 through 109 )
4	X-RAY DIFFRACTION	4	chain 'A' and (resid 110 through 147 )
5	X-RAY DIFFRACTION	5	chain 'A' and (resid 148 through 184 )
6	X-RAY DIFFRACTION	6	chain 'A' and (resid 185 through 199 )
7	X-RAY DIFFRACTION	7	chain 'A' and (resid 200 through 228 )
8	X-RAY DIFFRACTION	8	chain 'A' and (resid 229 through 255 )
9	X-RAY DIFFRACTION	9	chain 'A' and (resid 256 through 290 )
10	X-RAY DIFFRACTION	10	chain 'B' and (resid 9 through 31 )
11	X-RAY DIFFRACTION	11	chain 'B' and (resid 32 through 53 )
12	X-RAY DIFFRACTION	12	chain 'B' and (resid 54 through 73 )
13	X-RAY DIFFRACTION	13	chain 'B' and (resid 74 through 109 )
14	X-RAY DIFFRACTION	14	chain 'B' and (resid 110 through 184 )
15	X-RAY DIFFRACTION	15	chain 'B' and (resid 185 through 228 )
16	X-RAY DIFFRACTION	16	chain 'B' and (resid 229 through 255 )
17	X-RAY DIFFRACTION	17	chain 'B' and (resid 256 through 290 )
18	X-RAY DIFFRACTION	18	chain 'C' and (resid 11 through 53 )
19	X-RAY DIFFRACTION	19	chain 'C' and (resid 54 through 109 )
20	X-RAY DIFFRACTION	20	chain 'C' and (resid 110 through 133 )
21	X-RAY DIFFRACTION	21	chain 'C' and (resid 134 through 255 )
22	X-RAY DIFFRACTION	22	chain 'C' and (resid 256 through 289 )
23	X-RAY DIFFRACTION	23	chain 'D' and (resid 10 through 109 )
24	X-RAY DIFFRACTION	24	chain 'D' and (resid 110 through 133 )
25	X-RAY DIFFRACTION	25	chain 'D' and (resid 134 through 255 )
26	X-RAY DIFFRACTION	26	chain 'D' and (resid 256 through 290 )
27	X-RAY DIFFRACTION	27	chain 'E' and (resid 11 through 31 )
28	X-RAY DIFFRACTION	28	chain 'E' and (resid 32 through 53 )
29	X-RAY DIFFRACTION	29	chain 'E' and (resid 54 through 73 )
30	X-RAY DIFFRACTION	30	chain 'E' and (resid 74 through 109 )
31	X-RAY DIFFRACTION	31	chain 'E' and (resid 110 through 138 )
32	X-RAY DIFFRACTION	32	chain 'E' and (resid 139 through 184 )
33	X-RAY DIFFRACTION	33	chain 'E' and (resid 185 through 199 )
34	X-RAY DIFFRACTION	34	chain 'E' and (resid 200 through 228 )
35	X-RAY DIFFRACTION	35	chain 'E' and (resid 229 through 255 )
36	X-RAY DIFFRACTION	36	chain 'E' and (resid 256 through 289 )
37	X-RAY DIFFRACTION	37	chain 'F' and (resid 11 through 31 )
38	X-RAY DIFFRACTION	38	chain 'F' and (resid 32 through 53 )
39	X-RAY DIFFRACTION	39	chain 'F' and (resid 54 through 73 )
40	X-RAY DIFFRACTION	40	chain 'F' and (resid 74 through 109 )
41	X-RAY DIFFRACTION	41	chain 'F' and (resid 110 through 138 )
42	X-RAY DIFFRACTION	42	chain 'F' and (resid 139 through 184 )
43	X-RAY DIFFRACTION	43	chain 'F' and (resid 185 through 199 )
44	X-RAY DIFFRACTION	44	chain 'F' and (resid 200 through 228 )
45	X-RAY DIFFRACTION	45	chain 'F' and (resid 229 through 255 )
46	X-RAY DIFFRACTION	46	chain 'F' and (resid 256 through 289 )
47	X-RAY DIFFRACTION	47	chain 'G' and (resid 24 through 53 )
48	X-RAY DIFFRACTION	48	chain 'G' and (resid 54 through 109 )
49	X-RAY DIFFRACTION	49	chain 'G' and (resid 110 through 147 )
50	X-RAY DIFFRACTION	50	chain 'G' and (resid 148 through 255 )
51	X-RAY DIFFRACTION	51	chain 'G' and (resid 256 through 289 )
52	X-RAY DIFFRACTION	52	chain 'H' and (resid 10 through 53 )
53	X-RAY DIFFRACTION	53	chain 'H' and (resid 54 through 109 )
54	X-RAY DIFFRACTION	54	chain 'H' and (resid 110 through 138 )
55	X-RAY DIFFRACTION	55	chain 'H' and (resid 139 through 199 )
56	X-RAY DIFFRACTION	56	chain 'H' and (resid 200 through 290 )
57	X-RAY DIFFRACTION	57	chain 'I' and (resid 24 through 53 )
58	X-RAY DIFFRACTION	58	chain 'I' and (resid 54 through 73 )
59	X-RAY DIFFRACTION	59	chain 'I' and (resid 74 through 109 )
60	X-RAY DIFFRACTION	60	chain 'I' and (resid 110 through 147 )
61	X-RAY DIFFRACTION	61	chain 'I' and (resid 148 through 218 )
62	X-RAY DIFFRACTION	62	chain 'I' and (resid 219 through 255 )
63	X-RAY DIFFRACTION	63	chain 'I' and (resid 256 through 289 )
64	X-RAY DIFFRACTION	64	chain 'J' and (resid 11 through 31 )
65	X-RAY DIFFRACTION	65	chain 'J' and (resid 32 through 53 )
66	X-RAY DIFFRACTION	66	chain 'J' and (resid 54 through 73 )
67	X-RAY DIFFRACTION	67	chain 'J' and (resid 74 through 175 )
68	X-RAY DIFFRACTION	68	chain 'J' and (resid 176 through 228 )
69	X-RAY DIFFRACTION	69	chain 'J' and (resid 229 through 289 )
70	X-RAY DIFFRACTION	70	chain 'K' and (resid 3 through 53 )
71	X-RAY DIFFRACTION	71	chain 'K' and (resid 54 through 109 )
72	X-RAY DIFFRACTION	72	chain 'K' and (resid 110 through 184 )
73	X-RAY DIFFRACTION	73	chain 'K' and (resid 185 through 228 )
74	X-RAY DIFFRACTION	74	chain 'K' and (resid 229 through 289 )
75	X-RAY DIFFRACTION	75	chain 'L' and (resid 24 through 53 )
76	X-RAY DIFFRACTION	76	chain 'L' and (resid 54 through 73 )
77	X-RAY DIFFRACTION	77	chain 'L' and (resid 74 through 109 )
78	X-RAY DIFFRACTION	78	chain 'L' and (resid 110 through 133 )
79	X-RAY DIFFRACTION	79	chain 'L' and (resid 134 through 184 )
80	X-RAY DIFFRACTION	80	chain 'L' and (resid 185 through 199 )
81	X-RAY DIFFRACTION	81	chain 'L' and (resid 200 through 289 )
82	X-RAY DIFFRACTION	82	chain 'M' and (resid 26 through 53 )
83	X-RAY DIFFRACTION	83	chain 'M' and (resid 54 through 73 )
84	X-RAY DIFFRACTION	84	chain 'M' and (resid 74 through 109 )
85	X-RAY DIFFRACTION	85	chain 'M' and (resid 110 through 170 )
86	X-RAY DIFFRACTION	86	chain 'M' and (resid 171 through 218 )
87	X-RAY DIFFRACTION	87	chain 'M' and (resid 219 through 289 )
88	X-RAY DIFFRACTION	88	chain 'N' and (resid 11 through 53 )
89	X-RAY DIFFRACTION	89	chain 'N' and (resid 54 through 73 )
90	X-RAY DIFFRACTION	90	chain 'N' and (resid 74 through 109 )
91	X-RAY DIFFRACTION	91	chain 'N' and (resid 110 through 175 )
92	X-RAY DIFFRACTION	92	chain 'N' and (resid 176 through 228 )
93	X-RAY DIFFRACTION	93	chain 'N' and (resid 229 through 288 )
94	X-RAY DIFFRACTION	94	chain 'O' and (resid 11 through 53 )
95	X-RAY DIFFRACTION	95	chain 'O' and (resid 54 through 89 )
96	X-RAY DIFFRACTION	96	chain 'O' and (resid 90 through 109 )
97	X-RAY DIFFRACTION	97	chain 'O' and (resid 110 through 159 )
98	X-RAY DIFFRACTION	98	chain 'O' and (resid 160 through 218 )
99	X-RAY DIFFRACTION	99	chain 'O' and (resid 219 through 255 )
100	X-RAY DIFFRACTION	100	chain 'O' and (resid 256 through 289 )
101	X-RAY DIFFRACTION	101	chain 'P' and (resid 11 through 53 )
102	X-RAY DIFFRACTION	102	chain 'P' and (resid 54 through 73 )
103	X-RAY DIFFRACTION	103	chain 'P' and (resid 74 through 175 )
104	X-RAY DIFFRACTION	104	chain 'P' and (resid 176 through 228 )
105	X-RAY DIFFRACTION	105	chain 'P' and (resid 229 through 289 )
106	X-RAY DIFFRACTION	106	chain 'Q' and (resid 24 through 109 )
107	X-RAY DIFFRACTION	107	chain 'Q' and (resid 110 through 199 )
108	X-RAY DIFFRACTION	108	chain 'Q' and (resid 200 through 218 )
109	X-RAY DIFFRACTION	109	chain 'Q' and (resid 219 through 289 )
110	X-RAY DIFFRACTION	110	chain 'R' and (resid 10 through 53 )
111	X-RAY DIFFRACTION	111	chain 'R' and (resid 54 through 122 )
112	X-RAY DIFFRACTION	112	chain 'R' and (resid 123 through 184 )
113	X-RAY DIFFRACTION	113	chain 'R' and (resid 185 through 289 )

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新型コロナ情報

URL: https://pdbj.org/emnavi/covid19.php

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万見(Yorodumi)は、EMDB/PDB/SASBDBなどの構造データを閲覧するためのページです。
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関連情報:EMDB / PDB / SASBDB / 3つのデータバンクの比較 / 万見検索 / 2016年8月31日: 新しいEM Navigatorと万見 / 万見文献 / Jmol/JSmol / 機能・相同性情報 / 新しいEM Navigatorと万見の変更点

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